MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronococcus occultus SP4 plasmid 1

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019975	GA	3	6	115	120	50 %	0 %	50 %	0 %	435849357
2	NC_019975	CGA	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
3	NC_019975	GAA	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849357
4	NC_019975	GAC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
5	NC_019975	GAC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849357
6	NC_019975	AGT	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849357
7	NC_019975	CGA	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849358
8	NC_019975	TCG	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
9	NC_019975	TGA	2	6	475	480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849358
10	NC_019975	TGAT	2	8	594	601	25 %	50 %	25 %	0 %	435849358
11	NC_019975	CGG	2	6	620	625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849358
12	NC_019975	CGT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849358
13	NC_019975	GAG	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849358
14	NC_019975	ATA	2	6	853	858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019975	AAC	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019975	GGCT	2	8	969	976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019975	AAT	2	6	981	986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019975	GCA	2	6	1038	1043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019975	AG	3	6	1047	1052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019975	TTCG	2	8	1062	1069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019975	ACG	2	6	1070	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019975	CGGT	2	8	1122	1129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019975	CCG	2	6	1150	1155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019975	CGTC	2	8	1203	1210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019975	ACCG	2	8	1286	1293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019975	CTAA	2	8	1310	1317	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
27	NC_019975	TGGGG	2	10	1340	1349	0 %	20 %	80 %	0 %	435849359
28	NC_019975	TCGG	2	8	1367	1374	0 %	25 %	50 %	25 %	435849359
29	NC_019975	AAACC	2	10	1449	1458	60 %	0 %	0 %	40 %	435849359
30	NC_019975	CGA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
31	NC_019975	CCG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	435849359
32	NC_019975	GAG	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849359
33	NC_019975	CAA	2	6	1558	1563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	435849359
34	NC_019975	CGA	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849359
35	NC_019975	TCG	2	6	1704	1709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849359
36	NC_019975	ACTA	2	8	1736	1743	50 %	25 %	0 %	25 %	435849359
37	NC_019975	ACT	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849360
38	NC_019975	ACG	2	6	1826	1831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
39	NC_019975	TCG	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849360
40	NC_019975	TGT	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849360
41	NC_019975	TC	3	6	2014	2019	0 %	50 %	0 %	50 %	435849360
42	NC_019975	GAG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
43	NC_019975	TTC	2	6	2060	2065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849360
44	NC_019975	GGA	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849360
45	NC_019975	TC	3	6	2163	2168	0 %	50 %	0 %	50 %	435849360
46	NC_019975	GCA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
47	NC_019975	CGA	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849360
48	NC_019975	CCGT	2	8	2255	2262	0 %	25 %	25 %	50 %	435849360
49	NC_019975	TCGA	2	8	2275	2282	25 %	25 %	25 %	25 %	435849360
50	NC_019975	TGG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849360
51	NC_019975	ACC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849360
52	NC_019975	GAC	2	6	2406	2411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
53	NC_019975	TAG	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849361
54	NC_019975	ACG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
55	NC_019975	CAG	3	9	2725	2733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849361
56	NC_019975	ACT	2	6	2776	2781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849361
57	NC_019975	GCG	2	6	2807	2812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849362
58	NC_019975	CGA	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849362
59	NC_019975	CA	3	6	2847	2852	50 %	0 %	0 %	50 %	435849362
60	NC_019975	AGG	2	6	2886	2891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849362
61	NC_019975	GAA	2	6	3089	3094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
62	NC_019975	ACGA	2	8	3195	3202	50 %	0 %	25 %	25 %	435849363
63	NC_019975	GAA	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	435849363
64	NC_019975	AAT	2	6	3327	3332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	435849363
65	NC_019975	ACG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849364
66	NC_019975	CGAC	2	8	3519	3526	25 %	0 %	25 %	50 %	435849364
67	NC_019975	GAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849364
68	NC_019975	TGA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849364
69	NC_019975	AAC	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019975	TGGA	2	8	3726	3733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019975	CGG	2	6	3797	3802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019975	GA	3	6	3937	3942	50 %	0 %	50 %	0 %	435849365
73	NC_019975	CGG	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849365
74	NC_019975	TGA	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849365
75	NC_019975	AGT	2	6	4051	4056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849366
76	NC_019975	AT	3	6	4076	4081	50 %	50 %	0 %	0 %	435849366
77	NC_019975	TTG	2	6	4163	4168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019975	GT	3	6	4189	4194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019975	CAT	2	6	4242	4247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019975	CTG	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019975	ATG	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019975	TA	3	6	4413	4418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019975	TAA	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019975	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019975	TAGA	2	8	4552	4559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019975	TA	3	6	4595	4600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019975	CAA	2	6	4653	4658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019975	TCC	2	6	4671	4676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019975	CT	3	6	4716	4721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019975	TCC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019975	TCAA	2	8	4769	4776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_019975	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019975	TC	3	6	4830	4835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_019975	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019975	AAC	2	6	4888	4893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019975	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019975	CTC	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019975	GAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019975	AAG	2	6	5107	5112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019975	TCG	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849367
101	NC_019975	TCGA	2	8	5212	5219	25 %	25 %	25 %	25 %	435849367
102	NC_019975	CAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849367
103	NC_019975	GCG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849367
104	NC_019975	TTC	2	6	5292	5297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849367
105	NC_019975	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	435849367
106	NC_019975	TAGT	2	8	5358	5365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019975	ATT	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019975	TTC	2	6	5702	5707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849368
109	NC_019975	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	435849368
110	NC_019975	ACC	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849368
111	NC_019975	CGG	2	6	5863	5868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
112	NC_019975	GTTC	2	8	5871	5878	0 %	50 %	25 %	25 %	435849369
113	NC_019975	GCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
114	NC_019975	CGCT	2	8	5899	5906	0 %	25 %	25 %	50 %	435849369
115	NC_019975	CG	3	6	5925	5930	0 %	0 %	50 %	50 %	435849369
116	NC_019975	CGG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849369
117	NC_019975	TCG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849369
118	NC_019975	GGT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	435849369
119	NC_019975	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	435849370
120	NC_019975	CGG	2	6	6215	6220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	435849370
121	NC_019975	TCG	2	6	6238	6243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	435849370
122	NC_019975	TCCG	2	8	6265	6272	0 %	25 %	25 %	50 %	435849370
123	NC_019975	CCA	2	6	6326	6331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019975	AACGC	2	10	6348	6357	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019975	TAA	2	6	6404	6409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019975	GTA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019975	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849371
128	NC_019975	GTTC	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	435849371
129	NC_019975	CAC	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	435849371
130	NC_019975	GAG	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849371
131	NC_019975	CTT	2	6	6698	6703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	435849371
132	NC_019975	CGAG	2	8	6711	6718	25 %	0 %	50 %	25 %	435849371
133	NC_019975	CGA	2	6	6798	6803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
134	NC_019975	GAG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	435849372
135	NC_019975	TGA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
136	NC_019975	TGA	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	435849372
137	NC_019975	AGC	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	435849372
138	NC_019975	TC	3	6	7042	7047	0 %	50 %	0 %	50 %	435849372
139	NC_019975	AAAG	2	8	7053	7060	75 %	0 %	25 %	0 %	435849372
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.