MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 6268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019967	CAG	2	6	229677	229682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5002	NC_019967	ATC	2	6	229816	229821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593528
5003	NC_019967	CAG	2	6	229840	229845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5004	NC_019967	ACG	2	6	229964	229969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5005	NC_019967	CGC	2	6	229995	230000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593528
5006	NC_019967	AC	3	6	230018	230023	50 %	0 %	0 %	50 %	433593528
5007	NC_019967	ATCGA	2	10	230062	230071	40 %	20 %	20 %	20 %	433593528
5008	NC_019967	CGA	2	6	230099	230104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5009	NC_019967	ACG	2	6	230107	230112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5010	NC_019967	CTG	2	6	230131	230136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5011	NC_019967	CGT	2	6	230139	230144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5012	NC_019967	CTG	2	6	230152	230157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5013	NC_019967	GGCG	2	8	230212	230219	0 %	0 %	75 %	25 %	433593528
5014	NC_019967	TGG	3	9	230227	230235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593528
5015	NC_019967	GAC	2	6	230323	230328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593528
5016	NC_019967	CTT	2	6	230360	230365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_019967	CGG	2	6	230389	230394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_019967	CCG	3	9	230399	230407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_019967	CGA	2	6	230451	230456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019967	TCA	2	6	230458	230463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_019967	CAG	2	6	230464	230469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_019967	TCAGG	2	10	230480	230489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5023	NC_019967	TTGG	2	8	230572	230579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019967	TGG	2	6	230633	230638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019967	AGG	2	6	230657	230662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593529
5026	NC_019967	ATAC	2	8	230702	230709	50 %	25 %	0 %	25 %	433593529
5027	NC_019967	ATG	2	6	230755	230760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593529
5028	NC_019967	GC	3	6	230776	230781	0 %	0 %	50 %	50 %	433593529
5029	NC_019967	CGAG	2	8	230790	230797	25 %	0 %	50 %	25 %	433593529
5030	NC_019967	AAGG	2	8	230812	230819	50 %	0 %	50 %	0 %	433593529
5031	NC_019967	TGGA	2	8	230890	230897	25 %	25 %	50 %	0 %	433593529
5032	NC_019967	AAC	2	6	230996	231001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593529
5033	NC_019967	GACG	2	8	231085	231092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_019967	CGA	2	6	231174	231179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5035	NC_019967	CGA	2	6	231207	231212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5036	NC_019967	GAC	2	6	231232	231237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5037	NC_019967	CGA	2	6	231243	231248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5038	NC_019967	ATATCG	2	12	231264	231275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433593530
5039	NC_019967	CTC	2	6	231280	231285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593530
5040	NC_019967	CGGA	2	8	231305	231312	25 %	0 %	50 %	25 %	433593530
5041	NC_019967	CG	3	6	231363	231368	0 %	0 %	50 %	50 %	433593530
5042	NC_019967	CAG	2	6	231424	231429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5043	NC_019967	GCC	2	6	231458	231463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593530
5044	NC_019967	GTT	2	6	231472	231477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593530
5045	NC_019967	GCAA	2	8	231513	231520	50 %	0 %	25 %	25 %	433593530
5046	NC_019967	TCG	2	6	231545	231550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5047	NC_019967	TGA	2	6	231569	231574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593530
5048	NC_019967	CGG	3	9	231639	231647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593530
5049	NC_019967	CTAC	2	8	231677	231684	25 %	25 %	0 %	50 %	433593530
5050	NC_019967	TCG	3	9	231734	231742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5051	NC_019967	CTAC	2	8	231824	231831	25 %	25 %	0 %	50 %	433593530
5052	NC_019967	CTC	2	6	231856	231861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593530
5053	NC_019967	CGA	2	6	231900	231905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5054	NC_019967	TGTC	2	8	231947	231954	0 %	50 %	25 %	25 %	433593530
5055	NC_019967	ACG	2	6	231983	231988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5056	NC_019967	AGG	2	6	232046	232051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593530
5057	NC_019967	GCG	2	6	232095	232100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593530
5058	NC_019967	AGC	2	6	232115	232120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5059	NC_019967	GC	3	6	232119	232124	0 %	0 %	50 %	50 %	433593530
5060	NC_019967	A	6	6	232150	232155	100 %	0 %	0 %	0 %	433593530
5061	NC_019967	CAC	2	6	232186	232191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593530
5062	NC_019967	CG	3	6	232198	232203	0 %	0 %	50 %	50 %	433593530
5063	NC_019967	AAC	2	6	232219	232224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593530
5064	NC_019967	TC	3	6	232241	232246	0 %	50 %	0 %	50 %	433593530
5065	NC_019967	GACG	2	8	232284	232291	25 %	0 %	50 %	25 %	433593530
5066	NC_019967	TGA	2	6	232359	232364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593530
5067	NC_019967	TCC	2	6	232451	232456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593530
5068	NC_019967	GCCA	2	8	232472	232479	25 %	0 %	25 %	50 %	433593530
5069	NC_019967	ATC	2	6	232495	232500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593530
5070	NC_019967	ACGT	2	8	232519	232526	25 %	25 %	25 %	25 %	433593530
5071	NC_019967	GAC	2	6	232551	232556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593530
5072	NC_019967	GCTC	2	8	232577	232584	0 %	25 %	25 %	50 %	433593531
5073	NC_019967	ACC	2	6	232589	232594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593531
5074	NC_019967	GA	3	6	232644	232649	50 %	0 %	50 %	0 %	433593531
5075	NC_019967	AACG	2	8	232856	232863	50 %	0 %	25 %	25 %	433593531
5076	NC_019967	GTT	2	6	232871	232876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593531
5077	NC_019967	GAC	2	6	232895	232900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593531
5078	NC_019967	AC	3	6	232899	232904	50 %	0 %	0 %	50 %	433593531
5079	NC_019967	AGA	2	6	232905	232910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593531
5080	NC_019967	TGA	2	6	232933	232938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593531
5081	NC_019967	GAG	2	6	232988	232993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593531
5082	NC_019967	ACG	2	6	233066	233071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593531
5083	NC_019967	ACTG	2	8	233074	233081	25 %	25 %	25 %	25 %	433593531
5084	NC_019967	AGT	2	6	233084	233089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593531
5085	NC_019967	AC	3	6	233104	233109	50 %	0 %	0 %	50 %	433593531
5086	NC_019967	CTGG	2	8	233125	233132	0 %	25 %	50 %	25 %	433593531
5087	NC_019967	ACG	2	6	233172	233177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593531
5088	NC_019967	CGAT	2	8	233265	233272	25 %	25 %	25 %	25 %	433593531
5089	NC_019967	CGAA	2	8	233290	233297	50 %	0 %	25 %	25 %	433593531
5090	NC_019967	CGT	2	6	233340	233345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593531
5091	NC_019967	TC	3	6	233349	233354	0 %	50 %	0 %	50 %	433593531
5092	NC_019967	GGCA	2	8	233516	233523	25 %	0 %	50 %	25 %	433593531
5093	NC_019967	GAGC	2	8	233564	233571	25 %	0 %	50 %	25 %	433593531
5094	NC_019967	TAC	2	6	233589	233594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593531
5095	NC_019967	TGA	2	6	233620	233625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593531
5096	NC_019967	TGA	2	6	233628	233633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593531
5097	NC_019967	GCGA	2	8	233668	233675	25 %	0 %	50 %	25 %	433593531
5098	NC_019967	ATC	2	6	233684	233689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593531
5099	NC_019967	GAA	2	6	233725	233730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593531
5100	NC_019967	ATG	2	6	233793	233798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593531
5101	NC_019967	CGAG	2	8	233811	233818	25 %	0 %	50 %	25 %	433593531
5102	NC_019967	AGA	2	6	233872	233877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593531
5103	NC_019967	GAT	2	6	233923	233928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019967	AT	3	6	233995	234000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_019967	GC	3	6	234021	234026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_019967	ATC	2	6	234044	234049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_019967	CCG	2	6	234092	234097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_019967	AC	3	6	234123	234128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_019967	AC	3	6	234141	234146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_019967	TC	3	6	234188	234193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_019967	CGG	2	6	234214	234219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_019967	GCC	2	6	234225	234230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_019967	TTC	2	6	234265	234270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_019967	CGAG	2	8	234290	234297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_019967	GTC	2	6	234312	234317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_019967	GAG	2	6	234318	234323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019967	GAG	2	6	234366	234371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019967	CT	3	6	234413	234418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_019967	GCT	2	6	234422	234427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_019967	GGAT	2	8	234449	234456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019967	CGA	2	6	234490	234495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_019967	TCC	2	6	234664	234669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_019967	TC	3	6	234741	234746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_019967	TCC	2	6	234773	234778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_019967	TCT	2	6	234831	234836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593532
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5248	NC_019967	TC	3	6	240319	240324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5249	NC_019967	ATA	2	6	240336	240341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_019967	TA	3	6	240340	240345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5360	NC_019967	CGT	2	6	245004	245009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593543
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5489	NC_019967	AGC	2	6	249905	249910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5491	NC_019967	ACTG	2	8	250003	250010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5492	NC_019967	CGG	2	6	250076	250081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593549
5493	NC_019967	GCA	3	9	250127	250135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593549
5494	NC_019967	GAG	2	6	250164	250169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593549
5495	NC_019967	GAC	2	6	250178	250183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593549
5496	NC_019967	GCTG	2	8	250240	250247	0 %	25 %	50 %	25 %	433593549
5497	NC_019967	TGAG	2	8	250291	250298	25 %	25 %	50 %	0 %	433593549
5498	NC_019967	GAG	2	6	250332	250337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593549
5499	NC_019967	ACGTCG	2	12	250360	250371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433593549
5500	NC_019967	GAG	2	6	250398	250403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593549

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