MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE02

Total Repeats: 6107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019963	ACGA	2	8	65133	65140	50 %	0 %	25 %	25 %	433593135
1502	NC_019963	CGG	2	6	65146	65151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593135
1503	NC_019963	CGA	2	6	65219	65224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1504	NC_019963	CGT	3	9	65237	65245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1505	NC_019963	TCT	2	6	65248	65253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593135
1506	NC_019963	GAGT	2	8	65265	65272	25 %	25 %	50 %	0 %	433593135
1507	NC_019963	ATC	2	6	65299	65304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593135
1508	NC_019963	TCA	2	6	65317	65322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593135
1509	NC_019963	GTA	2	6	65367	65372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593135
1510	NC_019963	TCG	2	6	65375	65380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1511	NC_019963	GAC	2	6	65406	65411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1512	NC_019963	CGA	2	6	65414	65419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1513	NC_019963	TGATG	2	10	65441	65450	20 %	40 %	40 %	0 %	433593135
1514	NC_019963	CGC	2	6	65477	65482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593135
1515	NC_019963	TCC	2	6	65485	65490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593135
1516	NC_019963	CCT	2	6	65522	65527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593135
1517	NC_019963	ATC	2	6	65545	65550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593135
1518	NC_019963	TCG	2	6	65563	65568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593135
1519	NC_019963	GGT	2	6	65615	65620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593135
1520	NC_019963	ACT	2	6	65631	65636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593135
1521	NC_019963	GCT	2	6	65681	65686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_019963	GAC	2	6	65727	65732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019963	ATC	2	6	65774	65779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_019963	A	6	6	65781	65786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_019963	TCGACT	2	12	65850	65861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433593136
1526	NC_019963	ACG	2	6	65961	65966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593136
1527	NC_019963	CGC	2	6	66021	66026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593136
1528	NC_019963	TAC	2	6	66066	66071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593137
1529	NC_019963	CGA	2	6	66100	66105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1530	NC_019963	CTG	2	6	66111	66116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1531	NC_019963	GCC	2	6	66168	66173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1532	NC_019963	GTGG	2	8	66195	66202	0 %	25 %	75 %	0 %	433593137
1533	NC_019963	GCC	2	6	66318	66323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1534	NC_019963	GTC	2	6	66324	66329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1535	NC_019963	GCT	2	6	66398	66403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1536	NC_019963	CCGT	2	8	66427	66434	0 %	25 %	25 %	50 %	433593137
1537	NC_019963	CCCG	2	8	66459	66466	0 %	0 %	25 %	75 %	433593137
1538	NC_019963	GTC	3	9	66486	66494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1539	NC_019963	CGGG	2	8	66502	66509	0 %	0 %	75 %	25 %	433593137
1540	NC_019963	GTC	2	6	66531	66536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1541	NC_019963	GC	3	6	66580	66585	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
1542	NC_019963	CGA	2	6	66605	66610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1543	NC_019963	AGG	2	6	66634	66639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593137
1544	NC_019963	GC	3	6	66640	66645	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
1545	NC_019963	GAC	2	6	66656	66661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1546	NC_019963	ATC	2	6	66693	66698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593137
1547	NC_019963	CGTCG	2	10	66699	66708	0 %	20 %	40 %	40 %	433593137
1548	NC_019963	AGG	2	6	66709	66714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593137
1549	NC_019963	TAC	2	6	66765	66770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593137
1550	NC_019963	GCCG	2	8	66773	66780	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
1551	NC_019963	GC	3	6	66862	66867	0 %	0 %	50 %	50 %	433593137
1552	NC_019963	CGC	2	6	66911	66916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1553	NC_019963	TGA	2	6	66931	66936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593137
1554	NC_019963	GCG	2	6	66940	66945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593137
1555	NC_019963	TCG	2	6	66976	66981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1556	NC_019963	ACC	2	6	67017	67022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593137
1557	NC_019963	CGC	2	6	67049	67054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1558	NC_019963	CGA	2	6	67055	67060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1559	NC_019963	CCG	2	6	67081	67086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1560	NC_019963	AGA	3	9	67087	67095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593137
1561	NC_019963	ACC	2	6	67102	67107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593137
1562	NC_019963	TCG	2	6	67120	67125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1563	NC_019963	CTG	2	6	67147	67152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1564	NC_019963	GACG	2	8	67154	67161	25 %	0 %	50 %	25 %	433593137
1565	NC_019963	GACG	2	8	67190	67197	25 %	0 %	50 %	25 %	433593137
1566	NC_019963	GTT	2	6	67281	67286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593137
1567	NC_019963	CTG	2	6	67302	67307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1568	NC_019963	GAG	2	6	67362	67367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593137
1569	NC_019963	GTC	2	6	67380	67385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1570	NC_019963	CGT	2	6	67388	67393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1571	NC_019963	CAT	2	6	67406	67411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593137
1572	NC_019963	GTC	2	6	67458	67463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1573	NC_019963	GCC	3	9	67524	67532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1574	NC_019963	GAG	2	6	67539	67544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593137
1575	NC_019963	CGA	2	6	67553	67558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1576	NC_019963	CTC	2	6	67572	67577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593137
1577	NC_019963	ACG	2	6	67654	67659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1578	NC_019963	CCG	2	6	67675	67680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1579	NC_019963	GCC	2	6	67701	67706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1580	NC_019963	GGAC	2	8	67708	67715	25 %	0 %	50 %	25 %	433593137
1581	NC_019963	CGA	2	6	67751	67756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1582	NC_019963	TGACCG	2	12	67837	67848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433593137
1583	NC_019963	CGC	2	6	67886	67891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593137
1584	NC_019963	ATC	2	6	67974	67979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_019963	ACC	2	6	67980	67985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_019963	CCG	2	6	68012	68017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593138
1587	NC_019963	ACG	2	6	68051	68056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1588	NC_019963	CGATC	2	10	68058	68067	20 %	20 %	20 %	40 %	433593138
1589	NC_019963	TCA	2	6	68126	68131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593138
1590	NC_019963	CGA	2	6	68226	68231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1591	NC_019963	GGC	2	6	68262	68267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593138
1592	NC_019963	TGC	2	6	68283	68288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1593	NC_019963	TGA	2	6	68297	68302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593138
1594	NC_019963	CAT	2	6	68307	68312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593138
1595	NC_019963	GAC	2	6	68338	68343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1596	NC_019963	CGG	2	6	68361	68366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593138
1597	NC_019963	CGG	2	6	68370	68375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593138
1598	NC_019963	CCG	2	6	68376	68381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593138
1599	NC_019963	CCT	2	6	68385	68390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593138
1600	NC_019963	GTTCCG	2	12	68430	68441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1601	NC_019963	CGA	2	6	68535	68540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1602	NC_019963	CCG	2	6	68586	68591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593138
1603	NC_019963	GTC	2	6	68599	68604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1604	NC_019963	GAC	2	6	68611	68616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593138
1605	NC_019963	CCG	2	6	68848	68853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593139
1606	NC_019963	GTCGAT	2	12	68883	68894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433593139
1607	NC_019963	GAA	2	6	68918	68923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433593139
1608	NC_019963	CCGT	2	8	68935	68942	0 %	25 %	25 %	50 %	433593139
1609	NC_019963	CGG	2	6	68952	68957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593139
1610	NC_019963	TCG	2	6	69013	69018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
1611	NC_019963	CGG	2	6	69117	69122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593139
1612	NC_019963	CCA	2	6	69125	69130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593139
1613	NC_019963	CTG	2	6	69189	69194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
1614	NC_019963	TTC	2	6	69196	69201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593139
1615	NC_019963	CGT	2	6	69221	69226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
1616	NC_019963	TCC	2	6	69238	69243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593139
1617	NC_019963	CGC	2	6	69251	69256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593139
1618	NC_019963	GGA	2	6	69281	69286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593139
1619	NC_019963	GCC	2	6	69343	69348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593139
1620	NC_019963	GC	3	6	69363	69368	0 %	0 %	50 %	50 %	433593139
1621	NC_019963	GCT	2	6	69371	69376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
1622	NC_019963	TCG	2	6	69439	69444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
1623	NC_019963	CGT	2	6	69509	69514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593139
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1741	NC_019963	ATG	2	6	74867	74872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1742	NC_019963	TTCG	2	8	74899	74906	0 %	50 %	25 %	25 %	433593144
1743	NC_019963	GCTC	2	8	74913	74920	0 %	25 %	25 %	50 %	433593144
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1997	NC_019963	CAG	2	6	87797	87802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593157
1998	NC_019963	CGT	2	6	87877	87882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593157
1999	NC_019963	ATCC	2	8	87948	87955	25 %	25 %	0 %	50 %	433593158
2000	NC_019963	ACG	2	6	87964	87969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593158

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