MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Natronobacterium gregoryi SP2 chromosome

Total Repeats: 12722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019792	CGAT	2	8	316	323	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019792	GAGC	2	8	534	541	25 %	0 %	50 %	25 %	429190046
3	NC_019792	TCGG	2	8	594	601	0 %	25 %	50 %	25 %	429190046
4	NC_019792	CGAT	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	429190046
5	NC_019792	GACC	2	8	1675	1682	25 %	0 %	25 %	50 %	429190047
6	NC_019792	GAAC	2	8	3042	3049	50 %	0 %	25 %	25 %	429190048
7	NC_019792	CGTC	2	8	3495	3502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019792	TCGA	2	8	3697	3704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019792	CCAC	2	8	3873	3880	25 %	0 %	0 %	75 %	429190049
10	NC_019792	TCGA	2	8	4123	4130	25 %	25 %	25 %	25 %	429190049
11	NC_019792	TCGA	2	8	4792	4799	25 %	25 %	25 %	25 %	429190049
12	NC_019792	ACGA	2	8	5298	5305	50 %	0 %	25 %	25 %	429190050
13	NC_019792	GTTC	2	8	5334	5341	0 %	50 %	25 %	25 %	429190050
14	NC_019792	CTCG	2	8	5401	5408	0 %	25 %	25 %	50 %	429190050
15	NC_019792	GCAG	2	8	5659	5666	25 %	0 %	50 %	25 %	429190050
16	NC_019792	GGAC	2	8	5878	5885	25 %	0 %	50 %	25 %	429190050
17	NC_019792	CGCT	2	8	5906	5913	0 %	25 %	25 %	50 %	429190050
18	NC_019792	GGAC	2	8	5975	5982	25 %	0 %	50 %	25 %	429190051
19	NC_019792	TCGA	2	8	6000	6007	25 %	25 %	25 %	25 %	429190051
20	NC_019792	CGGC	2	8	6859	6866	0 %	0 %	50 %	50 %	429190052
21	NC_019792	GCGT	2	8	7928	7935	0 %	25 %	50 %	25 %	429190053
22	NC_019792	GAAC	2	8	8155	8162	50 %	0 %	25 %	25 %	429190053
23	NC_019792	GAAC	2	8	8168	8175	50 %	0 %	25 %	25 %	429190053
24	NC_019792	GCCT	2	8	8594	8601	0 %	25 %	25 %	50 %	429190053
25	NC_019792	TCGC	2	8	8645	8652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019792	GACC	2	8	8895	8902	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019792	GACG	2	8	9135	9142	25 %	0 %	50 %	25 %	429190054
28	NC_019792	TCAC	2	8	9209	9216	25 %	25 %	0 %	50 %	429190054
29	NC_019792	GGAG	2	8	9258	9265	25 %	0 %	75 %	0 %	429190054
30	NC_019792	CGAC	2	8	9432	9439	25 %	0 %	25 %	50 %	429190054
31	NC_019792	CGCT	2	8	9668	9675	0 %	25 %	25 %	50 %	429190054
32	NC_019792	TGGC	2	8	9790	9797	0 %	25 %	50 %	25 %	429190054
33	NC_019792	CGAC	2	8	10154	10161	25 %	0 %	25 %	50 %	429190054
34	NC_019792	CGAC	3	12	10262	10273	25 %	0 %	25 %	50 %	429190054
35	NC_019792	GCTC	2	8	10320	10327	0 %	25 %	25 %	50 %	429190054
36	NC_019792	CCCG	2	8	10392	10399	0 %	0 %	25 %	75 %	429190054
37	NC_019792	CGAC	2	8	11881	11888	25 %	0 %	25 %	50 %	429190056
38	NC_019792	GATC	2	8	12205	12212	25 %	25 %	25 %	25 %	429190056
39	NC_019792	CGGC	2	8	13160	13167	0 %	0 %	50 %	50 %	429190056
40	NC_019792	GACT	2	8	13666	13673	25 %	25 %	25 %	25 %	429190057
41	NC_019792	CCAC	2	8	13761	13768	25 %	0 %	0 %	75 %	429190058
42	NC_019792	TCGA	2	8	14086	14093	25 %	25 %	25 %	25 %	429190058
43	NC_019792	ACCG	2	8	14262	14269	25 %	0 %	25 %	50 %	429190058
44	NC_019792	TCCG	2	8	14468	14475	0 %	25 %	25 %	50 %	429190058
45	NC_019792	TCGG	2	8	14696	14703	0 %	25 %	50 %	25 %	429190058
46	NC_019792	AGTC	2	8	14875	14882	25 %	25 %	25 %	25 %	429190058
47	NC_019792	CGCC	2	8	14976	14983	0 %	0 %	25 %	75 %	429190058
48	NC_019792	CTCG	2	8	15003	15010	0 %	25 %	25 %	50 %	429190058
49	NC_019792	GTCG	2	8	15270	15277	0 %	25 %	50 %	25 %	429190058
50	NC_019792	CGTT	2	8	15298	15305	0 %	50 %	25 %	25 %	429190058
51	NC_019792	ACGC	2	8	15347	15354	25 %	0 %	25 %	50 %	429190058
52	NC_019792	CTCG	2	8	15979	15986	0 %	25 %	25 %	50 %	429190059
53	NC_019792	AGAA	2	8	16044	16051	75 %	0 %	25 %	0 %	429190059
54	NC_019792	CGCA	2	8	16082	16089	25 %	0 %	25 %	50 %	429190059
55	NC_019792	ACCC	2	8	16238	16245	25 %	0 %	0 %	75 %	429190059
56	NC_019792	ACTC	2	8	17115	17122	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019792	GATG	2	8	17266	17273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019792	TGGC	2	8	17428	17435	0 %	25 %	50 %	25 %	429190060
59	NC_019792	CGAA	2	8	17448	17455	50 %	0 %	25 %	25 %	429190060
60	NC_019792	CTGG	2	8	17724	17731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019792	TGGG	2	8	17946	17953	0 %	25 %	75 %	0 %	429190061
62	NC_019792	CCGT	2	8	18206	18213	0 %	25 %	25 %	50 %	429190061
63	NC_019792	CGAC	2	8	18289	18296	25 %	0 %	25 %	50 %	429190061
64	NC_019792	GGCC	2	8	18394	18401	0 %	0 %	50 %	50 %	429190061
65	NC_019792	GTCG	2	8	18571	18578	0 %	25 %	50 %	25 %	429190061
66	NC_019792	CCGG	2	8	19184	19191	0 %	0 %	50 %	50 %	429190061
67	NC_019792	ATCG	2	8	19618	19625	25 %	25 %	25 %	25 %	429190061
68	NC_019792	ACGA	2	8	19638	19645	50 %	0 %	25 %	25 %	429190061
69	NC_019792	ACGA	2	8	19754	19761	50 %	0 %	25 %	25 %	429190061
70	NC_019792	TTTC	2	8	19820	19827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019792	CCAG	2	8	20389	20396	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019792	TCGA	2	8	20550	20557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019792	TCGT	2	8	20896	20903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019792	CTTA	2	8	21159	21166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019792	CAGG	2	8	21344	21351	25 %	0 %	50 %	25 %	429190062
76	NC_019792	AATC	2	8	21946	21953	50 %	25 %	0 %	25 %	429190063
77	NC_019792	GAGC	2	8	22029	22036	25 %	0 %	50 %	25 %	429190063
78	NC_019792	CCGG	2	8	22313	22320	0 %	0 %	50 %	50 %	429190063
79	NC_019792	TACC	2	8	22613	22620	25 %	25 %	0 %	50 %	429190063
80	NC_019792	GATC	2	8	22718	22725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019792	ATTT	2	8	22860	22867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019792	CGAA	2	8	22990	22997	50 %	0 %	25 %	25 %	429190064
83	NC_019792	CTGA	2	8	23557	23564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019792	CGCC	2	8	24538	24545	0 %	0 %	25 %	75 %	429190066
85	NC_019792	GAGC	2	8	24764	24771	25 %	0 %	50 %	25 %	429190066
86	NC_019792	GACA	2	8	25090	25097	50 %	0 %	25 %	25 %	429190066
87	NC_019792	TGCG	2	8	25447	25454	0 %	25 %	50 %	25 %	429190066
88	NC_019792	CCCG	2	8	25585	25592	0 %	0 %	25 %	75 %	429190066
89	NC_019792	TGCC	2	8	25770	25777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019792	GCTT	2	8	26417	26424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019792	CCGC	2	8	26621	26628	0 %	0 %	25 %	75 %	429190067
92	NC_019792	GACT	2	8	26735	26742	25 %	25 %	25 %	25 %	429190067
93	NC_019792	GATG	3	12	26934	26945	25 %	25 %	50 %	0 %	429190067
94	NC_019792	GACG	2	8	27069	27076	25 %	0 %	50 %	25 %	429190068
95	NC_019792	GAAA	2	8	27680	27687	75 %	0 %	25 %	0 %	429190069
96	NC_019792	GACG	2	8	27921	27928	25 %	0 %	50 %	25 %	429190069
97	NC_019792	CTGT	2	8	28541	28548	0 %	50 %	25 %	25 %	429190071
98	NC_019792	TCCA	2	8	29144	29151	25 %	25 %	0 %	50 %	429190072
99	NC_019792	GACG	2	8	29346	29353	25 %	0 %	50 %	25 %	429190072
100	NC_019792	GAAA	2	8	30206	30213	75 %	0 %	25 %	0 %	429190073
101	NC_019792	ACCG	2	8	30940	30947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019792	AGCG	2	8	31017	31024	25 %	0 %	50 %	25 %	429190074
103	NC_019792	CGAC	2	8	31033	31040	25 %	0 %	25 %	50 %	429190074
104	NC_019792	GCAA	2	8	31350	31357	50 %	0 %	25 %	25 %	429190074
105	NC_019792	GATC	2	8	31414	31421	25 %	25 %	25 %	25 %	429190074
106	NC_019792	TCGG	2	8	31680	31687	0 %	25 %	50 %	25 %	429190074
107	NC_019792	TCGT	2	8	31756	31763	0 %	50 %	25 %	25 %	429190074
108	NC_019792	GTTC	2	8	32375	32382	0 %	50 %	25 %	25 %	429190075
109	NC_019792	GGCA	2	8	32977	32984	25 %	0 %	50 %	25 %	429190075
110	NC_019792	CTGC	2	8	33170	33177	0 %	25 %	25 %	50 %	429190075
111	NC_019792	TGGC	2	8	33210	33217	0 %	25 %	50 %	25 %	429190075
112	NC_019792	GACG	2	8	33325	33332	25 %	0 %	50 %	25 %	429190075
113	NC_019792	GTGA	2	8	33547	33554	25 %	25 %	50 %	0 %	429190075
114	NC_019792	GGGT	2	8	34222	34229	0 %	25 %	75 %	0 %	429190076
115	NC_019792	CTCG	2	8	34879	34886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019792	CGAT	2	8	34976	34983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019792	GTTC	2	8	35283	35290	0 %	50 %	25 %	25 %	429190077
118	NC_019792	CATC	2	8	35535	35542	25 %	25 %	0 %	50 %	429190077
119	NC_019792	GCTC	2	8	36568	36575	0 %	25 %	25 %	50 %	429190078
120	NC_019792	GCCG	2	8	37756	37763	0 %	0 %	50 %	50 %	429190079
121	NC_019792	TCGC	2	8	37983	37990	0 %	25 %	25 %	50 %	429190079
122	NC_019792	CGAC	2	8	38088	38095	25 %	0 %	25 %	50 %	429190079
123	NC_019792	AGGA	2	8	38193	38200	50 %	0 %	50 %	0 %	429190079
124	NC_019792	CAGC	2	8	38397	38404	25 %	0 %	25 %	50 %	429190079
125	NC_019792	ACTG	2	8	38629	38636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019792	CGAG	2	8	38909	38916	25 %	0 %	50 %	25 %	429190080
127	NC_019792	CGGC	2	8	39003	39010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019792	GACG	2	8	39144	39151	25 %	0 %	50 %	25 %	429190081
129	NC_019792	CGCT	2	8	39522	39529	0 %	25 %	25 %	50 %	429190082
130	NC_019792	GCTG	2	8	39544	39551	0 %	25 %	50 %	25 %	429190082
131	NC_019792	CTGG	2	8	39623	39630	0 %	25 %	50 %	25 %	429190082
132	NC_019792	TCGG	2	8	40547	40554	0 %	25 %	50 %	25 %	429190084
133	NC_019792	ACAG	2	8	41025	41032	50 %	0 %	25 %	25 %	429190084
134	NC_019792	TCGA	2	8	41039	41046	25 %	25 %	25 %	25 %	429190084
135	NC_019792	TCGA	2	8	41096	41103	25 %	25 %	25 %	25 %	429190084
136	NC_019792	CGGA	2	8	41394	41401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019792	CGCC	2	8	41545	41552	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_019792	CGCT	2	8	42062	42069	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019792	CTGG	2	8	42276	42283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019792	GCAG	2	8	42518	42525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019792	GACG	2	8	42614	42621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019792	CCGC	2	8	42799	42806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_019792	GATC	2	8	42966	42973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_019792	TCGA	2	8	48759	48766	25 %	25 %	25 %	25 %	429190090
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