MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 chromosome

Total Repeats: 4062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019684	CTCAT	2	10	670	679	20 %	40 %	0 %	40 %	427727290
2	NC_019684	TACAT	2	10	899	908	40 %	40 %	0 %	20 %	427727290
3	NC_019684	CCAAT	2	10	3033	3042	40 %	20 %	0 %	40 %	427727291
4	NC_019684	CGAGA	2	10	3801	3810	40 %	0 %	40 %	20 %	427727292
5	NC_019684	TGTTT	2	10	4166	4175	0 %	80 %	20 %	0 %	427727292
6	NC_019684	TGACC	2	10	5841	5850	20 %	20 %	20 %	40 %	427727292
7	NC_019684	CAAAA	2	10	6256	6265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019684	CTGCC	2	10	7577	7586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_019684	ACTTT	2	10	9006	9015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_019684	TAAAA	2	10	10062	10071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019684	AGCCA	2	10	12098	12107	40 %	0 %	20 %	40 %	427727300
12	NC_019684	CCATC	2	10	12109	12118	20 %	20 %	0 %	60 %	427727300
13	NC_019684	GGTTG	2	10	18314	18323	0 %	40 %	60 %	0 %	427727304
14	NC_019684	TGACT	2	10	18421	18430	20 %	40 %	20 %	20 %	427727304
15	NC_019684	TAAAT	2	10	18708	18717	60 %	40 %	0 %	0 %	427727304
16	NC_019684	TTAAT	2	10	21028	21037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019684	AGCAA	2	10	21338	21347	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019684	AATAG	2	10	33095	33104	60 %	20 %	20 %	0 %	427727315
19	NC_019684	AACTA	2	10	35099	35108	60 %	20 %	0 %	20 %	427727319
20	NC_019684	GCCAA	2	10	41225	41234	40 %	0 %	20 %	40 %	427727320
21	NC_019684	TTGAG	2	10	42775	42784	20 %	40 %	40 %	0 %	427727320
22	NC_019684	TTCAT	2	10	43235	43244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019684	AATCA	2	10	45267	45276	60 %	20 %	0 %	20 %	427727323
24	NC_019684	TTGGC	2	10	45593	45602	0 %	40 %	40 %	20 %	427727323
25	NC_019684	AGGTA	2	10	46319	46328	40 %	20 %	40 %	0 %	427727324
26	NC_019684	CCACA	2	10	46464	46473	40 %	0 %	0 %	60 %	427727324
27	NC_019684	GGCAT	2	10	47758	47767	20 %	20 %	40 %	20 %	427727325
28	NC_019684	AAAAT	2	10	48449	48458	80 %	20 %	0 %	0 %	427727325
29	NC_019684	TAACG	2	10	48932	48941	40 %	20 %	20 %	20 %	427727325
30	NC_019684	TTTTA	2	10	49792	49801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019684	ATAAA	2	10	50124	50133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019684	CGTTT	2	10	52813	52822	0 %	60 %	20 %	20 %	427727328
33	NC_019684	TGATG	2	10	52826	52835	20 %	40 %	40 %	0 %	427727328
34	NC_019684	TTGAG	2	10	57602	57611	20 %	40 %	40 %	0 %	427727333
35	NC_019684	TATAG	2	10	60637	60646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019684	TGATT	2	10	60911	60920	20 %	60 %	20 %	0 %	427727337
37	NC_019684	TTTAT	2	10	61824	61833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019684	ATCAA	2	10	62418	62427	60 %	20 %	0 %	20 %	427727339
39	NC_019684	AATTT	2	10	62526	62535	40 %	60 %	0 %	0 %	427727339
40	NC_019684	ATTAT	2	10	63669	63678	40 %	60 %	0 %	0 %	427727339
41	NC_019684	TTCCA	2	10	65257	65266	20 %	40 %	0 %	40 %	427727340
42	NC_019684	TGAAA	2	10	66738	66747	60 %	20 %	20 %	0 %	427727342
43	NC_019684	GGTCT	2	10	68151	68160	0 %	40 %	40 %	20 %	427727342
44	NC_019684	AGGTA	2	10	68636	68645	40 %	20 %	40 %	0 %	427727342
45	NC_019684	AAACT	2	10	71881	71890	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019684	AGTTT	2	10	71905	71914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019684	CAATT	2	10	72272	72281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019684	TAAAT	2	10	72413	72422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019684	GATTT	2	10	75018	75027	20 %	60 %	20 %	0 %	427727348
50	NC_019684	TACCC	2	10	75786	75795	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_019684	GTTTA	2	10	77252	77261	20 %	60 %	20 %	0 %	427727350
52	NC_019684	GTGGC	2	10	77380	77389	0 %	20 %	60 %	20 %	427727350
53	NC_019684	ATTTA	2	10	82100	82109	40 %	60 %	0 %	0 %	427727353
54	NC_019684	TAATT	2	10	83202	83211	40 %	60 %	0 %	0 %	427727354
55	NC_019684	TGGTT	2	10	83334	83343	0 %	60 %	40 %	0 %	427727354
56	NC_019684	AATTT	2	10	84844	84853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019684	AGCGG	2	10	86731	86740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019684	AGCGG	2	10	86760	86769	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019684	TCTGT	2	10	87745	87754	0 %	60 %	20 %	20 %	427727358
60	NC_019684	ATCCA	2	10	89144	89153	40 %	20 %	0 %	40 %	427727360
61	NC_019684	TCCAA	2	10	90184	90193	40 %	20 %	0 %	40 %	427727361
62	NC_019684	AAATA	2	10	90641	90650	80 %	20 %	0 %	0 %	427727361
63	NC_019684	CTACC	2	10	93327	93336	20 %	20 %	0 %	60 %	427727364
64	NC_019684	TCAGT	2	10	95904	95913	20 %	40 %	20 %	20 %	427727368
65	NC_019684	TATGC	2	10	99607	99616	20 %	40 %	20 %	20 %	427727369
66	NC_019684	CATCT	2	10	100399	100408	20 %	40 %	0 %	40 %	427727370
67	NC_019684	GTAGC	2	10	100577	100586	20 %	20 %	40 %	20 %	427727370
68	NC_019684	GTCTT	2	10	101499	101508	0 %	60 %	20 %	20 %	427727371
69	NC_019684	TATTG	2	10	102356	102365	20 %	60 %	20 %	0 %	427727372
70	NC_019684	CCTTG	2	10	103861	103870	0 %	40 %	20 %	40 %	427727372
71	NC_019684	CCCAT	2	10	104767	104776	20 %	20 %	0 %	60 %	427727372
72	NC_019684	TGATG	2	10	107376	107385	20 %	40 %	40 %	0 %	427727373
73	NC_019684	TCTGG	2	10	107440	107449	0 %	40 %	40 %	20 %	427727373
74	NC_019684	AGCCA	2	10	107665	107674	40 %	0 %	20 %	40 %	427727373
75	NC_019684	TATTT	2	10	109278	109287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019684	CTTTC	2	10	110562	110571	0 %	60 %	0 %	40 %	427727375
77	NC_019684	AAAAT	2	10	114762	114771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019684	TCATA	2	10	116862	116871	40 %	40 %	0 %	20 %	427727382
79	NC_019684	TTCCA	2	10	117110	117119	20 %	40 %	0 %	40 %	427727382
80	NC_019684	TAAAT	2	10	118230	118239	60 %	40 %	0 %	0 %	427727384
81	NC_019684	AATTT	2	10	118277	118286	40 %	60 %	0 %	0 %	427727384
82	NC_019684	ATCGA	2	10	119365	119374	40 %	20 %	20 %	20 %	427727385
83	NC_019684	CAATC	2	10	119466	119475	40 %	20 %	0 %	40 %	427727386
84	NC_019684	GCTTT	2	10	121371	121380	0 %	60 %	20 %	20 %	427727388
85	NC_019684	ATTAC	2	10	121929	121938	40 %	40 %	0 %	20 %	427727388
86	NC_019684	TTACT	2	10	127642	127651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019684	ACTAA	2	10	129282	129291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019684	CCACT	2	10	129993	130002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_019684	AGTTG	2	10	130357	130366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019684	GTAAT	2	10	131759	131768	40 %	40 %	20 %	0 %	427727399
91	NC_019684	AAGTC	2	10	132846	132855	40 %	20 %	20 %	20 %	427727400
92	NC_019684	TCATC	2	10	136246	136255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019684	TTTCT	2	10	137623	137632	0 %	80 %	0 %	20 %	427727405
94	NC_019684	TATTT	2	10	138407	138416	20 %	80 %	0 %	0 %	427727405
95	NC_019684	TAGAG	2	10	139160	139169	40 %	20 %	40 %	0 %	427727406
96	NC_019684	GACTG	2	10	143927	143936	20 %	20 %	40 %	20 %	427727408
97	NC_019684	TTTGG	2	10	144255	144264	0 %	60 %	40 %	0 %	427727408
98	NC_019684	GATTT	2	10	144278	144287	20 %	60 %	20 %	0 %	427727408
99	NC_019684	CTTTT	2	10	144592	144601	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019684	AACTA	2	10	145231	145240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019684	AGTTG	2	10	149234	149243	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019684	TTTGA	2	10	149263	149272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019684	TTTTC	2	10	149862	149871	0 %	80 %	0 %	20 %	427727413
104	NC_019684	AAAAT	2	10	151226	151235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019684	TTGAG	2	10	155013	155022	20 %	40 %	40 %	0 %	427727417
106	NC_019684	ATTTT	2	10	155035	155044	20 %	80 %	0 %	0 %	427727417
107	NC_019684	ATACA	2	10	155299	155308	60 %	20 %	0 %	20 %	427727417
108	NC_019684	ATTAA	2	10	155803	155812	60 %	40 %	0 %	0 %	427727417
109	NC_019684	GTGTA	2	10	155957	155966	20 %	40 %	40 %	0 %	427727417
110	NC_019684	AATGC	2	10	157300	157309	40 %	20 %	20 %	20 %	427727418
111	NC_019684	GCGGA	2	10	161020	161029	20 %	0 %	60 %	20 %	427727419
112	NC_019684	TCAAA	2	10	166541	166550	60 %	20 %	0 %	20 %	427727424
113	NC_019684	TCGTT	2	10	167433	167442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019684	AAATC	2	10	167766	167775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019684	ATGTC	2	10	168004	168013	20 %	40 %	20 %	20 %	427727425
116	NC_019684	CTGCA	2	10	168513	168522	20 %	20 %	20 %	40 %	427727425
117	NC_019684	CACTT	2	10	171846	171855	20 %	40 %	0 %	40 %	427727429
118	NC_019684	CAAAT	2	10	173879	173888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019684	ATTAA	2	10	174001	174010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019684	AAATA	2	10	174353	174362	80 %	20 %	0 %	0 %	427727431
121	NC_019684	AAATT	2	10	174933	174942	60 %	40 %	0 %	0 %	427727432
122	NC_019684	ATCCA	2	10	176219	176228	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_019684	CCCAC	2	10	176646	176655	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_019684	TCATC	2	10	176715	176724	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019684	TTTCT	2	10	177604	177613	0 %	80 %	0 %	20 %	427727434
126	NC_019684	TATTT	2	10	178388	178397	20 %	80 %	0 %	0 %	427727434
127	NC_019684	TAGAG	2	10	179141	179150	40 %	20 %	40 %	0 %	427727435
128	NC_019684	ACTGC	2	10	180157	180166	20 %	20 %	20 %	40 %	427727436
129	NC_019684	TCTCA	2	10	185380	185389	20 %	40 %	0 %	40 %	427727438
130	NC_019684	CCTAC	2	10	187695	187704	20 %	20 %	0 %	60 %	427727444
131	NC_019684	TCAAC	2	10	187782	187791	40 %	20 %	0 %	40 %	427727444
132	NC_019684	TTTAC	2	10	187948	187957	20 %	60 %	0 %	20 %	427727444
133	NC_019684	AATTG	2	10	188067	188076	40 %	40 %	20 %	0 %	427727444
134	NC_019684	CAAGA	2	10	188107	188116	60 %	0 %	20 %	20 %	427727444
135	NC_019684	GTGTT	2	10	190613	190622	0 %	60 %	40 %	0 %	427727447
136	NC_019684	AGTAC	2	10	190832	190841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019684	ATTTT	2	10	196264	196273	20 %	80 %	0 %	0 %	427727452
138	NC_019684	TATTT	2	10	196574	196583	20 %	80 %	0 %	0 %	427727452
139	NC_019684	GCAAA	2	10	198528	198537	60 %	0 %	20 %	20 %	427727454
140	NC_019684	TTGCA	2	10	198960	198969	20 %	40 %	20 %	20 %	427727454
141	NC_019684	TTTGG	2	10	199037	199046	0 %	60 %	40 %	0 %	427727454
142	NC_019684	CTCAT	2	10	202803	202812	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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152	NC_019684	TTGTT	2	10	218613	218622	0 %	80 %	20 %	0 %	427727472
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240	NC_019684	ATGAT	2	10	356973	356982	40 %	40 %	20 %	0 %	427727584
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242	NC_019684	AACTG	2	10	359435	359444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
243	NC_019684	CCGCT	2	10	361081	361090	0 %	20 %	20 %	60 %	427727588
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256	NC_019684	CCAGA	2	10	383078	383087	40 %	0 %	20 %	40 %	427727608
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259	NC_019684	AGAGA	2	10	390719	390728	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_019684	AACCA	2	10	391312	391321	60 %	0 %	0 %	40 %	427727615
261	NC_019684	TTCTG	2	10	391460	391469	0 %	60 %	20 %	20 %	427727615
262	NC_019684	ATCCG	2	10	394910	394919	20 %	20 %	20 %	40 %	427727617
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264	NC_019684	TCCCA	2	10	399130	399139	20 %	20 %	0 %	60 %	427727621
265	NC_019684	TCAGA	2	10	403353	403362	40 %	20 %	20 %	20 %	427727624
266	NC_019684	AAATG	2	10	404175	404184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019684	ATTCT	2	10	404936	404945	20 %	60 %	0 %	20 %	427727625
268	NC_019684	AATTC	2	10	406604	406613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_019684	TGTAA	2	10	407047	407056	40 %	40 %	20 %	0 %	427727626
270	NC_019684	CTAGC	2	10	408491	408500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_019684	TATTG	2	10	410348	410357	20 %	60 %	20 %	0 %	427727629
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273	NC_019684	TAAAT	2	10	415041	415050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019684	AAATT	2	10	415086	415095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019684	AGATT	2	10	415227	415236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_019684	ATTGA	3	15	612269	612283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
400	NC_019684	AATTG	2	10	616247	616256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
401	NC_019684	GCAAT	2	10	617325	617334	40 %	20 %	20 %	20 %	427727809
402	NC_019684	TTTGG	2	10	620604	620613	0 %	60 %	40 %	0 %	427727812
403	NC_019684	TGTAA	2	10	621010	621019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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