MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	CGCCCA	2	12	4221	4232	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_019677	GATACC	2	12	4315	4326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019677	CAGTGC	2	12	7033	7044	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427726399
4	NC_019677	GCGTAG	2	12	10357	10368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427726406
5	NC_019677	GTAGCG	2	12	14562	14573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019677	TTCATT	2	12	15155	15166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019677	GCTTTG	2	12	17595	17606	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019677	GCTGTT	2	12	21758	21769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427726420
9	NC_019677	CTAATT	2	12	24817	24828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	427726425
10	NC_019677	TGGTTC	2	12	24833	24844	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427726425
11	NC_019677	GGTGCT	2	12	26804	26815	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	427726427
12	NC_019677	GATTTC	2	12	27119	27130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427726427
13	NC_019677	TTTGAT	2	12	29910	29921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019677	TTAATG	2	12	33237	33248	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427726429
15	NC_019677	ATGGGA	2	12	35009	35020	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	427726429
16	NC_019677	AGATGA	2	12	36016	36027	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427726430
17	NC_019677	TGGTAA	2	12	38108	38119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726433
18	NC_019677	AATCAA	2	12	38625	38636	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427726433
19	NC_019677	TACGGT	2	12	42051	42062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427726435
20	NC_019677	TAAGCG	2	12	43539	43550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019677	TTGGTC	2	12	43779	43790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427726436
22	NC_019677	GATGAA	2	12	46001	46012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427726441
23	NC_019677	TTAGTT	2	12	46091	46102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019677	ACACAG	2	12	46770	46781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019677	CAACCA	2	12	51664	51675	50 %	0 %	0 %	50 %	427726449
26	NC_019677	TGCCAT	2	12	53367	53378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427726450
27	NC_019677	CTGGCA	2	12	56516	56527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427726455
28	NC_019677	AGAGAA	2	12	58793	58804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726457
29	NC_019677	TTGAGT	2	12	60209	60220	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	427726461
30	NC_019677	TCAGAA	2	12	60386	60397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427726462
31	NC_019677	ATCAGA	2	12	63831	63842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427726467
32	NC_019677	GCAACA	2	12	65008	65019	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427726469
33	NC_019677	TATGAG	2	12	66888	66899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019677	TTTTGG	2	12	67061	67072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726471
35	NC_019677	TAGCTT	2	12	68996	69007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427726472
36	NC_019677	CTGGTG	2	12	69365	69376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	427726472
37	NC_019677	CTGCCT	2	12	69981	69992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	427726473
38	NC_019677	AAATCT	2	12	71603	71614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	427726474
39	NC_019677	TATTGA	2	12	73241	73252	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427726475
40	NC_019677	CTGAGT	2	12	74971	74982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427726477

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.