MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nostoc sp. PCC 7107 chromosome

Total Repeats: 128662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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128502	NC_019676	GGT	2	6	6321682	6321687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427710695
128503	NC_019676	AGT	2	6	6321754	6321759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710695
128504	NC_019676	ATT	2	6	6321781	6321786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427710695
128505	NC_019676	TAG	2	6	6321807	6321812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710695
128506	NC_019676	GCT	2	6	6321832	6321837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710695
128507	NC_019676	GAC	2	6	6322014	6322019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427710695
128508	NC_019676	AC	3	6	6322071	6322076	50 %	0 %	0 %	50 %	427710695
128509	NC_019676	AGC	2	6	6322197	6322202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427710695
128510	NC_019676	AATA	2	8	6322396	6322403	75 %	25 %	0 %	0 %	427710695
128511	NC_019676	GAT	2	6	6322441	6322446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128512	NC_019676	CATT	2	8	6322493	6322500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128513	NC_019676	TAAT	2	8	6322504	6322511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128514	NC_019676	TCTG	2	8	6322512	6322519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128515	NC_019676	ACT	2	6	6322520	6322525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427710696
128516	NC_019676	TGA	2	6	6322559	6322564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710696
128517	NC_019676	GAT	2	6	6322602	6322607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710696
128518	NC_019676	ATT	2	6	6322692	6322697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427710696
128519	NC_019676	GCT	2	6	6322750	6322755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710696
128520	NC_019676	TCA	2	6	6322837	6322842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427710696
128521	NC_019676	GTG	2	6	6322851	6322856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427710696
128522	NC_019676	CTGA	2	8	6322893	6322900	25 %	25 %	25 %	25 %	427710696
128523	NC_019676	CGT	2	6	6322933	6322938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710696
128524	NC_019676	TAA	2	6	6323000	6323005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427710696
128525	NC_019676	GCT	2	6	6323041	6323046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710696
128526	NC_019676	CAT	2	6	6323064	6323069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427710696
128527	NC_019676	ATT	2	6	6323085	6323090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427710696
128528	NC_019676	AAT	2	6	6323113	6323118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128529	NC_019676	GAA	2	6	6323227	6323232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128530	NC_019676	GGC	2	6	6323290	6323295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128531	NC_019676	TGT	2	6	6323320	6323325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427710697
128532	NC_019676	CAG	2	6	6323338	6323343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427710697
128533	NC_019676	AAT	2	6	6323349	6323354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427710697
128534	NC_019676	TCT	2	6	6323367	6323372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427710697
128535	NC_019676	T	6	6	6323443	6323448	0 %	100 %	0 %	0 %	427710697
128536	NC_019676	TGA	2	6	6323470	6323475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710697
128537	NC_019676	GAG	2	6	6323531	6323536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427710697
128538	NC_019676	CAA	2	6	6323581	6323586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427710697
128539	NC_019676	TTGAA	2	10	6323622	6323631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128540	NC_019676	CAA	2	6	6323745	6323750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427710698
128541	NC_019676	TTG	2	6	6323751	6323756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427710698
128542	NC_019676	TGC	2	6	6323818	6323823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710698
128543	NC_019676	CGC	2	6	6323893	6323898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427710698
128544	NC_019676	CTG	2	6	6323937	6323942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710698
128545	NC_019676	CTG	2	6	6324132	6324137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710698
128546	NC_019676	GGT	2	6	6324207	6324212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427710698
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128549	NC_019676	ATAA	2	8	6324289	6324296	75 %	25 %	0 %	0 %	427710698
128550	NC_019676	TTG	2	6	6324343	6324348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427710698
128551	NC_019676	AAG	2	6	6324353	6324358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427710698
128552	NC_019676	CCAAG	2	10	6324408	6324417	40 %	0 %	20 %	40 %	427710698
128553	NC_019676	TAC	2	6	6324432	6324437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427710698
128554	NC_019676	AAT	2	6	6324445	6324450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427710698
128555	NC_019676	TGGG	2	8	6324493	6324500	0 %	25 %	75 %	0 %	427710698
128556	NC_019676	GTT	2	6	6324507	6324512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427710698
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128578	NC_019676	GCG	2	6	6325751	6325756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427710698
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128582	NC_019676	TGA	2	6	6325838	6325843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427710698
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128587	NC_019676	GCA	2	6	6326072	6326077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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128589	NC_019676	CTG	2	6	6326168	6326173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710699
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128597	NC_019676	CTG	2	6	6326594	6326599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427710700
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128600	NC_019676	TGT	2	6	6326653	6326658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427710700
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128603	NC_019676	GTTA	2	8	6326796	6326803	25 %	50 %	25 %	0 %	427710700
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128612	NC_019676	ATTT	2	8	6327273	6327280	25 %	75 %	0 %	0 %	427710700
128613	NC_019676	T	8	8	6327278	6327285	0 %	100 %	0 %	0 %	427710700
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.