MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018224	GGGC	2	8	156261	156268	0 %	0 %	75 %	25 %	397771938
4002	NC_018224	GGA	2	6	156283	156288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771938
4003	NC_018224	CGA	2	6	156313	156318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4004	NC_018224	CGA	2	6	156322	156327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4005	NC_018224	GAC	2	6	156340	156345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4006	NC_018224	GAG	2	6	156356	156361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771938
4007	NC_018224	CTT	2	6	156376	156381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771938
4008	NC_018224	CGT	2	6	156400	156405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4009	NC_018224	GGT	2	6	156459	156464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771938
4010	NC_018224	GCA	2	6	156508	156513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4011	NC_018224	GCT	2	6	156517	156522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4012	NC_018224	GAG	2	6	156524	156529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771938
4013	NC_018224	TAC	2	6	156605	156610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771938
4014	NC_018224	CCT	2	6	156621	156626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771938
4015	NC_018224	CGG	2	6	156628	156633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771938
4016	NC_018224	CGA	2	6	156640	156645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4017	NC_018224	GGA	2	6	156817	156822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771938
4018	NC_018224	CGA	2	6	156838	156843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4019	NC_018224	GAG	2	6	156848	156853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771938
4020	NC_018224	CGA	2	6	156865	156870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4021	NC_018224	CGC	2	6	156931	156936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771938
4022	NC_018224	CGA	2	6	156955	156960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938
4023	NC_018224	TGAC	2	8	156982	156989	25 %	25 %	25 %	25 %	397771938
4024	NC_018224	GCG	2	6	157028	157033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_018224	G	6	6	157049	157054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018224	CGA	2	6	157213	157218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4027	NC_018224	GC	3	6	157234	157239	0 %	0 %	50 %	50 %	397771939
4028	NC_018224	GGC	2	6	157296	157301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4029	NC_018224	TCG	2	6	157321	157326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4030	NC_018224	CGGACG	2	12	157327	157338	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771939
4031	NC_018224	CCGA	2	8	157369	157376	25 %	0 %	25 %	50 %	397771939
4032	NC_018224	CGA	3	9	157385	157393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4033	NC_018224	ACG	2	6	157411	157416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4034	NC_018224	G	6	6	157446	157451	0 %	0 %	100 %	0 %	397771939
4035	NC_018224	GC	3	6	157469	157474	0 %	0 %	50 %	50 %	397771939
4036	NC_018224	CGG	3	9	157577	157585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4037	NC_018224	TCG	2	6	157606	157611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4038	NC_018224	GCT	2	6	157616	157621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4039	NC_018224	CGG	2	6	157640	157645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4040	NC_018224	CCT	2	6	157681	157686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771939
4041	NC_018224	GCG	2	6	157720	157725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4042	NC_018224	CCCGG	2	10	157729	157738	0 %	0 %	40 %	60 %	397771939
4043	NC_018224	CCG	2	6	157786	157791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771939
4044	NC_018224	CGC	2	6	157811	157816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771939
4045	NC_018224	GAC	2	6	157835	157840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4046	NC_018224	CGA	2	6	157889	157894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4047	NC_018224	GGC	2	6	157907	157912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4048	NC_018224	TGAG	2	8	157975	157982	25 %	25 %	50 %	0 %	397771939
4049	NC_018224	GT	3	6	158001	158006	0 %	50 %	50 %	0 %	397771939
4050	NC_018224	CGG	2	6	158011	158016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771939
4051	NC_018224	CGC	3	9	158074	158082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771939
4052	NC_018224	ACG	2	6	158125	158130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4053	NC_018224	AC	3	6	158153	158158	50 %	0 %	0 %	50 %	397771939
4054	NC_018224	CGA	2	6	158159	158164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4055	NC_018224	GTCG	2	8	158174	158181	0 %	25 %	50 %	25 %	397771939
4056	NC_018224	ACG	2	6	158185	158190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771939
4057	NC_018224	AGCG	2	8	158193	158200	25 %	0 %	50 %	25 %	397771939
4058	NC_018224	GCC	2	6	158202	158207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771939
4059	NC_018224	CCGA	2	8	158277	158284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_018224	GCG	2	6	158317	158322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771940
4061	NC_018224	CGAACG	2	12	158356	158367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771940
4062	NC_018224	ACT	2	6	158396	158401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771940
4063	NC_018224	GC	3	6	158415	158420	0 %	0 %	50 %	50 %	397771941
4064	NC_018224	CCG	2	6	158471	158476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771941
4065	NC_018224	CCA	2	6	158516	158521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771941
4066	NC_018224	TATCA	2	10	158566	158575	40 %	40 %	0 %	20 %	397771941
4067	NC_018224	GTC	2	6	158650	158655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4068	NC_018224	CG	3	6	158660	158665	0 %	0 %	50 %	50 %	397771942
4069	NC_018224	GAG	2	6	158689	158694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771942
4070	NC_018224	CAC	2	6	158697	158702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771942
4071	NC_018224	GAG	2	6	158767	158772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771942
4072	NC_018224	CGG	2	6	158775	158780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771942
4073	NC_018224	TGC	2	6	158804	158809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4074	NC_018224	CGT	2	6	158810	158815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4075	NC_018224	GGTC	3	12	158823	158834	0 %	25 %	50 %	25 %	397771942
4076	NC_018224	GC	3	6	158843	158848	0 %	0 %	50 %	50 %	397771942
4077	NC_018224	CG	3	6	158857	158862	0 %	0 %	50 %	50 %	397771942
4078	NC_018224	AGG	2	6	158873	158878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771942
4079	NC_018224	CTC	2	6	158958	158963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771942
4080	NC_018224	CGA	2	6	159042	159047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4081	NC_018224	GTC	2	6	159052	159057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4082	NC_018224	GTG	2	6	159069	159074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771942
4083	NC_018224	GACC	2	8	159120	159127	25 %	0 %	25 %	50 %	397771942
4084	NC_018224	ATC	2	6	159157	159162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771942
4085	NC_018224	CGG	2	6	159216	159221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771942
4086	NC_018224	GAAGT	2	10	159256	159265	40 %	20 %	40 %	0 %	397771942
4087	NC_018224	CGG	3	9	159342	159350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771942
4088	NC_018224	GCTC	2	8	159392	159399	0 %	25 %	25 %	50 %	397771942
4089	NC_018224	CGCCGA	2	12	159480	159491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397771942
4090	NC_018224	CGC	2	6	159504	159509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771942
4091	NC_018224	CGC	2	6	159528	159533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771942
4092	NC_018224	GC	3	6	159532	159537	0 %	0 %	50 %	50 %	397771942
4093	NC_018224	CGTT	2	8	159691	159698	0 %	50 %	25 %	25 %	397771942
4094	NC_018224	TCG	2	6	159704	159709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4095	NC_018224	CGA	2	6	159717	159722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771942
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4097	NC_018224	TCGC	2	8	159740	159747	0 %	25 %	25 %	50 %	397771942
4098	NC_018224	CGA	2	6	159798	159803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4099	NC_018224	CGA	2	6	159825	159830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771942
4100	NC_018224	GAA	2	6	159873	159878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018224	ACG	2	6	159995	160000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_018224	CCGA	2	8	160003	160010	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_018224	CGA	2	6	160016	160021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_018224	CG	3	6	160026	160031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_018224	GAG	2	6	160139	160144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771943
4106	NC_018224	CG	3	6	160147	160152	0 %	0 %	50 %	50 %	397771943
4107	NC_018224	CGA	2	6	160165	160170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4108	NC_018224	GTCG	2	8	160189	160196	0 %	25 %	50 %	25 %	397771943
4109	NC_018224	CGC	2	6	160227	160232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771943
4110	NC_018224	AC	3	6	160239	160244	50 %	0 %	0 %	50 %	397771943
4111	NC_018224	GACGG	2	10	160283	160292	20 %	0 %	60 %	20 %	397771943
4112	NC_018224	TCC	2	6	160323	160328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771943
4113	NC_018224	GAC	2	6	160387	160392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4114	NC_018224	CG	3	6	160427	160432	0 %	0 %	50 %	50 %	397771943
4115	NC_018224	GAC	3	9	160478	160486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4116	NC_018224	GACC	2	8	160495	160502	25 %	0 %	25 %	50 %	397771943
4117	NC_018224	CGA	2	6	160534	160539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4118	NC_018224	CGA	2	6	160543	160548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4119	NC_018224	GGC	2	6	160552	160557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771943
4120	NC_018224	CGA	2	6	160564	160569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
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4122	NC_018224	GCA	2	6	160628	160633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4123	NC_018224	CGT	3	9	160708	160716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771943
4124	NC_018224	CAG	2	6	160733	160738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771943
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4200	NC_018224	GA	3	6	163821	163826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4220	NC_018224	GA	3	6	164484	164489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_018224	GTC	2	6	164499	164504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4222	NC_018224	CTCG	2	8	164565	164572	0 %	25 %	25 %	50 %	397771949
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4228	NC_018224	GAA	2	6	164853	164858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771949
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4233	NC_018224	AT	3	6	165093	165098	50 %	50 %	0 %	0 %	397771949
4234	NC_018224	GGT	2	6	165100	165105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771949
4235	NC_018224	TCGA	2	8	165108	165115	25 %	25 %	25 %	25 %	397771949
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4240	NC_018224	GAG	2	6	165294	165299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771949
4241	NC_018224	TG	3	6	165359	165364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_018224	TAA	2	6	165408	165413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_018224	TTC	2	6	165414	165419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_018224	GCTT	2	8	165491	165498	0 %	50 %	25 %	25 %	397771950
4245	NC_018224	ACA	2	6	165509	165514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771950
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4247	NC_018224	ATC	2	6	165631	165636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771950
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4249	NC_018224	CAGT	2	8	165679	165686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4250	NC_018224	TGA	2	6	165687	165692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_018224	TCG	2	6	165738	165743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_018224	AAT	2	6	165745	165750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_018224	TTC	2	6	165826	165831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771951
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4368	NC_018224	TCG	2	6	169647	169652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
4369	NC_018224	TCG	2	6	169680	169685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
4370	NC_018224	CGT	2	6	169741	169746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
4371	NC_018224	TCG	3	9	169777	169785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
4372	NC_018224	CGT	2	6	169801	169806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
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4374	NC_018224	CGT	3	9	169901	169909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771957
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4383	NC_018224	CGA	2	6	170224	170229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771957
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4423	NC_018224	CGA	2	6	171428	171433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771959
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4451	NC_018224	CCGGG	2	10	172437	172446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4452	NC_018224	GAC	2	6	172470	172475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4453	NC_018224	CGATC	2	10	172576	172585	20 %	20 %	20 %	40 %	397771960
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4455	NC_018224	CCGG	2	8	172618	172625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4456	NC_018224	TGCGCA	2	12	172670	172681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771961
4457	NC_018224	CGG	2	6	172736	172741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771961
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4471	NC_018224	GGT	2	6	173034	173039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4472	NC_018224	GAC	2	6	173058	173063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4473	NC_018224	CCGTCG	2	12	173124	173135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771962
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4480	NC_018224	GCCGCT	2	12	173399	173410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4481	NC_018224	GAG	2	6	173448	173453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771963
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4483	NC_018224	GCG	2	6	173503	173508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771963
4484	NC_018224	ACG	2	6	173509	173514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771963
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4486	NC_018224	ATCG	2	8	173556	173563	25 %	25 %	25 %	25 %	397771963
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