MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018224	GA	3	6	138404	138409	50 %	0 %	50 %	0 %	397771921
3502	NC_018224	GCG	2	6	138435	138440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771921
3503	NC_018224	GAC	2	6	138451	138456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3504	NC_018224	GTCG	2	8	138469	138476	0 %	25 %	50 %	25 %	397771921
3505	NC_018224	TCG	2	6	138542	138547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3506	NC_018224	TGTCGA	2	12	138588	138599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397771921
3507	NC_018224	CGA	2	6	138603	138608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3508	NC_018224	CGA	2	6	138651	138656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3509	NC_018224	CGA	2	6	138666	138671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3510	NC_018224	ACC	2	6	138674	138679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771921
3511	NC_018224	CCG	2	6	138741	138746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771921
3512	NC_018224	CGT	2	6	138756	138761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771921
3513	NC_018224	CACCG	2	10	138781	138790	20 %	0 %	20 %	60 %	397771921
3514	NC_018224	TCGCG	2	10	138791	138800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_018224	CTC	2	6	138854	138859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771922
3516	NC_018224	CTT	2	6	138914	138919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771922
3517	NC_018224	GTC	2	6	138965	138970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3518	NC_018224	CTC	2	6	139022	139027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771922
3519	NC_018224	TGT	2	6	139036	139041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397771922
3520	NC_018224	ACG	2	6	139068	139073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3521	NC_018224	GTC	2	6	139094	139099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3522	NC_018224	GAC	2	6	139178	139183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3523	NC_018224	GCCCG	2	10	139208	139217	0 %	0 %	40 %	60 %	397771922
3524	NC_018224	A	6	6	139227	139232	100 %	0 %	0 %	0 %	397771922
3525	NC_018224	CTG	2	6	139280	139285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3526	NC_018224	CTC	2	6	139334	139339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771922
3527	NC_018224	CTC	2	6	139352	139357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771922
3528	NC_018224	CGT	2	6	139366	139371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3529	NC_018224	GCT	2	6	139388	139393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3530	NC_018224	CGAAG	2	10	139394	139403	40 %	0 %	40 %	20 %	397771922
3531	NC_018224	CGG	2	6	139500	139505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771922
3532	NC_018224	GTA	2	6	139595	139600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771922
3533	NC_018224	CGTT	2	8	139608	139615	0 %	50 %	25 %	25 %	397771922
3534	NC_018224	CGT	2	6	139639	139644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771922
3535	NC_018224	TTC	2	6	139661	139666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771922
3536	NC_018224	GCC	2	6	139694	139699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771922
3537	NC_018224	GCG	3	9	139812	139820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771923
3538	NC_018224	CGA	2	6	139882	139887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3539	NC_018224	CGA	2	6	139906	139911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3540	NC_018224	AC	3	6	139968	139973	50 %	0 %	0 %	50 %	397771923
3541	NC_018224	TCC	2	6	139995	140000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771923
3542	NC_018224	CGC	2	6	140005	140010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771923
3543	NC_018224	CG	3	6	140031	140036	0 %	0 %	50 %	50 %	397771923
3544	NC_018224	CGA	2	6	140077	140082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3545	NC_018224	CGC	2	6	140114	140119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771923
3546	NC_018224	GGAT	2	8	140139	140146	25 %	25 %	50 %	0 %	397771923
3547	NC_018224	GAC	2	6	140153	140158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3548	NC_018224	CGGT	2	8	140163	140170	0 %	25 %	50 %	25 %	397771923
3549	NC_018224	TCG	2	6	140223	140228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3550	NC_018224	GTAG	2	8	140254	140261	25 %	25 %	50 %	0 %	397771923
3551	NC_018224	TGC	2	6	140325	140330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3552	NC_018224	CGA	2	6	140341	140346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3553	NC_018224	CCG	2	6	140389	140394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771923
3554	NC_018224	CTC	2	6	140411	140416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771923
3555	NC_018224	CGC	2	6	140540	140545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771923
3556	NC_018224	ACG	2	6	140586	140591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3557	NC_018224	ATC	2	6	140634	140639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771923
3558	NC_018224	GTC	2	6	140660	140665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3559	NC_018224	GACCC	2	10	140667	140676	20 %	0 %	20 %	60 %	397771923
3560	NC_018224	CGTCGG	2	12	140687	140698	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397771923
3561	NC_018224	GAA	2	6	140714	140719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771923
3562	NC_018224	AGT	2	6	140740	140745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771923
3563	NC_018224	GAC	3	9	140759	140767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771923
3564	NC_018224	CG	3	6	140792	140797	0 %	0 %	50 %	50 %	397771923
3565	NC_018224	GCG	2	6	140803	140808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771923
3566	NC_018224	TGA	2	6	140815	140820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771923
3567	NC_018224	G	6	6	140854	140859	0 %	0 %	100 %	0 %	397771923
3568	NC_018224	TG	3	6	140866	140871	0 %	50 %	50 %	0 %	397771923
3569	NC_018224	CAC	2	6	140879	140884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771923
3570	NC_018224	GT	3	6	140906	140911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_018224	CGC	2	6	140944	140949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_018224	ACCG	2	8	140986	140993	25 %	0 %	25 %	50 %	397771924
3573	NC_018224	GCC	2	6	141001	141006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771924
3574	NC_018224	GTG	2	6	141018	141023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771924
3575	NC_018224	TCGG	2	8	141036	141043	0 %	25 %	50 %	25 %	397771924
3576	NC_018224	AGCG	2	8	141050	141057	25 %	0 %	50 %	25 %	397771924
3577	NC_018224	CGC	3	9	141072	141080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771924
3578	NC_018224	CCG	2	6	141084	141089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771924
3579	NC_018224	CCT	2	6	141116	141121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771924
3580	NC_018224	AGCC	2	8	141163	141170	25 %	0 %	25 %	50 %	397771924
3581	NC_018224	GTGC	2	8	141171	141178	0 %	25 %	50 %	25 %	397771924
3582	NC_018224	CGC	2	6	141200	141205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771924
3583	NC_018224	CGA	2	6	141218	141223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3584	NC_018224	GGA	2	6	141284	141289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771924
3585	NC_018224	CGAT	2	8	141327	141334	25 %	25 %	25 %	25 %	397771924
3586	NC_018224	GACCG	2	10	141444	141453	20 %	0 %	40 %	40 %	397771924
3587	NC_018224	CGA	2	6	141530	141535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3588	NC_018224	CGT	2	6	141542	141547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3589	NC_018224	CCT	2	6	141575	141580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771924
3590	NC_018224	CATCGA	2	12	141611	141622	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397771924
3591	NC_018224	CGG	2	6	141624	141629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3592	NC_018224	CGT	2	6	141653	141658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3593	NC_018224	GAA	2	6	141660	141665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771924
3594	NC_018224	CGAG	2	8	141715	141722	25 %	0 %	50 %	25 %	397771924
3595	NC_018224	GCG	2	6	141727	141732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3596	NC_018224	GAA	2	6	141768	141773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771924
3597	NC_018224	GCG	2	6	141782	141787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3598	NC_018224	CGG	2	6	141796	141801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3599	NC_018224	GCG	2	6	141802	141807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3600	NC_018224	GAC	2	6	141843	141848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3601	NC_018224	TCG	2	6	141869	141874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3602	NC_018224	ACGG	2	8	141889	141896	25 %	0 %	50 %	25 %	397771924
3603	NC_018224	AGCG	2	8	141902	141909	25 %	0 %	50 %	25 %	397771924
3604	NC_018224	GC	3	6	141915	141920	0 %	0 %	50 %	50 %	397771924
3605	NC_018224	CGG	3	9	141936	141944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771924
3606	NC_018224	GAC	2	6	141969	141974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3607	NC_018224	CGTC	2	8	141986	141993	0 %	25 %	25 %	50 %	397771924
3608	NC_018224	CGT	2	6	142010	142015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771924
3609	NC_018224	GC	4	8	142079	142086	0 %	0 %	50 %	50 %	397771924
3610	NC_018224	CGG	2	6	142178	142183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_018224	GCG	2	6	142184	142189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_018224	CGC	2	6	142218	142223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_018224	CCG	2	6	142307	142312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771925
3614	NC_018224	CG	4	8	142320	142327	0 %	0 %	50 %	50 %	397771925
3615	NC_018224	CA	3	6	142330	142335	50 %	0 %	0 %	50 %	397771925
3616	NC_018224	GCCG	2	8	142346	142353	0 %	0 %	50 %	50 %	397771925
3617	NC_018224	CGG	2	6	142372	142377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771925
3618	NC_018224	TCG	2	6	142458	142463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771925
3619	NC_018224	TCG	2	6	142518	142523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3620	NC_018224	TCG	2	6	142551	142556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3621	NC_018224	TATCGA	2	12	142573	142584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	397771926
3622	NC_018224	GTC	2	6	142592	142597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3623	NC_018224	CGG	2	6	142680	142685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771926
3624	NC_018224	TTC	2	6	142721	142726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771926
3625	NC_018224	CGG	2	6	142732	142737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771926
3626	NC_018224	CTC	2	6	142745	142750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771926
3627	NC_018224	GCT	2	6	142789	142794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3628	NC_018224	CGCC	2	8	142828	142835	0 %	0 %	25 %	75 %	397771926
3629	NC_018224	TCG	2	6	142881	142886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
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3636	NC_018224	CGAT	2	8	143046	143053	25 %	25 %	25 %	25 %	397771926
3637	NC_018224	GTC	2	6	143054	143059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
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3641	NC_018224	CGA	2	6	143269	143274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3642	NC_018224	CG	3	6	143275	143280	0 %	0 %	50 %	50 %	397771926
3643	NC_018224	GCT	2	6	143284	143289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771926
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3645	NC_018224	CGG	2	6	143371	143376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771926
3646	NC_018224	CGA	2	6	143392	143397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771926
3647	NC_018224	GAC	2	6	143455	143460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771926
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3649	NC_018224	ACTACG	2	12	143523	143534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	397771926
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3652	NC_018224	GACG	2	8	143626	143633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3653	NC_018224	CGA	2	6	143644	143649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771927
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3655	NC_018224	GTC	2	6	143718	143723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771927
3656	NC_018224	CTG	2	6	143745	143750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771927
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3680	NC_018224	GCT	2	6	144770	144775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771927
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3719	NC_018224	TTG	2	6	146352	146357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3720	NC_018224	GAG	2	6	146379	146384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3721	NC_018224	CTG	2	6	146407	146412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771930
3722	NC_018224	CGA	2	6	146465	146470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771930
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3724	NC_018224	GACGC	2	10	146497	146506	20 %	0 %	40 %	40 %	397771930
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3730	NC_018224	TCG	2	6	146846	146851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771930
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3732	NC_018224	CGA	2	6	146885	146890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771930
3733	NC_018224	CCGACG	2	12	146891	146902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397771930
3734	NC_018224	TCG	2	6	146903	146908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771930
3735	NC_018224	CG	4	8	146929	146936	0 %	0 %	50 %	50 %	397771930
3736	NC_018224	CGG	2	6	146942	146947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771930
3737	NC_018224	ACG	2	6	146948	146953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771930
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3739	NC_018224	ACG	2	6	147005	147010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771930
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3839	NC_018224	TCG	2	6	150478	150483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771932
3840	NC_018224	TGTCG	2	10	150492	150501	0 %	40 %	40 %	20 %	397771932
3841	NC_018224	CGA	2	6	150545	150550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771932
3842	NC_018224	CGA	2	6	150647	150652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771932
3843	NC_018224	CCG	2	6	150677	150682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771932
3844	NC_018224	GAG	2	6	150705	150710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771932
3845	NC_018224	CGATCG	2	12	150780	150791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3846	NC_018224	AAG	2	6	150803	150808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3847	NC_018224	CGC	2	6	150817	150822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771933
3848	NC_018224	CTCGGC	2	12	150902	150913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771933
3849	NC_018224	AGG	2	6	150972	150977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771933
3850	NC_018224	GTC	2	6	150992	150997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771933
3851	NC_018224	CCGT	2	8	151008	151015	0 %	25 %	25 %	50 %	397771933
3852	NC_018224	CGG	2	6	151017	151022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771933
3853	NC_018224	GCG	2	6	151031	151036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771933
3854	NC_018224	GCC	2	6	151070	151075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771933
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3856	NC_018224	TCG	2	6	151222	151227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771933
3857	NC_018224	GACT	2	8	151260	151267	25 %	25 %	25 %	25 %	397771933
3858	NC_018224	GAC	2	6	151275	151280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771933
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3982	NC_018224	CGA	2	6	155482	155487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771937
3983	NC_018224	CGA	2	6	155494	155499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771937
3984	NC_018224	GAG	2	6	155585	155590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771937
3985	NC_018224	CTC	2	6	155624	155629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771937
3986	NC_018224	GCG	3	9	155654	155662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771937
3987	NC_018224	TCG	2	6	155688	155693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771937
3988	NC_018224	CGA	2	6	155774	155779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3989	NC_018224	CGG	2	6	155794	155799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_018224	CTC	2	6	155819	155824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3991	NC_018224	G	6	6	155855	155860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_018224	CTC	2	6	155868	155873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3993	NC_018224	TCG	2	6	155893	155898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_018224	TCG	2	6	155911	155916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_018224	CGA	2	6	155935	155940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_018224	GCC	2	6	155999	156004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3997	NC_018224	GAT	2	6	156082	156087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771938
3998	NC_018224	CTA	2	6	156112	156117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771938
3999	NC_018224	GACGG	2	10	156197	156206	20 %	0 %	60 %	20 %	397771938
4000	NC_018224	CGA	2	6	156211	156216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771938

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