MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018224	TCG	2	6	121458	121463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3002	NC_018224	CAG	2	6	121487	121492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3003	NC_018224	GGGC	2	8	121520	121527	0 %	0 %	75 %	25 %	397771903
3004	NC_018224	CTA	2	6	121648	121653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771903
3005	NC_018224	ATC	2	6	121697	121702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771903
3006	NC_018224	CGA	2	6	121708	121713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3007	NC_018224	CG	3	6	121757	121762	0 %	0 %	50 %	50 %	397771903
3008	NC_018224	ATC	2	6	121799	121804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771903
3009	NC_018224	CAA	2	6	121813	121818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771903
3010	NC_018224	CGA	2	6	121840	121845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3011	NC_018224	CAG	2	6	121855	121860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3012	NC_018224	CCG	2	6	121886	121891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771903
3013	NC_018224	TC	3	6	121954	121959	0 %	50 %	0 %	50 %	397771903
3014	NC_018224	GAC	2	6	121961	121966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3015	NC_018224	CGC	2	6	121990	121995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771903
3016	NC_018224	TCC	2	6	122031	122036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771903
3017	NC_018224	GA	4	8	122106	122113	50 %	0 %	50 %	0 %	397771903
3018	NC_018224	ATCG	2	8	122120	122127	25 %	25 %	25 %	25 %	397771903
3019	NC_018224	GCT	2	6	122188	122193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3020	NC_018224	GAG	2	6	122216	122221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771903
3021	NC_018224	GC	3	6	122271	122276	0 %	0 %	50 %	50 %	397771903
3022	NC_018224	CGA	2	6	122320	122325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3023	NC_018224	CGGA	2	8	122347	122354	25 %	0 %	50 %	25 %	397771903
3024	NC_018224	GCG	2	6	122382	122387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771903
3025	NC_018224	TAC	3	9	122396	122404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771903
3026	NC_018224	CGTC	2	8	122418	122425	0 %	25 %	25 %	50 %	397771903
3027	NC_018224	ACG	2	6	122442	122447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771903
3028	NC_018224	TCGA	2	8	122466	122473	25 %	25 %	25 %	25 %	397771903
3029	NC_018224	GGT	2	6	122505	122510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_018224	CGC	2	6	122613	122618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_018224	TATC	2	8	122693	122700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_018224	CGA	2	6	122754	122759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771904
3033	NC_018224	CGGAC	2	10	122892	122901	20 %	0 %	40 %	40 %	397771904
3034	NC_018224	AAG	2	6	122932	122937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771904
3035	NC_018224	GCG	2	6	122975	122980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771904
3036	NC_018224	GACCG	2	10	122995	123004	20 %	0 %	40 %	40 %	397771904
3037	NC_018224	CGG	2	6	123035	123040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771904
3038	NC_018224	CGAC	2	8	123050	123057	25 %	0 %	25 %	50 %	397771904
3039	NC_018224	TCG	2	6	123062	123067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771904
3040	NC_018224	CGG	2	6	123135	123140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771905
3041	NC_018224	TCG	2	6	123146	123151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3042	NC_018224	ATC	2	6	123188	123193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771905
3043	NC_018224	CTG	2	6	123214	123219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3044	NC_018224	GTCGG	2	10	123220	123229	0 %	20 %	60 %	20 %	397771905
3045	NC_018224	GGT	2	6	123237	123242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771905
3046	NC_018224	GCCC	3	12	123264	123275	0 %	0 %	25 %	75 %	397771905
3047	NC_018224	TCG	2	6	123287	123292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3048	NC_018224	TCG	2	6	123299	123304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3049	NC_018224	ACG	2	6	123347	123352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3050	NC_018224	GCA	3	9	123425	123433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3051	NC_018224	TCG	2	6	123443	123448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3052	NC_018224	CGT	2	6	123466	123471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3053	NC_018224	AGG	2	6	123503	123508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771905
3054	NC_018224	GA	3	6	123524	123529	50 %	0 %	50 %	0 %	397771905
3055	NC_018224	CGG	2	6	123561	123566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771905
3056	NC_018224	CGAT	2	8	123582	123589	25 %	25 %	25 %	25 %	397771905
3057	NC_018224	GAC	2	6	123613	123618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3058	NC_018224	TCG	2	6	123707	123712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3059	NC_018224	GAC	2	6	123736	123741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3060	NC_018224	TCG	2	6	123807	123812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3061	NC_018224	TCG	2	6	123818	123823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3062	NC_018224	CCG	2	6	123846	123851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771905
3063	NC_018224	CGA	2	6	123859	123864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3064	NC_018224	CGGG	2	8	123873	123880	0 %	0 %	75 %	25 %	397771905
3065	NC_018224	ACCGA	2	10	123892	123901	40 %	0 %	20 %	40 %	397771905
3066	NC_018224	GCC	2	6	123944	123949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771905
3067	NC_018224	TCG	2	6	123953	123958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3068	NC_018224	TTC	2	6	123994	123999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771905
3069	NC_018224	CGT	2	6	124044	124049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771905
3070	NC_018224	GT	3	6	124161	124166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018224	ACG	2	6	124218	124223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_018224	AGG	2	6	124224	124229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_018224	CCA	2	6	124238	124243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_018224	CTAC	2	8	124261	124268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_018224	GCC	2	6	124363	124368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771906
3076	NC_018224	CGC	2	6	124436	124441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771906
3077	NC_018224	ACCG	2	8	124457	124464	25 %	0 %	25 %	50 %	397771906
3078	NC_018224	GTA	2	6	124540	124545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_018224	CGA	2	6	124600	124605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_018224	GACG	2	8	124635	124642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_018224	CCGAT	2	10	124685	124694	20 %	20 %	20 %	40 %	397771907
3082	NC_018224	CAG	2	6	124709	124714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771907
3083	NC_018224	TCT	2	6	124774	124779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771907
3084	NC_018224	GAG	2	6	124818	124823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_018224	GTA	2	6	124828	124833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_018224	CAC	2	6	124955	124960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_018224	CTC	2	6	125058	125063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771908
3088	NC_018224	CCG	2	6	125086	125091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771908
3089	NC_018224	TTC	2	6	125097	125102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771908
3090	NC_018224	TCG	2	6	125125	125130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771908
3091	NC_018224	TCG	2	6	125224	125229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771908
3092	NC_018224	GCT	2	6	125237	125242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771908
3093	NC_018224	CGA	2	6	125293	125298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3094	NC_018224	TCC	2	6	125322	125327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771909
3095	NC_018224	CGT	2	6	125350	125355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
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3098	NC_018224	CGAC	2	8	125424	125431	25 %	0 %	25 %	50 %	397771909
3099	NC_018224	CGA	2	6	125487	125492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
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3101	NC_018224	AACGG	2	10	125525	125534	40 %	0 %	40 %	20 %	397771909
3102	NC_018224	TCG	3	9	125541	125549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3103	NC_018224	CG	3	6	125581	125586	0 %	0 %	50 %	50 %	397771909
3104	NC_018224	TCG	2	6	125598	125603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3105	NC_018224	CGG	2	6	125608	125613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771909
3106	NC_018224	TCG	2	6	125619	125624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3107	NC_018224	CG	3	6	125684	125689	0 %	0 %	50 %	50 %	397771909
3108	NC_018224	GCC	2	6	125694	125699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771909
3109	NC_018224	CGA	2	6	125707	125712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3110	NC_018224	ACG	2	6	125721	125726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3111	NC_018224	ACG	2	6	125837	125842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3112	NC_018224	ACG	2	6	125852	125857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771909
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3115	NC_018224	GTCG	2	8	125945	125952	0 %	25 %	50 %	25 %	397771909
3116	NC_018224	GTC	2	6	125960	125965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3117	NC_018224	CGAC	2	8	126004	126011	25 %	0 %	25 %	50 %	397771909
3118	NC_018224	CGGT	2	8	126019	126026	0 %	25 %	50 %	25 %	397771909
3119	NC_018224	CTG	2	6	126062	126067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3120	NC_018224	CGC	2	6	126079	126084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771909
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3122	NC_018224	GCG	2	6	126104	126109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771909
3123	NC_018224	TGC	2	6	126144	126149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3124	NC_018224	TCGGCG	2	12	126150	126161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397771909
3125	NC_018224	CGT	2	6	126163	126168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3126	NC_018224	CTG	2	6	126227	126232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771909
3127	NC_018224	GCGACG	2	12	126340	126351	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	397771909
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3130	NC_018224	CGACCG	2	12	126475	126486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_018224	CGA	2	6	126543	126548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771910
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3144	NC_018224	CGG	2	6	126951	126956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771910
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3202	NC_018224	CCCG	2	8	128596	128603	0 %	0 %	25 %	75 %	397771912
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3240	NC_018224	CGC	2	6	129805	129810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771913
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3242	NC_018224	CGA	2	6	129823	129828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771913
3243	NC_018224	GTC	2	6	129839	129844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771913
3244	NC_018224	TCG	2	6	129901	129906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771913
3245	NC_018224	CCG	2	6	129907	129912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771913
3246	NC_018224	GAG	2	6	129950	129955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771913
3247	NC_018224	CGG	2	6	129960	129965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771913
3248	NC_018224	CGTCTC	2	12	129968	129979	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	397771913
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3250	NC_018224	CGGC	2	8	130069	130076	0 %	0 %	50 %	50 %	397771913
3251	NC_018224	CGACC	2	10	130086	130095	20 %	0 %	20 %	60 %	397771913
3252	NC_018224	CGC	2	6	130135	130140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771913
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3254	NC_018224	CGCGA	2	10	130170	130179	20 %	0 %	40 %	40 %	397771913
3255	NC_018224	CGA	2	6	130216	130221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771913
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3257	NC_018224	GCG	2	6	130248	130253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771913
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3259	NC_018224	CGC	2	6	130337	130342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771913
3260	NC_018224	CGC	2	6	130358	130363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771913
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3262	NC_018224	CGAT	2	8	130584	130591	25 %	25 %	25 %	25 %	397771913
3263	NC_018224	GAC	2	6	130592	130597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771913
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3266	NC_018224	ACT	2	6	130695	130700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3267	NC_018224	GTC	2	6	130702	130707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3269	NC_018224	CGT	2	6	130808	130813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771914
3270	NC_018224	TCG	2	6	130819	130824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771914
3271	NC_018224	TCG	3	9	130831	130839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771914
3272	NC_018224	CGT	2	6	130844	130849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771914
3273	NC_018224	TCG	2	6	130876	130881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771914
3274	NC_018224	CCA	2	6	130920	130925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3275	NC_018224	ATT	2	6	130947	130952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_018224	T	6	6	131041	131046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3277	NC_018224	CAT	2	6	131074	131079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3282	NC_018224	CGA	2	6	131211	131216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771915
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3350	NC_018224	TCG	2	6	133463	133468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
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3354	NC_018224	CG	3	6	133601	133606	0 %	0 %	50 %	50 %	397771917
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3361	NC_018224	TCG	2	6	133984	133989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
3362	NC_018224	GGC	2	6	133997	134002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771917
3363	NC_018224	CGA	2	6	134039	134044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771917
3364	NC_018224	GTC	2	6	134073	134078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
3365	NC_018224	TCG	2	6	134125	134130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
3366	NC_018224	CGA	2	6	134144	134149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771917
3367	NC_018224	TCG	2	6	134155	134160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
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3370	NC_018224	TCG	2	6	134245	134250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771917
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3373	NC_018224	TCGCGA	2	12	134370	134381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	397771918
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3392	NC_018224	GTC	2	6	134780	134785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771918
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3394	NC_018224	G	6	6	134809	134814	0 %	0 %	100 %	0 %	397771918
3395	NC_018224	GCG	2	6	134855	134860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771918
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3401	NC_018224	CGT	2	6	134995	135000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771918
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3484	NC_018224	CG	3	6	137810	137815	0 %	0 %	50 %	50 %	397771921
3485	NC_018224	CGG	2	6	137820	137825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771921
3486	NC_018224	CGG	2	6	137843	137848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771921
3487	NC_018224	GGCA	2	8	137909	137916	25 %	0 %	50 %	25 %	397771921
3488	NC_018224	C	6	6	137920	137925	0 %	0 %	0 %	100 %	397771921
3489	NC_018224	CG	3	6	137955	137960	0 %	0 %	50 %	50 %	397771921
3490	NC_018224	GGT	2	6	137961	137966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771921
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