MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018224	GTCGGA	2	12	21219	21230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397771803
502	NC_018224	CCG	2	6	21237	21242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771803
503	NC_018224	CGTC	2	8	21251	21258	0 %	25 %	25 %	50 %	397771803
504	NC_018224	GGTCG	2	10	21286	21295	0 %	20 %	60 %	20 %	397771803
505	NC_018224	GTC	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
506	NC_018224	CCGG	2	8	21312	21319	0 %	0 %	50 %	50 %	397771803
507	NC_018224	GTC	2	6	21336	21341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
508	NC_018224	ATCG	2	8	21342	21349	25 %	25 %	25 %	25 %	397771803
509	NC_018224	CGAT	2	8	21354	21361	25 %	25 %	25 %	25 %	397771803
510	NC_018224	CGAG	2	8	21411	21418	25 %	0 %	50 %	25 %	397771803
511	NC_018224	TCG	2	6	21444	21449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
512	NC_018224	CGA	2	6	21462	21467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771803
513	NC_018224	CCG	2	6	21480	21485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771803
514	NC_018224	CGT	2	6	21494	21499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
515	NC_018224	CTG	2	6	21527	21532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
516	NC_018224	CGG	2	6	21626	21631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771803
517	NC_018224	CGAC	2	8	21648	21655	25 %	0 %	25 %	50 %	397771803
518	NC_018224	TGA	2	6	21688	21693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771803
519	NC_018224	CCGG	2	8	21695	21702	0 %	0 %	50 %	50 %	397771803
520	NC_018224	GTC	2	6	21738	21743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
521	NC_018224	GC	3	6	21810	21815	0 %	0 %	50 %	50 %	397771803
522	NC_018224	ACCC	2	8	21830	21837	25 %	0 %	0 %	75 %	397771803
523	NC_018224	GATG	2	8	21864	21871	25 %	25 %	50 %	0 %	397771803
524	NC_018224	GTC	2	6	21906	21911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
525	NC_018224	GTC	2	6	21993	21998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771803
526	NC_018224	TCA	2	6	22007	22012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771803
527	NC_018224	TCG	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018224	GCT	2	6	22027	22032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_018224	CAC	2	6	22067	22072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_018224	TAT	2	6	22101	22106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018224	CGC	2	6	22131	22136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_018224	CAG	2	6	22156	22161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_018224	CCT	2	6	22245	22250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_018224	CCG	2	6	22254	22259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_018224	CGG	2	6	22314	22319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_018224	GTGG	2	8	22518	22525	0 %	25 %	75 %	0 %	397771804
537	NC_018224	TGA	2	6	22572	22577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
538	NC_018224	CTTC	2	8	22627	22634	0 %	50 %	0 %	50 %	397771804
539	NC_018224	GCC	2	6	22696	22701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771804
540	NC_018224	AGCGG	2	10	22754	22763	20 %	0 %	60 %	20 %	397771804
541	NC_018224	CGC	2	6	22807	22812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771804
542	NC_018224	GAT	2	6	22846	22851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
543	NC_018224	TCGA	2	8	22889	22896	25 %	25 %	25 %	25 %	397771804
544	NC_018224	ATA	2	6	22925	22930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397771804
545	NC_018224	GCTC	2	8	23032	23039	0 %	25 %	25 %	50 %	397771804
546	NC_018224	CGA	3	9	23050	23058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771804
547	NC_018224	CGG	2	6	23093	23098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771804
548	NC_018224	GTA	2	6	23129	23134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
549	NC_018224	GAT	2	6	23194	23199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
550	NC_018224	ATCT	2	8	23206	23213	25 %	50 %	0 %	25 %	397771804
551	NC_018224	TGA	2	6	23214	23219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771804
552	NC_018224	CT	5	10	23237	23246	0 %	50 %	0 %	50 %	397771804
553	NC_018224	ACA	2	6	23280	23285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771804
554	NC_018224	ATC	2	6	23303	23308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771804
555	NC_018224	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018224	CGCTT	2	10	23456	23465	0 %	40 %	20 %	40 %	397771805
557	NC_018224	CGA	2	6	23491	23496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771806
558	NC_018224	GTC	2	6	23547	23552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
559	NC_018224	CCG	2	6	23577	23582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771806
560	NC_018224	GGC	2	6	23624	23629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771806
561	NC_018224	CTT	2	6	23662	23667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771806
562	NC_018224	GTGA	2	8	23691	23698	25 %	25 %	50 %	0 %	397771806
563	NC_018224	TCG	2	6	23703	23708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
564	NC_018224	GTC	2	6	23717	23722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
565	NC_018224	TTC	2	6	23738	23743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771806
566	NC_018224	TCG	2	6	23754	23759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
567	NC_018224	CCGC	2	8	23809	23816	0 %	0 %	25 %	75 %	397771806
568	NC_018224	CTG	2	6	23873	23878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
569	NC_018224	GAGG	2	8	23903	23910	25 %	0 %	75 %	0 %	397771806
570	NC_018224	TC	3	6	23937	23942	0 %	50 %	0 %	50 %	397771806
571	NC_018224	CGGTCT	2	12	23962	23973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771806
572	NC_018224	ACCA	2	8	23993	24000	50 %	0 %	0 %	50 %	397771806
573	NC_018224	TGGA	2	8	24154	24161	25 %	25 %	50 %	0 %	397771807
574	NC_018224	CGA	2	6	24171	24176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771807
575	NC_018224	GATC	2	8	24243	24250	25 %	25 %	25 %	25 %	397771807
576	NC_018224	GAT	2	6	24262	24267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771807
577	NC_018224	CG	3	6	24279	24284	0 %	0 %	50 %	50 %	397771807
578	NC_018224	TCG	2	6	24302	24307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771807
579	NC_018224	TCG	2	6	24359	24364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771807
580	NC_018224	GATC	2	8	24471	24478	25 %	25 %	25 %	25 %	397771807
581	NC_018224	AGAT	2	8	24560	24567	50 %	25 %	25 %	0 %	397771807
582	NC_018224	ACGGT	2	10	24603	24612	20 %	20 %	40 %	20 %	397771807
583	NC_018224	CTC	2	6	24637	24642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771807
584	NC_018224	TTGA	2	8	24808	24815	25 %	50 %	25 %	0 %	397771807
585	NC_018224	TCA	2	6	24830	24835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771807
586	NC_018224	T	6	6	24847	24852	0 %	100 %	0 %	0 %	397771807
587	NC_018224	GAT	2	6	24890	24895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771807
588	NC_018224	CAT	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771807
589	NC_018224	CAG	2	6	24966	24971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771807
590	NC_018224	TGAT	2	8	24972	24979	25 %	50 %	25 %	0 %	397771807
591	NC_018224	ATG	2	6	24986	24991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771807
592	NC_018224	AGT	2	6	25014	25019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771808
593	NC_018224	TTC	2	6	25042	25047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771808
594	NC_018224	GCC	2	6	25159	25164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
595	NC_018224	CCG	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
596	NC_018224	CAC	2	6	25178	25183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771808
597	NC_018224	CCG	2	6	25288	25293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
598	NC_018224	ACC	2	6	25338	25343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771808
599	NC_018224	GA	3	6	25360	25365	50 %	0 %	50 %	0 %	397771808
600	NC_018224	TGG	2	6	25382	25387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771808
601	NC_018224	GCT	2	6	25422	25427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771808
602	NC_018224	CG	3	6	25460	25465	0 %	0 %	50 %	50 %	397771808
603	NC_018224	TCGGA	2	10	25493	25502	20 %	20 %	40 %	20 %	397771808
604	NC_018224	CTC	2	6	25512	25517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771808
605	NC_018224	TAG	2	6	25531	25536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771808
606	NC_018224	CGA	2	6	25541	25546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771808
607	NC_018224	GCC	2	6	25591	25596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
608	NC_018224	GAGG	2	8	25686	25693	25 %	0 %	75 %	0 %	397771808
609	NC_018224	CAT	2	6	25731	25736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771808
610	NC_018224	CTG	2	6	25755	25760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771808
611	NC_018224	CCG	2	6	25799	25804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
612	NC_018224	ATTG	2	8	25869	25876	25 %	50 %	25 %	0 %	397771808
613	NC_018224	CGAA	2	8	25925	25932	50 %	0 %	25 %	25 %	397771808
614	NC_018224	GCCG	2	8	26031	26038	0 %	0 %	50 %	50 %	397771808
615	NC_018224	GCG	2	6	26050	26055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771808
616	NC_018224	GCG	2	6	26088	26093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771808
617	NC_018224	TCG	2	6	26101	26106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771808
618	NC_018224	GGC	2	6	26124	26129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771808
619	NC_018224	CTC	2	6	26190	26195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771808
620	NC_018224	CGGAT	2	10	26212	26221	20 %	20 %	40 %	20 %	397771808
621	NC_018224	TCG	2	6	26257	26262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771808
622	NC_018224	GCC	2	6	26322	26327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771808
623	NC_018224	GTCG	2	8	26381	26388	0 %	25 %	50 %	25 %	397771808
624	NC_018224	GTC	2	6	26395	26400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771808
625	NC_018224	TAAA	2	8	26491	26498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018224	AT	3	6	26539	26544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018224	ACG	2	6	26579	26584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771809
628	NC_018224	CCT	2	6	26593	26598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771809
629	NC_018224	GCC	2	6	26633	26638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771809
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634	NC_018224	TG	3	6	26786	26791	0 %	50 %	50 %	0 %	397771809
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693	NC_018224	ACC	2	6	28727	28732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
694	NC_018224	CAGC	2	8	28741	28748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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741	NC_018224	GATC	2	8	30873	30880	25 %	25 %	25 %	25 %	397771813
742	NC_018224	TCGCGA	2	12	30917	30928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_018224	CGTT	2	8	31002	31009	0 %	50 %	25 %	25 %	397771814
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746	NC_018224	GA	3	6	31120	31125	50 %	0 %	50 %	0 %	397771814
747	NC_018224	TCG	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771814
748	NC_018224	GGA	2	6	31189	31194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771814
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750	NC_018224	ACCTCG	2	12	31329	31340	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	397771814
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752	NC_018224	CCG	3	9	31470	31478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771815
753	NC_018224	TCG	2	6	31614	31619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771815
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755	NC_018224	CTC	2	6	31717	31722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771816
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989	NC_018224	TATT	2	8	40199	40206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
990	NC_018224	GGA	2	6	40237	40242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
991	NC_018224	CG	3	6	40271	40276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
992	NC_018224	GTCT	2	8	40301	40308	0 %	50 %	25 %	25 %	397771823
993	NC_018224	GC	3	6	40321	40326	0 %	0 %	50 %	50 %	397771823
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997	NC_018224	CTC	3	9	40444	40452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771823
998	NC_018224	CGC	2	6	40460	40465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771823
999	NC_018224	GGT	2	6	40485	40490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771823
1000	NC_018224	CGC	2	6	40557	40562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771823

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