MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018224	GCG	2	6	213451	213456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772005
5502	NC_018224	TCG	2	6	213469	213474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772005
5503	NC_018224	CG	3	6	213488	213493	0 %	0 %	50 %	50 %	397772005
5504	NC_018224	CGT	2	6	213533	213538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772005
5505	NC_018224	CT	3	6	213558	213563	0 %	50 %	0 %	50 %	397772005
5506	NC_018224	C	6	6	213574	213579	0 %	0 %	0 %	100 %	397772005
5507	NC_018224	GAG	2	6	213585	213590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772005
5508	NC_018224	CGTC	2	8	213620	213627	0 %	25 %	25 %	50 %	397772005
5509	NC_018224	GCG	3	9	213628	213636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772005
5510	NC_018224	TCC	2	6	213673	213678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772005
5511	NC_018224	CAC	2	6	213702	213707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397772005
5512	NC_018224	GGA	3	9	213809	213817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772005
5513	NC_018224	CCGT	2	8	213832	213839	0 %	25 %	25 %	50 %	397772005
5514	NC_018224	CGA	2	6	213851	213856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772005
5515	NC_018224	GCCG	2	8	213930	213937	0 %	0 %	50 %	50 %	397772005
5516	NC_018224	CCA	2	6	214022	214027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397772005
5517	NC_018224	CGT	2	6	214037	214042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772005
5518	NC_018224	GAG	2	6	214092	214097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772005
5519	NC_018224	CGAC	2	8	214108	214115	25 %	0 %	25 %	50 %	397772005
5520	NC_018224	GCC	2	6	214146	214151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_018224	CGC	2	6	214174	214179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_018224	CCA	2	6	214193	214198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_018224	CGGC	2	8	214199	214206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5524	NC_018224	CGA	2	6	214244	214249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_018224	GAC	2	6	214296	214301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5526	NC_018224	CGA	2	6	214304	214309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5527	NC_018224	CGA	2	6	214316	214321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5528	NC_018224	ATG	2	6	214344	214349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772006
5529	NC_018224	GAT	2	6	214355	214360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772006
5530	NC_018224	TCG	2	6	214392	214397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5531	NC_018224	CGA	2	6	214451	214456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5532	NC_018224	ACC	2	6	214552	214557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397772006
5533	NC_018224	ACG	2	6	214564	214569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5534	NC_018224	AC	3	6	214601	214606	50 %	0 %	0 %	50 %	397772006
5535	NC_018224	CGC	3	9	214607	214615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772006
5536	NC_018224	ACA	2	6	214621	214626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397772006
5537	NC_018224	GTC	2	6	214641	214646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772006
5538	NC_018224	TCG	2	6	214788	214793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5539	NC_018224	TCG	2	6	214795	214800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5540	NC_018224	ACC	2	6	214821	214826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397772007
5541	NC_018224	GGT	2	6	214831	214836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397772007
5542	NC_018224	CGAC	2	8	214885	214892	25 %	0 %	25 %	50 %	397772007
5543	NC_018224	CCGCG	2	10	214939	214948	0 %	0 %	40 %	60 %	397772007
5544	NC_018224	ACCCCC	2	12	215172	215183	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	397772007
5545	NC_018224	CGT	2	6	215186	215191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5546	NC_018224	ACG	2	6	215208	215213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5547	NC_018224	GGC	2	6	215214	215219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772007
5548	NC_018224	GACC	2	8	215276	215283	25 %	0 %	25 %	50 %	397772007
5549	NC_018224	CCGC	2	8	215299	215306	0 %	0 %	25 %	75 %	397772007
5550	NC_018224	CGT	2	6	215437	215442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5551	NC_018224	TCG	2	6	215445	215450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772007
5552	NC_018224	CGG	2	6	215459	215464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772007
5553	NC_018224	GATC	2	8	215578	215585	25 %	25 %	25 %	25 %	397772007
5554	NC_018224	GGC	2	6	215626	215631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_018224	GA	3	6	215679	215684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_018224	GAGT	2	8	215728	215735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_018224	CGA	2	6	215758	215763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_018224	GGA	2	6	215794	215799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_018224	GCG	2	6	215833	215838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_018224	CGC	2	6	215886	215891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772008
5561	NC_018224	CGA	3	9	215895	215903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772008
5562	NC_018224	CGG	2	6	215911	215916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772008
5563	NC_018224	TTG	2	6	215924	215929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772008
5564	NC_018224	CGT	2	6	215964	215969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772008
5565	NC_018224	GC	3	6	216013	216018	0 %	0 %	50 %	50 %	397772008
5566	NC_018224	CGA	2	6	216027	216032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772008
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5569	NC_018224	TCC	2	6	216230	216235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772008
5570	NC_018224	TGA	2	6	216237	216242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772008
5571	NC_018224	TGTGC	2	10	216294	216303	0 %	40 %	40 %	20 %	397772008
5572	NC_018224	TGG	2	6	216396	216401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_018224	TTAC	2	8	216402	216409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_018224	GGC	2	6	216491	216496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_018224	GAG	2	6	216558	216563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772009
5576	NC_018224	TCGG	2	8	216681	216688	0 %	25 %	50 %	25 %	397772009
5577	NC_018224	TCGAT	2	10	216696	216705	20 %	40 %	20 %	20 %	397772009
5578	NC_018224	TA	3	6	216780	216785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_018224	TAG	2	6	216791	216796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_018224	GAC	2	6	216824	216829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_018224	CGT	2	6	216837	216842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_018224	ATCGA	2	10	216864	216873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5583	NC_018224	GCC	2	6	216876	216881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_018224	GAAC	2	8	216884	216891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_018224	CGG	2	6	216947	216952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_018224	CCG	3	9	216966	216974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_018224	GAG	2	6	216989	216994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772010
5588	NC_018224	CGGAT	2	10	216999	217008	20 %	20 %	40 %	20 %	397772010
5589	NC_018224	CTG	2	6	217047	217052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5590	NC_018224	GTT	2	6	217061	217066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397772010
5591	NC_018224	GAG	2	6	217092	217097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772010
5592	NC_018224	ACG	2	6	217114	217119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5593	NC_018224	AGC	2	6	217124	217129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5594	NC_018224	GCG	2	6	217153	217158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5595	NC_018224	ACG	2	6	217161	217166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5596	NC_018224	CGG	2	6	217189	217194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
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5598	NC_018224	CGT	2	6	217211	217216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
5599	NC_018224	CACT	2	8	217233	217240	25 %	25 %	0 %	50 %	397772010
5600	NC_018224	CGG	2	6	217292	217297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
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5603	NC_018224	GTCGGC	2	12	217380	217391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	397772010
5604	NC_018224	TCG	2	6	217405	217410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
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5606	NC_018224	CGG	2	6	217514	217519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772010
5607	NC_018224	GCT	2	6	217535	217540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772010
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5612	NC_018224	GCC	2	6	217677	217682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
5613	NC_018224	CAG	2	6	217695	217700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772010
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5621	NC_018224	TGA	2	6	217951	217956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772010
5622	NC_018224	CGAC	2	8	217957	217964	25 %	0 %	25 %	50 %	397772010
5623	NC_018224	CGATG	2	10	217988	217997	20 %	20 %	40 %	20 %	397772010
5624	NC_018224	GCC	2	6	218032	218037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397772010
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5626	NC_018224	TGA	2	6	218089	218094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397772010
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5730	NC_018224	CG	3	6	221867	221872	0 %	0 %	50 %	50 %	397772015
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5735	NC_018224	TCG	2	6	222111	222116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772015
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5864	NC_018224	GAC	2	6	226432	226437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772018
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5866	NC_018224	CGA	2	6	226504	226509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772018
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5985	NC_018224	CGA	2	6	230943	230948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772025
5986	NC_018224	ATC	2	6	230954	230959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397772025
5987	NC_018224	GCG	2	6	231029	231034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772025
5988	NC_018224	AAC	2	6	231041	231046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397772025
5989	NC_018224	CCT	2	6	231087	231092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397772025
5990	NC_018224	CGA	2	6	231096	231101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772025
5991	NC_018224	CGA	2	6	231104	231109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397772025
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5994	NC_018224	CA	3	6	231207	231212	50 %	0 %	0 %	50 %	397772025
5995	NC_018224	GGC	2	6	231213	231218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397772025
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5997	NC_018224	GAG	2	6	231280	231285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397772025
5998	NC_018224	GTC	2	6	231286	231291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397772025
5999	NC_018224	AAC	2	6	231296	231301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397772025
6000	NC_018224	GCGA	2	8	231442	231449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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