MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 94947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018224	TCT	2	6	174035	174040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771964
4502	NC_018224	CGA	2	6	174062	174067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4503	NC_018224	CGT	2	6	174069	174074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4504	NC_018224	CTCGCG	2	12	174079	174090	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771964
4505	NC_018224	TCG	2	6	174107	174112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771964
4506	NC_018224	CGA	2	6	174133	174138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_018224	TCC	2	6	174175	174180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771965
4508	NC_018224	CGC	2	6	174191	174196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771965
4509	NC_018224	CGA	2	6	174290	174295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771965
4510	NC_018224	GTC	2	6	174346	174351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4511	NC_018224	GTGAT	2	10	174412	174421	20 %	40 %	40 %	0 %	397771966
4512	NC_018224	CGC	2	6	174422	174427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4513	NC_018224	CTCG	2	8	174456	174463	0 %	25 %	25 %	50 %	397771966
4514	NC_018224	CGC	2	6	174509	174514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4515	NC_018224	CGA	2	6	174521	174526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4516	NC_018224	CGA	2	6	174536	174541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4517	NC_018224	CCT	2	6	174545	174550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4518	NC_018224	GATCTC	2	12	174555	174566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	397771966
4519	NC_018224	GCC	2	6	174658	174663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4520	NC_018224	CTC	2	6	174684	174689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4521	NC_018224	CGT	2	6	174782	174787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4522	NC_018224	CGA	2	6	174803	174808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4523	NC_018224	CGT	2	6	174884	174889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4524	NC_018224	GTC	2	6	174915	174920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4525	NC_018224	CG	3	6	174944	174949	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4526	NC_018224	AGCG	2	8	174967	174974	25 %	0 %	50 %	25 %	397771966
4527	NC_018224	GCC	3	9	174984	174992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4528	NC_018224	GAT	2	6	174993	174998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4529	NC_018224	GCC	2	6	175050	175055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4530	NC_018224	GAC	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4531	NC_018224	GAG	2	6	175101	175106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771966
4532	NC_018224	TCG	2	6	175124	175129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4533	NC_018224	GCC	2	6	175137	175142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4534	NC_018224	CGAC	2	8	175184	175191	25 %	0 %	25 %	50 %	397771966
4535	NC_018224	GAT	2	6	175197	175202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4536	NC_018224	CGA	2	6	175214	175219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4537	NC_018224	GTC	2	6	175264	175269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4538	NC_018224	ACG	3	9	175309	175317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4539	NC_018224	CGC	2	6	175322	175327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4540	NC_018224	AAC	2	6	175342	175347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771966
4541	NC_018224	TGA	2	6	175376	175381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4542	NC_018224	TCC	2	6	175432	175437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771966
4543	NC_018224	GGCCGC	2	12	175479	175490	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4544	NC_018224	CGCC	2	8	175493	175500	0 %	0 %	25 %	75 %	397771966
4545	NC_018224	CGA	2	6	175532	175537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4546	NC_018224	GA	3	6	175588	175593	50 %	0 %	50 %	0 %	397771966
4547	NC_018224	GAC	2	6	175617	175622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4548	NC_018224	CGA	2	6	175628	175633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4549	NC_018224	CGA	2	6	175640	175645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4550	NC_018224	AAC	2	6	175672	175677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397771966
4551	NC_018224	GGT	2	6	175692	175697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397771966
4552	NC_018224	CGC	2	6	175749	175754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4553	NC_018224	CGT	2	6	175760	175765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4554	NC_018224	ACGG	2	8	175806	175813	25 %	0 %	50 %	25 %	397771966
4555	NC_018224	GAC	2	6	175815	175820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4556	NC_018224	TGA	2	6	175835	175840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4557	NC_018224	GC	3	6	175865	175870	0 %	0 %	50 %	50 %	397771966
4558	NC_018224	GAA	2	6	175905	175910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771966
4559	NC_018224	CGG	3	9	175919	175927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771966
4560	NC_018224	CGC	2	6	175944	175949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771966
4561	NC_018224	TCG	2	6	175955	175960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4562	NC_018224	GAT	2	6	176031	176036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771966
4563	NC_018224	TCG	2	6	176057	176062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4564	NC_018224	GAG	2	6	176175	176180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771966
4565	NC_018224	AGA	2	6	176186	176191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397771966
4566	NC_018224	CGA	2	6	176201	176206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771966
4567	NC_018224	GCT	2	6	176263	176268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_018224	GCT	3	9	176295	176303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_018224	CGC	2	6	176360	176365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4570	NC_018224	GGCGAC	2	12	176414	176425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_018224	GTC	2	6	176446	176451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4572	NC_018224	TCT	2	6	176505	176510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397771967
4573	NC_018224	TCG	2	6	176514	176519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4574	NC_018224	CCT	2	6	176616	176621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4575	NC_018224	GTC	3	9	176644	176652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
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4577	NC_018224	GATC	2	8	176679	176686	25 %	25 %	25 %	25 %	397771967
4578	NC_018224	CCG	2	6	176688	176693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771967
4579	NC_018224	GAG	2	6	176731	176736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771967
4580	NC_018224	CGA	2	6	176763	176768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4581	NC_018224	CGA	2	6	176781	176786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4582	NC_018224	TCGC	2	8	176789	176796	0 %	25 %	25 %	50 %	397771967
4583	NC_018224	T	6	6	176831	176836	0 %	100 %	0 %	0 %	397771967
4584	NC_018224	GAT	2	6	176851	176856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771967
4585	NC_018224	GAT	2	6	176905	176910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397771967
4586	NC_018224	GCC	2	6	176942	176947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771967
4587	NC_018224	CGCGTC	2	12	176959	176970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	397771967
4588	NC_018224	CTCG	2	8	176977	176984	0 %	25 %	25 %	50 %	397771967
4589	NC_018224	GCC	2	6	176990	176995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771967
4590	NC_018224	GCG	2	6	177005	177010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771967
4591	NC_018224	GAG	2	6	177079	177084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397771967
4592	NC_018224	TCG	2	6	177104	177109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4593	NC_018224	CCT	2	6	177117	177122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4594	NC_018224	TCG	2	6	177137	177142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4595	NC_018224	GCG	2	6	177165	177170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	397771967
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4597	NC_018224	G	7	7	177199	177205	0 %	0 %	100 %	0 %	397771967
4598	NC_018224	TCG	2	6	177207	177212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4599	NC_018224	CGA	2	6	177213	177218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771967
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4601	NC_018224	GCC	2	6	177334	177339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771967
4602	NC_018224	CCT	2	6	177489	177494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4603	NC_018224	CGT	2	6	177504	177509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4604	NC_018224	CGT	2	6	177544	177549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4605	NC_018224	CGA	2	6	177555	177560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771967
4606	NC_018224	TCC	2	6	177569	177574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4607	NC_018224	GT	3	6	177579	177584	0 %	50 %	50 %	0 %	397771967
4608	NC_018224	CTC	2	6	177691	177696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397771967
4609	NC_018224	CGT	2	6	177711	177716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771967
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4615	NC_018224	TCGAGG	2	12	177986	177997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	397771967
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4853	NC_018224	GCT	2	6	187189	187194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4854	NC_018224	AAC	2	6	187221	187226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4855	NC_018224	ATC	2	6	187290	187295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397771979
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4981	NC_018224	CCGGAC	2	12	192126	192137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	397771983
4982	NC_018224	CGA	2	6	192156	192161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771983
4983	NC_018224	CAC	2	6	192165	192170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397771983
4984	NC_018224	CGC	2	6	192177	192182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4985	NC_018224	CA	3	6	192193	192198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4986	NC_018224	CGTC	2	8	192331	192338	0 %	25 %	25 %	50 %	397771984
4987	NC_018224	CGA	2	6	192352	192357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397771984
4988	NC_018224	GCC	2	6	192368	192373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397771984
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4991	NC_018224	CGT	2	6	192417	192422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771984
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4996	NC_018224	CTG	2	6	192644	192649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397771984
4997	NC_018224	TCCT	2	8	192650	192657	0 %	50 %	0 %	50 %	397771984
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4999	NC_018224	CCCG	2	8	192705	192712	0 %	0 %	25 %	75 %	397771984
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