MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 48341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	TATCCA	2	12	15	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856166
2	NC_017518	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856166
3	NC_017518	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385856166
4	NC_017518	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856166
5	NC_017518	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856166
6	NC_017518	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856166
7	NC_017518	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856166
8	NC_017518	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385856166
9	NC_017518	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856167
10	NC_017518	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385856167
11	NC_017518	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856167
12	NC_017518	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385856167
13	NC_017518	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385856167
14	NC_017518	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385856167
15	NC_017518	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
16	NC_017518	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
17	NC_017518	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856168
18	NC_017518	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
19	NC_017518	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
20	NC_017518	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	385856168
21	NC_017518	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385856168
22	NC_017518	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
23	NC_017518	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385856168
24	NC_017518	GC	3	6	1497	1502	0 %	0 %	50 %	50 %	385856168
25	NC_017518	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
26	NC_017518	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385856168
27	NC_017518	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856168
28	NC_017518	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
29	NC_017518	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
30	NC_017518	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856168
31	NC_017518	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
32	NC_017518	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385856168
33	NC_017518	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856168
34	NC_017518	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
35	NC_017518	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
36	NC_017518	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
37	NC_017518	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
38	NC_017518	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
39	NC_017518	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
40	NC_017518	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
41	NC_017518	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
42	NC_017518	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385856168
43	NC_017518	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
44	NC_017518	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
45	NC_017518	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
46	NC_017518	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
47	NC_017518	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017518	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017518	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017518	A	8	8	2494	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017518	A	6	6	2523	2528	100 %	0 %	0 %	0 %	385856169
52	NC_017518	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856169
53	NC_017518	T	7	7	2590	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	385856169
54	NC_017518	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856169
55	NC_017518	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856169
56	NC_017518	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856169
57	NC_017518	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385856169
58	NC_017518	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856169
59	NC_017518	GC	3	6	2801	2806	0 %	0 %	50 %	50 %	385856169
60	NC_017518	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856169
61	NC_017518	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	385856169
62	NC_017518	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856169
63	NC_017518	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856169
64	NC_017518	GCCC	2	8	3031	3038	0 %	0 %	25 %	75 %	385856169
65	NC_017518	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856170
66	NC_017518	GAT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856170
67	NC_017518	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856170
68	NC_017518	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856170
69	NC_017518	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856170
70	NC_017518	CG	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	385856170
71	NC_017518	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856170
72	NC_017518	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856170
73	NC_017518	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856170
74	NC_017518	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856170
75	NC_017518	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856170
76	NC_017518	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856170
77	NC_017518	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385856170
78	NC_017518	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017518	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856171
80	NC_017518	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856171
81	NC_017518	TGCC	2	8	3812	3819	0 %	25 %	25 %	50 %	385856171
82	NC_017518	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	385856171
83	NC_017518	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856171
84	NC_017518	ACAA	2	8	4037	4044	75 %	0 %	0 %	25 %	385856171
85	NC_017518	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	385856171
86	NC_017518	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017518	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017518	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017518	CGG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856172
90	NC_017518	CAA	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
91	NC_017518	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856172
92	NC_017518	CGG	2	6	4728	4733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856172
93	NC_017518	AAC	3	9	4736	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
94	NC_017518	CGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
95	NC_017518	CTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
96	NC_017518	CGA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856172
97	NC_017518	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
98	NC_017518	TCG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
99	NC_017518	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856172
100	NC_017518	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856173
101	NC_017518	CG	3	6	4997	5002	0 %	0 %	50 %	50 %	385856173
102	NC_017518	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
103	NC_017518	CCG	3	9	5170	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
104	NC_017518	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
105	NC_017518	GC	3	6	5214	5219	0 %	0 %	50 %	50 %	385856173
106	NC_017518	ACA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856173
107	NC_017518	AGA	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
108	NC_017518	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
109	NC_017518	CGCC	2	8	5365	5372	0 %	0 %	25 %	75 %	385856173
110	NC_017518	TTTC	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	385856173
111	NC_017518	AGA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
112	NC_017518	GC	3	6	5599	5604	0 %	0 %	50 %	50 %	385856173
113	NC_017518	CGT	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
114	NC_017518	CCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
115	NC_017518	CCG	3	9	5662	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
116	NC_017518	GCT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
117	NC_017518	CT	3	6	5697	5702	0 %	50 %	0 %	50 %	385856173
118	NC_017518	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856173
119	NC_017518	CCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856173
120	NC_017518	A	6	6	5868	5873	100 %	0 %	0 %	0 %	385856173
121	NC_017518	CAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017518	T	6	6	6050	6055	0 %	100 %	0 %	0 %	385856174
123	NC_017518	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856174
124	NC_017518	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385856174
125	NC_017518	CG	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	385856174
126	NC_017518	GCAC	2	8	6155	6162	25 %	0 %	25 %	50 %	385856174
127	NC_017518	GCC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856174
128	NC_017518	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856174
129	NC_017518	CA	3	6	6220	6225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017518	T	6	6	6264	6269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017518	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
132	NC_017518	AGC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
133	NC_017518	GGCA	2	8	6312	6319	25 %	0 %	50 %	25 %	385856175
134	NC_017518	CCG	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
135	NC_017518	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
136	NC_017518	TGCTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385856175
137	NC_017518	TCAAAC	2	12	6496	6507	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385856175
138	NC_017518	CGG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856175
139	NC_017518	GCG	3	9	6565	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856175
140	NC_017518	ATC	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856175
141	NC_017518	TCGGCA	2	12	6640	6651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385856175
142	NC_017518	ACG	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
143	NC_017518	TCGG	2	8	6676	6683	0 %	25 %	50 %	25 %	385856175
144	NC_017518	GCC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
145	NC_017518	T	7	7	6725	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	385856175
146	NC_017518	TTC	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856175
147	NC_017518	CCG	3	9	6811	6819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
148	NC_017518	TGG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856175
149	NC_017518	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856175
150	NC_017518	GC	3	6	6909	6914	0 %	0 %	50 %	50 %	385856175
151	NC_017518	CGCC	2	8	6950	6957	0 %	0 %	25 %	75 %	385856175
152	NC_017518	AAG	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856175
153	NC_017518	TCT	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856175
154	NC_017518	TTG	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856175
155	NC_017518	GCA	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
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159	NC_017518	TCGG	2	8	7267	7274	0 %	25 %	50 %	25 %	385856175
160	NC_017518	TCA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856175
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166	NC_017518	ATGGTG	2	12	7815	7826	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385856176
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171	NC_017518	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
172	NC_017518	TGC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
173	NC_017518	TGC	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
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178	NC_017518	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385856176
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181	NC_017518	T	8	8	8666	8673	0 %	100 %	0 %	0 %	385856177
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201	NC_017518	TACCG	2	10	9641	9650	20 %	20 %	20 %	40 %	385856177
202	NC_017518	CG	4	8	9688	9695	0 %	0 %	50 %	50 %	385856177
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211	NC_017518	T	6	6	10408	10413	0 %	100 %	0 %	0 %	385856178
212	NC_017518	CGAC	2	8	10461	10468	25 %	0 %	25 %	50 %	385856178
213	NC_017518	CAG	2	6	10585	10590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856178
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224	NC_017518	CAG	2	6	11005	11010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856178
225	NC_017518	ATC	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856178
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230	NC_017518	A	8	8	11317	11324	100 %	0 %	0 %	0 %	385856178
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233	NC_017518	GAC	2	6	11460	11465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856179
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241	NC_017518	A	6	6	11778	11783	100 %	0 %	0 %	0 %	385856179
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244	NC_017518	CTGCAT	2	12	11986	11997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385856180
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246	NC_017518	T	6	6	12021	12026	0 %	100 %	0 %	0 %	385856180
247	NC_017518	CACGC	2	10	12036	12045	20 %	0 %	20 %	60 %	385856180
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249	NC_017518	CCG	2	6	12066	12071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856180
250	NC_017518	CAG	2	6	12092	12097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856180
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253	NC_017518	GCC	2	6	12193	12198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856180
254	NC_017518	ACG	2	6	12371	12376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856180
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258	NC_017518	CGC	2	6	12409	12414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856180
259	NC_017518	CAG	2	6	12415	12420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856180
260	NC_017518	CG	3	6	12450	12455	0 %	0 %	50 %	50 %	385856180
261	NC_017518	TGC	2	6	12456	12461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856180
262	NC_017518	CGC	2	6	12598	12603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856180
263	NC_017518	GCG	2	6	12641	12646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856180
264	NC_017518	GGC	2	6	12660	12665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856180
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266	NC_017518	T	7	7	12831	12837	0 %	100 %	0 %	0 %	385856180
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