MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 48341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017518	T	6	6	187189	187194	0 %	100 %	0 %	0 %	385856335
4002	NC_017518	GGGC	2	8	187235	187242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_017518	GAC	2	6	187320	187325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017518	AGG	2	6	187331	187336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017518	GCG	2	6	187460	187465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
4006	NC_017518	GCA	2	6	187474	187479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4007	NC_017518	GATGCG	2	12	187595	187606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385856336
4008	NC_017518	TTG	2	6	187640	187645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856336
4009	NC_017518	AGC	2	6	187680	187685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4010	NC_017518	GGC	2	6	187724	187729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
4011	NC_017518	AGC	2	6	187740	187745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4012	NC_017518	GGT	2	6	187748	187753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856336
4013	NC_017518	TGC	2	6	187776	187781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4014	NC_017518	CAT	2	6	187790	187795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856336
4015	NC_017518	GGC	2	6	187826	187831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
4016	NC_017518	TGCG	2	8	187855	187862	0 %	25 %	50 %	25 %	385856336
4017	NC_017518	CG	3	6	187903	187908	0 %	0 %	50 %	50 %	385856336
4018	NC_017518	TGC	2	6	187945	187950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4019	NC_017518	GCA	2	6	188005	188010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4020	NC_017518	GGC	3	9	188015	188023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
4021	NC_017518	GC	3	6	188058	188063	0 %	0 %	50 %	50 %	385856336
4022	NC_017518	CCG	2	6	188158	188163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856336
4023	NC_017518	TGCCG	2	10	188183	188192	0 %	20 %	40 %	40 %	385856336
4024	NC_017518	AGA	2	6	188203	188208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856336
4025	NC_017518	AAT	2	6	188224	188229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856336
4026	NC_017518	GAC	2	6	188339	188344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4027	NC_017518	AGC	2	6	188385	188390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856336
4028	NC_017518	CCG	2	6	188421	188426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856336
4029	NC_017518	GGC	2	6	188446	188451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856336
4030	NC_017518	GGTAGC	2	12	188452	188463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385856336
4031	NC_017518	GTTGC	2	10	188498	188507	0 %	40 %	40 %	20 %	385856336
4032	NC_017518	AGGG	2	8	188572	188579	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017518	GCT	2	6	188642	188647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017518	T	6	6	188671	188676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017518	AT	4	8	188684	188691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017518	GTT	2	6	188697	188702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017518	CGGG	2	8	188715	188722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_017518	CGT	2	6	188766	188771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017518	TCG	2	6	188860	188865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017518	TA	3	6	188892	188897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017518	ATG	2	6	189011	189016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856337
4042	NC_017518	CGGA	2	8	189033	189040	25 %	0 %	50 %	25 %	385856337
4043	NC_017518	GCT	2	6	189045	189050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856337
4044	NC_017518	GGTGTC	2	12	189051	189062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385856337
4045	NC_017518	CGG	2	6	189066	189071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856337
4046	NC_017518	GAG	2	6	189083	189088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856337
4047	NC_017518	GTG	2	6	189100	189105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856337
4048	NC_017518	CGG	2	6	189149	189154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856337
4049	NC_017518	GAT	2	6	189180	189185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856337
4050	NC_017518	GCG	2	6	189186	189191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856337
4051	NC_017518	GGC	2	6	189225	189230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856337
4052	NC_017518	GCT	2	6	189238	189243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856337
4053	NC_017518	GCT	3	9	189264	189272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856337
4054	NC_017518	GGGC	2	8	189288	189295	0 %	0 %	75 %	25 %	385856337
4055	NC_017518	TGG	2	6	189338	189343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856337
4056	NC_017518	CG	4	8	189371	189378	0 %	0 %	50 %	50 %	385856337
4057	NC_017518	GGT	2	6	189390	189395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856337
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4059	NC_017518	CGC	2	6	189542	189547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856338
4060	NC_017518	GCG	2	6	189570	189575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856338
4061	NC_017518	TTG	2	6	189603	189608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856338
4062	NC_017518	CGA	2	6	189647	189652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856338
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4064	NC_017518	CAT	2	6	189669	189674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856338
4065	NC_017518	GCT	2	6	189692	189697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856338
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4070	NC_017518	CAG	2	6	189834	189839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856338
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4077	NC_017518	GC	3	6	190134	190139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_017518	T	6	6	190159	190164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017518	T	6	6	190199	190204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017518	CGGG	2	8	190222	190229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_017518	ACG	4	12	190283	190294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856339
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4084	NC_017518	TGG	2	6	190338	190343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856339
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4089	NC_017518	TGG	2	6	190647	190652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856339
4090	NC_017518	CGG	2	6	190653	190658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856339
4091	NC_017518	GCG	2	6	190659	190664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856339
4092	NC_017518	TGT	2	6	190677	190682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856339
4093	NC_017518	GCA	2	6	190800	190805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856339
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4095	NC_017518	GGC	2	6	190981	190986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856339
4096	NC_017518	TAAAA	2	10	191070	191079	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017518	TCG	2	6	191216	191221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4099	NC_017518	A	7	7	191271	191277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017518	T	6	6	191410	191415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017518	CAAAAA	2	12	191580	191591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4102	NC_017518	T	6	6	191724	191729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017518	A	8	8	191822	191829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017518	CGGA	2	8	191837	191844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_017518	T	6	6	191886	191891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017518	TTCT	2	8	191926	191933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_017518	CTG	2	6	192005	192010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856340
4108	NC_017518	GCA	2	6	192055	192060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856340
4109	NC_017518	TGC	2	6	192087	192092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856340
4110	NC_017518	GCG	2	6	192192	192197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856340
4111	NC_017518	GAT	2	6	192206	192211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856340
4112	NC_017518	GAC	2	6	192227	192232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856340
4113	NC_017518	TGG	2	6	192337	192342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856340
4114	NC_017518	TTC	2	6	192368	192373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856340
4115	NC_017518	GGC	3	9	192380	192388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856340
4116	NC_017518	T	6	6	192411	192416	0 %	100 %	0 %	0 %	385856340
4117	NC_017518	T	6	6	192440	192445	0 %	100 %	0 %	0 %	385856340
4118	NC_017518	T	6	6	192455	192460	0 %	100 %	0 %	0 %	385856340
4119	NC_017518	CGG	3	9	192505	192513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856340
4120	NC_017518	CGG	2	6	192559	192564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856340
4121	NC_017518	ATG	2	6	192576	192581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856340
4122	NC_017518	TGCC	2	8	192726	192733	0 %	25 %	25 %	50 %	385856341
4123	NC_017518	TGC	2	6	192766	192771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856341
4124	NC_017518	CGG	2	6	192841	192846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856341
4125	NC_017518	TTC	2	6	192855	192860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856341
4126	NC_017518	CGG	2	6	192920	192925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856341
4127	NC_017518	TCA	2	6	192959	192964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856341
4128	NC_017518	GCG	2	6	192967	192972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856341
4129	NC_017518	GCG	2	6	192987	192992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856341
4130	NC_017518	AGG	2	6	192994	192999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856341
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4134	NC_017518	GTTC	2	8	193259	193266	0 %	50 %	25 %	25 %	385856341
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4156	NC_017518	CGG	2	6	194284	194289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856341
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4166	NC_017518	CGC	2	6	194695	194700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4228	NC_017518	GCG	2	6	197530	197535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4229	NC_017518	TTCGGT	2	12	197621	197632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4231	NC_017518	TTCGGT	2	12	197792	197803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4232	NC_017518	T	9	9	197803	197811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_017518	CCG	2	6	197994	197999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4234	NC_017518	GCG	2	6	198034	198039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4235	NC_017518	CCG	2	6	198175	198180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4236	NC_017518	T	8	8	198317	198324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_017518	TA	3	6	198511	198516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_017518	A	6	6	198516	198521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_017518	GCC	2	6	198550	198555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4248	NC_017518	CAT	2	6	198867	198872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856344
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4275	NC_017518	GGC	2	6	199702	199707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856344
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4302	NC_017518	CGG	2	6	200814	200819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856344
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4333	NC_017518	TTG	2	6	202264	202269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856345
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4339	NC_017518	GAC	2	6	202372	202377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856345
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4341	NC_017518	GCAC	2	8	202565	202572	25 %	0 %	25 %	50 %	385856345
4342	NC_017518	CGA	2	6	202617	202622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856345
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4345	NC_017518	GAA	3	9	202858	202866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4346	NC_017518	A	7	7	202881	202887	100 %	0 %	0 %	0 %	385856346
4347	NC_017518	CGG	2	6	202994	202999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
4348	NC_017518	TGA	2	6	203005	203010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856346
4349	NC_017518	GGC	2	6	203080	203085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
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4351	NC_017518	GGC	2	6	203254	203259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
4352	NC_017518	GCGG	2	8	203340	203347	0 %	0 %	75 %	25 %	385856346
4353	NC_017518	GAC	2	6	203397	203402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856346
4354	NC_017518	CTG	2	6	203457	203462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
4355	NC_017518	T	6	6	203505	203510	0 %	100 %	0 %	0 %	385856346
4356	NC_017518	ATT	2	6	203519	203524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856346
4357	NC_017518	GTT	2	6	203525	203530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856346
4358	NC_017518	CTG	2	6	203556	203561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
4359	NC_017518	CGG	2	6	203572	203577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
4360	NC_017518	CGA	2	6	203578	203583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856346
4361	NC_017518	GCG	2	6	203585	203590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
4362	NC_017518	GACA	2	8	203646	203653	50 %	0 %	25 %	25 %	385856346
4363	NC_017518	GCG	2	6	203673	203678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856346
4364	NC_017518	TCA	2	6	203743	203748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856346
4365	NC_017518	CGC	2	6	203761	203766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856346
4366	NC_017518	CTTATG	2	12	203770	203781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385856346
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4368	NC_017518	GCT	2	6	203852	203857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856346
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4492	NC_017518	CGT	2	6	209714	209719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856353
4493	NC_017518	GGC	3	9	209763	209771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856353
4494	NC_017518	CGG	2	6	209875	209880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4495	NC_017518	GTT	2	6	209962	209967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856354
4496	NC_017518	CTG	2	6	210034	210039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856354
4497	NC_017518	ATT	2	6	210098	210103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856354
4498	NC_017518	GGC	2	6	210179	210184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856354
4499	NC_017518	GTC	2	6	210303	210308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856354
4500	NC_017518	TGC	2	6	210383	210388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856354

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