MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 48341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017518	GCT	2	6	136692	136697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856275
3003	NC_017518	GTT	2	6	136728	136733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856275
3004	NC_017518	TTG	2	6	136759	136764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856275
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3007	NC_017518	CTG	2	6	136993	136998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856275
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3014	NC_017518	GCT	2	6	137563	137568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856276
3015	NC_017518	TGC	3	9	137583	137591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856276
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3018	NC_017518	TGT	2	6	137717	137722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856276
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3021	NC_017518	GCT	2	6	137776	137781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856276
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3039	NC_017518	ATTT	2	8	138326	138333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017518	AAAT	2	8	138358	138365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017518	GTT	2	6	138390	138395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017518	TAT	2	6	138406	138411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017518	GT	3	6	138430	138435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017518	A	6	6	138457	138462	100 %	0 %	0 %	0 %	385856278
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3096	NC_017518	AAGA	2	8	142018	142025	75 %	0 %	25 %	0 %	385856278
3097	NC_017518	CTGA	2	8	142039	142046	25 %	25 %	25 %	25 %	385856278
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3103	NC_017518	CG	3	6	142317	142322	0 %	0 %	50 %	50 %	385856278
3104	NC_017518	CAG	2	6	142351	142356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856278
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3106	NC_017518	GAC	2	6	142471	142476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856278
3107	NC_017518	GTC	2	6	142642	142647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_017518	TTG	2	6	142777	142782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856279
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3111	NC_017518	A	6	6	142891	142896	100 %	0 %	0 %	0 %	385856279
3112	NC_017518	GCG	2	6	143039	143044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856279
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3114	NC_017518	CTGA	2	8	143254	143261	25 %	25 %	25 %	25 %	385856279
3115	NC_017518	TAC	2	6	143269	143274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856279
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3118	NC_017518	CGAAAT	2	12	143364	143375	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385856279
3119	NC_017518	A	7	7	143419	143425	100 %	0 %	0 %	0 %	385856279
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3123	NC_017518	TGG	2	6	143544	143549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856279
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3243	NC_017518	CAT	2	6	149367	149372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856285
3244	NC_017518	GAA	2	6	149443	149448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3245	NC_017518	GAA	2	6	149488	149493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3246	NC_017518	GGC	2	6	149512	149517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856285
3247	NC_017518	GAA	3	9	149530	149538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3248	NC_017518	TGT	2	6	149588	149593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856285
3249	NC_017518	TGC	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856285
3250	NC_017518	TCC	2	6	149673	149678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856285
3251	NC_017518	GTA	2	6	149818	149823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856285
3252	NC_017518	GAA	2	6	149917	149922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3253	NC_017518	TAC	2	6	149967	149972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856285
3254	NC_017518	TG	3	6	149984	149989	0 %	50 %	50 %	0 %	385856285
3255	NC_017518	GC	3	6	149996	150001	0 %	0 %	50 %	50 %	385856285
3256	NC_017518	AGA	2	6	150114	150119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3257	NC_017518	CTT	2	6	150122	150127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856285
3258	NC_017518	GAA	2	6	150145	150150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3259	NC_017518	ATT	2	6	150163	150168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856285
3260	NC_017518	ATT	2	6	150196	150201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856285
3261	NC_017518	GGT	2	6	150319	150324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856285
3262	NC_017518	G	6	6	150372	150377	0 %	0 %	100 %	0 %	385856285
3263	NC_017518	ATTC	2	8	150429	150436	25 %	50 %	0 %	25 %	385856285
3264	NC_017518	ATG	2	6	150536	150541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856285
3265	NC_017518	AAG	2	6	150590	150595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3266	NC_017518	CCTGC	2	10	150613	150622	0 %	20 %	20 %	60 %	385856285
3267	NC_017518	GAA	2	6	150658	150663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856285
3268	NC_017518	CCG	2	6	150693	150698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856285
3269	NC_017518	GAT	2	6	150721	150726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856285
3270	NC_017518	CGG	2	6	150735	150740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856285
3271	NC_017518	A	6	6	150742	150747	100 %	0 %	0 %	0 %	385856285
3272	NC_017518	CGAC	2	8	150788	150795	25 %	0 %	25 %	50 %	385856285
3273	NC_017518	TACT	2	8	150822	150829	25 %	50 %	0 %	25 %	385856285
3274	NC_017518	GCT	3	9	150871	150879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856285
3275	NC_017518	ACC	2	6	151066	151071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856286
3276	NC_017518	ACT	2	6	151087	151092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856286
3277	NC_017518	A	6	6	151102	151107	100 %	0 %	0 %	0 %	385856286
3278	NC_017518	GGT	2	6	151111	151116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856286
3279	NC_017518	GAA	2	6	151153	151158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856286
3280	NC_017518	CGAAAC	2	12	151200	151211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385856286
3281	NC_017518	CTG	2	6	151351	151356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3282	NC_017518	CAT	2	6	151380	151385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856286
3283	NC_017518	CGA	2	6	151413	151418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3284	NC_017518	CTG	2	6	151459	151464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3285	NC_017518	CGA	2	6	151485	151490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3286	NC_017518	CTG	2	6	151624	151629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3287	NC_017518	AGT	2	6	151668	151673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856286
3288	NC_017518	ATC	2	6	151696	151701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856286
3289	NC_017518	GAAA	2	8	151734	151741	75 %	0 %	25 %	0 %	385856286
3290	NC_017518	A	6	6	151745	151750	100 %	0 %	0 %	0 %	385856286
3291	NC_017518	CTG	2	6	151783	151788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3292	NC_017518	TGC	2	6	151823	151828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856286
3293	NC_017518	CTC	2	6	151889	151894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856286
3294	NC_017518	AGA	2	6	151932	151937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856286
3295	NC_017518	TTC	2	6	151957	151962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856286
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3298	NC_017518	GAA	2	6	152098	152103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856286
3299	NC_017518	GGC	2	6	152128	152133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856286
3300	NC_017518	TCT	2	6	152158	152163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856286
3301	NC_017518	A	6	6	152203	152208	100 %	0 %	0 %	0 %	385856287
3302	NC_017518	TGA	2	6	152452	152457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856287
3303	NC_017518	GCCG	2	8	152468	152475	0 %	0 %	50 %	50 %	385856287
3304	NC_017518	AAT	2	6	152500	152505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856287
3305	NC_017518	CAAT	2	8	152529	152536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3306	NC_017518	T	6	6	152546	152551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3307	NC_017518	CCA	2	6	152599	152604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3308	NC_017518	CTT	2	6	152633	152638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856288
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3310	NC_017518	A	6	6	152746	152751	100 %	0 %	0 %	0 %	385856288
3311	NC_017518	ACC	2	6	152767	152772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856288
3312	NC_017518	GTC	2	6	152776	152781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856288
3313	NC_017518	TGT	2	6	152794	152799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856288
3314	NC_017518	TCA	2	6	152866	152871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856288
3315	NC_017518	TCA	2	6	152930	152935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856288
3316	NC_017518	TGA	2	6	152974	152979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856288
3317	NC_017518	CTTTA	2	10	153170	153179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3318	NC_017518	AAT	2	6	153187	153192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3319	NC_017518	CGA	2	6	153241	153246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856289
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3321	NC_017518	A	6	6	153359	153364	100 %	0 %	0 %	0 %	385856289
3322	NC_017518	CAA	2	6	153376	153381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856289
3323	NC_017518	TTGA	2	8	153431	153438	25 %	50 %	25 %	0 %	385856289
3324	NC_017518	GAA	2	6	153452	153457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856289
3325	NC_017518	TAAAGG	2	12	153541	153552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385856289
3326	NC_017518	GGCC	2	8	153685	153692	0 %	0 %	50 %	50 %	385856289
3327	NC_017518	CTG	2	6	153758	153763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856289
3328	NC_017518	TGT	2	6	153802	153807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856289
3329	NC_017518	GTCT	2	8	153881	153888	0 %	50 %	25 %	25 %	385856290
3330	NC_017518	TCA	2	6	153933	153938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856290
3331	NC_017518	A	6	6	154018	154023	100 %	0 %	0 %	0 %	385856290
3332	NC_017518	CTT	2	6	154067	154072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856290
3333	NC_017518	CG	3	6	154096	154101	0 %	0 %	50 %	50 %	385856290
3334	NC_017518	CGA	2	6	154116	154121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856290
3335	NC_017518	GTTT	2	8	154202	154209	0 %	75 %	25 %	0 %	385856290
3336	NC_017518	GTT	2	6	154290	154295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856290
3337	NC_017518	CGA	2	6	154311	154316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856290
3338	NC_017518	CAA	2	6	154369	154374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856290
3339	NC_017518	TGC	2	6	154391	154396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856290
3340	NC_017518	A	6	6	154402	154407	100 %	0 %	0 %	0 %	385856290
3341	NC_017518	ATC	2	6	154411	154416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856290
3342	NC_017518	CAA	2	6	154461	154466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856291
3343	NC_017518	A	6	6	154504	154509	100 %	0 %	0 %	0 %	385856291
3344	NC_017518	GCT	2	6	154584	154589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856291
3345	NC_017518	GCT	2	6	154595	154600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856291
3346	NC_017518	GCC	2	6	154675	154680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856291
3347	NC_017518	A	6	6	154692	154697	100 %	0 %	0 %	0 %	385856291
3348	NC_017518	GCT	2	6	154743	154748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856291
3349	NC_017518	GAAAA	2	10	154877	154886	80 %	0 %	20 %	0 %	385856292
3350	NC_017518	GCCG	2	8	154895	154902	0 %	0 %	50 %	50 %	385856292
3351	NC_017518	AAT	2	6	154907	154912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856292
3352	NC_017518	CAC	2	6	154921	154926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856292
3353	NC_017518	GGC	2	6	154937	154942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856292
3354	NC_017518	TGT	2	6	155052	155057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856292
3355	NC_017518	CGT	2	6	155075	155080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856292
3356	NC_017518	CAT	2	6	155083	155088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856292
3357	NC_017518	CTC	2	6	155091	155096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856292
3358	NC_017518	AAG	2	6	155274	155279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856292
3359	NC_017518	A	7	7	155381	155387	100 %	0 %	0 %	0 %	385856292
3360	NC_017518	GTG	2	6	155436	155441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856292
3361	NC_017518	TGG	3	9	155470	155478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856292
3362	NC_017518	TAA	2	6	155551	155556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856292
3363	NC_017518	TCG	2	6	155581	155586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856292
3364	NC_017518	A	6	6	155630	155635	100 %	0 %	0 %	0 %	385856293
3365	NC_017518	A	6	6	155663	155668	100 %	0 %	0 %	0 %	385856293
3366	NC_017518	TGC	2	6	155674	155679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856293
3367	NC_017518	GCAA	2	8	155684	155691	50 %	0 %	25 %	25 %	385856293
3368	NC_017518	TCG	2	6	155719	155724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856293
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3477	NC_017518	TCA	2	6	161159	161164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856307
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3480	NC_017518	CTA	2	6	161305	161310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856307
3481	NC_017518	ATA	2	6	161317	161322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856307
3482	NC_017518	CTG	2	6	161365	161370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856307
3483	NC_017518	A	7	7	161432	161438	100 %	0 %	0 %	0 %	385856308
3484	NC_017518	GTC	2	6	161516	161521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856308
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3487	NC_017518	CTG	2	6	161631	161636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856309
3488	NC_017518	GTC	2	6	161655	161660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856309
3489	NC_017518	GTGGTC	2	12	161700	161711	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385856309
3490	NC_017518	TGG	2	6	161734	161739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856309
3491	NC_017518	GGT	2	6	161762	161767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856309
3492	NC_017518	ACG	2	6	161782	161787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856309
3493	NC_017518	AAGC	2	8	161894	161901	50 %	0 %	25 %	25 %	385856309
3494	NC_017518	GCT	2	6	162005	162010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856309
3495	NC_017518	TGG	2	6	162022	162027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856309
3496	NC_017518	CAA	2	6	162064	162069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856310
3497	NC_017518	TCA	2	6	162073	162078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856310
3498	NC_017518	ATTG	2	8	162132	162139	25 %	50 %	25 %	0 %	385856310
3499	NC_017518	AT	3	6	162297	162302	50 %	50 %	0 %	0 %	385856310
3500	NC_017518	TAT	2	6	162312	162317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856310

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