MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 48341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017518	GCAAAC	3	18	45697	45714	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017518	A	6	6	45792	45797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017518	A	8	8	45839	45846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017518	AAT	2	6	45863	45868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017518	GTT	2	6	45878	45883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017518	A	7	7	45888	45894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017518	CGGCG	2	10	45910	45919	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1008	NC_017518	ACCT	2	8	45920	45927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_017518	GCC	2	6	45928	45933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017518	ACCC	2	8	46007	46014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1011	NC_017518	GCA	2	6	46050	46055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017518	ACT	2	6	46059	46064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017518	CAG	2	6	46072	46077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017518	AAAG	2	8	46134	46141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017518	AGC	2	6	46241	46246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017518	TCT	2	6	46286	46291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017518	AATA	2	8	46382	46389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017518	TTC	2	6	46390	46395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017518	CCG	2	6	46422	46427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_017518	CTG	2	6	46457	46462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017518	A	6	6	46466	46471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017518	A	8	8	46550	46557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017518	T	6	6	46568	46573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017518	GGT	2	6	46577	46582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017518	CAA	2	6	46657	46662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017518	CCCAAT	2	12	46670	46681	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017518	AGC	2	6	46793	46798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017518	GGC	2	6	46911	46916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017518	GCG	2	6	46938	46943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017518	CAG	2	6	46946	46951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017518	A	6	6	47060	47065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017518	TGC	2	6	47070	47075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017518	ATG	2	6	47097	47102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017518	CAA	2	6	47122	47127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017518	AGA	2	6	47128	47133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017518	AAC	2	6	47135	47140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017518	CAG	2	6	47179	47184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017518	CGG	2	6	47236	47241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017518	ACG	2	6	47262	47267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017518	A	6	6	47285	47290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017518	GC	3	6	47413	47418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_017518	CGG	2	6	47461	47466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017518	GGC	2	6	47534	47539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017518	TTTG	2	8	47599	47606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017518	AAT	2	6	47624	47629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017518	AAT	2	6	47633	47638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017518	CGC	2	6	47667	47672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017518	CGC	2	6	47701	47706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_017518	TGTATG	2	12	47766	47777	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017518	AGC	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017518	A	7	7	47804	47810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017518	CGG	2	6	47821	47826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017518	GGGC	2	8	47830	47837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_017518	TGG	2	6	47853	47858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017518	CGG	2	6	47905	47910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_017518	TTTGA	2	10	47924	47933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017518	CAA	2	6	47965	47970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017518	TGAG	2	8	48045	48052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017518	AT	3	6	48079	48084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017518	GAC	2	6	48098	48103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017518	CGG	2	6	48108	48113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017518	GCT	2	6	48154	48159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017518	ACCG	2	8	48280	48287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_017518	CCAT	2	8	48312	48319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_017518	GCG	2	6	48342	48347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017518	CCG	2	6	48375	48380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017518	CGG	2	6	48382	48387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017518	GAA	2	6	48397	48402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017518	GC	4	8	48405	48412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_017518	ATCC	2	8	48481	48488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017518	GAAAA	2	10	48575	48584	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017518	CAA	2	6	48597	48602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017518	GCGG	2	8	48617	48624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_017518	CCG	2	6	48639	48644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_017518	GCT	2	6	48669	48674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017518	CTG	2	6	48698	48703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017518	TCT	3	9	48774	48782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017518	T	6	6	48826	48831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017518	CAATT	2	10	48918	48927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_017518	CT	4	8	49287	49294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_017518	GGC	2	6	49318	49323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1082	NC_017518	GTA	2	6	49363	49368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1083	NC_017518	GGA	3	9	49404	49412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385856208
1084	NC_017518	GTC	2	6	49489	49494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1085	NC_017518	GT	3	6	49532	49537	0 %	50 %	50 %	0 %	385856208
1086	NC_017518	CGG	2	6	49539	49544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1087	NC_017518	TTC	2	6	49579	49584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856208
1088	NC_017518	GCT	2	6	49696	49701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1089	NC_017518	TGC	2	6	49716	49721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1090	NC_017518	GCG	2	6	49727	49732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1091	NC_017518	GT	3	6	49733	49738	0 %	50 %	50 %	0 %	385856208
1092	NC_017518	GCG	3	9	49747	49755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1093	NC_017518	CGT	2	6	49773	49778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
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1095	NC_017518	T	6	6	49812	49817	0 %	100 %	0 %	0 %	385856208
1096	NC_017518	TGC	2	6	49833	49838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1097	NC_017518	GCG	2	6	49850	49855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1098	NC_017518	GCC	2	6	49904	49909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856208
1099	NC_017518	GAT	2	6	49939	49944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1100	NC_017518	GGC	2	6	49957	49962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1101	NC_017518	GAA	2	6	50014	50019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856208
1102	NC_017518	GGT	2	6	50062	50067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856208
1103	NC_017518	CGAG	2	8	50121	50128	25 %	0 %	50 %	25 %	385856208
1104	NC_017518	CGA	2	6	50130	50135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1105	NC_017518	TGG	2	6	50181	50186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856208
1106	NC_017518	GTTGG	2	10	50194	50203	0 %	40 %	60 %	0 %	385856208
1107	NC_017518	AGT	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1108	NC_017518	GAGGTT	2	12	50239	50250	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385856208
1109	NC_017518	CGA	2	6	50259	50264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1110	NC_017518	GGC	3	9	50272	50280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1111	NC_017518	CGGA	2	8	50338	50345	25 %	0 %	50 %	25 %	385856208
1112	NC_017518	TGCC	2	8	50347	50354	0 %	25 %	25 %	50 %	385856208
1113	NC_017518	GCG	2	6	50384	50389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1114	NC_017518	CTGC	2	8	50418	50425	0 %	25 %	25 %	50 %	385856208
1115	NC_017518	TTG	2	6	50452	50457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856208
1116	NC_017518	CGT	2	6	50520	50525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1117	NC_017518	GGC	2	6	50544	50549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1118	NC_017518	GC	3	6	50600	50605	0 %	0 %	50 %	50 %	385856208
1119	NC_017518	GAT	2	6	50668	50673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1120	NC_017518	GCG	2	6	50750	50755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856208
1121	NC_017518	AGT	2	6	50757	50762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1122	NC_017518	GCA	2	6	50766	50771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1123	NC_017518	TGA	2	6	50847	50852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1124	NC_017518	GAA	2	6	50917	50922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856208
1125	NC_017518	GCC	2	6	50944	50949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856208
1126	NC_017518	CGT	2	6	50955	50960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856208
1127	NC_017518	GAT	2	6	51001	51006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1128	NC_017518	GAT	2	6	51016	51021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
1129	NC_017518	GTG	2	6	51101	51106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856208
1130	NC_017518	CGAAGG	2	12	51129	51140	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385856208
1131	NC_017518	TCA	2	6	51186	51191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856208
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1133	NC_017518	GAT	2	6	51277	51282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856208
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