MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 48341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017518	GCC	2	6	234584	234589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5002	NC_017518	GGC	2	6	234672	234677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856371
5003	NC_017518	TTG	2	6	234700	234705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856371
5004	NC_017518	TCA	2	6	234713	234718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856371
5005	NC_017518	GC	3	6	234719	234724	0 %	0 %	50 %	50 %	385856371
5006	NC_017518	CGC	3	9	234759	234767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5007	NC_017518	GAC	2	6	234775	234780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856371
5008	NC_017518	GCG	3	9	234791	234799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856371
5009	NC_017518	CGC	3	9	234936	234944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5010	NC_017518	CTG	2	6	234946	234951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856371
5011	NC_017518	A	6	6	234973	234978	100 %	0 %	0 %	0 %	385856371
5012	NC_017518	CGT	2	6	235002	235007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856371
5013	NC_017518	CGG	2	6	235023	235028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856371
5014	NC_017518	ACG	2	6	235073	235078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856371
5015	NC_017518	GCC	2	6	235109	235114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5016	NC_017518	CGCC	2	8	235116	235123	0 %	0 %	25 %	75 %	385856371
5017	NC_017518	CCACCG	2	12	235142	235153	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385856371
5018	NC_017518	GCAG	2	8	235156	235163	25 %	0 %	50 %	25 %	385856371
5019	NC_017518	CCTGCG	2	12	235179	235190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385856371
5020	NC_017518	CGC	2	6	235227	235232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5021	NC_017518	CCG	2	6	235358	235363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5022	NC_017518	ATC	2	6	235393	235398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856371
5023	NC_017518	A	6	6	235409	235414	100 %	0 %	0 %	0 %	385856371
5024	NC_017518	ACGC	2	8	235454	235461	25 %	0 %	25 %	50 %	385856371
5025	NC_017518	GGC	2	6	235462	235467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856371
5026	NC_017518	CCG	2	6	235635	235640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856371
5027	NC_017518	GCA	2	6	235641	235646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856371
5028	NC_017518	A	6	6	235673	235678	100 %	0 %	0 %	0 %	385856371
5029	NC_017518	GCG	2	6	235688	235693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856371
5030	NC_017518	GAA	2	6	235747	235752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856371
5031	NC_017518	A	6	6	235770	235775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017518	ATG	2	6	235940	235945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017518	T	6	6	235949	235954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017518	ACAA	2	8	235973	235980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_017518	T	6	6	236112	236117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017518	CCG	2	6	236186	236191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_017518	GGT	2	6	236329	236334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856372
5038	NC_017518	GTTT	2	8	236388	236395	0 %	75 %	25 %	0 %	385856372
5039	NC_017518	GT	3	6	236505	236510	0 %	50 %	50 %	0 %	385856372
5040	NC_017518	ATGGTG	2	12	236535	236546	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385856372
5041	NC_017518	GAT	2	6	236627	236632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856372
5042	NC_017518	AAT	2	6	236664	236669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856372
5043	NC_017518	CGA	2	6	236734	236739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5044	NC_017518	GAC	2	6	236759	236764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5045	NC_017518	TGC	2	6	236794	236799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5046	NC_017518	TGC	2	6	236821	236826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5047	NC_017518	TGC	2	6	236851	236856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5048	NC_017518	TGG	2	6	236898	236903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856372
5049	NC_017518	TGG	2	6	236913	236918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856372
5050	NC_017518	GCG	2	6	236960	236965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856372
5051	NC_017518	TGC	2	6	237072	237077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856372
5052	NC_017518	GGTGC	2	10	237083	237092	0 %	20 %	60 %	20 %	385856372
5053	NC_017518	TCTT	2	8	237226	237233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_017518	CCG	2	6	237304	237309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_017518	CAG	2	6	237324	237329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017518	TCCCTT	2	12	237335	237346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017518	CT	3	6	237412	237417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017518	CTCC	2	8	237426	237433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5059	NC_017518	CCCG	2	8	237505	237512	0 %	0 %	25 %	75 %	385856373
5060	NC_017518	GCG	2	6	237547	237552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856373
5061	NC_017518	GCC	2	6	237661	237666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856373
5062	NC_017518	GCGG	2	8	237688	237695	0 %	0 %	75 %	25 %	385856373
5063	NC_017518	GCA	2	6	237781	237786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856373
5064	NC_017518	CGTT	2	8	237801	237808	0 %	50 %	25 %	25 %	385856373
5065	NC_017518	GGC	2	6	237814	237819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856373
5066	NC_017518	GGT	2	6	237823	237828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856373
5067	NC_017518	GCG	2	6	237837	237842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856373
5068	NC_017518	GAC	2	6	237870	237875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856373
5069	NC_017518	TGGG	2	8	237953	237960	0 %	25 %	75 %	0 %	385856373
5070	NC_017518	TCGTT	2	10	238003	238012	0 %	60 %	20 %	20 %	385856373
5071	NC_017518	GCC	2	6	238014	238019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856373
5072	NC_017518	A	6	6	238046	238051	100 %	0 %	0 %	0 %	385856373
5073	NC_017518	TTCGAT	2	12	238127	238138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385856373
5074	NC_017518	GGC	2	6	238235	238240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017518	ATA	2	6	238250	238255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017518	GCC	2	6	238297	238302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5077	NC_017518	AT	3	6	238304	238309	50 %	50 %	0 %	0 %	385856374
5078	NC_017518	TGATGG	2	12	238314	238325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385856374
5079	NC_017518	GGC	2	6	238417	238422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856374
5080	NC_017518	AATCAG	2	12	238423	238434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385856374
5081	NC_017518	TGG	2	6	238506	238511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856374
5082	NC_017518	CGG	2	6	238518	238523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856374
5083	NC_017518	AAT	2	6	238543	238548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856374
5084	NC_017518	GAA	2	6	238591	238596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856374
5085	NC_017518	GCC	2	6	238640	238645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5086	NC_017518	CAC	2	6	238651	238656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856374
5087	NC_017518	CAG	2	6	238666	238671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856374
5088	NC_017518	CGC	2	6	238684	238689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5089	NC_017518	ACAAT	2	10	238767	238776	60 %	20 %	0 %	20 %	385856374
5090	NC_017518	CAG	2	6	238861	238866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856374
5091	NC_017518	GCC	2	6	238894	238899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5092	NC_017518	GCC	2	6	238906	238911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5093	NC_017518	CGG	2	6	238965	238970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856374
5094	NC_017518	GCG	2	6	238980	238985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856374
5095	NC_017518	TGCCA	2	10	238994	239003	20 %	20 %	20 %	40 %	385856374
5096	NC_017518	CTT	2	6	239070	239075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856374
5097	NC_017518	AC	3	6	239085	239090	50 %	0 %	0 %	50 %	385856374
5098	NC_017518	CGC	2	6	239103	239108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5099	NC_017518	CAG	2	6	239143	239148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856374
5100	NC_017518	GCC	2	6	239167	239172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5101	NC_017518	GCC	2	6	239360	239365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856374
5102	NC_017518	T	7	7	239462	239468	0 %	100 %	0 %	0 %	385856374
5103	NC_017518	GTT	2	6	239503	239508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017518	TGCC	2	8	239624	239631	0 %	25 %	25 %	50 %	385856375
5105	NC_017518	AGT	2	6	239635	239640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856375
5106	NC_017518	T	6	6	239651	239656	0 %	100 %	0 %	0 %	385856375
5107	NC_017518	CAGA	2	8	239691	239698	50 %	0 %	25 %	25 %	385856375
5108	NC_017518	CTT	2	6	239783	239788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856375
5109	NC_017518	GGC	2	6	239813	239818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856375
5110	NC_017518	GCG	2	6	239850	239855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856375
5111	NC_017518	TCAATT	2	12	239933	239944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385856375
5112	NC_017518	CGC	2	6	240000	240005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856375
5113	NC_017518	TTG	2	6	240195	240200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856375
5114	NC_017518	GCC	2	6	240214	240219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856375
5115	NC_017518	TGC	2	6	240233	240238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856375
5116	NC_017518	CAA	2	6	240282	240287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856375
5117	NC_017518	TCG	2	6	240292	240297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856375
5118	NC_017518	CTT	2	6	240402	240407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856376
5119	NC_017518	ATT	2	6	240416	240421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385856376
5120	NC_017518	TGC	2	6	240435	240440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856376
5121	NC_017518	CGG	3	9	240471	240479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856376
5122	NC_017518	CCG	2	6	240503	240508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856376
5123	NC_017518	CAG	2	6	240526	240531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856376
5124	NC_017518	GCC	2	6	240544	240549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856376
5125	NC_017518	GGC	2	6	240551	240556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856376
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5234	NC_017518	GTT	2	6	245422	245427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_017518	TTC	2	6	245477	245482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_017518	AAT	2	6	245529	245534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_017518	CTCTT	2	10	245540	245549	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5238	NC_017518	ATA	2	6	245559	245564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_017518	TCA	2	6	245568	245573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5240	NC_017518	ATA	2	6	245595	245600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_017518	ATTTT	2	10	245601	245610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_017518	AAGT	2	8	245620	245627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_017518	CCA	2	6	245656	245661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5244	NC_017518	ATC	2	6	245703	245708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5246	NC_017518	TAA	2	6	245765	245770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856380
5247	NC_017518	TAA	2	6	245836	245841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856380
5248	NC_017518	A	8	8	245881	245888	100 %	0 %	0 %	0 %	385856380
5249	NC_017518	CTT	2	6	245890	245895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856380
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5255	NC_017518	CA	3	6	246305	246310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5491	NC_017518	A	6	6	258632	258637	100 %	0 %	0 %	0 %	385856391
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