MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385852232
2	NC_017516	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385852232
3	NC_017516	GTTT	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	385852234
4	NC_017516	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385852234
5	NC_017516	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017516	CGGA	2	8	2742	2749	25 %	0 %	50 %	25 %	385852235
7	NC_017516	TGCC	2	8	3813	3820	0 %	25 %	25 %	50 %	385852237
8	NC_017516	CAAA	2	8	3910	3917	75 %	0 %	0 %	25 %	385852237
9	NC_017516	CGCC	2	8	5364	5371	0 %	0 %	25 %	75 %	385852239
10	NC_017516	TTTC	2	8	5492	5499	0 %	75 %	0 %	25 %	385852239
11	NC_017516	GCAC	2	8	6154	6161	25 %	0 %	25 %	50 %	385852240
12	NC_017516	GGCA	2	8	6311	6318	25 %	0 %	50 %	25 %	385852241
13	NC_017516	TCGG	2	8	6741	6748	0 %	25 %	50 %	25 %	385852241
14	NC_017516	CGCC	2	8	7015	7022	0 %	0 %	25 %	75 %	385852241
15	NC_017516	GTTT	2	8	7228	7235	0 %	75 %	25 %	0 %	385852241
16	NC_017516	TCGG	2	8	7332	7339	0 %	25 %	50 %	25 %	385852241
17	NC_017516	CGAG	2	8	7402	7409	25 %	0 %	50 %	25 %	385852241
18	NC_017516	ACGC	2	8	7746	7753	25 %	0 %	25 %	50 %	385852242
19	NC_017516	CATC	2	8	8382	8389	25 %	25 %	0 %	50 %	385852242
20	NC_017516	GCGG	2	8	9354	9361	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017516	CGAC	2	8	9444	9451	25 %	0 %	25 %	50 %	385852243
22	NC_017516	CAGC	2	8	10165	10172	25 %	0 %	25 %	50 %	385852243
23	NC_017516	CAGG	2	8	10180	10187	25 %	0 %	50 %	25 %	385852243
24	NC_017516	GTAT	2	8	10454	10461	25 %	50 %	25 %	0 %	385852244
25	NC_017516	ACCG	2	8	10470	10477	25 %	0 %	25 %	50 %	385852244
26	NC_017516	GAAG	2	8	10569	10576	50 %	0 %	50 %	0 %	385852244
27	NC_017516	GGAC	2	8	10739	10746	25 %	0 %	50 %	25 %	385852244
28	NC_017516	CCGG	2	8	11457	11464	0 %	0 %	50 %	50 %	385852245
29	NC_017516	CCGA	2	8	11969	11976	25 %	0 %	25 %	50 %	385852245
30	NC_017516	GGCA	2	8	12342	12349	25 %	0 %	50 %	25 %	385852246
31	NC_017516	GGCA	2	8	12451	12458	25 %	0 %	50 %	25 %	385852246
32	NC_017516	CCCG	2	8	13224	13231	0 %	0 %	25 %	75 %	385852246
33	NC_017516	ACAA	2	8	13288	13295	75 %	0 %	0 %	25 %	385852246
34	NC_017516	TAAA	2	8	13791	13798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017516	TCAG	2	8	14201	14208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017516	ATCC	2	8	14903	14910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017516	TAAA	2	8	15765	15772	75 %	25 %	0 %	0 %	385852247
38	NC_017516	ACCC	2	8	16265	16272	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017516	CCGG	2	8	16778	16785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017516	ATTT	2	8	17160	17167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017516	TTTC	2	8	17875	17882	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017516	GGGT	2	8	18063	18070	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017516	TGGG	2	8	18071	18078	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017516	CCGT	2	8	24232	24239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017516	TGTT	2	8	24293	24300	0 %	75 %	25 %	0 %	385852257
46	NC_017516	CCGG	2	8	24646	24653	0 %	0 %	50 %	50 %	385852258
47	NC_017516	TGCC	2	8	24952	24959	0 %	25 %	25 %	50 %	385852258
48	NC_017516	CGGA	2	8	25076	25083	25 %	0 %	50 %	25 %	385852258
49	NC_017516	TTTG	2	8	26020	26027	0 %	75 %	25 %	0 %	385852259
50	NC_017516	CAGT	2	8	26401	26408	25 %	25 %	25 %	25 %	385852259
51	NC_017516	GCGG	2	8	26480	26487	0 %	0 %	75 %	25 %	385852259
52	NC_017516	CCAG	2	8	26899	26906	25 %	0 %	25 %	50 %	385852259
53	NC_017516	TCGG	2	8	27189	27196	0 %	25 %	50 %	25 %	385852259
54	NC_017516	TGTT	2	8	27384	27391	0 %	75 %	25 %	0 %	385852259
55	NC_017516	CCAA	2	8	28691	28698	50 %	0 %	0 %	50 %	385852260
56	NC_017516	GCGA	2	8	28909	28916	25 %	0 %	50 %	25 %	385852260
57	NC_017516	GGCA	2	8	28944	28951	25 %	0 %	50 %	25 %	385852260
58	NC_017516	TGAT	2	8	29239	29246	25 %	50 %	25 %	0 %	385852260
59	NC_017516	CTCG	2	8	29891	29898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017516	CGGG	2	8	30505	30512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017516	CTTC	2	8	31518	31525	0 %	50 %	0 %	50 %	385852262
62	NC_017516	GGCA	2	8	31670	31677	25 %	0 %	50 %	25 %	385852262
63	NC_017516	CCGG	2	8	32059	32066	0 %	0 %	50 %	50 %	385852262
64	NC_017516	GTTC	2	8	32385	32392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017516	GCCG	2	8	32848	32855	0 %	0 %	50 %	50 %	385852263
66	NC_017516	TCCG	2	8	34187	34194	0 %	25 %	25 %	50 %	385852264
67	NC_017516	CAGG	2	8	34842	34849	25 %	0 %	50 %	25 %	385852265
68	NC_017516	CCGC	2	8	34945	34952	0 %	0 %	25 %	75 %	385852265
69	NC_017516	TGTT	2	8	36352	36359	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017516	TTGT	2	8	36409	36416	0 %	75 %	25 %	0 %	385852267
71	NC_017516	GGCG	2	8	36453	36460	0 %	0 %	75 %	25 %	385852267
72	NC_017516	GGCG	2	8	36786	36793	0 %	0 %	75 %	25 %	385852267
73	NC_017516	ATCA	2	8	36955	36962	50 %	25 %	0 %	25 %	385852267
74	NC_017516	GGTC	2	8	37179	37186	0 %	25 %	50 %	25 %	385852267
75	NC_017516	TTTC	2	8	37278	37285	0 %	75 %	0 %	25 %	385852267
76	NC_017516	TTGG	2	8	37897	37904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017516	GACG	2	8	38004	38011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017516	TTTC	2	8	38108	38115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017516	ATCG	2	8	38558	38565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017516	GGCG	2	8	39026	39033	0 %	0 %	75 %	25 %	385852268
81	NC_017516	CGAA	2	8	39037	39044	50 %	0 %	25 %	25 %	385852268
82	NC_017516	TCCG	2	8	39707	39714	0 %	25 %	25 %	50 %	385852268
83	NC_017516	AAAC	2	8	39869	39876	75 %	0 %	0 %	25 %	385852268
84	NC_017516	GAAC	2	8	40727	40734	50 %	0 %	25 %	25 %	385852269
85	NC_017516	GCAG	2	8	40945	40952	25 %	0 %	50 %	25 %	385852270
86	NC_017516	TCCG	2	8	41245	41252	0 %	25 %	25 %	50 %	385852270
87	NC_017516	TGTT	2	8	42148	42155	0 %	75 %	25 %	0 %	385852271
88	NC_017516	GACA	2	8	42775	42782	50 %	0 %	25 %	25 %	385852271
89	NC_017516	GCAG	2	8	42944	42951	25 %	0 %	50 %	25 %	385852271
90	NC_017516	AAAG	2	8	42972	42979	75 %	0 %	25 %	0 %	385852271
91	NC_017516	GGCG	2	8	43560	43567	0 %	0 %	75 %	25 %	385852272
92	NC_017516	ATGG	2	8	44582	44589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017516	TTGA	2	8	45133	45140	25 %	50 %	25 %	0 %	385852273
94	NC_017516	ATGG	2	8	46756	46763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017516	ATGG	2	8	47061	47068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017516	GGAT	2	8	47218	47225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017516	GGAT	2	8	47442	47449	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017516	ACCT	2	8	48389	48396	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
99	NC_017516	TTGG	2	8	48670	48677	0 %	50 %	50 %	0 %	385852274
100	NC_017516	ACTG	2	8	49141	49148	25 %	25 %	25 %	25 %	385852274
101	NC_017516	TGAG	2	8	49308	49315	25 %	25 %	50 %	0 %	385852274
102	NC_017516	CAAA	2	8	49723	49730	75 %	0 %	0 %	25 %	385852274
103	NC_017516	GGGC	2	8	50254	50261	0 %	0 %	75 %	25 %	385852274
104	NC_017516	TGAG	2	8	50484	50491	25 %	25 %	50 %	0 %	385852274
105	NC_017516	GGGT	2	8	50675	50682	0 %	25 %	75 %	0 %	385852274
106	NC_017516	ACCG	2	8	50719	50726	25 %	0 %	25 %	50 %	385852274
107	NC_017516	CCAT	2	8	50751	50758	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
108	NC_017516	GCCG	2	8	50860	50867	0 %	0 %	50 %	50 %	385852274
109	NC_017516	ATCC	2	8	50920	50927	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
110	NC_017516	GCGG	2	8	51056	51063	0 %	0 %	75 %	25 %	385852274
111	NC_017516	GGAT	2	8	52261	52268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017516	CGAA	2	8	52484	52491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017516	GGAT	2	8	52538	52545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017516	CGAA	2	8	52761	52768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017516	CGAG	2	8	53770	53777	25 %	0 %	50 %	25 %	385852275
116	NC_017516	CGGA	2	8	53987	53994	25 %	0 %	50 %	25 %	385852275
117	NC_017516	TGCC	2	8	53996	54003	0 %	25 %	25 %	50 %	385852275
118	NC_017516	CTGC	2	8	54067	54074	0 %	25 %	25 %	50 %	385852275
119	NC_017516	GGCG	2	8	55652	55659	0 %	0 %	75 %	25 %	385852276
120	NC_017516	CGGG	2	8	56713	56720	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017516	TGCG	2	8	56824	56831	0 %	25 %	50 %	25 %	385852277
122	NC_017516	TTGG	2	8	57863	57870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017516	TCCT	2	8	58293	58300	0 %	50 %	0 %	50 %	385852278
124	NC_017516	TGCC	2	8	58568	58575	0 %	25 %	25 %	50 %	385852278
125	NC_017516	TTGC	2	8	58677	58684	0 %	50 %	25 %	25 %	385852279
126	NC_017516	TTGA	2	8	58956	58963	25 %	50 %	25 %	0 %	385852279
127	NC_017516	GAAT	2	8	59054	59061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017516	AATG	2	8	59093	59100	50 %	25 %	25 %	0 %	385852280
129	NC_017516	GCGG	2	8	59139	59146	0 %	0 %	75 %	25 %	385852280
130	NC_017516	GTCG	2	8	59366	59373	0 %	25 %	50 %	25 %	385852280
131	NC_017516	GTAT	2	8	59461	59468	25 %	50 %	25 %	0 %	385852280
132	NC_017516	ATGA	2	8	60089	60096	50 %	25 %	25 %	0 %	385852281
133	NC_017516	GGAA	2	8	60743	60750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017516	AGAC	2	8	60829	60836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017516	GCTT	2	8	60987	60994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017516	GTAG	2	8	62339	62346	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017516	AGAA	2	8	62451	62458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017516	GTTT	2	8	62887	62894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017516	GCGA	2	8	63358	63365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017516	AAAC	2	8	63898	63905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017516	GACA	2	8	64053	64060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017516	AAAG	2	8	64195	64202	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017516	ACTG	2	8	66035	66042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017516	GGTT	2	8	66728	66735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017516	TGTA	2	8	67652	67659	25 %	50 %	25 %	0 %	385852283
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