MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 48275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017516	CAG	2	6	164930	164935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852378
3502	NC_017516	TGC	2	6	164942	164947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852378
3503	NC_017516	TGC	2	6	164950	164955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852378
3504	NC_017516	ATT	2	6	164972	164977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852378
3505	NC_017516	AAC	2	6	164996	165001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852378
3506	NC_017516	GTA	2	6	165030	165035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852378
3507	NC_017516	CCG	2	6	165077	165082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852378
3508	NC_017516	TGT	2	6	165113	165118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852378
3509	NC_017516	GGT	2	6	165165	165170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852378
3510	NC_017516	GCT	2	6	165249	165254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852378
3511	NC_017516	CAT	2	6	165390	165395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017516	A	6	6	165397	165402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017516	ATG	2	6	165407	165412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852379
3514	NC_017516	TA	3	6	165416	165421	50 %	50 %	0 %	0 %	385852379
3515	NC_017516	AAG	2	6	165524	165529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852379
3516	NC_017516	GTT	2	6	165545	165550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852379
3517	NC_017516	TGC	2	6	165601	165606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852379
3518	NC_017516	GTT	2	6	165616	165621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852379
3519	NC_017516	GCT	2	6	165674	165679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852379
3520	NC_017516	TGTC	2	8	165707	165714	0 %	50 %	25 %	25 %	385852379
3521	NC_017516	GGA	2	6	165763	165768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852379
3522	NC_017516	CAG	2	6	165821	165826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852379
3523	NC_017516	ATTG	2	8	165883	165890	25 %	50 %	25 %	0 %	385852379
3524	NC_017516	GCAG	2	8	165985	165992	25 %	0 %	50 %	25 %	385852379
3525	NC_017516	AGC	2	6	166056	166061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852379
3526	NC_017516	TTG	2	6	166073	166078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852379
3527	NC_017516	ATT	2	6	166157	166162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852380
3528	NC_017516	GTA	2	6	166163	166168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852380
3529	NC_017516	CGT	2	6	166307	166312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852380
3530	NC_017516	TAT	2	6	166501	166506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852380
3531	NC_017516	TGA	2	6	166561	166566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852380
3532	NC_017516	GCAAA	2	10	166633	166642	60 %	0 %	20 %	20 %	385852380
3533	NC_017516	CGGTT	2	10	166663	166672	0 %	40 %	40 %	20 %	385852380
3534	NC_017516	CTGT	2	8	166730	166737	0 %	50 %	25 %	25 %	385852380
3535	NC_017516	CATC	2	8	166831	166838	25 %	25 %	0 %	50 %	385852380
3536	NC_017516	GGC	2	6	166849	166854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852380
3537	NC_017516	A	7	7	166928	166934	100 %	0 %	0 %	0 %	385852380
3538	NC_017516	CTT	2	6	166936	166941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852380
3539	NC_017516	GGA	2	6	166955	166960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852380
3540	NC_017516	ATC	2	6	167036	167041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852381
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3542	NC_017516	AAG	2	6	167061	167066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852381
3543	NC_017516	TCG	2	6	167259	167264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852382
3544	NC_017516	GCG	2	6	167294	167299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852382
3545	NC_017516	GTT	2	6	167304	167309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852382
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3547	NC_017516	GAA	2	6	167351	167356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852382
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3551	NC_017516	CTG	2	6	167546	167551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852382
3552	NC_017516	CATT	2	8	167750	167757	25 %	50 %	0 %	25 %	385852382
3553	NC_017516	GAG	2	6	167795	167800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852382
3554	NC_017516	TGC	2	6	167808	167813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852382
3555	NC_017516	GGC	2	6	167866	167871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852382
3556	NC_017516	AAC	2	6	167874	167879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852382
3557	NC_017516	ATT	2	6	168011	168016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852382
3558	NC_017516	CGC	2	6	168030	168035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852382
3559	NC_017516	CGG	2	6	168041	168046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852382
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3561	NC_017516	GTCC	2	8	168074	168081	0 %	25 %	25 %	50 %	385852382
3562	NC_017516	GGC	2	6	168103	168108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852382
3563	NC_017516	ACA	2	6	168194	168199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017516	TCA	2	6	168221	168226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017516	TCA	2	6	168302	168307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_017516	TCG	2	6	168396	168401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_017516	TCAA	2	8	168475	168482	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_017516	CCA	2	6	168564	168569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852383
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3570	NC_017516	CGG	2	6	168675	168680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852383
3571	NC_017516	GC	4	8	168709	168716	0 %	0 %	50 %	50 %	385852383
3572	NC_017516	GCG	2	6	168758	168763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852383
3573	NC_017516	TCA	2	6	168789	168794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852383
3574	NC_017516	GTC	2	6	168823	168828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852383
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3576	NC_017516	CGC	2	6	168954	168959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852383
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3579	NC_017516	TTC	2	6	169039	169044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852383
3580	NC_017516	TGA	2	6	169047	169052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852383
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3582	NC_017516	GGC	2	6	169081	169086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852383
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3588	NC_017516	TTG	2	6	169397	169402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852383
3589	NC_017516	T	6	6	169528	169533	0 %	100 %	0 %	0 %	385852383
3590	NC_017516	CTT	2	6	169539	169544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852383
3591	NC_017516	GGT	2	6	169579	169584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852383
3592	NC_017516	CAG	2	6	169594	169599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852383
3593	NC_017516	T	7	7	169665	169671	0 %	100 %	0 %	0 %	385852383
3594	NC_017516	GTGG	2	8	169735	169742	0 %	25 %	75 %	0 %	385852383
3595	NC_017516	TCA	2	6	169743	169748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852383
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3602	NC_017516	TGT	2	6	170043	170048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852383
3603	NC_017516	CGC	2	6	170100	170105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852383
3604	NC_017516	T	6	6	170116	170121	0 %	100 %	0 %	0 %	385852383
3605	NC_017516	CGC	2	6	170166	170171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852383
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3607	NC_017516	GT	3	6	170264	170269	0 %	50 %	50 %	0 %	385852383
3608	NC_017516	TTTG	2	8	170316	170323	0 %	75 %	25 %	0 %	385852383
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3610	NC_017516	CAGG	2	8	170358	170365	25 %	0 %	50 %	25 %	385852383
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3612	NC_017516	ACGGCA	2	12	170636	170647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852383
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3620	NC_017516	CG	3	6	170904	170909	0 %	0 %	50 %	50 %	385852383
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3622	NC_017516	TTG	2	6	170941	170946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852383
3623	NC_017516	GCC	2	6	170956	170961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852383
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3734	NC_017516	TTTCC	2	10	176271	176280	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3735	NC_017516	GAC	2	6	176334	176339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3737	NC_017516	TGA	2	6	176377	176382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852388
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3740	NC_017516	GAT	2	6	176606	176611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852388
3741	NC_017516	TGTC	2	8	176803	176810	0 %	50 %	25 %	25 %	385852388
3742	NC_017516	GCT	3	9	176866	176874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852389
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3980	NC_017516	TCG	2	6	187355	187360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3982	NC_017516	ATG	2	6	187506	187511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3984	NC_017516	GGTGTC	2	12	187546	187557	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3985	NC_017516	CGG	2	6	187561	187566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3986	NC_017516	TGGCG	2	10	187574	187583	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3987	NC_017516	GTTTG	2	10	187598	187607	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3989	NC_017516	CGG	2	6	187644	187649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_017516	GAT	2	6	187675	187680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_017516	GCG	2	6	187681	187686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_017516	AC	3	6	187698	187703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3993	NC_017516	GGC	2	6	187720	187725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_017516	GCG	2	6	187730	187735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_017516	GCT	3	9	187759	187767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_017516	GGGC	2	8	187783	187790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3997	NC_017516	TGG	2	6	187832	187837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_017516	CG	4	8	187865	187872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_017516	GGT	2	6	187884	187889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_017516	A	6	6	187900	187905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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