MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 48275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017516	CGGCG	2	10	48379	48388	0 %	0 %	60 %	40 %	385852274
1002	NC_017516	ACCT	2	8	48389	48396	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
1003	NC_017516	GCC	2	6	48397	48402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852274
1004	NC_017516	A	6	6	48586	48591	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1005	NC_017516	CGG	3	9	48598	48606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1006	NC_017516	AT	3	6	48612	48617	50 %	50 %	0 %	0 %	385852274
1007	NC_017516	ATC	2	6	48663	48668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852274
1008	NC_017516	TTGG	2	8	48670	48677	0 %	50 %	50 %	0 %	385852274
1009	NC_017516	GA	3	6	48699	48704	50 %	0 %	50 %	0 %	385852274
1010	NC_017516	TCT	2	6	48740	48745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852274
1011	NC_017516	GCA	2	6	48763	48768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1012	NC_017516	AAT	2	6	48836	48841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852274
1013	NC_017516	CTG	2	6	48899	48904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1014	NC_017516	A	6	6	48908	48913	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1015	NC_017516	T	6	6	49010	49015	0 %	100 %	0 %	0 %	385852274
1016	NC_017516	ACTG	2	8	49141	49148	25 %	25 %	25 %	25 %	385852274
1017	NC_017516	AGC	2	6	49232	49237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1018	NC_017516	GAAAA	2	10	49258	49267	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
1019	NC_017516	A	6	6	49264	49269	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1020	NC_017516	CAA	2	6	49276	49281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852274
1021	NC_017516	TGAG	2	8	49308	49315	25 %	25 %	50 %	0 %	385852274
1022	NC_017516	A	6	6	49499	49504	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1023	NC_017516	TGC	2	6	49509	49514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1024	NC_017516	ATG	2	6	49536	49541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852274
1025	NC_017516	CAA	2	6	49561	49566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852274
1026	NC_017516	AGA	2	6	49567	49572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852274
1027	NC_017516	ACG	2	6	49701	49706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1028	NC_017516	CAAA	2	8	49723	49730	75 %	0 %	0 %	25 %	385852274
1029	NC_017516	GCG	2	6	49731	49736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1030	NC_017516	GC	3	6	49834	49839	0 %	0 %	50 %	50 %	385852274
1031	NC_017516	A	6	6	49848	49853	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1032	NC_017516	CGG	2	6	49882	49887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1033	NC_017516	GAACG	2	10	49907	49916	40 %	0 %	40 %	20 %	385852274
1034	NC_017516	GGC	2	6	49955	49960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1035	NC_017516	CGGCAA	2	12	49999	50010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1036	NC_017516	CGC	2	6	50091	50096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852274
1037	NC_017516	ACG	2	6	50112	50117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1038	NC_017516	CGC	2	6	50125	50130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852274
1039	NC_017516	GCG	2	6	50169	50174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1040	NC_017516	TGTATG	2	12	50190	50201	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385852274
1041	NC_017516	AGC	2	6	50210	50215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1042	NC_017516	A	7	7	50228	50234	100 %	0 %	0 %	0 %	385852274
1043	NC_017516	GGGC	2	8	50254	50261	0 %	0 %	75 %	25 %	385852274
1044	NC_017516	TGG	2	6	50277	50282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852274
1045	NC_017516	CGG	2	6	50329	50334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1046	NC_017516	TTTGA	2	10	50348	50357	20 %	60 %	20 %	0 %	385852274
1047	NC_017516	TGAG	2	8	50484	50491	25 %	25 %	50 %	0 %	385852274
1048	NC_017516	GAT	2	6	50492	50497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852274
1049	NC_017516	AT	3	6	50518	50523	50 %	50 %	0 %	0 %	385852274
1050	NC_017516	CGA	3	9	50536	50544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1051	NC_017516	GCT	2	6	50593	50598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1052	NC_017516	AGG	2	6	50616	50621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852274
1053	NC_017516	GCA	2	6	50667	50672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1054	NC_017516	GGGT	2	8	50675	50682	0 %	25 %	75 %	0 %	385852274
1055	NC_017516	ACCG	2	8	50719	50726	25 %	0 %	25 %	50 %	385852274
1056	NC_017516	CCAT	2	8	50751	50758	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
1057	NC_017516	GCG	2	6	50781	50786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1058	NC_017516	CCG	2	6	50814	50819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852274
1059	NC_017516	CGG	2	6	50821	50826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852274
1060	NC_017516	GC	4	8	50844	50851	0 %	0 %	50 %	50 %	385852274
1061	NC_017516	GCCG	2	8	50860	50867	0 %	0 %	50 %	50 %	385852274
1062	NC_017516	ATCC	2	8	50920	50927	25 %	25 %	0 %	50 %	385852274
1063	NC_017516	GAAAA	2	10	51014	51023	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
1064	NC_017516	CAA	2	6	51036	51041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852274
1065	NC_017516	GCGG	2	8	51056	51063	0 %	0 %	75 %	25 %	385852274
1066	NC_017516	CCG	2	6	51078	51083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852274
1067	NC_017516	GCT	2	6	51108	51113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1068	NC_017516	CTG	2	6	51137	51142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852274
1069	NC_017516	TCT	2	6	51213	51218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852274
1070	NC_017516	T	6	6	51265	51270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017516	CAATT	2	10	51357	51366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1072	NC_017516	AAC	2	6	51422	51427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017516	AAC	2	6	51554	51559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_017516	ATG	2	6	51664	51669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017516	A	6	6	51697	51702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017516	GTC	2	6	51716	51721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017516	A	6	6	51788	51793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017516	AAC	2	6	51904	51909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017516	ATG	2	6	52013	52018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017516	A	6	6	52046	52051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017516	AAC	2	6	52102	52107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017516	GTG	2	6	52194	52199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017516	GTG	2	6	52218	52223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017516	GTG	2	6	52242	52247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017516	GGAT	2	8	52261	52268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017516	AAC	2	6	52305	52310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017516	CGAA	2	8	52484	52491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_017516	GGAT	2	8	52538	52545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017516	A	6	6	52617	52622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017516	CGAA	2	8	52761	52768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_017516	CT	3	6	52938	52943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_017516	GTA	2	6	53012	53017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852275
1093	NC_017516	GGA	3	9	53053	53061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852275
1094	NC_017516	GCT	2	6	53078	53083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1095	NC_017516	CGC	2	6	53107	53112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852275
1096	NC_017516	GTC	2	6	53138	53143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1097	NC_017516	GT	3	6	53181	53186	0 %	50 %	50 %	0 %	385852275
1098	NC_017516	CGG	2	6	53188	53193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1099	NC_017516	TTC	2	6	53228	53233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852275
1100	NC_017516	GCT	2	6	53345	53350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1101	NC_017516	TGC	2	6	53365	53370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1102	NC_017516	GCG	2	6	53376	53381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1103	NC_017516	GT	3	6	53382	53387	0 %	50 %	50 %	0 %	385852275
1104	NC_017516	GCG	3	9	53396	53404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1105	NC_017516	CGT	2	6	53422	53427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1106	NC_017516	CGC	2	6	53437	53442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852275
1107	NC_017516	T	6	6	53461	53466	0 %	100 %	0 %	0 %	385852275
1108	NC_017516	TGC	2	6	53482	53487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1109	NC_017516	GCG	2	6	53499	53504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1110	NC_017516	GCC	2	6	53553	53558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852275
1111	NC_017516	GAT	2	6	53588	53593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852275
1112	NC_017516	GGC	2	6	53606	53611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1113	NC_017516	GAA	2	6	53663	53668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852275
1114	NC_017516	GGT	2	6	53711	53716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852275
1115	NC_017516	CGAG	2	8	53770	53777	25 %	0 %	50 %	25 %	385852275
1116	NC_017516	CGA	2	6	53779	53784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1117	NC_017516	TGG	2	6	53830	53835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852275
1118	NC_017516	GTTGG	2	10	53843	53852	0 %	40 %	60 %	0 %	385852275
1119	NC_017516	AGT	2	6	53871	53876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852275
1120	NC_017516	GAGGTT	2	12	53888	53899	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385852275
1121	NC_017516	CGA	2	6	53908	53913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1122	NC_017516	GGC	3	9	53921	53929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
1123	NC_017516	ACG	2	6	53931	53936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1124	NC_017516	CGGA	2	8	53987	53994	25 %	0 %	50 %	25 %	385852275
1125	NC_017516	TGCC	2	8	53996	54003	0 %	25 %	25 %	50 %	385852275
1126	NC_017516	GCT	2	6	54017	54022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
1127	NC_017516	GCG	2	6	54033	54038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852275
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1129	NC_017516	CTG	2	6	54101	54106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852275
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