MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 48275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017516	TGA	2	6	24760	24765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852258
502	NC_017516	ATT	2	6	24777	24782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852258
503	NC_017516	GCG	2	6	24849	24854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852258
504	NC_017516	GGC	2	6	24857	24862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852258
505	NC_017516	TGA	2	6	24928	24933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852258
506	NC_017516	TGCC	2	8	24952	24959	0 %	25 %	25 %	50 %	385852258
507	NC_017516	GC	3	6	25018	25023	0 %	0 %	50 %	50 %	385852258
508	NC_017516	CGGA	2	8	25076	25083	25 %	0 %	50 %	25 %	385852258
509	NC_017516	GTG	2	6	25119	25124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852258
510	NC_017516	GCT	2	6	25191	25196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852258
511	NC_017516	TGT	2	6	25201	25206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852258
512	NC_017516	GCG	2	6	25303	25308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852258
513	NC_017516	TGG	2	6	25312	25317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852258
514	NC_017516	GCT	2	6	25328	25333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852258
515	NC_017516	GCC	2	6	25391	25396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852258
516	NC_017516	CGC	2	6	25447	25452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852258
517	NC_017516	AT	3	6	25495	25500	50 %	50 %	0 %	0 %	385852258
518	NC_017516	A	7	7	25574	25580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017516	GC	3	6	25654	25659	0 %	0 %	50 %	50 %	385852259
520	NC_017516	GGC	2	6	25700	25705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
521	NC_017516	GAT	2	6	25832	25837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852259
522	NC_017516	TGC	2	6	25882	25887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
523	NC_017516	GTC	2	6	25943	25948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
524	NC_017516	CGG	2	6	25990	25995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
525	NC_017516	TGCGGC	2	12	26000	26011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385852259
526	NC_017516	TTTG	2	8	26020	26027	0 %	75 %	25 %	0 %	385852259
527	NC_017516	TTG	2	6	26088	26093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852259
528	NC_017516	GGC	2	6	26159	26164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
529	NC_017516	GCG	2	6	26169	26174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
530	NC_017516	TGA	2	6	26224	26229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852259
531	NC_017516	CTT	2	6	26266	26271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852259
532	NC_017516	TTG	2	6	26292	26297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852259
533	NC_017516	ATG	2	6	26334	26339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852259
534	NC_017516	CAGT	2	8	26401	26408	25 %	25 %	25 %	25 %	385852259
535	NC_017516	GCGG	2	8	26480	26487	0 %	0 %	75 %	25 %	385852259
536	NC_017516	CGA	2	6	26506	26511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852259
537	NC_017516	GGC	2	6	26582	26587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
538	NC_017516	GTA	2	6	26591	26596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852259
539	NC_017516	TAA	2	6	26644	26649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852259
540	NC_017516	CG	3	6	26656	26661	0 %	0 %	50 %	50 %	385852259
541	NC_017516	T	6	6	26671	26676	0 %	100 %	0 %	0 %	385852259
542	NC_017516	GCA	2	6	26740	26745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852259
543	NC_017516	ACG	2	6	26872	26877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852259
544	NC_017516	CCAG	2	8	26899	26906	25 %	0 %	25 %	50 %	385852259
545	NC_017516	GGT	2	6	26987	26992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852259
546	NC_017516	TTC	2	6	26993	26998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852259
547	NC_017516	TTG	2	6	27024	27029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852259
548	NC_017516	CGT	2	6	27058	27063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
549	NC_017516	GTT	2	6	27068	27073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852259
550	NC_017516	GAA	3	9	27119	27127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852259
551	NC_017516	CGG	2	6	27166	27171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852259
552	NC_017516	TCGG	2	8	27189	27196	0 %	25 %	50 %	25 %	385852259
553	NC_017516	GCT	2	6	27316	27321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
554	NC_017516	GC	3	6	27358	27363	0 %	0 %	50 %	50 %	385852259
555	NC_017516	TGTT	2	8	27384	27391	0 %	75 %	25 %	0 %	385852259
556	NC_017516	TAA	2	6	27411	27416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852259
557	NC_017516	GTC	2	6	27539	27544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
558	NC_017516	GCA	2	6	27548	27553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852259
559	NC_017516	TGC	2	6	27637	27642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852259
560	NC_017516	AGGGC	2	10	27652	27661	20 %	0 %	60 %	20 %	385852259
561	NC_017516	CGG	2	6	27795	27800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017516	GAG	2	6	27882	27887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385852260
563	NC_017516	ACG	2	6	27907	27912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852260
564	NC_017516	CGC	3	9	28007	28015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
565	NC_017516	GC	4	8	28014	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	385852260
566	NC_017516	GAC	3	9	28077	28085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852260
567	NC_017516	CCA	2	6	28100	28105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852260
568	NC_017516	GC	3	6	28229	28234	0 %	0 %	50 %	50 %	385852260
569	NC_017516	TGC	2	6	28294	28299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852260
570	NC_017516	TTC	2	6	28323	28328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852260
571	NC_017516	TCT	2	6	28345	28350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852260
572	NC_017516	AAACC	2	10	28355	28364	60 %	0 %	0 %	40 %	385852260
573	NC_017516	GCT	2	6	28476	28481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852260
574	NC_017516	CG	3	6	28484	28489	0 %	0 %	50 %	50 %	385852260
575	NC_017516	CGGTAT	2	12	28636	28647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385852260
576	NC_017516	CCAA	2	8	28691	28698	50 %	0 %	0 %	50 %	385852260
577	NC_017516	GCG	2	6	28714	28719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852260
578	NC_017516	GCC	2	6	28809	28814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
579	NC_017516	CCG	2	6	28829	28834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
580	NC_017516	CG	3	6	28845	28850	0 %	0 %	50 %	50 %	385852260
581	NC_017516	GCT	2	6	28853	28858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852260
582	NC_017516	GCGA	2	8	28909	28916	25 %	0 %	50 %	25 %	385852260
583	NC_017516	GGCA	2	8	28944	28951	25 %	0 %	50 %	25 %	385852260
584	NC_017516	CAG	2	6	28992	28997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852260
585	NC_017516	CGG	2	6	29048	29053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852260
586	NC_017516	TCG	2	6	29080	29085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852260
587	NC_017516	TCA	2	6	29131	29136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852260
588	NC_017516	CTT	2	6	29192	29197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852260
589	NC_017516	GCC	2	6	29217	29222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
590	NC_017516	TGAT	2	8	29239	29246	25 %	50 %	25 %	0 %	385852260
591	NC_017516	TG	3	6	29249	29254	0 %	50 %	50 %	0 %	385852260
592	NC_017516	GAT	2	6	29334	29339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852260
593	NC_017516	CCG	2	6	29365	29370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
594	NC_017516	CGC	2	6	29402	29407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
595	NC_017516	GT	3	6	29409	29414	0 %	50 %	50 %	0 %	385852260
596	NC_017516	CCGATG	2	12	29431	29442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385852260
597	NC_017516	CCG	2	6	29443	29448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852260
598	NC_017516	TCC	2	6	29473	29478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852260
599	NC_017516	TGA	2	6	29544	29549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852260
600	NC_017516	CGA	2	6	29597	29602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852260
601	NC_017516	CGA	2	6	29627	29632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852260
602	NC_017516	A	8	8	29666	29673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017516	GGCTTG	2	12	29760	29771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
604	NC_017516	A	7	7	29775	29781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017516	CTG	3	9	29829	29837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017516	A	11	11	29873	29883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017516	CTCG	2	8	29891	29898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
608	NC_017516	GTG	2	6	29951	29956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852261
609	NC_017516	CGG	2	6	29986	29991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852261
610	NC_017516	A	6	6	30023	30028	100 %	0 %	0 %	0 %	385852261
611	NC_017516	A	6	6	30047	30052	100 %	0 %	0 %	0 %	385852261
612	NC_017516	TAA	2	6	30073	30078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852261
613	NC_017516	GC	3	6	30132	30137	0 %	0 %	50 %	50 %	385852261
614	NC_017516	CGA	2	6	30181	30186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852261
615	NC_017516	GCG	2	6	30233	30238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852261
616	NC_017516	ATC	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852261
617	NC_017516	CG	3	6	30301	30306	0 %	0 %	50 %	50 %	385852261
618	NC_017516	CAG	2	6	30335	30340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852261
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620	NC_017516	CGG	2	6	30368	30373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852261
621	NC_017516	TTG	2	6	30434	30439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852261
622	NC_017516	TAG	2	6	30443	30448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852261
623	NC_017516	GCC	2	6	30466	30471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017516	CGGG	2	8	30505	30512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
625	NC_017516	T	6	6	30527	30532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017516	TCG	2	6	30721	30726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017516	TCG	2	6	30951	30956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852262
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629	NC_017516	GCG	2	6	31132	31137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852262
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