MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 48275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017516	GGC	2	6	235195	235200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
5002	NC_017516	AATCAG	2	12	235201	235212	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385852431
5003	NC_017516	TGG	2	6	235284	235289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852431
5004	NC_017516	CGG	2	6	235296	235301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
5005	NC_017516	AAT	2	6	235321	235326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852431
5006	NC_017516	GAA	2	6	235369	235374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852431
5007	NC_017516	GCC	2	6	235418	235423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5008	NC_017516	CAC	2	6	235429	235434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852431
5009	NC_017516	CAG	2	6	235444	235449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
5010	NC_017516	CGC	2	6	235462	235467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5011	NC_017516	ACAAT	2	10	235545	235554	60 %	20 %	0 %	20 %	385852431
5012	NC_017516	CAG	2	6	235639	235644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
5013	NC_017516	GCC	2	6	235672	235677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5014	NC_017516	GCC	2	6	235684	235689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5015	NC_017516	CGG	2	6	235743	235748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
5016	NC_017516	GCG	2	6	235758	235763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852431
5017	NC_017516	TGCCA	2	10	235772	235781	20 %	20 %	20 %	40 %	385852431
5018	NC_017516	CTT	2	6	235848	235853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852431
5019	NC_017516	AC	3	6	235863	235868	50 %	0 %	0 %	50 %	385852431
5020	NC_017516	CGC	2	6	235881	235886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5021	NC_017516	CAG	2	6	235921	235926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852431
5022	NC_017516	GCC	2	6	235945	235950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5023	NC_017516	GCC	2	6	236138	236143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852431
5024	NC_017516	T	7	7	236240	236246	0 %	100 %	0 %	0 %	385852431
5025	NC_017516	GTT	2	6	236281	236286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017516	TGCC	2	8	236402	236409	0 %	25 %	25 %	50 %	385852432
5027	NC_017516	AGT	2	6	236413	236418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852432
5028	NC_017516	T	6	6	236429	236434	0 %	100 %	0 %	0 %	385852432
5029	NC_017516	CAGA	2	8	236469	236476	50 %	0 %	25 %	25 %	385852432
5030	NC_017516	CTT	2	6	236561	236566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852432
5031	NC_017516	GGC	2	6	236591	236596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852432
5032	NC_017516	GCG	2	6	236628	236633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852432
5033	NC_017516	TCAATT	2	12	236711	236722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385852432
5034	NC_017516	CGC	2	6	236778	236783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852432
5035	NC_017516	TTG	2	6	236973	236978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385852432
5036	NC_017516	GCC	2	6	236992	236997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852432
5037	NC_017516	TGC	2	6	237011	237016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852432
5038	NC_017516	CAA	2	6	237060	237065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852432
5039	NC_017516	TCG	2	6	237070	237075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852432
5040	NC_017516	CTT	2	6	237180	237185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385852433
5041	NC_017516	ATT	2	6	237194	237199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852433
5042	NC_017516	TGC	2	6	237213	237218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852433
5043	NC_017516	CGG	3	9	237249	237257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852433
5044	NC_017516	CCG	2	6	237281	237286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
5045	NC_017516	CAG	2	6	237304	237309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
5046	NC_017516	GCC	2	6	237322	237327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
5047	NC_017516	GGC	2	6	237329	237334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852433
5048	NC_017516	CCTG	2	8	237347	237354	0 %	25 %	25 %	50 %	385852433
5049	NC_017516	CGA	2	6	237502	237507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
5050	NC_017516	GCA	2	6	237606	237611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852433
5051	NC_017516	GCC	2	6	237625	237630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
5052	NC_017516	CCGC	2	8	237686	237693	0 %	0 %	25 %	75 %	385852433
5053	NC_017516	CA	3	6	237698	237703	50 %	0 %	0 %	50 %	385852433
5054	NC_017516	GCACG	2	10	237720	237729	20 %	0 %	40 %	40 %	385852433
5055	NC_017516	GCGG	2	8	237754	237761	0 %	0 %	75 %	25 %	385852433
5056	NC_017516	TCG	2	6	237896	237901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852433
5057	NC_017516	CGC	2	6	237922	237927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852433
5058	NC_017516	CAA	2	6	238055	238060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852434
5059	NC_017516	CGC	2	6	238077	238082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
5060	NC_017516	CAG	2	6	238083	238088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852434
5061	NC_017516	CGG	2	6	238092	238097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
5062	NC_017516	GCC	2	6	238149	238154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
5063	NC_017516	GCGAA	2	10	238157	238166	40 %	0 %	40 %	20 %	385852434
5064	NC_017516	AC	3	6	238172	238177	50 %	0 %	0 %	50 %	385852434
5065	NC_017516	GCC	2	6	238188	238193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
5066	NC_017516	ACCG	2	8	238197	238204	25 %	0 %	25 %	50 %	385852434
5067	NC_017516	CGGCA	2	10	238227	238236	20 %	0 %	40 %	40 %	385852434
5068	NC_017516	CGG	2	6	238237	238242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
5069	NC_017516	GCC	2	6	238266	238271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
5070	NC_017516	CAT	2	6	238299	238304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852434
5071	NC_017516	GGC	2	6	238331	238336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
5072	NC_017516	AGC	2	6	238368	238373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852434
5073	NC_017516	CGC	2	6	238400	238405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852434
5074	NC_017516	CCA	2	6	238424	238429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852434
5075	NC_017516	CGG	2	6	238451	238456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852434
5076	NC_017516	CA	3	6	238465	238470	50 %	0 %	0 %	50 %	385852434
5077	NC_017516	ACC	2	6	238543	238548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852434
5078	NC_017516	TGC	2	6	238567	238572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852434
5079	NC_017516	TGT	2	6	238684	238689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017516	GCG	2	6	238727	238732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017516	TCT	2	6	238744	238749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017516	TGC	2	6	238751	238756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_017516	ATC	2	6	238757	238762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017516	TGC	2	6	238782	238787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017516	GAC	2	6	238808	238813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017516	CTG	2	6	238893	238898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5087	NC_017516	AAC	2	6	238915	238920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
5088	NC_017516	CCG	2	6	238924	238929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5089	NC_017516	GCC	2	6	238937	238942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5090	NC_017516	GGCG	2	8	238961	238968	0 %	0 %	75 %	25 %	385852435
5091	NC_017516	CG	3	6	238984	238989	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
5092	NC_017516	CGCAT	2	10	239001	239010	20 %	20 %	20 %	40 %	385852435
5093	NC_017516	CAA	2	6	239066	239071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
5094	NC_017516	GCC	2	6	239073	239078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5095	NC_017516	GAT	2	6	239105	239110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852435
5096	NC_017516	CAC	2	6	239178	239183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385852435
5097	NC_017516	CGG	2	6	239222	239227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852435
5098	NC_017516	TCA	2	6	239242	239247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
5099	NC_017516	GAA	2	6	239277	239282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
5100	NC_017516	ATC	2	6	239283	239288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
5101	NC_017516	GC	3	6	239339	239344	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
5102	NC_017516	GC	3	6	239356	239361	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
5103	NC_017516	CA	3	6	239370	239375	50 %	0 %	0 %	50 %	385852435
5104	NC_017516	CGC	2	6	239376	239381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5105	NC_017516	TGC	2	6	239470	239475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5106	NC_017516	AAC	2	6	239478	239483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
5107	NC_017516	CAA	2	6	239549	239554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
5108	NC_017516	GCA	2	6	239595	239600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5109	NC_017516	CGA	3	9	239615	239623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5110	NC_017516	GAA	2	6	239679	239684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
5111	NC_017516	GCC	3	9	239745	239753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5112	NC_017516	ACG	2	6	239773	239778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5113	NC_017516	CTA	2	6	239831	239836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
5114	NC_017516	GAA	2	6	239856	239861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
5115	NC_017516	CGG	2	6	240005	240010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852435
5116	NC_017516	CGA	3	9	240077	240085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5117	NC_017516	TCA	2	6	240103	240108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
5118	NC_017516	CG	3	6	240118	240123	0 %	0 %	50 %	50 %	385852435
5119	NC_017516	GCC	2	6	240192	240197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5120	NC_017516	GCC	2	6	240216	240221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5121	NC_017516	GTC	2	6	240225	240230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5122	NC_017516	CTGTCC	2	12	240276	240287	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385852435
5123	NC_017516	ATC	2	6	240291	240296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852435
5124	NC_017516	CGC	2	6	240392	240397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5125	NC_017516	CCTG	2	8	240434	240441	0 %	25 %	25 %	50 %	385852435
5126	NC_017516	GAC	2	6	240453	240458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5127	NC_017516	GCC	2	6	240492	240497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5128	NC_017516	CAGG	2	8	240516	240523	25 %	0 %	50 %	25 %	385852435
5129	NC_017516	CGC	2	6	240560	240565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
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5131	NC_017516	CGG	2	6	240647	240652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852435
5132	NC_017516	GAA	3	9	240657	240665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852435
5133	NC_017516	CGC	2	6	240666	240671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852435
5134	NC_017516	CAA	2	6	240726	240731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385852435
5135	NC_017516	TGC	2	6	240736	240741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5136	NC_017516	TCG	2	6	240775	240780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852435
5137	NC_017516	GCCT	2	8	240824	240831	0 %	25 %	25 %	50 %	385852435
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5141	NC_017516	CGCCA	2	10	240939	240948	20 %	0 %	20 %	60 %	385852435
5142	NC_017516	GA	3	6	241128	241133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_017516	AC	3	6	241234	241239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5144	NC_017516	A	6	6	241354	241359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_017516	GTA	2	6	241361	241366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_017516	CCG	3	9	241417	241425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5147	NC_017516	CCG	2	6	241512	241517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5148	NC_017516	GACG	2	8	241528	241535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5149	NC_017516	ACCC	2	8	241555	241562	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5150	NC_017516	GAA	2	6	241587	241592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_017516	TCC	2	6	241627	241632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385852436
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5153	NC_017516	ATTGA	2	10	241744	241753	40 %	40 %	20 %	0 %	385852436
5154	NC_017516	CGG	2	6	241767	241772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852436
5155	NC_017516	AAG	2	6	241868	241873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852436
5156	NC_017516	GCG	2	6	241883	241888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852436
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5158	NC_017516	GTG	2	6	242023	242028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385852436
5159	NC_017516	TCG	2	6	242057	242062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852436
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5162	NC_017516	ATC	2	6	242158	242163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_017516	TGG	2	6	242219	242224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_017516	A	6	6	242248	242253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_017516	ATT	2	6	242274	242279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5166	NC_017516	TGT	2	6	242329	242334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5167	NC_017516	AATT	2	8	242356	242363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5168	NC_017516	GTT	2	6	242364	242369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_017516	TTC	2	6	242419	242424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5170	NC_017516	AAT	2	6	242471	242476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5171	NC_017516	CTCTT	2	10	242482	242491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5172	NC_017516	ATA	2	6	242501	242506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5173	NC_017516	TCA	2	6	242510	242515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5174	NC_017516	ATA	2	6	242537	242542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5175	NC_017516	ATTTT	2	10	242543	242552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5176	NC_017516	AAGT	2	8	242562	242569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5177	NC_017516	CCA	2	6	242598	242603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5186	NC_017516	GTC	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5187	NC_017516	AAC	2	6	243273	243278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5188	NC_017516	ATT	2	6	243356	243361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5189	NC_017516	CAG	2	6	243384	243389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5191	NC_017516	ATT	2	6	243678	243683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852438
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5199	NC_017516	T	6	6	243992	243997	0 %	100 %	0 %	0 %	385852438
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5228	NC_017516	TGA	2	6	245190	245195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385852439
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5232	NC_017516	TCGGC	2	10	245399	245408	0 %	20 %	40 %	40 %	385852439
5233	NC_017516	TAA	2	6	245427	245432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385852439
5234	NC_017516	TC	3	6	245451	245456	0 %	50 %	0 %	50 %	385852439
5235	NC_017516	GGCA	2	8	245479	245486	25 %	0 %	50 %	25 %	385852439
5236	NC_017516	CAG	2	6	245496	245501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852439
5237	NC_017516	TGC	2	6	245511	245516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385852439
5238	NC_017516	TC	3	6	245531	245536	0 %	50 %	0 %	50 %	385852439
5239	NC_017516	TTA	2	6	245579	245584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385852439
5240	NC_017516	CGA	2	6	245586	245591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385852439
5241	NC_017516	A	7	7	245685	245691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_017516	CAG	2	6	245700	245705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_017516	TA	4	8	245750	245757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_017516	CGA	2	6	245784	245789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_017516	TATT	2	8	245980	245987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_017516	T	7	7	245991	245997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_017516	ATT	2	6	246054	246059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5367	NC_017516	A	6	6	251844	251849	100 %	0 %	0 %	0 %	385852447
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5371	NC_017516	ATTG	2	8	252113	252120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_017516	GAC	2	6	252160	252165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_017516	ATT	2	6	252177	252182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_017516	GAAC	2	8	252203	252210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5375	NC_017516	AAATCG	2	12	252219	252230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385852448
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5443	NC_017516	GT	3	6	255837	255842	0 %	50 %	50 %	0 %	385852450
5444	NC_017516	GAA	2	6	255870	255875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852450
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5487	NC_017516	AGGT	2	8	257859	257866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5488	NC_017516	CGC	2	6	257958	257963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385852454
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5491	NC_017516	CGG	2	6	258041	258046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385852454
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5493	NC_017516	GAA	2	6	258171	258176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385852454
5494	NC_017516	ATC	2	6	258177	258182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852454
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5496	NC_017516	A	8	8	258267	258274	100 %	0 %	0 %	0 %	385852454
5497	NC_017516	A	6	6	258279	258284	100 %	0 %	0 %	0 %	385852454
5498	NC_017516	GTAA	2	8	258303	258310	50 %	25 %	25 %	0 %	385852454
5499	NC_017516	CTGA	2	8	258384	258391	25 %	25 %	25 %	25 %	385852454
5500	NC_017516	ATC	2	6	258411	258416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385852454

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