MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017515	ATTACT	2	12	163815	163826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385850424
3502	NC_017515	TTA	2	6	163914	163919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850425
3503	NC_017515	A	6	6	163949	163954	100 %	0 %	0 %	0 %	385850425
3504	NC_017515	CG	3	6	163967	163972	0 %	0 %	50 %	50 %	385850425
3505	NC_017515	CGT	3	9	164078	164086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850425
3506	NC_017515	TTTGG	2	10	164126	164135	0 %	60 %	40 %	0 %	385850425
3507	NC_017515	GTT	2	6	164183	164188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850425
3508	NC_017515	TAA	2	6	164278	164283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850426
3509	NC_017515	AGC	2	6	164284	164289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850426
3510	NC_017515	CTT	2	6	164301	164306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850426
3511	NC_017515	AGA	2	6	164341	164346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850426
3512	NC_017515	AT	3	6	164350	164355	50 %	50 %	0 %	0 %	385850426
3513	NC_017515	GTC	2	6	164421	164426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850426
3514	NC_017515	TGG	2	6	164581	164586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850426
3515	NC_017515	GTT	2	6	164590	164595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850426
3516	NC_017515	GGA	2	6	164613	164618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017515	A	6	6	164639	164644	100 %	0 %	0 %	0 %	385850427
3518	NC_017515	TTA	2	6	164698	164703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850427
3519	NC_017515	ATG	2	6	164761	164766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850427
3520	NC_017515	TTG	2	6	164779	164784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850427
3521	NC_017515	CAG	2	6	164792	164797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850427
3522	NC_017515	GTT	2	6	165042	165047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850427
3523	NC_017515	TGC	2	6	165056	165061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850427
3524	NC_017515	TAAAGG	2	12	165095	165106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385850427
3525	NC_017515	AGT	2	6	165125	165130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850427
3526	NC_017515	AAG	2	6	165139	165144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850427
3527	NC_017515	A	6	6	165150	165155	100 %	0 %	0 %	0 %	385850427
3528	NC_017515	CGT	2	6	165196	165201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850428
3529	NC_017515	TG	3	6	165250	165255	0 %	50 %	50 %	0 %	385850428
3530	NC_017515	AAT	2	6	165265	165270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850428
3531	NC_017515	AGC	2	6	165378	165383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850428
3532	NC_017515	AGC	2	6	165420	165425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850428
3533	NC_017515	GCT	2	6	165496	165501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850428
3534	NC_017515	GAA	2	6	165562	165567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850429
3535	NC_017515	AGT	2	6	165618	165623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850429
3536	NC_017515	ACTG	2	8	165654	165661	25 %	25 %	25 %	25 %	385850429
3537	NC_017515	TTG	2	6	165662	165667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850429
3538	NC_017515	GTGATG	2	12	165668	165679	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385850429
3539	NC_017515	AAG	2	6	165710	165715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850429
3540	NC_017515	TCA	2	6	165792	165797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850429
3541	NC_017515	CTA	2	6	165821	165826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850429
3542	NC_017515	ATA	2	6	165911	165916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850429
3543	NC_017515	CTA	2	6	165938	165943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850429
3544	NC_017515	ATA	2	6	165950	165955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850429
3545	NC_017515	CTG	2	6	165998	166003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850429
3546	NC_017515	A	7	7	166065	166071	100 %	0 %	0 %	0 %	385850430
3547	NC_017515	CGT	2	6	166148	166153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850430
3548	NC_017515	TAA	2	6	166204	166209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850430
3549	NC_017515	TTG	2	6	166220	166225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850430
3550	NC_017515	CTG	2	6	166264	166269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850431
3551	NC_017515	GTC	2	6	166288	166293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850431
3552	NC_017515	GTGGTC	2	12	166333	166344	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385850431
3553	NC_017515	TGG	2	6	166367	166372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850431
3554	NC_017515	GGT	2	6	166395	166400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850431
3555	NC_017515	ACG	2	6	166415	166420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850431
3556	NC_017515	AAGC	2	8	166527	166534	50 %	0 %	25 %	25 %	385850431
3557	NC_017515	GCT	2	6	166638	166643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850431
3558	NC_017515	TGG	2	6	166655	166660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850431
3559	NC_017515	CAA	2	6	166697	166702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850432
3560	NC_017515	TCA	2	6	166706	166711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850432
3561	NC_017515	ATTG	2	8	166765	166772	25 %	50 %	25 %	0 %	385850432
3562	NC_017515	AT	3	6	166930	166935	50 %	50 %	0 %	0 %	385850432
3563	NC_017515	TAT	2	6	166945	166950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850432
3564	NC_017515	CAT	2	6	166977	166982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850432
3565	NC_017515	A	7	7	166993	166999	100 %	0 %	0 %	0 %	385850432
3566	NC_017515	TTC	2	6	167064	167069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850432
3567	NC_017515	TTG	2	6	167109	167114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850432
3568	NC_017515	GTT	2	6	167326	167331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850432
3569	NC_017515	TTA	3	9	167348	167356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850432
3570	NC_017515	ATTT	2	8	167357	167364	25 %	75 %	0 %	0 %	385850432
3571	NC_017515	TAT	2	6	167509	167514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850432
3572	NC_017515	GGTT	2	8	167537	167544	0 %	50 %	50 %	0 %	385850432
3573	NC_017515	ACA	2	6	167593	167598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850432
3574	NC_017515	A	6	6	167701	167706	100 %	0 %	0 %	0 %	385850432
3575	NC_017515	GTG	2	6	167709	167714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850432
3576	NC_017515	TTG	2	6	167879	167884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850432
3577	NC_017515	GTT	2	6	167891	167896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850432
3578	NC_017515	AAAT	2	8	167919	167926	75 %	25 %	0 %	0 %	385850432
3579	NC_017515	GAAAT	2	10	167972	167981	60 %	20 %	20 %	0 %	385850432
3580	NC_017515	AGA	2	6	168011	168016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850433
3581	NC_017515	AAAAT	2	10	168234	168243	80 %	20 %	0 %	0 %	385850434
3582	NC_017515	ATT	2	6	168287	168292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850434
3583	NC_017515	AC	3	6	168393	168398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_017515	A	6	6	168414	168419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017515	TAA	2	6	168450	168455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850435
3586	NC_017515	CA	3	6	168458	168463	50 %	0 %	0 %	50 %	385850435
3587	NC_017515	CGT	2	6	168628	168633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850435
3588	NC_017515	GCT	2	6	168671	168676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850435
3589	NC_017515	TCG	2	6	168693	168698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850435
3590	NC_017515	AAAT	2	8	168778	168785	75 %	25 %	0 %	0 %	385850435
3591	NC_017515	TTA	2	6	168797	168802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017515	A	6	6	168836	168841	100 %	0 %	0 %	0 %	385850436
3593	NC_017515	GTGA	2	8	168854	168861	25 %	25 %	50 %	0 %	385850436
3594	NC_017515	CAA	2	6	168889	168894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850436
3595	NC_017515	CAT	2	6	168898	168903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850436
3596	NC_017515	GGC	2	6	168950	168955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850436
3597	NC_017515	GCA	2	6	168992	168997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850436
3598	NC_017515	GCA	2	6	169004	169009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850436
3599	NC_017515	AGC	2	6	169012	169017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850436
3600	NC_017515	AGGTCC	2	12	169069	169080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385850436
3601	NC_017515	A	6	6	169181	169186	100 %	0 %	0 %	0 %	385850436
3602	NC_017515	CGT	2	6	169187	169192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850436
3603	NC_017515	GC	3	6	169287	169292	0 %	0 %	50 %	50 %	385850437
3604	NC_017515	A	7	7	169346	169352	100 %	0 %	0 %	0 %	385850437
3605	NC_017515	A	6	6	169393	169398	100 %	0 %	0 %	0 %	385850437
3606	NC_017515	CCG	2	6	169400	169405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850437
3607	NC_017515	CGT	2	6	169434	169439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850437
3608	NC_017515	TCG	2	6	169457	169462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850437
3609	NC_017515	CTT	2	6	169615	169620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850437
3610	NC_017515	TGT	2	6	169640	169645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850437
3611	NC_017515	A	6	6	169665	169670	100 %	0 %	0 %	0 %	385850437
3612	NC_017515	AAG	2	6	169684	169689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850437
3613	NC_017515	GGGTT	2	10	169721	169730	0 %	40 %	60 %	0 %	385850437
3614	NC_017515	GT	3	6	169756	169761	0 %	50 %	50 %	0 %	385850437
3615	NC_017515	TGG	2	6	169813	169818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850437
3616	NC_017515	AAT	2	6	169834	169839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850437
3617	NC_017515	TGT	2	6	170094	170099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850438
3618	NC_017515	GAA	2	6	170169	170174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850438
3619	NC_017515	TCAGGT	2	12	170176	170187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385850438
3620	NC_017515	ATG	2	6	170219	170224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850438
3621	NC_017515	GTCAT	2	10	170243	170252	20 %	40 %	20 %	20 %	385850438
3622	NC_017515	GTC	2	6	170330	170335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850438
3623	NC_017515	TGA	2	6	170346	170351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850438
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3626	NC_017515	GGA	2	6	170577	170582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385850438
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3854	NC_017515	TTTCC	2	10	182406	182415	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3855	NC_017515	GTC	2	6	182451	182456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3861	NC_017515	GCT	3	9	183001	183009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850450
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3863	NC_017515	GACG	2	8	183140	183147	25 %	0 %	50 %	25 %	385850450
3864	NC_017515	GCC	3	9	183149	183157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850450
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3977	NC_017515	CGG	2	6	188113	188118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850453
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3985	NC_017515	GTCC	2	8	188588	188595	0 %	25 %	25 %	50 %	385850454
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3987	NC_017515	CGG	2	6	188609	188614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850454
3988	NC_017515	GGC	2	6	188622	188627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850454
3989	NC_017515	CAGG	2	8	188682	188689	25 %	0 %	50 %	25 %	385850454
3990	NC_017515	GGAT	2	8	188881	188888	25 %	25 %	50 %	0 %	385850454
3991	NC_017515	GAC	2	6	188889	188894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850454
3992	NC_017515	CGG	2	6	188907	188912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850454
3993	NC_017515	TCAA	2	8	188935	188942	50 %	25 %	0 %	25 %	385850454
3994	NC_017515	TCA	2	6	188957	188962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850454
3995	NC_017515	GGGC	2	8	189023	189030	0 %	0 %	75 %	25 %	385850454
3996	NC_017515	CGG	2	6	189056	189061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850454
3997	NC_017515	GCC	2	6	189072	189077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850454
3998	NC_017515	GTTC	2	8	189110	189117	0 %	50 %	25 %	25 %	385850454
3999	NC_017515	CGGC	2	8	189121	189128	0 %	0 %	50 %	50 %	385850454
4000	NC_017515	CG	3	6	189134	189139	0 %	0 %	50 %	50 %	385850454

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