MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017515	CGAAAC	2	12	138513	138524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385850394
3003	NC_017515	CTG	2	6	138664	138669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3004	NC_017515	CAT	2	6	138693	138698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850394
3005	NC_017515	CGA	2	6	138726	138731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3006	NC_017515	CTG	2	6	138772	138777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3007	NC_017515	CGA	2	6	138798	138803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3008	NC_017515	GAA	2	6	138859	138864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850394
3009	NC_017515	A	6	6	138863	138868	100 %	0 %	0 %	0 %	385850394
3010	NC_017515	CTG	2	6	138937	138942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3011	NC_017515	AGT	2	6	138981	138986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850394
3012	NC_017515	ATC	2	6	139009	139014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850394
3013	NC_017515	TCG	2	6	139037	139042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3014	NC_017515	GAAA	2	8	139047	139054	75 %	0 %	25 %	0 %	385850394
3015	NC_017515	A	6	6	139058	139063	100 %	0 %	0 %	0 %	385850394
3016	NC_017515	CTG	2	6	139096	139101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3017	NC_017515	GGCG	2	8	139113	139120	0 %	0 %	75 %	25 %	385850394
3018	NC_017515	TGC	2	6	139136	139141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850394
3019	NC_017515	CTC	2	6	139202	139207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850394
3020	NC_017515	GTAC	2	8	139230	139237	25 %	25 %	25 %	25 %	385850394
3021	NC_017515	AGA	2	6	139245	139250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850394
3022	NC_017515	GCC	2	6	139256	139261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850394
3023	NC_017515	TTC	2	6	139270	139275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850394
3024	NC_017515	ACC	2	6	139306	139311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850394
3025	NC_017515	GAA	2	6	139336	139341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850394
3026	NC_017515	GAA	2	6	139411	139416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850394
3027	NC_017515	GGC	2	6	139441	139446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850394
3028	NC_017515	TCT	2	6	139471	139476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850394
3029	NC_017515	A	6	6	139574	139579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017515	T	7	7	139603	139609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017515	CT	3	6	139629	139634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_017515	ATG	2	6	139669	139674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017515	ATAA	2	8	139676	139683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017515	A	7	7	139704	139710	100 %	0 %	0 %	0 %	385850395
3035	NC_017515	GTT	2	6	139733	139738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850395
3036	NC_017515	AAGG	2	8	139769	139776	50 %	0 %	50 %	0 %	385850395
3037	NC_017515	T	6	6	139778	139783	0 %	100 %	0 %	0 %	385850395
3038	NC_017515	GGT	2	6	139819	139824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850395
3039	NC_017515	TTG	2	6	139875	139880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850395
3040	NC_017515	T	6	6	139931	139936	0 %	100 %	0 %	0 %	385850395
3041	NC_017515	GAAGG	2	10	139950	139959	40 %	0 %	60 %	0 %	385850395
3042	NC_017515	A	6	6	139971	139976	100 %	0 %	0 %	0 %	385850396
3043	NC_017515	TGT	2	6	139982	139987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850396
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3047	NC_017515	GTT	2	6	140097	140102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850396
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3049	NC_017515	C	6	6	140209	140214	0 %	0 %	0 %	100 %	385850396
3050	NC_017515	GGAG	2	8	140232	140239	25 %	0 %	75 %	0 %	385850396
3051	NC_017515	AG	4	8	140266	140273	50 %	0 %	50 %	0 %	385850396
3052	NC_017515	ATT	2	6	140280	140285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850396
3053	NC_017515	CAG	2	6	140289	140294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850396
3054	NC_017515	GGTC	2	8	140339	140346	0 %	25 %	50 %	25 %	385850396
3055	NC_017515	GAG	2	6	140397	140402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385850396
3056	NC_017515	A	8	8	140514	140521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3058	NC_017515	TGC	2	6	140730	140735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850397
3059	NC_017515	TGA	2	6	140810	140815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850397
3060	NC_017515	TTG	2	6	140836	140841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850397
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3062	NC_017515	GAA	2	6	140920	140925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850397
3063	NC_017515	CTG	3	9	140954	140962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850397
3064	NC_017515	GCTC	2	8	140998	141005	0 %	25 %	25 %	50 %	385850397
3065	NC_017515	TGA	2	6	141104	141109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850398
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3069	NC_017515	TCG	2	6	141316	141321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850398
3070	NC_017515	GCT	2	6	141336	141341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850398
3071	NC_017515	GTT	2	6	141372	141377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850398
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3074	NC_017515	GTACC	2	10	141521	141530	20 %	20 %	20 %	40 %	385850398
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3077	NC_017515	GCT	2	6	141766	141771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017515	TGG	2	6	141911	141916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_017515	GCT	2	6	142420	142425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850399
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3091	NC_017515	GAA	2	6	142447	142452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850399
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3093	NC_017515	T	6	6	142488	142493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017515	AGA	2	6	142533	142538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850400
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3102	NC_017515	AAG	2	6	142769	142774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850400
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3105	NC_017515	CTT	2	6	142898	142903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017515	CTT	2	6	142939	142944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_017515	ATTT	2	8	142970	142977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017515	AAAT	2	8	143002	143009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017515	TAT	2	6	143051	143056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017515	A	6	6	143102	143107	100 %	0 %	0 %	0 %	385850401
3111	NC_017515	GCAG	2	8	143239	143246	25 %	0 %	50 %	25 %	385850401
3112	NC_017515	GC	4	8	143380	143387	0 %	0 %	50 %	50 %	385850401
3113	NC_017515	AAG	2	6	143436	143441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850401
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3117	NC_017515	CCG	3	9	143689	143697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850401
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3123	NC_017515	ATG	2	6	144036	144041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850401
3124	NC_017515	AGA	2	6	144049	144054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850401
3125	NC_017515	GTT	2	6	144055	144060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850401
3126	NC_017515	GCCG	2	8	144164	144171	0 %	0 %	50 %	50 %	385850401
3127	NC_017515	GGC	2	6	144175	144180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850401
3128	NC_017515	ATG	2	6	144200	144205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850401
3129	NC_017515	TTC	2	6	144260	144265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850401
3130	NC_017515	CAA	2	6	144347	144352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850401
3131	NC_017515	GCC	2	6	144366	144371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850401
3132	NC_017515	TGC	2	6	144394	144399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850401
3133	NC_017515	CCG	2	6	144511	144516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850401
3134	NC_017515	CTGA	2	8	144536	144543	25 %	25 %	25 %	25 %	385850401
3135	NC_017515	TTC	2	6	144674	144679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850401
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3138	NC_017515	CCG	2	6	144934	144939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850401
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3141	NC_017515	GGT	2	6	145138	145143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850401
3142	NC_017515	ATG	2	6	145179	145184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850401
3143	NC_017515	CTTG	2	8	145233	145240	0 %	50 %	25 %	25 %	385850401
3144	NC_017515	CCGTTG	2	12	145281	145292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850401
3145	NC_017515	GGC	2	6	145322	145327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850401
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3148	NC_017515	TGG	2	6	145506	145511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850401
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3154	NC_017515	TAC	2	6	146152	146157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850401
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3159	NC_017515	CGA	2	6	146320	146325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850401
3160	NC_017515	A	6	6	146343	146348	100 %	0 %	0 %	0 %	385850401
3161	NC_017515	GCC	2	6	146406	146411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850401
3162	NC_017515	TTGGG	2	10	146552	146561	0 %	40 %	60 %	0 %	385850401
3163	NC_017515	AAGA	2	8	146663	146670	75 %	0 %	25 %	0 %	385850401
3164	NC_017515	GAA	2	6	146693	146698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850401
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3168	NC_017515	TGA	2	6	147115	147120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850401
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3230	NC_017515	GTTG	2	8	150340	150347	0 %	50 %	50 %	0 %	385850402
3231	NC_017515	ACG	2	6	150378	150383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850402
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3234	NC_017515	GAT	2	6	150502	150507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850402
3235	NC_017515	CAAA	2	8	150565	150572	75 %	0 %	0 %	25 %	385850402
3236	NC_017515	GAT	2	6	150575	150580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850402
3237	NC_017515	TGG	2	6	150600	150605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850402
3238	NC_017515	CGT	2	6	150620	150625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850402
3239	NC_017515	CTG	2	6	150644	150649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850402
3240	NC_017515	CGG	2	6	150832	150837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850402
3241	NC_017515	CG	3	6	150843	150848	0 %	0 %	50 %	50 %	385850402
3242	NC_017515	ACG	2	6	151020	151025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850402
3243	NC_017515	TCA	2	6	151188	151193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850402
3244	NC_017515	GGC	2	6	151282	151287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850402
3245	NC_017515	GAA	2	6	151304	151309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850402
3246	NC_017515	TCG	2	6	151479	151484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850402
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3331	NC_017515	CGAC	2	8	155433	155440	25 %	0 %	25 %	50 %	385850408
3332	NC_017515	TACT	2	8	155467	155474	25 %	50 %	0 %	25 %	385850408
3333	NC_017515	GCT	3	9	155516	155524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850408
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3352	NC_017515	A	6	6	156388	156393	100 %	0 %	0 %	0 %	385850409
3353	NC_017515	CTG	2	6	156426	156431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850409
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3359	NC_017515	ACC	2	6	156636	156641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385850409
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3362	NC_017515	GGC	2	6	156771	156776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850409
3363	NC_017515	TCT	2	6	156801	156806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850409
3364	NC_017515	A	6	6	156846	156851	100 %	0 %	0 %	0 %	385850410
3365	NC_017515	TGA	2	6	157095	157100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850410
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3491	NC_017515	GA	3	6	163367	163372	50 %	0 %	50 %	0 %	385850424
3492	NC_017515	GTT	2	6	163389	163394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850424
3493	NC_017515	A	6	6	163450	163455	100 %	0 %	0 %	0 %	385850424
3494	NC_017515	TGGGTG	2	12	163468	163479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850424
3495	NC_017515	A	6	6	163494	163499	100 %	0 %	0 %	0 %	385850424
3496	NC_017515	GTT	2	6	163551	163556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850424
3497	NC_017515	GGTT	2	8	163607	163614	0 %	50 %	50 %	0 %	385850424
3498	NC_017515	CGT	2	6	163629	163634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850424
3499	NC_017515	GTG	2	6	163699	163704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850424
3500	NC_017515	ATT	2	6	163761	163766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850424

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