MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017515	GCT	2	6	25028	25033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850307
502	NC_017515	GC	3	6	25070	25075	0 %	0 %	50 %	50 %	385850307
503	NC_017515	TGTT	2	8	25096	25103	0 %	75 %	25 %	0 %	385850307
504	NC_017515	TAA	2	6	25123	25128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850307
505	NC_017515	GTC	2	6	25251	25256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850307
506	NC_017515	GCA	2	6	25260	25265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850307
507	NC_017515	TGC	2	6	25349	25354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850307
508	NC_017515	AGGGC	2	10	25364	25373	20 %	0 %	60 %	20 %	385850307
509	NC_017515	CAAA	2	8	25412	25419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017515	CGG	2	6	25507	25512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017515	TATT	2	8	25513	25520	25 %	75 %	0 %	0 %	385850308
512	NC_017515	ACG	2	6	25619	25624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850308
513	NC_017515	GGCGC	2	10	25644	25653	0 %	0 %	60 %	40 %	385850308
514	NC_017515	GCC	2	6	25720	25725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
515	NC_017515	GAC	3	9	25789	25797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850308
516	NC_017515	GC	3	6	25941	25946	0 %	0 %	50 %	50 %	385850308
517	NC_017515	TGC	2	6	26006	26011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850308
518	NC_017515	TTC	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850308
519	NC_017515	TCT	2	6	26057	26062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850308
520	NC_017515	AAACC	2	10	26067	26076	60 %	0 %	0 %	40 %	385850308
521	NC_017515	GCT	2	6	26188	26193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850308
522	NC_017515	CG	3	6	26196	26201	0 %	0 %	50 %	50 %	385850308
523	NC_017515	CGGTAT	2	12	26348	26359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385850308
524	NC_017515	CCAA	2	8	26403	26410	50 %	0 %	0 %	50 %	385850308
525	NC_017515	GCG	2	6	26426	26431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850308
526	NC_017515	GCC	2	6	26521	26526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
527	NC_017515	CCG	2	6	26541	26546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
528	NC_017515	CG	4	8	26557	26564	0 %	0 %	50 %	50 %	385850308
529	NC_017515	GCT	2	6	26565	26570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850308
530	NC_017515	GCGA	2	8	26621	26628	25 %	0 %	50 %	25 %	385850308
531	NC_017515	GGCA	2	8	26656	26663	25 %	0 %	50 %	25 %	385850308
532	NC_017515	CAG	2	6	26704	26709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850308
533	NC_017515	CGG	2	6	26760	26765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850308
534	NC_017515	TCG	2	6	26792	26797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850308
535	NC_017515	TCA	2	6	26843	26848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850308
536	NC_017515	CTT	2	6	26904	26909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385850308
537	NC_017515	GCC	2	6	26929	26934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
538	NC_017515	TGAT	2	8	26951	26958	25 %	50 %	25 %	0 %	385850308
539	NC_017515	TG	3	6	26961	26966	0 %	50 %	50 %	0 %	385850308
540	NC_017515	GAT	2	6	27046	27051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850308
541	NC_017515	CCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
542	NC_017515	CGC	2	6	27114	27119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
543	NC_017515	GT	3	6	27121	27126	0 %	50 %	50 %	0 %	385850308
544	NC_017515	CCGATG	2	12	27143	27154	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385850308
545	NC_017515	CCG	2	6	27155	27160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850308
546	NC_017515	TCC	2	6	27185	27190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850308
547	NC_017515	TGA	2	6	27256	27261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850308
548	NC_017515	CGA	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850308
549	NC_017515	CGA	2	6	27339	27344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850308
550	NC_017515	A	8	8	27378	27385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017515	GGCTTG	2	12	27472	27483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_017515	A	7	7	27487	27493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017515	CTG	3	9	27541	27549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017515	A	11	11	27585	27595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017515	CTCG	2	8	27603	27610	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
556	NC_017515	GTG	2	6	27663	27668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850309
557	NC_017515	CGG	2	6	27698	27703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850309
558	NC_017515	A	6	6	27735	27740	100 %	0 %	0 %	0 %	385850309
559	NC_017515	A	6	6	27759	27764	100 %	0 %	0 %	0 %	385850309
560	NC_017515	TAA	2	6	27785	27790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850309
561	NC_017515	GC	3	6	27844	27849	0 %	0 %	50 %	50 %	385850309
562	NC_017515	CGA	2	6	27893	27898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850309
563	NC_017515	GCG	2	6	27945	27950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850309
564	NC_017515	ATC	2	6	27963	27968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850309
565	NC_017515	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	385850309
566	NC_017515	CAG	2	6	28047	28052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850309
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569	NC_017515	TTG	2	6	28146	28151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850309
570	NC_017515	TAG	2	6	28155	28160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850309
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573	NC_017515	T	6	6	28239	28244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017515	TCG	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017515	TCG	2	6	28663	28668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850310
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589	NC_017515	GGCA	2	8	29382	29389	25 %	0 %	50 %	25 %	385850310
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597	NC_017515	CCGG	2	8	29771	29778	0 %	0 %	50 %	50 %	385850310
598	NC_017515	TGA	2	6	29789	29794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850310
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600	NC_017515	GGC	3	9	29853	29861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850310
601	NC_017515	GCG	2	6	29875	29880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850310
602	NC_017515	T	6	6	29892	29897	0 %	100 %	0 %	0 %	385850310
603	NC_017515	TAA	2	6	29922	29927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017515	GCG	2	6	29943	29948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017515	CCG	2	6	30009	30014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017515	CG	3	6	30013	30018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_017515	ATA	2	6	30074	30079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017515	TAT	2	6	30080	30085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017515	TCA	2	6	30086	30091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017515	GTTC	2	8	30097	30104	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
611	NC_017515	T	6	6	30122	30127	0 %	100 %	0 %	0 %	385850311
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620	NC_017515	T	7	7	30514	30520	0 %	100 %	0 %	0 %	385850311
621	NC_017515	GCCG	2	8	30560	30567	0 %	0 %	50 %	50 %	385850311
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631	NC_017515	GCC	2	6	31009	31014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850312
632	NC_017515	GCCG	2	8	31033	31040	0 %	0 %	50 %	50 %	385850312
633	NC_017515	ACA	2	6	31161	31166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850312
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635	NC_017515	CG	3	6	31311	31316	0 %	0 %	50 %	50 %	385850312
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637	NC_017515	TGG	2	6	31434	31439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850312
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652	NC_017515	GGC	2	6	32138	32143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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654	NC_017515	TCG	2	6	32236	32241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_017515	AT	3	6	32278	32283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_017515	CTG	2	6	32349	32354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_017515	AACC	2	8	32386	32393	50 %	0 %	0 %	50 %	385850313
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703	NC_017515	TTGT	2	8	34122	34129	0 %	75 %	25 %	0 %	385850315
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750	NC_017515	GCA	2	6	36028	36033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_017515	ATC	2	6	36106	36111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
754	NC_017515	ACG	2	6	36177	36182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_017515	A	6	6	36192	36197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
756	NC_017515	GGC	2	6	36216	36221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_017515	TGG	2	6	36320	36325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
758	NC_017515	CGG	2	6	36387	36392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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760	NC_017515	TGA	2	6	36441	36446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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