MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 48390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017515	A	6	6	235433	235438	100 %	0 %	0 %	0 %	385850488
5002	NC_017515	GAT	2	6	235456	235461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850488
5003	NC_017515	GGCA	2	8	235595	235602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_017515	A	6	6	235611	235616	100 %	0 %	0 %	0 %	385850489
5005	NC_017515	TCTT	2	8	235648	235655	0 %	75 %	0 %	25 %	385850489
5006	NC_017515	AATA	2	8	235682	235689	75 %	25 %	0 %	0 %	385850489
5007	NC_017515	TTGGG	2	10	235691	235700	0 %	40 %	60 %	0 %	385850489
5008	NC_017515	ATG	2	6	235743	235748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850489
5009	NC_017515	GT	3	6	235752	235757	0 %	50 %	50 %	0 %	385850489
5010	NC_017515	CAA	2	6	235774	235779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850489
5011	NC_017515	ATT	2	6	235836	235841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850489
5012	NC_017515	AGA	2	6	235891	235896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850489
5013	NC_017515	A	6	6	235923	235928	100 %	0 %	0 %	0 %	385850489
5014	NC_017515	GAA	2	6	235952	235957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850489
5015	NC_017515	GCC	2	6	235981	235986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850489
5016	NC_017515	GAA	2	6	236021	236026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850489
5017	NC_017515	AAC	2	6	236066	236071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850489
5018	NC_017515	GTT	2	6	236168	236173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850490
5019	NC_017515	AAC	2	6	236184	236189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850490
5020	NC_017515	TTAT	2	8	236194	236201	25 %	75 %	0 %	0 %	385850490
5021	NC_017515	GGA	2	6	236213	236218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385850490
5022	NC_017515	AAG	2	6	236260	236265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850490
5023	NC_017515	GA	3	6	236292	236297	50 %	0 %	50 %	0 %	385850490
5024	NC_017515	CAG	2	6	236322	236327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850490
5025	NC_017515	CGC	2	6	236346	236351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850490
5026	NC_017515	T	6	6	236369	236374	0 %	100 %	0 %	0 %	385850490
5027	NC_017515	T	7	7	236463	236469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017515	GGTA	2	8	236473	236480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017515	TCCG	2	8	236481	236488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_017515	GAC	2	6	236509	236514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017515	CCGC	2	8	236657	236664	0 %	0 %	25 %	75 %	385850491
5032	NC_017515	CGCC	2	8	236682	236689	0 %	0 %	25 %	75 %	385850491
5033	NC_017515	CG	3	6	236791	236796	0 %	0 %	50 %	50 %	385850491
5034	NC_017515	GAA	2	6	236797	236802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5035	NC_017515	GAA	2	6	236809	236814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5036	NC_017515	TAT	2	6	236968	236973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385850491
5037	NC_017515	CGC	2	6	237014	237019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5038	NC_017515	GTG	2	6	237031	237036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850491
5039	NC_017515	GGCG	2	8	237048	237055	0 %	0 %	75 %	25 %	385850491
5040	NC_017515	GATTT	2	10	237085	237094	20 %	60 %	20 %	0 %	385850491
5041	NC_017515	GCT	2	6	237183	237188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5042	NC_017515	CCG	2	6	237200	237205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5043	NC_017515	TGCGGC	2	12	237230	237241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385850491
5044	NC_017515	GTG	2	6	237330	237335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850491
5045	NC_017515	A	6	6	237472	237477	100 %	0 %	0 %	0 %	385850491
5046	NC_017515	ACA	2	6	237488	237493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850491
5047	NC_017515	GCGG	2	8	237505	237512	0 %	0 %	75 %	25 %	385850491
5048	NC_017515	GAT	2	6	237549	237554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850491
5049	NC_017515	CGG	2	6	237558	237563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850491
5050	NC_017515	GC	4	8	237570	237577	0 %	0 %	50 %	50 %	385850491
5051	NC_017515	GAA	2	6	237606	237611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5052	NC_017515	CAT	2	6	237627	237632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850491
5053	NC_017515	GCC	2	6	237661	237666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5054	NC_017515	GAC	2	6	237709	237714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5055	NC_017515	CAA	2	6	237715	237720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850491
5056	NC_017515	CGC	2	6	237789	237794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5057	NC_017515	GTT	2	6	237837	237842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850491
5058	NC_017515	GAA	2	6	237865	237870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5059	NC_017515	TGA	2	6	237918	237923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850491
5060	NC_017515	AGA	2	6	237924	237929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5061	NC_017515	CGCCCA	2	12	238026	238037	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385850491
5062	NC_017515	GTT	2	6	238062	238067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850491
5063	NC_017515	GCG	2	6	238075	238080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850491
5064	NC_017515	AAC	2	6	238090	238095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850491
5065	NC_017515	CCGA	2	8	238096	238103	25 %	0 %	25 %	50 %	385850491
5066	NC_017515	GCC	2	6	238142	238147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5067	NC_017515	GGC	2	6	238230	238235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850491
5068	NC_017515	TTG	2	6	238258	238263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385850491
5069	NC_017515	TCA	2	6	238271	238276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850491
5070	NC_017515	GC	3	6	238277	238282	0 %	0 %	50 %	50 %	385850491
5071	NC_017515	CGC	3	9	238317	238325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5072	NC_017515	GAC	2	6	238333	238338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5073	NC_017515	GCG	3	9	238349	238357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850491
5074	NC_017515	CGC	3	9	238494	238502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5075	NC_017515	CTG	2	6	238504	238509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5076	NC_017515	A	6	6	238531	238536	100 %	0 %	0 %	0 %	385850491
5077	NC_017515	AC	3	6	238544	238549	50 %	0 %	0 %	50 %	385850491
5078	NC_017515	CGT	2	6	238560	238565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5079	NC_017515	CGG	2	6	238581	238586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850491
5080	NC_017515	CGACCT	2	12	238608	238619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385850491
5081	NC_017515	ACG	2	6	238631	238636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5082	NC_017515	GCC	2	6	238667	238672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5083	NC_017515	CCG	2	6	238700	238705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5084	NC_017515	GCAG	2	8	238714	238721	25 %	0 %	50 %	25 %	385850491
5085	NC_017515	CCTGCG	2	12	238737	238748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385850491
5086	NC_017515	CGC	2	6	238785	238790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5087	NC_017515	CCG	2	6	238916	238921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5088	NC_017515	ATC	2	6	238951	238956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850491
5089	NC_017515	A	6	6	238967	238972	100 %	0 %	0 %	0 %	385850491
5090	NC_017515	CACC	2	8	238980	238987	25 %	0 %	0 %	75 %	385850491
5091	NC_017515	CG	4	8	239013	239020	0 %	0 %	50 %	50 %	385850491
5092	NC_017515	CGC	2	6	239127	239132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850491
5093	NC_017515	CGA	2	6	239247	239252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850491
5094	NC_017515	GAA	2	6	239305	239310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850491
5095	NC_017515	A	6	6	239328	239333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017515	ATG	2	6	239498	239503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017515	T	6	6	239507	239512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017515	ACAA	2	8	239531	239538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_017515	CCG	2	6	239558	239563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_017515	GGT	2	6	239701	239706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850492
5101	NC_017515	GTTT	2	8	239760	239767	0 %	75 %	25 %	0 %	385850492
5102	NC_017515	GT	3	6	239877	239882	0 %	50 %	50 %	0 %	385850492
5103	NC_017515	ATGGTG	2	12	239907	239918	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385850492
5104	NC_017515	GAT	2	6	239999	240004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850492
5105	NC_017515	AAT	2	6	240036	240041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850492
5106	NC_017515	CGA	2	6	240106	240111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850492
5107	NC_017515	TGC	2	6	240166	240171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850492
5108	NC_017515	TGC	2	6	240193	240198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850492
5109	NC_017515	TGC	2	6	240223	240228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850492
5110	NC_017515	TGG	2	6	240270	240275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850492
5111	NC_017515	TGG	2	6	240285	240290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850492
5112	NC_017515	GCG	2	6	240332	240337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850492
5113	NC_017515	TGC	2	6	240444	240449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850492
5114	NC_017515	GGTGC	2	10	240455	240464	0 %	20 %	60 %	20 %	385850492
5115	NC_017515	TCTT	2	8	240598	240605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_017515	CCG	2	6	240676	240681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_017515	CAG	2	6	240696	240701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017515	TCCCTT	2	12	240707	240718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_017515	CT	3	6	240784	240789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_017515	CTCC	2	8	240798	240805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5121	NC_017515	CCCG	2	8	240877	240884	0 %	0 %	25 %	75 %	385850493
5122	NC_017515	GCG	2	6	240919	240924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850493
5123	NC_017515	GC	3	6	241021	241026	0 %	0 %	50 %	50 %	385850493
5124	NC_017515	GCC	2	6	241033	241038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850493
5125	NC_017515	GCGG	2	8	241060	241067	0 %	0 %	75 %	25 %	385850493
5126	NC_017515	GCA	2	6	241153	241158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850493
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5129	NC_017515	GGT	2	6	241195	241200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385850493
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5132	NC_017515	TGGG	2	8	241325	241332	0 %	25 %	75 %	0 %	385850493
5133	NC_017515	TCGTT	2	10	241375	241384	0 %	60 %	20 %	20 %	385850493
5134	NC_017515	GCC	2	6	241386	241391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850493
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5231	NC_017515	CG	3	6	245578	245583	0 %	0 %	50 %	50 %	385850498
5232	NC_017515	CGCAT	2	10	245595	245604	20 %	20 %	20 %	40 %	385850498
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5241	NC_017515	GC	3	6	245950	245955	0 %	0 %	50 %	50 %	385850498
5242	NC_017515	CA	3	6	245964	245969	50 %	0 %	0 %	50 %	385850498
5243	NC_017515	TGC	2	6	246064	246069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850498
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5245	NC_017515	CAA	2	6	246143	246148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850498
5246	NC_017515	GGCG	2	8	246176	246183	0 %	0 %	75 %	25 %	385850498
5247	NC_017515	CGA	3	9	246209	246217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850498
5248	NC_017515	GAA	2	6	246273	246278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850498
5249	NC_017515	GCC	3	9	246339	246347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850498
5250	NC_017515	ACG	2	6	246367	246372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850498
5251	NC_017515	CTA	2	6	246425	246430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850498
5252	NC_017515	GAA	2	6	246450	246455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850498
5253	NC_017515	CGG	2	6	246599	246604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850498
5254	NC_017515	CGA	3	9	246671	246679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850498
5255	NC_017515	TCA	2	6	246697	246702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850498
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5257	NC_017515	GGCA	2	8	246781	246788	25 %	0 %	50 %	25 %	385850498
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5259	NC_017515	CGC	2	6	246821	246826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850498
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5270	NC_017515	GAA	3	9	247251	247259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850498
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5272	NC_017515	CAA	2	6	247320	247325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385850498
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5274	NC_017515	TCG	2	6	247369	247374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385850498
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5276	NC_017515	ATC	2	6	247473	247478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385850498
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5279	NC_017515	A	6	6	247777	247782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5280	NC_017515	AAC	2	6	247822	247827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5281	NC_017515	CCG	2	6	247845	247850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5282	NC_017515	GACG	2	8	247953	247960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5283	NC_017515	GAA	2	6	248014	248019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_017515	TCC	2	6	248054	248059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385850499
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5286	NC_017515	ATTGA	2	10	248171	248180	40 %	40 %	20 %	0 %	385850499
5287	NC_017515	CGG	2	6	248194	248199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385850499
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5289	NC_017515	AAG	2	6	248295	248300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385850499
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5297	NC_017515	ATT	2	6	248704	248709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5299	NC_017515	GTT	2	6	248794	248799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5300	NC_017515	TTC	2	6	248849	248854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5302	NC_017515	CTCTT	2	10	248912	248921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5303	NC_017515	ATA	2	6	248931	248936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5304	NC_017515	TCA	2	6	248940	248945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5305	NC_017515	ATA	2	6	248967	248972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5306	NC_017515	ATTTT	2	10	248973	248982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5307	NC_017515	AAGT	2	8	248992	248999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5308	NC_017515	CCA	2	6	249028	249033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5320	NC_017515	CA	3	6	249677	249682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5321	NC_017515	AAC	2	6	249816	249821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5322	NC_017515	ATT	2	6	249898	249903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5323	NC_017515	CAG	2	6	249926	249931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5324	NC_017515	CATTT	2	10	250040	250049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5352	NC_017515	AAAC	2	8	251372	251379	75 %	0 %	0 %	25 %	385850502
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5357	NC_017515	CGC	2	6	251526	251531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385850502
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5361	NC_017515	AATC	2	8	251615	251622	50 %	25 %	0 %	25 %	385850502
5362	NC_017515	TGA	2	6	251732	251737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850502
5363	NC_017515	TGA	2	6	251755	251760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385850502
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5366	NC_017515	TCGGC	2	10	251941	251950	0 %	20 %	40 %	40 %	385850502
5367	NC_017515	TAA	2	6	251969	251974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385850502
5368	NC_017515	TC	3	6	251993	251998	0 %	50 %	0 %	50 %	385850502
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5494	NC_017515	CGG	2	6	258077	258082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_017515	A	6	6	258127	258132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_017515	GTT	3	9	258133	258141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_017515	TA	3	6	258195	258200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5498	NC_017515	GCA	2	6	258268	258273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385850510
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