MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 47767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31003	NC_017514	CGC	2	6	1433221	1433226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342201
31004	NC_017514	GAA	2	6	1433241	1433246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385342201
31005	NC_017514	AGC	3	9	1433290	1433298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342201
31006	NC_017514	A	6	6	1433540	1433545	100 %	0 %	0 %	0 %	385342202
31007	NC_017514	A	7	7	1433550	1433556	100 %	0 %	0 %	0 %	385342202
31008	NC_017514	TGC	2	6	1433565	1433570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342202
31009	NC_017514	CGA	2	6	1433824	1433829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342202
31010	NC_017514	ACC	2	6	1433907	1433912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385342202
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31012	NC_017514	CGAC	2	8	1433993	1434000	25 %	0 %	25 %	50 %	385342203
31013	NC_017514	AAC	2	6	1434032	1434037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385342203
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31017	NC_017514	GC	3	6	1434204	1434209	0 %	0 %	50 %	50 %	385342203
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31039	NC_017514	GAA	2	6	1434979	1434984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31046	NC_017514	GAG	2	6	1435123	1435128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31047	NC_017514	CGG	2	6	1435184	1435189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342205
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31052	NC_017514	GCC	2	6	1435467	1435472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342205
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31055	NC_017514	CGG	2	6	1435653	1435658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31088	NC_017514	ATT	2	6	1436858	1436863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385342206
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31101	NC_017514	GCAC	2	8	1437516	1437523	25 %	0 %	25 %	50 %	385342207
31102	NC_017514	GC	3	6	1437544	1437549	0 %	0 %	50 %	50 %	385342207
31103	NC_017514	TTC	2	6	1437552	1437557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342207
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31107	NC_017514	GAC	2	6	1437720	1437725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342207
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31111	NC_017514	T	7	7	1437806	1437812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_017514	GGC	2	6	1437819	1437824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31113	NC_017514	CCT	2	6	1437899	1437904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31114	NC_017514	CAA	2	6	1437917	1437922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31115	NC_017514	CAT	2	6	1437929	1437934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342208
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31117	NC_017514	GCC	2	6	1438008	1438013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342208
31118	NC_017514	CGC	2	6	1438034	1438039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342208
31119	NC_017514	GCC	2	6	1438044	1438049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342208
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31124	NC_017514	TGA	2	6	1438225	1438230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385342208
31125	NC_017514	ATG	2	6	1438272	1438277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385342208
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31228	NC_017514	GC	3	6	1442897	1442902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31229	NC_017514	CCGGCA	2	12	1442979	1442990	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385342213
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31231	NC_017514	A	7	7	1443039	1443045	100 %	0 %	0 %	0 %	385342213
31232	NC_017514	GCC	2	6	1443080	1443085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31233	NC_017514	CCG	2	6	1443087	1443092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31234	NC_017514	GC	3	6	1443109	1443114	0 %	0 %	50 %	50 %	385342213
31235	NC_017514	GAC	2	6	1443170	1443175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342213
31236	NC_017514	CGC	2	6	1443193	1443198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31237	NC_017514	GCC	2	6	1443299	1443304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31238	NC_017514	CGC	2	6	1443322	1443327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31239	NC_017514	CTT	2	6	1443376	1443381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342213
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31241	NC_017514	CCCG	2	8	1443555	1443562	0 %	0 %	25 %	75 %	385342213
31242	NC_017514	CCG	2	6	1443574	1443579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31243	NC_017514	GCGCA	2	10	1443602	1443611	20 %	0 %	40 %	40 %	385342213
31244	NC_017514	GCC	2	6	1443639	1443644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
31245	NC_017514	TGC	2	6	1443645	1443650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342213
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31250	NC_017514	GCA	2	6	1443863	1443868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342213
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31254	NC_017514	A	6	6	1443998	1444003	100 %	0 %	0 %	0 %	385342213
31255	NC_017514	CGC	2	6	1444007	1444012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
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31258	NC_017514	CGA	2	6	1444123	1444128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342213
31259	NC_017514	TCG	2	6	1444203	1444208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342213
31260	NC_017514	GCC	2	6	1444268	1444273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
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31262	NC_017514	CCA	2	6	1444302	1444307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385342213
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31265	NC_017514	GC	3	6	1444344	1444349	0 %	0 %	50 %	50 %	385342213
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31276	NC_017514	CG	3	6	1444698	1444703	0 %	0 %	50 %	50 %	385342213
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31292	NC_017514	CGCCTG	2	12	1445354	1445365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385342213
31293	NC_017514	CGC	2	6	1445410	1445415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
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31300	NC_017514	CCG	2	6	1445640	1445645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342213
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31311	NC_017514	CGA	2	6	1446136	1446141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342213
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31313	NC_017514	ACC	2	6	1446279	1446284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385342213
31314	NC_017514	CAC	3	9	1446338	1446346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385342213
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31316	NC_017514	CCGC	2	8	1446410	1446417	0 %	0 %	25 %	75 %	385342213
31317	NC_017514	TCCG	2	8	1446425	1446432	0 %	25 %	25 %	50 %	385342213
31318	NC_017514	GGC	3	9	1446464	1446472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342213
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31328	NC_017514	CGG	2	6	1446879	1446884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342214
31329	NC_017514	A	6	6	1446901	1446906	100 %	0 %	0 %	0 %	385342214
31330	NC_017514	GCGCG	2	10	1446987	1446996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31331	NC_017514	CGC	2	6	1446997	1447002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31332	NC_017514	AAAC	2	8	1447020	1447027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31333	NC_017514	ATG	2	6	1447040	1447045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31334	NC_017514	CCCA	2	8	1447238	1447245	25 %	0 %	0 %	75 %	385342215
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31339	NC_017514	CG	3	6	1447542	1447547	0 %	0 %	50 %	50 %	385342215
31340	NC_017514	A	6	6	1447620	1447625	100 %	0 %	0 %	0 %	385342215
31341	NC_017514	CTT	2	6	1447850	1447855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342216
31342	NC_017514	CG	4	8	1447871	1447878	0 %	0 %	50 %	50 %	385342216
31343	NC_017514	T	6	6	1447925	1447930	0 %	100 %	0 %	0 %	385342216
31344	NC_017514	GCGG	2	8	1447937	1447944	0 %	0 %	75 %	25 %	385342216
31345	NC_017514	CCG	3	9	1447985	1447993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342216
31346	NC_017514	GCC	2	6	1448055	1448060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342216
31347	NC_017514	AGC	2	6	1448080	1448085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342216
31348	NC_017514	GTC	2	6	1448223	1448228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342216
31349	NC_017514	AC	3	6	1448264	1448269	50 %	0 %	0 %	50 %	385342216
31350	NC_017514	CG	3	6	1448411	1448416	0 %	0 %	50 %	50 %	385342216
31351	NC_017514	GGC	2	6	1448499	1448504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342216
31352	NC_017514	TGGA	2	8	1448566	1448573	25 %	25 %	50 %	0 %	385342216
31353	NC_017514	GCT	2	6	1448611	1448616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342216
31354	NC_017514	GC	4	8	1448681	1448688	0 %	0 %	50 %	50 %	385342216
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31359	NC_017514	GGA	2	6	1448901	1448906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385342216
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31367	NC_017514	CCG	2	6	1449282	1449287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342217
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31431	NC_017514	ACCCAA	2	12	1452768	1452779	50 %	0 %	0 %	50 %	385342219
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31433	NC_017514	TGC	2	6	1452815	1452820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342219
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31443	NC_017514	TCA	2	6	1453315	1453320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342220
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31456	NC_017514	T	6	6	1454064	1454069	0 %	100 %	0 %	0 %	385342221
31457	NC_017514	TA	3	6	1454077	1454082	50 %	50 %	0 %	0 %	385342221
31458	NC_017514	TGT	3	9	1454085	1454093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385342221
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31460	NC_017514	T	7	7	1454172	1454178	0 %	100 %	0 %	0 %	385342221
31461	NC_017514	GCA	3	9	1454233	1454241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31462	NC_017514	GTC	2	6	1454310	1454315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31463	NC_017514	TG	3	6	1454317	1454322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31464	NC_017514	CAT	2	6	1454329	1454334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31465	NC_017514	AGAAA	2	10	1454352	1454361	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31466	NC_017514	TCT	2	6	1454377	1454382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31467	NC_017514	ATT	2	6	1454431	1454436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385342222
31468	NC_017514	AGC	2	6	1454454	1454459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342222
31469	NC_017514	CGC	2	6	1454467	1454472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342222
31470	NC_017514	GC	4	8	1454523	1454530	0 %	0 %	50 %	50 %	385342222
31471	NC_017514	CTT	2	6	1454575	1454580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385342222
31472	NC_017514	TCAG	2	8	1454767	1454774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31473	NC_017514	GAT	2	6	1454820	1454825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385342223
31474	NC_017514	GCG	2	6	1454857	1454862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385342223
31475	NC_017514	CGT	2	6	1454888	1454893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342223
31476	NC_017514	TGG	2	6	1454975	1454980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385342223
31477	NC_017514	TCG	2	6	1455088	1455093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342223
31478	NC_017514	ACG	2	6	1455181	1455186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342223
31479	NC_017514	GC	3	6	1455291	1455296	0 %	0 %	50 %	50 %	385342223
31480	NC_017514	TGC	2	6	1455329	1455334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385342223
31481	NC_017514	CCTC	2	8	1455341	1455348	0 %	25 %	0 %	75 %	385342223
31482	NC_017514	TAACGT	2	12	1455386	1455397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385342223
31483	NC_017514	T	8	8	1455441	1455448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31484	NC_017514	GAAAA	2	10	1455458	1455467	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31485	NC_017514	CAG	2	6	1455516	1455521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342224
31486	NC_017514	GCCT	2	8	1455534	1455541	0 %	25 %	25 %	50 %	385342224
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31488	NC_017514	ACG	2	6	1455766	1455771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385342224
31489	NC_017514	GT	3	6	1455774	1455779	0 %	50 %	50 %	0 %	385342224
31490	NC_017514	TAC	2	6	1455783	1455788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385342224
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31492	NC_017514	TGT	2	6	1455923	1455928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385342225
31493	NC_017514	CTC	2	6	1455946	1455951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385342225
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31495	NC_017514	CCG	3	9	1455989	1455997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342225
31496	NC_017514	T	7	7	1456006	1456012	0 %	100 %	0 %	0 %	385342225
31497	NC_017514	GCC	2	6	1456024	1456029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385342225
31498	NC_017514	GGCA	2	8	1456084	1456091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31499	NC_017514	GCA	2	6	1456096	1456101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31500	NC_017514	TCG	2	6	1456146	1456151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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