MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis WUE 2594

Total Repeats: 1624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017512	TCAAA	2	10	1547	1556	60 %	20 %	0 %	20 %	385337123
2	NC_017512	GCCCA	2	10	1603	1612	20 %	0 %	20 %	60 %	385337123
3	NC_017512	CCAGC	2	10	4813	4822	20 %	0 %	20 %	60 %	385337127
4	NC_017512	AAGGC	2	10	6122	6131	40 %	0 %	40 %	20 %	385337129
5	NC_017512	GAATG	2	10	6232	6241	40 %	20 %	40 %	0 %	385337129
6	NC_017512	GCTTT	2	10	6483	6492	0 %	60 %	20 %	20 %	385337130
7	NC_017512	GGAAT	2	10	7292	7301	40 %	20 %	40 %	0 %	385337130
8	NC_017512	TACCG	2	10	8599	8608	20 %	20 %	20 %	40 %	385337131
9	NC_017512	TCAAT	2	10	9665	9674	40 %	40 %	0 %	20 %	385337132
10	NC_017512	CGCGC	2	10	10678	10687	0 %	0 %	40 %	60 %	385337133
11	NC_017512	CCCGT	2	10	10699	10708	0 %	20 %	20 %	60 %	385337133
12	NC_017512	TCCCG	2	10	11848	11857	0 %	20 %	20 %	60 %	385337134
13	NC_017512	GCCGC	2	10	13220	13229	0 %	0 %	40 %	60 %	385337135
14	NC_017512	TGTCG	2	10	13304	13313	0 %	40 %	40 %	20 %	385337135
15	NC_017512	ATTTA	2	10	13651	13660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017512	CTTGC	2	10	16660	16669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017512	AGGCG	2	10	19515	19524	20 %	0 %	60 %	20 %	385337139
18	NC_017512	AGGGC	2	10	21637	21646	20 %	0 %	60 %	20 %	385337140
19	NC_017512	AAACC	2	10	22340	22349	60 %	0 %	0 %	40 %	385337141
20	NC_017512	CAAAC	2	10	24306	24315	60 %	0 %	0 %	40 %	385337142
21	NC_017512	TCCGC	2	10	25501	25510	0 %	20 %	20 %	60 %	385337143
22	NC_017512	GCCTT	2	10	28333	28342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017512	CATTC	2	10	30084	30093	20 %	40 %	0 %	40 %	385337147
24	NC_017512	AGGTG	2	10	30532	30541	20 %	20 %	60 %	0 %	385337148
25	NC_017512	GGGCT	2	10	33197	33206	0 %	20 %	60 %	20 %	385337149
26	NC_017512	TGCGG	2	10	35736	35745	0 %	20 %	60 %	20 %	385337152
27	NC_017512	GGCGG	2	10	36695	36704	0 %	0 %	80 %	20 %	385337152
28	NC_017512	GCGGT	2	10	37170	37179	0 %	20 %	60 %	20 %	385337153
29	NC_017512	GCGCG	2	10	37567	37576	0 %	0 %	60 %	40 %	385337153
30	NC_017512	ACGGC	2	10	38112	38121	20 %	0 %	40 %	40 %	385337153
31	NC_017512	CCCGT	2	10	39650	39659	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017512	CGGCG	2	10	39984	39993	0 %	0 %	60 %	40 %	385337155
33	NC_017512	TTTGA	2	10	41953	41962	20 %	60 %	20 %	0 %	385337155
34	NC_017512	CGACC	2	10	41970	41979	20 %	0 %	20 %	60 %	385337155
35	NC_017512	GGGCA	2	10	42175	42184	20 %	0 %	60 %	20 %	385337155
36	NC_017512	GAAAA	2	10	42607	42616	80 %	0 %	20 %	0 %	385337155
37	NC_017512	CAATT	2	10	42950	42959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017512	CGAAC	2	10	45093	45102	40 %	0 %	20 %	40 %	385337156
39	NC_017512	CGTGG	2	10	49047	49056	0 %	20 %	60 %	20 %	385337157
40	NC_017512	TTTAA	2	10	50155	50164	40 %	60 %	0 %	0 %	385337157
41	NC_017512	TAAAG	2	10	50593	50602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017512	TCGGT	2	10	50974	50983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017512	TGTTT	2	10	52062	52071	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017512	CGGCC	2	10	53619	53628	0 %	0 %	40 %	60 %	385337158
45	NC_017512	TGGGG	2	10	53769	53778	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017512	TTTTC	2	10	53822	53831	0 %	80 %	0 %	20 %	385337159
47	NC_017512	GAAAA	2	10	53927	53936	80 %	0 %	20 %	0 %	385337159
48	NC_017512	TAAAT	2	10	59025	59034	60 %	40 %	0 %	0 %	385337164
49	NC_017512	AATAA	2	10	59983	59992	80 %	20 %	0 %	0 %	385337166
50	NC_017512	ATTTT	2	10	62840	62849	20 %	80 %	0 %	0 %	385337170
51	NC_017512	TCATT	2	10	63103	63112	20 %	60 %	0 %	20 %	385337171
52	NC_017512	ATAAA	2	10	67449	67458	80 %	20 %	0 %	0 %	385337176
53	NC_017512	ATTTG	2	10	68381	68390	20 %	60 %	20 %	0 %	385337177
54	NC_017512	TTGTT	2	10	68600	68609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017512	GCGCC	2	10	70959	70968	0 %	0 %	40 %	60 %	385337181
56	NC_017512	TGCCG	2	10	73013	73022	0 %	20 %	40 %	40 %	385337183
57	NC_017512	GGCAG	2	10	74229	74238	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017512	TATAT	2	10	75338	75347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017512	CGGTT	2	10	76670	76679	0 %	40 %	40 %	20 %	385337187
60	NC_017512	TTTGG	2	10	77280	77289	0 %	60 %	40 %	0 %	385337188
61	NC_017512	CTGTT	2	10	78242	78251	0 %	60 %	20 %	20 %	385337190
62	NC_017512	GTCGG	2	10	80888	80897	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017512	GAACA	2	10	84050	84059	60 %	0 %	20 %	20 %	385337194
64	NC_017512	TCCGC	2	10	85638	85647	0 %	20 %	20 %	60 %	385337195
65	NC_017512	TGCCG	2	10	87078	87087	0 %	20 %	40 %	40 %	385337197
66	NC_017512	ACCGA	2	10	88419	88428	40 %	0 %	20 %	40 %	385337198
67	NC_017512	AGGCA	2	10	90029	90038	40 %	0 %	40 %	20 %	385337200
68	NC_017512	AAATA	2	10	90229	90238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017512	GCCGG	2	10	90731	90740	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017512	CGGCG	2	10	93582	93591	0 %	0 %	60 %	40 %	385337203
71	NC_017512	CGGGC	2	10	95514	95523	0 %	0 %	60 %	40 %	385337204
72	NC_017512	GGTGC	2	10	96667	96676	0 %	20 %	60 %	20 %	385337205
73	NC_017512	AGGAG	2	10	100467	100476	40 %	0 %	60 %	0 %	385337209
74	NC_017512	TCGAT	2	10	101039	101048	20 %	40 %	20 %	20 %	385337210
75	NC_017512	CCCGC	2	10	101486	101495	0 %	0 %	20 %	80 %	385337210
76	NC_017512	CGGGG	2	10	103023	103032	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017512	AGCGG	2	10	103254	103263	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017512	AATCC	2	10	105261	105270	40 %	20 %	0 %	40 %	385337212
79	NC_017512	AGGGC	2	10	106760	106769	20 %	0 %	60 %	20 %	385337213
80	NC_017512	TTTCC	2	10	110061	110070	0 %	60 %	0 %	40 %	385337215
81	NC_017512	CAAAA	2	10	111158	111167	80 %	0 %	0 %	20 %	385337216
82	NC_017512	TTTGC	2	10	113167	113176	0 %	60 %	20 %	20 %	385337220
83	NC_017512	CGGCG	2	10	113312	113321	0 %	0 %	60 %	40 %	385337220
84	NC_017512	GTTTT	2	10	113506	113515	0 %	80 %	20 %	0 %	385337220
85	NC_017512	CGATA	2	10	113587	113596	40 %	20 %	20 %	20 %	385337220
86	NC_017512	GGCAA	2	10	115178	115187	40 %	0 %	40 %	20 %	385337222
87	NC_017512	CAAAC	2	10	115583	115592	60 %	0 %	0 %	40 %	385337223
88	NC_017512	AGCAA	2	10	115597	115606	60 %	0 %	20 %	20 %	385337223
89	NC_017512	GGTAT	2	10	116490	116499	20 %	40 %	40 %	0 %	385337223
90	NC_017512	AGCGG	2	10	118633	118642	20 %	0 %	60 %	20 %	385337225
91	NC_017512	TGCCG	2	10	121754	121763	0 %	20 %	40 %	40 %	385337228
92	NC_017512	GGCAG	2	10	122764	122773	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017512	GGGCA	2	10	123530	123539	20 %	0 %	60 %	20 %	385337231
94	NC_017512	GTTCA	2	10	126237	126246	20 %	40 %	20 %	20 %	385337232
95	NC_017512	CAAAA	2	10	127275	127284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017512	CCGCA	2	10	128017	128026	20 %	0 %	20 %	60 %	385337234
97	NC_017512	ACGGC	2	10	129213	129222	20 %	0 %	40 %	40 %	385337234
98	NC_017512	GTTAC	2	10	129231	129240	20 %	40 %	20 %	20 %	385337234
99	NC_017512	ATAGG	2	10	135806	135815	40 %	20 %	40 %	0 %	385337238
100	NC_017512	TGAAA	2	10	137042	137051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017512	GGCGT	2	10	137533	137542	0 %	20 %	60 %	20 %	385337239
102	NC_017512	AGGCG	2	10	138603	138612	20 %	0 %	60 %	20 %	385337240
103	NC_017512	TGCGG	2	10	138728	138737	0 %	20 %	60 %	20 %	385337241
104	NC_017512	TTGGG	2	10	139292	139301	0 %	40 %	60 %	0 %	385337242
105	NC_017512	GGGAT	2	10	139310	139319	20 %	20 %	60 %	0 %	385337242
106	NC_017512	AGCCC	2	10	142072	142081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017512	GCGCC	2	10	144251	144260	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017512	GGCGC	3	15	144551	144565	0 %	0 %	60 %	40 %	385337246
109	NC_017512	TGGCG	2	10	148625	148634	0 %	20 %	60 %	20 %	385337250
110	NC_017512	CGCGG	2	10	151912	151921	0 %	0 %	60 %	40 %	385337254
111	NC_017512	CCGCG	2	10	153576	153585	0 %	0 %	40 %	60 %	385337257
112	NC_017512	AAAAT	2	10	154745	154754	80 %	20 %	0 %	0 %	385337258
113	NC_017512	TAAAT	2	10	154764	154773	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017512	GTAGC	2	10	155952	155961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017512	TCGTG	2	10	156170	156179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017512	AGAAA	2	10	157133	157142	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017512	GGGAG	2	10	157797	157806	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017512	AGGTT	2	10	158740	158749	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017512	AAGTA	2	10	160988	160997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017512	GTTTT	2	10	161671	161680	0 %	80 %	20 %	0 %	385337261
121	NC_017512	AAAGG	2	10	164673	164682	60 %	0 %	40 %	0 %	385337263
122	NC_017512	CATAG	2	10	164926	164935	40 %	20 %	20 %	20 %	385337263
123	NC_017512	AAACC	2	10	165284	165293	60 %	0 %	0 %	40 %	385337264
124	NC_017512	AAGTG	2	10	170786	170795	40 %	20 %	40 %	0 %	385337266
125	NC_017512	GCCGC	2	10	173897	173906	0 %	0 %	40 %	60 %	385337267
126	NC_017512	CGGCA	2	10	176460	176469	20 %	0 %	40 %	40 %	385337269
127	NC_017512	GCGCG	2	10	177530	177539	0 %	0 %	60 %	40 %	385337272
128	NC_017512	GGGCG	2	10	178111	178120	0 %	0 %	80 %	20 %	385337272
129	NC_017512	ACCGT	2	10	178690	178699	20 %	20 %	20 %	40 %	385337273
130	NC_017512	TGCCG	2	10	182377	182386	0 %	20 %	40 %	40 %	385337276
131	NC_017512	CGGCG	2	10	182737	182746	0 %	0 %	60 %	40 %	385337276
132	NC_017512	CCGCG	2	10	184344	184353	0 %	0 %	40 %	60 %	385337276
133	NC_017512	GCCGC	2	10	184556	184565	0 %	0 %	40 %	60 %	385337276
134	NC_017512	GTGTC	2	10	187932	187941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017512	GCGCC	2	10	189392	189401	0 %	0 %	40 %	60 %	385337280
136	NC_017512	GTACG	2	10	195119	195128	20 %	20 %	40 %	20 %	385337284
137	NC_017512	CGGAT	2	10	197695	197704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017512	CGGCG	2	10	198515	198524	0 %	0 %	60 %	40 %	385337285
139	NC_017512	ACAAA	2	10	200762	200771	80 %	0 %	0 %	20 %	385337288
140	NC_017512	TCCAA	2	10	200986	200995	40 %	20 %	0 %	40 %	385337288
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142	NC_017512	GTTTG	2	10	204918	204927	0 %	60 %	40 %	0 %	385337289
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145	NC_017512	AAATT	2	10	208597	208606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017512	GTAGT	2	10	228583	228592	20 %	40 %	40 %	0 %	385337305
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251	NC_017512	GTTTG	2	10	372760	372769	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017512	TTGCT	2	10	373971	373980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_017512	GCGTT	2	10	397360	397369	0 %	40 %	40 %	20 %	385337447
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271	NC_017512	GGTAA	2	10	417566	417575	40 %	20 %	40 %	0 %	385337463
272	NC_017512	TACCG	2	10	420311	420320	20 %	20 %	20 %	40 %	385337464
273	NC_017512	CGTGG	2	10	421053	421062	0 %	20 %	60 %	20 %	385337465
274	NC_017512	TGGGC	2	10	421359	421368	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
275	NC_017512	TAAAA	2	10	421851	421860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_017512	CGGCA	2	10	423922	423931	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
278	NC_017512	CAGCG	2	10	426942	426951	20 %	0 %	40 %	40 %	385337468
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285	NC_017512	GCCTT	2	10	432143	432152	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_017512	CGGTA	2	10	446764	446773	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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380	NC_017512	GGTAA	2	10	564028	564037	40 %	20 %	40 %	0 %	385337581
381	NC_017512	TTTCT	2	10	565735	565744	0 %	80 %	0 %	20 %	385337582
382	NC_017512	CATTG	2	10	565747	565756	20 %	40 %	20 %	20 %	385337582
383	NC_017512	TGCCG	2	10	566875	566884	0 %	20 %	40 %	40 %	385337583
384	NC_017512	TTTTC	2	10	567669	567678	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
385	NC_017512	GGCAA	3	15	567771	567785	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
386	NC_017512	TAATA	2	10	567838	567847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_017512	CCGTA	2	10	569213	569222	20 %	20 %	20 %	40 %	385337586
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389	NC_017512	TTTTA	2	10	574279	574288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017512	GTTTG	2	10	575380	575389	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017512	TCCAA	2	10	580334	580343	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
392	NC_017512	GCACG	2	10	583904	583913	20 %	0 %	40 %	40 %	385337595
393	NC_017512	TTCTT	2	10	586809	586818	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
394	NC_017512	GGACG	2	10	587633	587642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
395	NC_017512	GCACC	2	10	588296	588305	20 %	0 %	20 %	60 %	385337598
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400	NC_017512	GGCGT	2	10	597318	597327	0 %	20 %	60 %	20 %	385337606
401	NC_017512	GAATA	2	10	597531	597540	60 %	20 %	20 %	0 %	385337606
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403	NC_017512	CGGTA	2	10	599940	599949	20 %	20 %	40 %	20 %	385337608
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500	NC_017512	TTTTC	2	10	719702	719711	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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