MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	GCGG	2	8	227	234	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
2	NC_017510	GACG	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
3	NC_017510	GGCG	2	8	479	486	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
4	NC_017510	GGAT	2	8	539	546	25 %	25 %	50 %	0 %	385334850
5	NC_017510	AAAG	2	8	1202	1209	75 %	0 %	25 %	0 %	385334850
6	NC_017510	TTAT	2	8	1260	1267	25 %	75 %	0 %	0 %	385334850
7	NC_017510	CGAT	2	8	1531	1538	25 %	25 %	25 %	25 %	385334850
8	NC_017510	GGGC	2	8	1571	1578	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
9	NC_017510	GCAG	2	8	1930	1937	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
10	NC_017510	TCAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	385334850
11	NC_017510	GGCA	2	8	2235	2242	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
12	NC_017510	ACGG	2	8	2644	2651	25 %	0 %	50 %	25 %	385334851
13	NC_017510	CAGG	2	8	4128	4135	25 %	0 %	50 %	25 %	385334851
14	NC_017510	ACCG	2	8	4245	4252	25 %	0 %	25 %	50 %	385334851
15	NC_017510	ACGG	2	8	4626	4633	25 %	0 %	50 %	25 %	385334852
16	NC_017510	TGCT	2	8	4973	4980	0 %	50 %	25 %	25 %	385334853
17	NC_017510	TACC	2	8	5799	5806	25 %	25 %	0 %	50 %	385334853
18	NC_017510	AAGG	2	8	6412	6419	50 %	0 %	50 %	0 %	385334853
19	NC_017510	TTCA	2	8	7970	7977	25 %	50 %	0 %	25 %	385334854
20	NC_017510	TGCG	2	8	8047	8054	0 %	25 %	50 %	25 %	385334854
21	NC_017510	GATG	2	8	8297	8304	25 %	25 %	50 %	0 %	385334854
22	NC_017510	TCCC	2	8	8590	8597	0 %	25 %	0 %	75 %	385334854
23	NC_017510	TCAA	2	8	8602	8609	50 %	25 %	0 %	25 %	385334854
24	NC_017510	GGAC	2	8	9197	9204	25 %	0 %	50 %	25 %	385334854
25	NC_017510	GAGC	2	8	9407	9414	25 %	0 %	50 %	25 %	385334854
26	NC_017510	ACCG	2	8	9540	9547	25 %	0 %	25 %	50 %	385334854
27	NC_017510	CCAG	2	8	10377	10384	25 %	0 %	25 %	50 %	385334855
28	NC_017510	GAGG	2	8	10655	10662	25 %	0 %	75 %	0 %	385334855
29	NC_017510	AGGG	2	8	10708	10715	25 %	0 %	75 %	0 %	385334855
30	NC_017510	GCTT	2	8	10764	10771	0 %	50 %	25 %	25 %	385334856
31	NC_017510	TATC	2	8	11223	11230	25 %	50 %	0 %	25 %	385334856
32	NC_017510	TTTA	2	8	11348	11355	25 %	75 %	0 %	0 %	385334857
33	NC_017510	CGGC	2	8	11755	11762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017510	GACG	2	8	12111	12118	25 %	0 %	50 %	25 %	385334858
35	NC_017510	TGTT	2	8	12690	12697	0 %	75 %	25 %	0 %	385334860
36	NC_017510	GGGC	2	8	13101	13108	0 %	0 %	75 %	25 %	385334860
37	NC_017510	AGGA	2	8	13135	13142	50 %	0 %	50 %	0 %	385334860
38	NC_017510	CAGG	2	8	13500	13507	25 %	0 %	50 %	25 %	385334860
39	NC_017510	TCAG	2	8	13662	13669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017510	ATCA	2	8	14174	14181	50 %	25 %	0 %	25 %	385334861
41	NC_017510	TCAC	2	8	14209	14216	25 %	25 %	0 %	50 %	385334861
42	NC_017510	AATT	2	8	14246	14253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017510	AATA	2	8	14264	14271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017510	ATTT	2	8	14299	14306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017510	ATTT	2	8	14513	14520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017510	CATT	2	8	14800	14807	25 %	50 %	0 %	25 %	385334862
47	NC_017510	AGGG	2	8	15105	15112	25 %	0 %	75 %	0 %	385334863
48	NC_017510	AACA	2	8	15569	15576	75 %	0 %	0 %	25 %	385334863
49	NC_017510	GGAA	2	8	16072	16079	50 %	0 %	50 %	0 %	385334863
50	NC_017510	AACA	2	8	16455	16462	75 %	0 %	0 %	25 %	385334865
51	NC_017510	ATTG	2	8	17515	17522	25 %	50 %	25 %	0 %	385334865
52	NC_017510	GAAA	2	8	17583	17590	75 %	0 %	25 %	0 %	385334866
53	NC_017510	GGAA	2	8	18665	18672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017510	CGGC	2	8	18787	18794	0 %	0 %	50 %	50 %	385334868
55	NC_017510	CCAT	2	8	19057	19064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017510	CTGA	2	8	19489	19496	25 %	25 %	25 %	25 %	385334869
57	NC_017510	CTTT	2	8	20932	20939	0 %	75 %	0 %	25 %	385334871
58	NC_017510	AAAT	2	8	21473	21480	75 %	25 %	0 %	0 %	385334871
59	NC_017510	ATAA	2	8	21729	21736	75 %	25 %	0 %	0 %	385334871
60	NC_017510	TTGG	2	8	23874	23881	0 %	50 %	50 %	0 %	385334874
61	NC_017510	TGCC	2	8	23915	23922	0 %	25 %	25 %	50 %	385334874
62	NC_017510	CAGG	2	8	24043	24050	25 %	0 %	50 %	25 %	385334874
63	NC_017510	GTTC	2	8	24106	24113	0 %	50 %	25 %	25 %	385334874
64	NC_017510	TGCC	2	8	24161	24168	0 %	25 %	25 %	50 %	385334874
65	NC_017510	CGCC	2	8	25108	25115	0 %	0 %	25 %	75 %	385334876
66	NC_017510	GGCA	2	8	25153	25160	25 %	0 %	50 %	25 %	385334876
67	NC_017510	CGGT	2	8	25205	25212	0 %	25 %	50 %	25 %	385334876
68	NC_017510	GCCC	2	8	26212	26219	0 %	0 %	25 %	75 %	385334877
69	NC_017510	CAGC	2	8	26415	26422	25 %	0 %	25 %	50 %	385334878
70	NC_017510	GAAA	2	8	27348	27355	75 %	0 %	25 %	0 %	385334878
71	NC_017510	CAGC	2	8	28215	28222	25 %	0 %	25 %	50 %	385334878
72	NC_017510	CCTT	2	8	28378	28385	0 %	50 %	0 %	50 %	385334878
73	NC_017510	TGCC	2	8	28500	28507	0 %	25 %	25 %	50 %	385334878
74	NC_017510	CCTG	2	8	28554	28561	0 %	25 %	25 %	50 %	385334878
75	NC_017510	TGAT	2	8	28639	28646	25 %	50 %	25 %	0 %	385334878
76	NC_017510	CAGC	2	8	29490	29497	25 %	0 %	25 %	50 %	385334880
77	NC_017510	TCGT	2	8	29656	29663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017510	TGCA	2	8	29930	29937	25 %	25 %	25 %	25 %	385334881
79	NC_017510	ACTG	2	8	30251	30258	25 %	25 %	25 %	25 %	385334881
80	NC_017510	AATG	2	8	30836	30843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017510	TTGA	2	8	30960	30967	25 %	50 %	25 %	0 %	385334882
82	NC_017510	GAAT	2	8	31270	31277	50 %	25 %	25 %	0 %	385334883
83	NC_017510	GAAG	2	8	31491	31498	50 %	0 %	50 %	0 %	385334883
84	NC_017510	TTTG	2	8	31784	31791	0 %	75 %	25 %	0 %	385334884
85	NC_017510	TGTT	2	8	31848	31855	0 %	75 %	25 %	0 %	385334884
86	NC_017510	TTAC	2	8	33182	33189	25 %	50 %	0 %	25 %	385334885
87	NC_017510	TAAA	2	8	33500	33507	75 %	25 %	0 %	0 %	385334885
88	NC_017510	CGGA	2	8	33568	33575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017510	GTTT	2	8	34013	34020	0 %	75 %	25 %	0 %	385334887
90	NC_017510	GCGG	2	8	34165	34172	0 %	0 %	75 %	25 %	385334887
91	NC_017510	TCAA	2	8	34701	34708	50 %	25 %	0 %	25 %	385334888
92	NC_017510	GATC	2	8	34925	34932	25 %	25 %	25 %	25 %	385334888
93	NC_017510	AACA	2	8	35756	35763	75 %	0 %	0 %	25 %	385334889
94	NC_017510	ATTT	2	8	35843	35850	25 %	75 %	0 %	0 %	385334889
95	NC_017510	ATGA	2	8	36116	36123	50 %	25 %	25 %	0 %	385334890
96	NC_017510	GCAG	2	8	36186	36193	25 %	0 %	50 %	25 %	385334890
97	NC_017510	CCGG	2	8	36328	36335	0 %	0 %	50 %	50 %	385334890
98	NC_017510	CTGT	2	8	36899	36906	0 %	50 %	25 %	25 %	385334891
99	NC_017510	GCTG	2	8	36963	36970	0 %	25 %	50 %	25 %	385334891

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.