MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 2845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	TCTTG	2	10	89	98	0 %	60 %	20 %	20 %	339481523
2	NC_015731	GCCGC	2	10	7358	7367	0 %	0 %	40 %	60 %	339481526
3	NC_015731	AAGCA	2	10	7651	7660	60 %	0 %	20 %	20 %	339481526
4	NC_015731	CGGTG	2	10	12256	12265	0 %	20 %	60 %	20 %	339481530
5	NC_015731	ACTGA	2	10	16179	16188	40 %	20 %	20 %	20 %	339481532
6	NC_015731	CTATG	2	10	17019	17028	20 %	40 %	20 %	20 %	339481533
7	NC_015731	AGCGG	2	10	17050	17059	20 %	0 %	60 %	20 %	339481533
8	NC_015731	CAAAT	2	10	19461	19470	60 %	20 %	0 %	20 %	339481534
9	NC_015731	GGCAA	2	10	21242	21251	40 %	0 %	40 %	20 %	339481537
10	NC_015731	TCCTA	2	10	21369	21378	20 %	40 %	0 %	40 %	339481537
11	NC_015731	CAAAC	2	10	22436	22445	60 %	0 %	0 %	40 %	339481538
12	NC_015731	TATTT	2	10	23284	23293	20 %	80 %	0 %	0 %	339481538
13	NC_015731	GTAAT	2	10	23654	23663	40 %	40 %	20 %	0 %	339481539
14	NC_015731	GGAAT	2	10	24552	24561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015731	GAGAT	2	10	25655	25664	40 %	20 %	40 %	0 %	339481542
16	NC_015731	ACGAT	2	10	26109	26118	40 %	20 %	20 %	20 %	339481542
17	NC_015731	GCAAA	2	10	27566	27575	60 %	0 %	20 %	20 %	339481545
18	NC_015731	AACAA	2	10	28114	28123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015731	TTTGT	2	10	28718	28727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015731	CCACA	2	10	29429	29438	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015731	TCGTT	2	10	30231	30240	0 %	60 %	20 %	20 %	339481548
22	NC_015731	TAACC	2	10	32472	32481	40 %	20 %	0 %	40 %	339481548
23	NC_015731	ATCGA	2	10	33310	33319	40 %	20 %	20 %	20 %	339481548
24	NC_015731	GTGAC	2	10	37790	37799	20 %	20 %	40 %	20 %	339481548
25	NC_015731	ATTGC	2	10	39726	39735	20 %	40 %	20 %	20 %	339481549
26	NC_015731	CAGGC	2	10	40406	40415	20 %	0 %	40 %	40 %	339481551
27	NC_015731	CGATC	2	10	40719	40728	20 %	20 %	20 %	40 %	339481551
28	NC_015731	AGCGA	2	10	42081	42090	40 %	0 %	40 %	20 %	339481552
29	NC_015731	GCCGG	2	10	42347	42356	0 %	0 %	60 %	40 %	339481552
30	NC_015731	AAATT	2	10	43402	43411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015731	GCCGG	2	10	45104	45113	0 %	0 %	60 %	40 %	339481554
32	NC_015731	GCCAA	2	10	45811	45820	40 %	0 %	20 %	40 %	339481555
33	NC_015731	AATTG	2	10	45842	45851	40 %	40 %	20 %	0 %	339481555
34	NC_015731	TTCAT	2	10	46924	46933	20 %	60 %	0 %	20 %	339481555
35	NC_015731	TGGTG	2	10	48258	48267	0 %	40 %	60 %	0 %	339481556
36	NC_015731	TGAAC	2	10	49356	49365	40 %	20 %	20 %	20 %	339481556
37	NC_015731	CGATC	2	10	50713	50722	20 %	20 %	20 %	40 %	339481557
38	NC_015731	GCATC	2	10	50905	50914	20 %	20 %	20 %	40 %	339481557
39	NC_015731	ATTGA	2	10	50948	50957	40 %	40 %	20 %	0 %	339481557
40	NC_015731	CAGGA	2	10	54790	54799	40 %	0 %	40 %	20 %	339481559
41	NC_015731	CGAAG	2	10	56824	56833	40 %	0 %	40 %	20 %	339481560
42	NC_015731	TTTTA	2	10	57773	57782	20 %	80 %	0 %	0 %	339481563
43	NC_015731	GCGCA	2	10	59484	59493	20 %	0 %	40 %	40 %	339481566
44	NC_015731	TTCGA	2	10	59542	59551	20 %	40 %	20 %	20 %	339481566
45	NC_015731	AAGCC	2	10	59866	59875	40 %	0 %	20 %	40 %	339481566
46	NC_015731	GCAAG	2	10	64098	64107	40 %	0 %	40 %	20 %	339481570
47	NC_015731	GATCG	2	10	64136	64145	20 %	20 %	40 %	20 %	339481570
48	NC_015731	GCGTT	2	10	65332	65341	0 %	40 %	40 %	20 %	339481571
49	NC_015731	TGCGA	2	10	65518	65527	20 %	20 %	40 %	20 %	339481571
50	NC_015731	ACGGC	2	10	67101	67110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015731	ACCAA	2	10	67521	67530	60 %	0 %	0 %	40 %	339481574
52	NC_015731	TATTT	2	10	68304	68313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015731	GTGCT	2	10	69418	69427	0 %	40 %	40 %	20 %	339481575
54	NC_015731	GGGAT	2	10	70364	70373	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015731	CACCG	2	10	72971	72980	20 %	0 %	20 %	60 %	339481578
56	NC_015731	GCGAT	2	10	74348	74357	20 %	20 %	40 %	20 %	339481578
57	NC_015731	GCATC	2	10	75278	75287	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015731	TGCTT	2	10	75356	75365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015731	CTATG	2	10	77708	77717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015731	CGGCC	2	10	78515	78524	0 %	0 %	40 %	60 %	339481581
61	NC_015731	GTTTC	2	10	79486	79495	0 %	60 %	20 %	20 %	339481583
62	NC_015731	AATGG	2	10	80728	80737	40 %	20 %	40 %	0 %	339481584
63	NC_015731	GGGTA	2	10	81157	81166	20 %	20 %	60 %	0 %	339481584
64	NC_015731	TAGCT	2	10	83371	83380	20 %	40 %	20 %	20 %	339481589
65	NC_015731	AAACA	2	10	88806	88815	80 %	0 %	0 %	20 %	339481594
66	NC_015731	TTGCT	2	10	88848	88857	0 %	60 %	20 %	20 %	339481594
67	NC_015731	ATAAA	2	10	92197	92206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015731	ATTTA	2	10	92723	92732	40 %	60 %	0 %	0 %	339481597
69	NC_015731	CGAAG	2	10	93585	93594	40 %	0 %	40 %	20 %	339481598
70	NC_015731	GGAAA	2	10	93595	93604	60 %	0 %	40 %	0 %	339481598
71	NC_015731	CCACT	2	10	96230	96239	20 %	20 %	0 %	60 %	339481601
72	NC_015731	ATGCT	2	10	96980	96989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015731	GACCG	2	10	97928	97937	20 %	0 %	40 %	40 %	339481603
74	NC_015731	AGTTA	2	10	98563	98572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015731	CGGTG	2	10	101645	101654	0 %	20 %	60 %	20 %	339481607
76	NC_015731	CTTTT	2	10	101914	101923	0 %	80 %	0 %	20 %	339481607
77	NC_015731	AATGC	2	10	104866	104875	40 %	20 %	20 %	20 %	339481608
78	NC_015731	TTTGA	2	10	105172	105181	20 %	60 %	20 %	0 %	339481608
79	NC_015731	TGATG	2	10	105877	105886	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015731	GCCGG	2	10	108244	108253	0 %	0 %	60 %	40 %	339481611
81	NC_015731	GCGTA	2	10	109310	109319	20 %	20 %	40 %	20 %	339481612
82	NC_015731	GCCGC	2	10	110465	110474	0 %	0 %	40 %	60 %	339481613
83	NC_015731	GAAAA	2	10	111877	111886	80 %	0 %	20 %	0 %	339481613
84	NC_015731	GCCAC	2	10	113118	113127	20 %	0 %	20 %	60 %	339481614
85	NC_015731	TCCTG	2	10	114288	114297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015731	CGGCC	2	10	114704	114713	0 %	0 %	40 %	60 %	339481615
87	NC_015731	AGTTG	2	10	117738	117747	20 %	40 %	40 %	0 %	339481616
88	NC_015731	TCCAT	2	10	119110	119119	20 %	40 %	0 %	40 %	339481617
89	NC_015731	CGCAA	2	10	119344	119353	40 %	0 %	20 %	40 %	339481617
90	NC_015731	TGCAG	2	10	120085	120094	20 %	20 %	40 %	20 %	339481618
91	NC_015731	ACAAA	2	10	121516	121525	80 %	0 %	0 %	20 %	339481620
92	NC_015731	AGATC	2	10	123103	123112	40 %	20 %	20 %	20 %	339481622
93	NC_015731	ACGGC	2	10	123132	123141	20 %	0 %	40 %	40 %	339481622
94	NC_015731	CGTGC	2	10	124456	124465	0 %	20 %	40 %	40 %	339481623
95	NC_015731	GAATT	2	10	124996	125005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015731	TGATT	2	10	127393	127402	20 %	60 %	20 %	0 %	339481626
97	NC_015731	ATTGG	2	10	128673	128682	20 %	40 %	40 %	0 %	339481628
98	NC_015731	CAATC	2	10	130762	130771	40 %	20 %	0 %	40 %	339481630
99	NC_015731	GCCGC	2	10	132849	132858	0 %	0 %	40 %	60 %	339481632
100	NC_015731	AAAGC	2	10	134872	134881	60 %	0 %	20 %	20 %	339481633
101	NC_015731	TTAAG	2	10	137081	137090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015731	ATTTC	2	10	137128	137137	20 %	60 %	0 %	20 %	339481637
103	NC_015731	AGATC	2	10	137141	137150	40 %	20 %	20 %	20 %	339481637
104	NC_015731	GTTGC	2	10	139398	139407	0 %	40 %	40 %	20 %	339481637
105	NC_015731	AAGTA	2	10	143061	143070	60 %	20 %	20 %	0 %	339481640
106	NC_015731	CGGAA	2	10	143972	143981	40 %	0 %	40 %	20 %	339481640
107	NC_015731	TTAAT	2	10	145171	145180	40 %	60 %	0 %	0 %	339481641
108	NC_015731	ACAAT	2	10	145466	145475	60 %	20 %	0 %	20 %	339481642
109	NC_015731	CTGTG	2	10	149510	149519	0 %	40 %	40 %	20 %	339481646
110	NC_015731	CACGG	2	10	149604	149613	20 %	0 %	40 %	40 %	339481646
111	NC_015731	ACGTA	2	10	150723	150732	40 %	20 %	20 %	20 %	339481646
112	NC_015731	GCACT	2	10	153270	153279	20 %	20 %	20 %	40 %	339481649
113	NC_015731	CATCA	2	10	154741	154750	40 %	20 %	0 %	40 %	339481650
114	NC_015731	AAAAT	2	10	156250	156259	80 %	20 %	0 %	0 %	339481652
115	NC_015731	AAGGA	2	10	156283	156292	60 %	0 %	40 %	0 %	339481652
116	NC_015731	CAATC	2	10	160511	160520	40 %	20 %	0 %	40 %	339481656
117	NC_015731	ATGCC	2	10	160872	160881	20 %	20 %	20 %	40 %	339481656
118	NC_015731	CAGTA	2	10	163086	163095	40 %	20 %	20 %	20 %	339481657
119	NC_015731	TACAA	2	10	164364	164373	60 %	20 %	0 %	20 %	339481657
120	NC_015731	ATGGC	2	10	164646	164655	20 %	20 %	40 %	20 %	339481657
121	NC_015731	CACTA	2	10	166320	166329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015731	TTATT	2	10	167343	167352	20 %	80 %	0 %	0 %	339481659
123	NC_015731	GGAAT	2	10	170400	170409	40 %	20 %	40 %	0 %	339481662
124	NC_015731	TGGTG	2	10	173750	173759	0 %	40 %	60 %	0 %	339481667
125	NC_015731	CTGCC	2	10	174092	174101	0 %	20 %	20 %	60 %	339481667
126	NC_015731	ATACG	2	10	175861	175870	40 %	20 %	20 %	20 %	339481668
127	NC_015731	GGGGT	2	10	176647	176656	0 %	20 %	80 %	0 %	339481669
128	NC_015731	AAACT	2	10	176823	176832	60 %	20 %	0 %	20 %	339481669
129	NC_015731	CAAAG	2	10	176997	177006	60 %	0 %	20 %	20 %	339481669
130	NC_015731	TGATG	2	10	177274	177283	20 %	40 %	40 %	0 %	339481669
131	NC_015731	ATTTT	2	10	177828	177837	20 %	80 %	0 %	0 %	339481669
132	NC_015731	AACGC	2	10	178070	178079	40 %	0 %	20 %	40 %	339481669
133	NC_015731	TGGTT	2	10	178174	178183	0 %	60 %	40 %	0 %	339481670
134	NC_015731	TTGCT	2	10	179014	179023	0 %	60 %	20 %	20 %	339481670
135	NC_015731	ATTTT	2	10	179393	179402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015731	CCCAG	2	10	179936	179945	20 %	0 %	20 %	60 %	339481671
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138	NC_015731	AATTC	2	10	182266	182275	40 %	40 %	0 %	20 %	339481674
139	NC_015731	TATTT	2	10	182624	182633	20 %	80 %	0 %	0 %	339481674
140	NC_015731	GGCAA	2	10	183296	183305	40 %	0 %	40 %	20 %	339481674
141	NC_015731	CTCTT	2	10	184009	184018	0 %	60 %	0 %	40 %	339481674
142	NC_015731	AAATG	2	10	184073	184082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015731	TGCTG	2	10	193713	193722	0 %	40 %	40 %	20 %	339481683
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171	NC_015731	TTTTG	2	10	216554	216563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_015731	GTATA	2	10	243599	243608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_015731	GTTTT	2	10	301693	301702	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015731	ACGAA	2	10	304512	304521	60 %	0 %	20 %	20 %	339481784
251	NC_015731	AAAAT	2	10	306653	306662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015731	CTAAT	2	10	306708	306717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_015731	CGCAC	2	10	311645	311654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
255	NC_015731	GTTAA	2	10	313073	313082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
256	NC_015731	AGCCA	2	10	313961	313970	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_015731	TAAAT	2	10	315900	315909	60 %	40 %	0 %	0 %	339481796
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403	NC_015731	AAATC	2	10	500702	500711	60 %	20 %	0 %	20 %	339481961
404	NC_015731	TCTGG	2	10	503239	503248	0 %	40 %	40 %	20 %	339481964
405	NC_015731	CTTCT	2	10	503680	503689	0 %	60 %	0 %	40 %	339481964
406	NC_015731	CTGGC	2	10	503786	503795	0 %	20 %	40 %	40 %	339481964
407	NC_015731	ATTGG	2	10	503870	503879	20 %	40 %	40 %	0 %	339481964
408	NC_015731	TGGAT	2	10	504268	504277	20 %	40 %	40 %	0 %	339481964
409	NC_015731	TGACT	2	10	505180	505189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
410	NC_015731	CTGGG	2	10	506041	506050	0 %	20 %	60 %	20 %	339481966
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412	NC_015731	TGGGG	2	10	510281	510290	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
413	NC_015731	GACTG	2	10	512210	512219	20 %	20 %	40 %	20 %	339481973
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420	NC_015731	CGATC	2	10	518660	518669	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
421	NC_015731	TTTAG	2	10	521117	521126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015731	TAGCG	2	10	521256	521265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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432	NC_015731	CTATT	2	10	533216	533225	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_015731	TAACA	2	10	533384	533393	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_015731	TCAAA	2	10	538912	538921	60 %	20 %	0 %	20 %	339481992
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450	NC_015731	GAAGA	2	10	545501	545510	60 %	0 %	40 %	0 %	339482000
451	NC_015731	AGGTT	2	10	546925	546934	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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