MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015731	TGT	2	6	198346	198351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481687
4002	NC_015731	ATAA	2	8	198507	198514	75 %	25 %	0 %	0 %	339481688
4003	NC_015731	AAT	2	6	198539	198544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481688
4004	NC_015731	TGT	2	6	198550	198555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481688
4005	NC_015731	GTT	2	6	198586	198591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481688
4006	NC_015731	GAT	2	6	198643	198648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481688
4007	NC_015731	TGT	2	6	198662	198667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481688
4008	NC_015731	TGC	2	6	198697	198702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481688
4009	NC_015731	GAT	2	6	198731	198736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481688
4010	NC_015731	TGT	2	6	198760	198765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481688
4011	NC_015731	GGT	2	6	198771	198776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481688
4012	NC_015731	ATA	2	6	198790	198795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481688
4013	NC_015731	TGT	2	6	199096	199101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481688
4014	NC_015731	GGATG	2	10	199109	199118	20 %	20 %	60 %	0 %	339481688
4015	NC_015731	CAC	2	6	199164	199169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481688
4016	NC_015731	CGT	2	6	199186	199191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481688
4017	NC_015731	TAGT	2	8	199290	199297	25 %	50 %	25 %	0 %	339481688
4018	NC_015731	CAT	2	6	199309	199314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481688
4019	NC_015731	AAT	2	6	199318	199323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481688
4020	NC_015731	GCG	2	6	199336	199341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481688
4021	NC_015731	GAT	2	6	199365	199370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481688
4022	NC_015731	ATG	2	6	199485	199490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481688
4023	NC_015731	A	6	6	199515	199520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015731	G	6	6	199634	199639	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015731	TAA	2	6	199719	199724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015731	AGT	2	6	199939	199944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481689
4027	NC_015731	TGG	2	6	199986	199991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481689
4028	NC_015731	GCA	2	6	200140	200145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481689
4029	NC_015731	TAC	2	6	200166	200171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481689
4030	NC_015731	TG	3	6	200183	200188	0 %	50 %	50 %	0 %	339481689
4031	NC_015731	CAA	2	6	200226	200231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481689
4032	NC_015731	CTG	2	6	200293	200298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481690
4033	NC_015731	CAA	2	6	200442	200447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481690
4034	NC_015731	TGCG	2	8	200470	200477	0 %	25 %	50 %	25 %	339481690
4035	NC_015731	ATG	2	6	200506	200511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481690
4036	NC_015731	CAG	2	6	200534	200539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481690
4037	NC_015731	GCT	2	6	200565	200570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481690
4038	NC_015731	T	6	6	200666	200671	0 %	100 %	0 %	0 %	339481690
4039	NC_015731	CTT	2	6	200756	200761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481690
4040	NC_015731	AAT	2	6	200823	200828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481691
4041	NC_015731	ACA	2	6	200843	200848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481691
4042	NC_015731	AAC	2	6	200915	200920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481691
4043	NC_015731	AGC	2	6	200928	200933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481691
4044	NC_015731	AAGC	2	8	201018	201025	50 %	0 %	25 %	25 %	339481691
4045	NC_015731	ATG	2	6	201133	201138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481691
4046	NC_015731	TGA	2	6	201146	201151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481691
4047	NC_015731	TGG	2	6	201301	201306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481691
4048	NC_015731	AGA	2	6	201314	201319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481691
4049	NC_015731	GCCA	2	8	201383	201390	25 %	0 %	25 %	50 %	339481691
4050	NC_015731	GTT	2	6	201402	201407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481691
4051	NC_015731	TG	3	6	201420	201425	0 %	50 %	50 %	0 %	339481691
4052	NC_015731	CTG	2	6	201457	201462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481691
4053	NC_015731	CGG	2	6	201510	201515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481691
4054	NC_015731	ATC	2	6	201575	201580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481691
4055	NC_015731	AAC	2	6	201600	201605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481692
4056	NC_015731	AGC	2	6	201765	201770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481692
4057	NC_015731	CAAC	2	8	201792	201799	50 %	0 %	0 %	50 %	339481692
4058	NC_015731	TAC	2	6	201860	201865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481692
4059	NC_015731	ATTA	2	8	201926	201933	50 %	50 %	0 %	0 %	339481692
4060	NC_015731	CAG	2	6	201990	201995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481692
4061	NC_015731	A	7	7	202031	202037	100 %	0 %	0 %	0 %	339481692
4062	NC_015731	CAC	2	6	202038	202043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481692
4063	NC_015731	TAC	2	6	202064	202069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481692
4064	NC_015731	TGCG	2	8	202080	202087	0 %	25 %	50 %	25 %	339481692
4065	NC_015731	GAA	2	6	202178	202183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481693
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4067	NC_015731	T	7	7	202285	202291	0 %	100 %	0 %	0 %	339481693
4068	NC_015731	GAT	2	6	202329	202334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481693
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4071	NC_015731	GAT	2	6	202428	202433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481693
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4077	NC_015731	TCA	2	6	202695	202700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481693
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4081	NC_015731	CA	3	6	202943	202948	50 %	0 %	0 %	50 %	339481693
4082	NC_015731	TGGCG	2	10	203006	203015	0 %	20 %	60 %	20 %	339481693
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4088	NC_015731	TGA	2	6	203242	203247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481693
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4092	NC_015731	AGAT	2	8	203599	203606	50 %	25 %	25 %	0 %	339481693
4093	NC_015731	TGC	2	6	203618	203623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481693
4094	NC_015731	T	7	7	203642	203648	0 %	100 %	0 %	0 %	339481693
4095	NC_015731	CCAATT	2	12	203740	203751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481693
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4099	NC_015731	GTA	2	6	203932	203937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481693
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4102	NC_015731	T	6	6	204044	204049	0 %	100 %	0 %	0 %	339481693
4103	NC_015731	AGT	2	6	204057	204062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481693
4104	NC_015731	GCGCTA	2	12	204094	204105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339481693
4105	NC_015731	ATT	2	6	204153	204158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481693
4106	NC_015731	TGC	2	6	204236	204241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481693
4107	NC_015731	GGAA	2	8	204352	204359	50 %	0 %	50 %	0 %	339481693
4108	NC_015731	GACA	2	8	204407	204414	50 %	0 %	25 %	25 %	339481693
4109	NC_015731	TTGG	2	8	204507	204514	0 %	50 %	50 %	0 %	339481693
4110	NC_015731	CTG	2	6	204598	204603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481693
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4112	NC_015731	CAAA	2	8	204707	204714	75 %	0 %	0 %	25 %	339481693
4113	NC_015731	GTT	2	6	204744	204749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481693
4114	NC_015731	TA	3	6	204792	204797	50 %	50 %	0 %	0 %	339481693
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4117	NC_015731	TCGCC	2	10	205060	205069	0 %	20 %	20 %	60 %	339481693
4118	NC_015731	G	6	6	205092	205097	0 %	0 %	100 %	0 %	339481693
4119	NC_015731	TTTG	2	8	205106	205113	0 %	75 %	25 %	0 %	339481693
4120	NC_015731	TAC	2	6	205142	205147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481693
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4122	NC_015731	CAG	2	6	205224	205229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481693
4123	NC_015731	CAA	2	6	205285	205290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481693
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4235	NC_015731	AATCA	2	10	210887	210896	60 %	20 %	0 %	20 %	339481699
4236	NC_015731	AAAT	2	8	210906	210913	75 %	25 %	0 %	0 %	339481699
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4354	NC_015731	CAA	2	6	218279	218284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481709
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4359	NC_015731	ATAA	2	8	218357	218364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_015731	ATT	2	6	218461	218466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_015731	ATG	2	6	218488	218493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_015731	ATG	2	6	218504	218509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_015731	CTT	2	6	218510	218515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_015731	CGG	2	6	218528	218533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481710
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4369	NC_015731	CAG	2	6	218865	218870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481710
4370	NC_015731	ACG	2	6	218879	218884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481710
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4491	NC_015731	ATT	2	6	224978	224983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481713
4492	NC_015731	TCCG	2	8	225004	225011	0 %	25 %	25 %	50 %	339481713
4493	NC_015731	TCAA	2	8	225144	225151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4494	NC_015731	GCAA	2	8	225252	225259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4495	NC_015731	TACA	2	8	225272	225279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4496	NC_015731	CA	3	6	225426	225431	50 %	0 %	0 %	50 %	339481714
4497	NC_015731	TTG	2	6	225487	225492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481714
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4499	NC_015731	CAA	2	6	225604	225609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481715
4500	NC_015731	GACG	2	8	225627	225634	25 %	0 %	50 %	25 %	339481715

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