MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015731	ACGGC	2	10	123132	123141	20 %	0 %	40 %	40 %	339481622
2502	NC_015731	GCA	2	6	123146	123151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481622
2503	NC_015731	GA	3	6	123237	123242	50 %	0 %	50 %	0 %	339481622
2504	NC_015731	GAA	2	6	123260	123265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481622
2505	NC_015731	GAA	2	6	123395	123400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481622
2506	NC_015731	CGG	2	6	123412	123417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481622
2507	NC_015731	CAT	2	6	123436	123441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481622
2508	NC_015731	CAT	2	6	123451	123456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481622
2509	NC_015731	GGC	2	6	123457	123462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481622
2510	NC_015731	GCA	2	6	123472	123477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481622
2511	NC_015731	AAT	2	6	123608	123613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015731	AGTC	2	8	123615	123622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_015731	A	7	7	123638	123644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_015731	CTAA	2	8	123653	123660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_015731	TCA	2	6	123670	123675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_015731	A	7	7	123760	123766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015731	TTA	2	6	123820	123825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015731	GGA	2	6	123831	123836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015731	GCG	2	6	123940	123945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481623
2520	NC_015731	TGG	2	6	124120	124125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481623
2521	NC_015731	GAT	2	6	124202	124207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481623
2522	NC_015731	GCA	2	6	124223	124228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481623
2523	NC_015731	GCA	2	6	124314	124319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481623
2524	NC_015731	GCC	2	6	124359	124364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481623
2525	NC_015731	ACC	2	6	124380	124385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481623
2526	NC_015731	CGG	2	6	124391	124396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481623
2527	NC_015731	CGTGC	2	10	124456	124465	0 %	20 %	40 %	40 %	339481623
2528	NC_015731	GCG	2	6	124542	124547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481623
2529	NC_015731	CCA	2	6	124617	124622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481623
2530	NC_015731	GCT	2	6	124671	124676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481623
2531	NC_015731	GCT	2	6	124692	124697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481623
2532	NC_015731	AAT	2	6	124743	124748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481623
2533	NC_015731	GTG	2	6	124749	124754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481623
2534	NC_015731	GCA	2	6	124773	124778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481623
2535	NC_015731	A	6	6	124778	124783	100 %	0 %	0 %	0 %	339481623
2536	NC_015731	A	6	6	124891	124896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_015731	GCA	2	6	124904	124909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_015731	T	6	6	124933	124938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_015731	CAA	2	6	124944	124949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_015731	GAATT	2	10	124996	125005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_015731	ATT	2	6	125013	125018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015731	ATTC	2	8	125175	125182	25 %	50 %	0 %	25 %	339481624
2543	NC_015731	GC	3	6	125187	125192	0 %	0 %	50 %	50 %	339481624
2544	NC_015731	GCGG	2	8	125199	125206	0 %	0 %	75 %	25 %	339481624
2545	NC_015731	AGCA	2	8	125239	125246	50 %	0 %	25 %	25 %	339481624
2546	NC_015731	TA	3	6	125317	125322	50 %	50 %	0 %	0 %	339481624
2547	NC_015731	TCAT	2	8	125361	125368	25 %	50 %	0 %	25 %	339481624
2548	NC_015731	GCA	2	6	125377	125382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481624
2549	NC_015731	TCA	2	6	125392	125397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481624
2550	NC_015731	GGC	2	6	125415	125420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481624
2551	NC_015731	GCT	2	6	125578	125583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481624
2552	NC_015731	AATC	2	8	125621	125628	50 %	25 %	0 %	25 %	339481624
2553	NC_015731	ACC	2	6	125640	125645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481624
2554	NC_015731	AAC	2	6	125646	125651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481624
2555	NC_015731	CCG	2	6	125702	125707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481624
2556	NC_015731	ACA	2	6	125731	125736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481624
2557	NC_015731	TGGCGA	2	12	125833	125844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339481624
2558	NC_015731	CTGG	2	8	125862	125869	0 %	25 %	50 %	25 %	339481624
2559	NC_015731	CGG	3	9	125897	125905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481624
2560	NC_015731	TGG	2	6	126064	126069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481624
2561	NC_015731	AGA	2	6	126092	126097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481624
2562	NC_015731	ATT	2	6	126108	126113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481624
2563	NC_015731	GTC	2	6	126192	126197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481624
2564	NC_015731	A	7	7	126200	126206	100 %	0 %	0 %	0 %	339481624
2565	NC_015731	ATT	2	6	126252	126257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481625
2566	NC_015731	AAG	2	6	126394	126399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481625
2567	NC_015731	GCC	2	6	126440	126445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481625
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2569	NC_015731	CAT	2	6	126464	126469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481625
2570	NC_015731	ATG	2	6	126534	126539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481625
2571	NC_015731	GAA	2	6	126545	126550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481625
2572	NC_015731	GAA	2	6	126573	126578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481625
2573	NC_015731	TGC	2	6	126583	126588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481625
2574	NC_015731	TA	3	6	126660	126665	50 %	50 %	0 %	0 %	339481625
2575	NC_015731	GCC	2	6	126714	126719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481625
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2577	NC_015731	TGA	2	6	126847	126852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481625
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2579	NC_015731	TTC	2	6	126989	126994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481625
2580	NC_015731	TAT	2	6	127121	127126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_015731	T	6	6	127164	127169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_015731	GCAC	2	8	127173	127180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_015731	ATGA	2	8	127229	127236	50 %	25 %	25 %	0 %	339481626
2584	NC_015731	TTTTCT	2	12	127297	127308	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339481626
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2586	NC_015731	TGATT	2	10	127393	127402	20 %	60 %	20 %	0 %	339481626
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2589	NC_015731	TGA	2	6	127533	127538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481626
2590	NC_015731	CTG	2	6	127547	127552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481626
2591	NC_015731	ATT	2	6	127562	127567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481626
2592	NC_015731	TCG	2	6	127691	127696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481626
2593	NC_015731	CTG	2	6	127703	127708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481626
2594	NC_015731	TTGC	2	8	127748	127755	0 %	50 %	25 %	25 %	339481626
2595	NC_015731	T	6	6	127777	127782	0 %	100 %	0 %	0 %	339481626
2596	NC_015731	ATT	2	6	127817	127822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481626
2597	NC_015731	CAA	2	6	127835	127840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481626
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2599	NC_015731	CTG	2	6	127866	127871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_015731	CAT	2	6	127890	127895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481627
2601	NC_015731	A	6	6	127966	127971	100 %	0 %	0 %	0 %	339481627
2602	NC_015731	TTG	2	6	127981	127986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481627
2603	NC_015731	AAAC	2	8	128015	128022	75 %	0 %	0 %	25 %	339481627
2604	NC_015731	TTG	2	6	128037	128042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481627
2605	NC_015731	CTGC	2	8	128246	128253	0 %	25 %	25 %	50 %	339481627
2606	NC_015731	GCC	2	6	128281	128286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481627
2607	NC_015731	CGG	2	6	128298	128303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481627
2608	NC_015731	CAG	2	6	128308	128313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481627
2609	NC_015731	T	6	6	128385	128390	0 %	100 %	0 %	0 %	339481627
2610	NC_015731	AG	3	6	128433	128438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_015731	CTG	2	6	128512	128517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_015731	TCA	2	6	128554	128559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481628
2613	NC_015731	TGT	2	6	128593	128598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481628
2614	NC_015731	ATTGG	2	10	128673	128682	20 %	40 %	40 %	0 %	339481628
2615	NC_015731	GAA	2	6	128696	128701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481628
2616	NC_015731	T	6	6	128716	128721	0 %	100 %	0 %	0 %	339481628
2617	NC_015731	ACA	2	6	128799	128804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481628
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2619	NC_015731	CTG	2	6	128926	128931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481628
2620	NC_015731	T	7	7	128939	128945	0 %	100 %	0 %	0 %	339481628
2621	NC_015731	CAG	2	6	128978	128983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481628
2622	NC_015731	CAAA	2	8	129048	129055	75 %	0 %	0 %	25 %	339481628
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2624	NC_015731	CTT	2	6	129119	129124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481628
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2626	NC_015731	T	7	7	129171	129177	0 %	100 %	0 %	0 %	339481628
2627	NC_015731	GCAG	2	8	129307	129314	25 %	0 %	50 %	25 %	339481628
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2633	NC_015731	CTAC	2	8	129595	129602	25 %	25 %	0 %	50 %	339481628
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2863	NC_015731	TAT	2	6	140353	140358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2864	NC_015731	GCA	2	6	140523	140528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481638
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2993	NC_015731	TGC	2	6	147329	147334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481645
2994	NC_015731	ATA	2	6	147389	147394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481645
2995	NC_015731	TCA	2	6	147496	147501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481645
2996	NC_015731	ATT	2	6	147555	147560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481645
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2998	NC_015731	ATT	2	6	147698	147703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481645
2999	NC_015731	GC	3	6	147712	147717	0 %	0 %	50 %	50 %	339481645
3000	NC_015731	GCA	2	6	147837	147842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481645

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