MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_015731	CAC	2	6	98791	98796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481604
2004	NC_015731	GGA	2	6	98824	98829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481604
2005	NC_015731	CTG	3	9	98963	98971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481604
2006	NC_015731	CGG	2	6	99051	99056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481604
2007	NC_015731	CAT	2	6	99068	99073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481604
2008	NC_015731	TCGA	2	8	99074	99081	25 %	25 %	25 %	25 %	339481604
2009	NC_015731	GTT	3	9	99100	99108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481604
2010	NC_015731	CGC	2	6	99179	99184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481604
2011	NC_015731	ACC	2	6	99237	99242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481604
2012	NC_015731	GCT	2	6	99256	99261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481604
2013	NC_015731	GGA	2	6	99277	99282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481604
2014	NC_015731	AAGA	2	8	99311	99318	75 %	0 %	25 %	0 %	339481604
2015	NC_015731	TGC	2	6	99330	99335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481604
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2017	NC_015731	TGG	2	6	99517	99522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481605
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2123	NC_015731	TTC	2	6	104926	104931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481608
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2145	NC_015731	TAG	2	6	105893	105898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2243	NC_015731	CGA	2	6	110115	110120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481613
2244	NC_015731	AT	3	6	110176	110181	50 %	50 %	0 %	0 %	339481613
2245	NC_015731	GCCC	2	8	110340	110347	0 %	0 %	25 %	75 %	339481613
2246	NC_015731	GCA	2	6	110400	110405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481613
2247	NC_015731	GCCGC	2	10	110465	110474	0 %	0 %	40 %	60 %	339481613
2248	NC_015731	GC	3	6	110591	110596	0 %	0 %	50 %	50 %	339481613
2249	NC_015731	ATC	2	6	110614	110619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481613
2250	NC_015731	TCGA	2	8	110625	110632	25 %	25 %	25 %	25 %	339481613
2251	NC_015731	GC	3	6	110796	110801	0 %	0 %	50 %	50 %	339481613
2252	NC_015731	GCA	2	6	110876	110881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481613
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2254	NC_015731	CCG	2	6	110930	110935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481613
2255	NC_015731	GCT	2	6	111014	111019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481613
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2258	NC_015731	ATA	2	6	111172	111177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481613
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2262	NC_015731	ATC	2	6	111365	111370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481613
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2264	NC_015731	GACA	2	8	111517	111524	50 %	0 %	25 %	25 %	339481613
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2281	NC_015731	GC	3	6	112193	112198	0 %	0 %	50 %	50 %	339481613
2282	NC_015731	CG	3	6	112239	112244	0 %	0 %	50 %	50 %	339481613
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2322	NC_015731	TCCTG	2	10	114288	114297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2356	NC_015731	ATG	2	6	115848	115853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2358	NC_015731	TTG	2	6	115988	115993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2359	NC_015731	TAA	2	6	116015	116020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2360	NC_015731	A	7	7	116067	116073	100 %	0 %	0 %	0 %	339481616
2361	NC_015731	AT	3	6	116305	116310	50 %	50 %	0 %	0 %	339481616
2362	NC_015731	CAA	2	6	116350	116355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481616
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2364	NC_015731	ATG	2	6	116396	116401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481616
2365	NC_015731	CTGA	2	8	116581	116588	25 %	25 %	25 %	25 %	339481616
2366	NC_015731	AAG	2	6	116744	116749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481616
2367	NC_015731	GCC	2	6	116795	116800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481616
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2369	NC_015731	TAT	2	6	116817	116822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481616
2370	NC_015731	ATG	2	6	116849	116854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481616
2371	NC_015731	TTG	2	6	116861	116866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481616
2372	NC_015731	GATG	2	8	116904	116911	25 %	25 %	50 %	0 %	339481616
2373	NC_015731	T	6	6	117046	117051	0 %	100 %	0 %	0 %	339481616
2374	NC_015731	CAGC	2	8	117065	117072	25 %	0 %	25 %	50 %	339481616
2375	NC_015731	TCAA	2	8	117122	117129	50 %	25 %	0 %	25 %	339481616
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2377	NC_015731	ATC	2	6	117265	117270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481616
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2380	NC_015731	ATT	2	6	117391	117396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481616
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2393	NC_015731	CTT	2	6	117894	117899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_015731	GAT	2	6	117913	117918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2396	NC_015731	TCA	2	6	117985	117990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2447	NC_015731	TGC	2	6	120225	120230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481618
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2450	NC_015731	T	6	6	120355	120360	0 %	100 %	0 %	0 %	339481618
2451	NC_015731	ATTC	2	8	120425	120432	25 %	50 %	0 %	25 %	339481618
2452	NC_015731	A	6	6	120437	120442	100 %	0 %	0 %	0 %	339481618
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2454	NC_015731	ATG	2	6	120519	120524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481618
2455	NC_015731	A	6	6	120603	120608	100 %	0 %	0 %	0 %	339481618
2456	NC_015731	A	7	7	120661	120667	100 %	0 %	0 %	0 %	339481618
2457	NC_015731	AATG	2	8	120708	120715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2458	NC_015731	GGC	2	6	120763	120768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481619
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2479	NC_015731	GCA	2	6	121976	121981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481620
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2482	NC_015731	CAA	2	6	122095	122100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481620
2483	NC_015731	A	7	7	122196	122202	100 %	0 %	0 %	0 %	339481620
2484	NC_015731	GAT	2	6	122329	122334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481620
2485	NC_015731	AAT	2	6	122353	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2486	NC_015731	A	6	6	122453	122458	100 %	0 %	0 %	0 %	339481621
2487	NC_015731	GC	3	6	122540	122545	0 %	0 %	50 %	50 %	339481621
2488	NC_015731	TAAA	2	8	122569	122576	75 %	25 %	0 %	0 %	339481621
2489	NC_015731	GGC	2	6	122629	122634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481622
2490	NC_015731	ATTG	2	8	122647	122654	25 %	50 %	25 %	0 %	339481622
2491	NC_015731	A	6	6	122715	122720	100 %	0 %	0 %	0 %	339481622
2492	NC_015731	T	7	7	122733	122739	0 %	100 %	0 %	0 %	339481622
2493	NC_015731	CTG	2	6	122834	122839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481622
2494	NC_015731	GCG	2	6	122919	122924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481622
2495	NC_015731	ATT	2	6	122971	122976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481622
2496	NC_015731	GAA	2	6	122990	122995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481622
2497	NC_015731	GAT	3	9	123017	123025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481622
2498	NC_015731	GTA	2	6	123056	123061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481622
2499	NC_015731	AGC	2	6	123082	123087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481622
2500	NC_015731	AGATC	2	10	123103	123112	40 %	20 %	20 %	20 %	339481622

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