MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015731	TGCG	2	8	48221	48228	0 %	25 %	50 %	25 %	339481556
1002	NC_015731	TCA	2	6	48242	48247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1003	NC_015731	TGG	2	6	48248	48253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481556
1004	NC_015731	TGGTG	2	10	48258	48267	0 %	40 %	60 %	0 %	339481556
1005	NC_015731	ATC	2	6	48400	48405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1006	NC_015731	A	6	6	48511	48516	100 %	0 %	0 %	0 %	339481556
1007	NC_015731	GCC	2	6	48520	48525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481556
1008	NC_015731	AC	3	6	48618	48623	50 %	0 %	0 %	50 %	339481556
1009	NC_015731	CCA	2	6	48653	48658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481556
1010	NC_015731	AGCA	2	8	48775	48782	50 %	0 %	25 %	25 %	339481556
1011	NC_015731	TGC	2	6	48842	48847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1012	NC_015731	GAT	2	6	48849	48854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481556
1013	NC_015731	GC	3	6	48892	48897	0 %	0 %	50 %	50 %	339481556
1014	NC_015731	GATG	2	8	48945	48952	25 %	25 %	50 %	0 %	339481556
1015	NC_015731	CAT	2	6	49072	49077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1016	NC_015731	CGA	2	6	49098	49103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1017	NC_015731	GAG	2	6	49120	49125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481556
1018	NC_015731	AGAT	2	8	49163	49170	50 %	25 %	25 %	0 %	339481556
1019	NC_015731	GCG	3	9	49191	49199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481556
1020	NC_015731	TGAAC	2	10	49356	49365	40 %	20 %	20 %	20 %	339481556
1021	NC_015731	CTG	2	6	49462	49467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1022	NC_015731	CCTT	2	8	49478	49485	0 %	50 %	0 %	50 %	339481556
1023	NC_015731	AGC	2	6	49520	49525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1024	NC_015731	ATGA	2	8	49648	49655	50 %	25 %	25 %	0 %	339481556
1025	NC_015731	ATC	2	6	49726	49731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1026	NC_015731	CG	3	6	49732	49737	0 %	0 %	50 %	50 %	339481556
1027	NC_015731	GTG	2	6	49756	49761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481556
1028	NC_015731	ACG	2	6	49784	49789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1029	NC_015731	GCC	2	6	49804	49809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481556
1030	NC_015731	ATC	2	6	49854	49859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1031	NC_015731	ATC	2	6	49864	49869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1032	NC_015731	CTG	2	6	49885	49890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1033	NC_015731	TGC	2	6	49892	49897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481556
1034	NC_015731	CGG	2	6	49918	49923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481556
1035	NC_015731	GGC	2	6	49956	49961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481556
1036	NC_015731	GTG	2	6	49990	49995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481556
1037	NC_015731	CAA	2	6	50049	50054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481556
1038	NC_015731	CCT	2	6	50055	50060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339481556
1039	NC_015731	ACC	2	6	50077	50082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481556
1040	NC_015731	TGA	2	6	50139	50144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481556
1041	NC_015731	TTC	2	6	50203	50208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481556
1042	NC_015731	CAA	2	6	50316	50321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481556
1043	NC_015731	ATC	3	9	50371	50379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481556
1044	NC_015731	CGG	2	6	50384	50389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481556
1045	NC_015731	CTCC	2	8	50440	50447	0 %	25 %	0 %	75 %	339481556
1046	NC_015731	GTT	2	6	50460	50465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481556
1047	NC_015731	GGC	2	6	50600	50605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481557
1048	NC_015731	TCG	2	6	50606	50611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1049	NC_015731	TGC	2	6	50658	50663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1050	NC_015731	GCCT	2	8	50685	50692	0 %	25 %	25 %	50 %	339481557
1051	NC_015731	CGATC	2	10	50713	50722	20 %	20 %	20 %	40 %	339481557
1052	NC_015731	CAG	2	6	50729	50734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1053	NC_015731	AGC	2	6	50741	50746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1054	NC_015731	CGG	2	6	50769	50774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481557
1055	NC_015731	GGC	2	6	50802	50807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481557
1056	NC_015731	GCATC	2	10	50905	50914	20 %	20 %	20 %	40 %	339481557
1057	NC_015731	CG	3	6	50940	50945	0 %	0 %	50 %	50 %	339481557
1058	NC_015731	ATTGA	2	10	50948	50957	40 %	40 %	20 %	0 %	339481557
1059	NC_015731	CAC	2	6	51020	51025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481557
1060	NC_015731	CG	3	6	51033	51038	0 %	0 %	50 %	50 %	339481557
1061	NC_015731	CTG	2	6	51047	51052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1062	NC_015731	GGCA	2	8	51145	51152	25 %	0 %	50 %	25 %	339481557
1063	NC_015731	CA	3	6	51151	51156	50 %	0 %	0 %	50 %	339481557
1064	NC_015731	GCA	2	6	51228	51233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1065	NC_015731	ACG	2	6	51239	51244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1066	NC_015731	ATG	2	6	51272	51277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481557
1067	NC_015731	GGC	2	6	51451	51456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481557
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1069	NC_015731	CGG	2	6	51547	51552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481557
1070	NC_015731	GCA	2	6	51566	51571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481557
1071	NC_015731	GTTC	2	8	51575	51582	0 %	50 %	25 %	25 %	339481557
1072	NC_015731	ACGA	2	8	51698	51705	50 %	0 %	25 %	25 %	339481557
1073	NC_015731	TGA	2	6	51711	51716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481557
1074	NC_015731	GT	3	6	51728	51733	0 %	50 %	50 %	0 %	339481557
1075	NC_015731	A	8	8	51778	51785	100 %	0 %	0 %	0 %	339481558
1076	NC_015731	CT	3	6	51796	51801	0 %	50 %	0 %	50 %	339481558
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1079	NC_015731	GC	3	6	51834	51839	0 %	0 %	50 %	50 %	339481558
1080	NC_015731	ATC	2	6	51988	51993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481558
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1083	NC_015731	CGG	2	6	52155	52160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481558
1084	NC_015731	GCA	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481558
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1088	NC_015731	CGCA	2	8	52579	52586	25 %	0 %	25 %	50 %	339481558
1089	NC_015731	GAT	2	6	52614	52619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481558
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1091	NC_015731	AACC	2	8	52670	52677	50 %	0 %	0 %	50 %	339481558
1092	NC_015731	AGCC	2	8	52720	52727	25 %	0 %	25 %	50 %	339481558
1093	NC_015731	ATT	2	6	52779	52784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481558
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1096	NC_015731	CGG	2	6	52869	52874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481558
1097	NC_015731	GTA	2	6	52990	52995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481558
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1100	NC_015731	GTT	2	6	53081	53086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481558
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1104	NC_015731	T	6	6	53208	53213	0 %	100 %	0 %	0 %	339481558
1105	NC_015731	TTCA	2	8	53230	53237	25 %	50 %	0 %	25 %	339481558
1106	NC_015731	CAT	2	6	53238	53243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481558
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1109	NC_015731	TG	3	6	53343	53348	0 %	50 %	50 %	0 %	339481558
1110	NC_015731	TCA	2	6	53373	53378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481558
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1112	NC_015731	ATC	2	6	53422	53427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481558
1113	NC_015731	ATCT	2	8	53431	53438	25 %	50 %	0 %	25 %	339481558
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1120	NC_015731	CGA	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481558
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1123	NC_015731	TGA	2	6	53741	53746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481558
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1125	NC_015731	TGA	2	6	53954	53959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481558
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