MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015731	T	6	6	276117	276122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015731	AAC	2	6	276147	276152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015731	TTGA	2	8	276196	276203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_015731	TGC	2	6	276251	276256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481757
5505	NC_015731	GTT	2	6	276336	276341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481757
5506	NC_015731	A	6	6	276472	276477	100 %	0 %	0 %	0 %	339481757
5507	NC_015731	GGT	2	6	276480	276485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481757
5508	NC_015731	GCA	2	6	276489	276494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481757
5509	NC_015731	TTG	2	6	276561	276566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481757
5510	NC_015731	TC	3	6	276568	276573	0 %	50 %	0 %	50 %	339481757
5511	NC_015731	GTG	2	6	276645	276650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481757
5512	NC_015731	GCA	2	6	276660	276665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481757
5513	NC_015731	GCA	2	6	276772	276777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481757
5514	NC_015731	ACG	2	6	276846	276851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481757
5515	NC_015731	TCCG	2	8	276879	276886	0 %	25 %	25 %	50 %	339481757
5516	NC_015731	CGC	2	6	276897	276902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481757
5517	NC_015731	A	6	6	276915	276920	100 %	0 %	0 %	0 %	339481757
5518	NC_015731	CG	3	6	276946	276951	0 %	0 %	50 %	50 %	339481757
5519	NC_015731	CAAGG	2	10	277119	277128	40 %	0 %	40 %	20 %	339481757
5520	NC_015731	GAAA	2	8	277244	277251	75 %	0 %	25 %	0 %	339481757
5521	NC_015731	TG	3	6	277289	277294	0 %	50 %	50 %	0 %	339481758
5522	NC_015731	TGCG	2	8	277317	277324	0 %	25 %	50 %	25 %	339481758
5523	NC_015731	CG	3	6	277387	277392	0 %	0 %	50 %	50 %	339481758
5524	NC_015731	ACGC	2	8	277483	277490	25 %	0 %	25 %	50 %	339481758
5525	NC_015731	GAAA	2	8	277531	277538	75 %	0 %	25 %	0 %	339481758
5526	NC_015731	TTGA	2	8	277556	277563	25 %	50 %	25 %	0 %	339481758
5527	NC_015731	AAGAG	2	10	277648	277657	60 %	0 %	40 %	0 %	339481758
5528	NC_015731	ATG	2	6	277679	277684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481758
5529	NC_015731	ATA	2	6	277706	277711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481758
5530	NC_015731	CAA	2	6	277712	277717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481758
5531	NC_015731	GCT	2	6	277755	277760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481759
5532	NC_015731	A	6	6	277896	277901	100 %	0 %	0 %	0 %	339481759
5533	NC_015731	ATC	2	6	278041	278046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481759
5534	NC_015731	A	6	6	278102	278107	100 %	0 %	0 %	0 %	339481759
5535	NC_015731	ACA	2	6	278129	278134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481760
5536	NC_015731	T	6	6	278145	278150	0 %	100 %	0 %	0 %	339481760
5537	NC_015731	TCG	2	6	278170	278175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5538	NC_015731	CAGT	2	8	278287	278294	25 %	25 %	25 %	25 %	339481760
5539	NC_015731	GCGG	2	8	278313	278320	0 %	0 %	75 %	25 %	339481760
5540	NC_015731	CAT	2	6	278361	278366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481760
5541	NC_015731	AGA	2	6	278498	278503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481760
5542	NC_015731	TGA	2	6	278504	278509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481760
5543	NC_015731	TGAA	2	8	278527	278534	50 %	25 %	25 %	0 %	339481760
5544	NC_015731	CGTA	2	8	278558	278565	25 %	25 %	25 %	25 %	339481760
5545	NC_015731	T	6	6	278629	278634	0 %	100 %	0 %	0 %	339481760
5546	NC_015731	GCC	2	6	278663	278668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481760
5547	NC_015731	TGCCGA	2	12	278675	278686	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5548	NC_015731	AC	3	6	278749	278754	50 %	0 %	0 %	50 %	339481760
5549	NC_015731	GCA	2	6	278819	278824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5550	NC_015731	GATT	2	8	278843	278850	25 %	50 %	25 %	0 %	339481760
5551	NC_015731	CAAC	2	8	278884	278891	50 %	0 %	0 %	50 %	339481760
5552	NC_015731	GTAT	2	8	278996	279003	25 %	50 %	25 %	0 %	339481760
5553	NC_015731	CAT	2	6	279011	279016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481760
5554	NC_015731	CCG	2	6	279017	279022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481760
5555	NC_015731	CTTT	2	8	279061	279068	0 %	75 %	0 %	25 %	339481760
5556	NC_015731	AGA	2	6	279080	279085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481760
5557	NC_015731	GCA	2	6	279126	279131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5558	NC_015731	ACA	2	6	279155	279160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481760
5559	NC_015731	AGA	3	9	279161	279169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481760
5560	NC_015731	GAA	2	6	279210	279215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481760
5561	NC_015731	TAAAA	2	10	279227	279236	80 %	20 %	0 %	0 %	339481760
5562	NC_015731	GGT	2	6	279411	279416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481760
5563	NC_015731	GCA	2	6	279464	279469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5564	NC_015731	GTT	2	6	279543	279548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481760
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5566	NC_015731	GT	3	6	279661	279666	0 %	50 %	50 %	0 %	339481760
5567	NC_015731	TTA	2	6	279681	279686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481760
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5571	NC_015731	CG	4	8	279852	279859	0 %	0 %	50 %	50 %	339481760
5572	NC_015731	GAT	2	6	279975	279980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481760
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5574	NC_015731	GCA	2	6	280196	280201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481760
5575	NC_015731	AACC	2	8	280241	280248	50 %	0 %	0 %	50 %	339481760
5576	NC_015731	CA	3	6	280259	280264	50 %	0 %	0 %	50 %	339481760
5577	NC_015731	A	6	6	280264	280269	100 %	0 %	0 %	0 %	339481760
5578	NC_015731	ATC	2	6	280278	280283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481760
5579	NC_015731	GAT	2	6	280350	280355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481760
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5581	NC_015731	CTGAC	2	10	280534	280543	20 %	20 %	20 %	40 %	339481760
5582	NC_015731	CAA	2	6	280584	280589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481760
5583	NC_015731	GGGC	2	8	280608	280615	0 %	0 %	75 %	25 %	339481760
5584	NC_015731	AG	3	6	280689	280694	50 %	0 %	50 %	0 %	339481760
5585	NC_015731	ATAG	2	8	280706	280713	50 %	25 %	25 %	0 %	339481760
5586	NC_015731	TTA	2	6	280737	280742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_015731	AGA	2	6	280791	280796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_015731	TGA	2	6	280866	280871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015731	TCGC	2	8	280880	280887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5590	NC_015731	TCT	2	6	280904	280909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_015731	T	6	6	280953	280958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_015731	A	6	6	280969	280974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015731	TAAA	2	8	281012	281019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015731	AGAA	2	8	281034	281041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_015731	CAT	2	6	281182	281187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_015731	CTTG	2	8	281190	281197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5597	NC_015731	CAG	2	6	281210	281215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015731	ATGG	2	8	281329	281336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015731	ATTT	2	8	281341	281348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_015731	CAAA	2	8	281360	281367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5601	NC_015731	CG	3	6	281422	281427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_015731	TATC	2	8	281428	281435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_015731	AT	3	6	281478	281483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015731	CGT	2	6	281484	281489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_015731	TCT	2	6	281529	281534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_015731	AAGC	2	8	281552	281559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_015731	ATA	2	6	281660	281665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015731	ATCA	3	12	281732	281743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_015731	ATT	2	6	281806	281811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_015731	ATCC	2	8	281849	281856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_015731	GGATT	2	10	281968	281977	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015731	CAAA	2	8	281990	281997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_015731	ATT	2	6	282011	282016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015731	ATC	2	6	282074	282079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015731	AAT	2	6	282094	282099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015731	GCC	2	6	282133	282138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_015731	CAC	2	6	282146	282151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5618	NC_015731	CAAT	2	8	282189	282196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_015731	TGG	2	6	282208	282213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015731	GCA	2	6	282214	282219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_015731	AAAAT	2	10	282253	282262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_015731	CAA	2	6	282358	282363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_015731	TAG	2	6	282377	282382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015731	GGGAT	2	10	282399	282408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_015731	GCA	2	6	282430	282435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_015731	AAT	2	6	282475	282480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5628	NC_015731	AAAT	2	8	282512	282519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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