MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015731	A	6	6	250975	250980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015731	AAAAT	2	10	250995	251004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015731	GAA	2	6	251009	251014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481736
5004	NC_015731	GCC	2	6	251108	251113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481736
5005	NC_015731	TTG	2	6	251158	251163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481736
5006	NC_015731	CCG	2	6	251197	251202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481736
5007	NC_015731	GAT	2	6	251228	251233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481736
5008	NC_015731	GATTG	2	10	251348	251357	20 %	40 %	40 %	0 %	339481736
5009	NC_015731	CAT	2	6	251573	251578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481736
5010	NC_015731	CGG	2	6	251579	251584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481736
5011	NC_015731	G	7	7	251583	251589	0 %	0 %	100 %	0 %	339481736
5012	NC_015731	TGC	2	6	251635	251640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481736
5013	NC_015731	AGC	2	6	251654	251659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481736
5014	NC_015731	ATT	2	6	251691	251696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481736
5015	NC_015731	GCG	2	6	251741	251746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481736
5016	NC_015731	CCA	2	6	251823	251828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481736
5017	NC_015731	TGG	2	6	251835	251840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481736
5018	NC_015731	GAA	2	6	251910	251915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481736
5019	NC_015731	ATT	2	6	251940	251945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481736
5020	NC_015731	CAG	2	6	252010	252015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481736
5021	NC_015731	CCGGG	2	10	252043	252052	0 %	0 %	60 %	40 %	339481736
5022	NC_015731	TGG	2	6	252066	252071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481736
5023	NC_015731	TGAT	2	8	252073	252080	25 %	50 %	25 %	0 %	339481736
5024	NC_015731	CAG	2	6	252096	252101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481736
5025	NC_015731	TGGT	2	8	252121	252128	0 %	50 %	50 %	0 %	339481736
5026	NC_015731	CCG	2	6	252161	252166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481736
5027	NC_015731	CAT	2	6	252194	252199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481736
5028	NC_015731	TCG	2	6	252214	252219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481736
5029	NC_015731	CCTT	2	8	252223	252230	0 %	50 %	0 %	50 %	339481736
5030	NC_015731	ATT	2	6	252240	252245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481736
5031	NC_015731	G	6	6	252287	252292	0 %	0 %	100 %	0 %	339481736
5032	NC_015731	TGAT	2	8	252319	252326	25 %	50 %	25 %	0 %	339481736
5033	NC_015731	T	7	7	252416	252422	0 %	100 %	0 %	0 %	339481736
5034	NC_015731	TCAA	2	8	252484	252491	50 %	25 %	0 %	25 %	339481736
5035	NC_015731	TGT	2	6	252521	252526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481736
5036	NC_015731	ATT	2	6	252591	252596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481736
5037	NC_015731	TATTT	2	10	252689	252698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015731	GAAA	3	12	252709	252720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015731	AATT	2	8	252736	252743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015731	TG	3	6	252771	252776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015731	TATG	2	8	252795	252802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015731	T	6	6	252809	252814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015731	CAA	2	6	252818	252823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015731	ATTG	2	8	252838	252845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015731	TAT	2	6	252878	252883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481737
5046	NC_015731	T	7	7	252892	252898	0 %	100 %	0 %	0 %	339481737
5047	NC_015731	ATG	2	6	252900	252905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481737
5048	NC_015731	TAT	2	6	252910	252915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481737
5049	NC_015731	AGCTG	2	10	252968	252977	20 %	20 %	40 %	20 %	339481737
5050	NC_015731	GAT	2	6	253059	253064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481737
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5052	NC_015731	AG	3	6	253127	253132	50 %	0 %	50 %	0 %	339481737
5053	NC_015731	TGT	2	6	253176	253181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015731	GAA	2	6	253200	253205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015731	TG	3	6	253259	253264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015731	TAT	2	6	253281	253286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015731	TTG	2	6	253322	253327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481738
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5059	NC_015731	CCGG	2	8	253408	253415	0 %	0 %	50 %	50 %	339481738
5060	NC_015731	CCGG	2	8	253428	253435	0 %	0 %	50 %	50 %	339481738
5061	NC_015731	GAT	2	6	253443	253448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481738
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5065	NC_015731	AG	3	6	253593	253598	50 %	0 %	50 %	0 %	339481738
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5072	NC_015731	TGA	2	6	253980	253985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481738
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5079	NC_015731	TTA	2	6	254340	254345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_015731	TAA	2	6	254415	254420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_015731	TAT	2	6	254532	254537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481739
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5088	NC_015731	GT	4	8	254829	254836	0 %	50 %	50 %	0 %	339481739
5089	NC_015731	AGTA	2	8	254858	254865	50 %	25 %	25 %	0 %	339481739
5090	NC_015731	A	6	6	254884	254889	100 %	0 %	0 %	0 %	339481739
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5113	NC_015731	AAGC	2	8	255879	255886	50 %	0 %	25 %	25 %	339481741
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5122	NC_015731	GAA	2	6	256462	256467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481742
5123	NC_015731	A	6	6	256474	256479	100 %	0 %	0 %	0 %	339481742
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5125	NC_015731	AGAA	2	8	256547	256554	75 %	0 %	25 %	0 %	339481742
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5233	NC_015731	CAATA	2	10	262035	262044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5234	NC_015731	TTG	2	6	262054	262059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_015731	ATTT	2	8	262061	262068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_015731	TATGTT	2	12	262072	262083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	339481748
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5240	NC_015731	TGA	2	6	262306	262311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481748
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5243	NC_015731	A	6	6	262500	262505	100 %	0 %	0 %	0 %	339481748
5244	NC_015731	A	6	6	262521	262526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_015731	TCT	2	6	262537	262542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_015731	ATT	2	6	262609	262614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481749
5247	NC_015731	CA	3	6	262648	262653	50 %	0 %	0 %	50 %	339481749
5248	NC_015731	TGA	2	6	262696	262701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481749
5249	NC_015731	TGA	2	6	262714	262719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481749
5250	NC_015731	GCT	2	6	262766	262771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481749
5251	NC_015731	ACA	2	6	262842	262847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481749
5252	NC_015731	CATTT	2	10	262878	262887	20 %	60 %	0 %	20 %	339481749
5253	NC_015731	ATTG	2	8	262940	262947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_015731	TGAT	2	8	262952	262959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_015731	ATT	2	6	263022	263027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481750
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5288	NC_015731	GTAA	2	8	265170	265177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_015731	GC	3	6	269356	269361	0 %	0 %	50 %	50 %	339481752
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5373	NC_015731	GTT	2	6	269526	269531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481752
5374	NC_015731	GTCAAT	2	12	269554	269565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	339481752
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5403	NC_015731	CTAAA	2	10	271146	271155	60 %	20 %	0 %	20 %	339481753
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5413	NC_015731	TAAG	2	8	271565	271572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5481	NC_015731	TGAT	2	8	275215	275222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5482	NC_015731	GTAA	2	8	275229	275236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5483	NC_015731	GGTT	2	8	275332	275339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5484	NC_015731	ATTTT	2	10	275342	275351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5485	NC_015731	T	6	6	275348	275353	0 %	100 %	0 %	0 %	339481756
5486	NC_015731	TGC	2	6	275361	275366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481756
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5494	NC_015731	A	6	6	275761	275766	100 %	0 %	0 %	0 %	339481756
5495	NC_015731	ATA	2	6	275815	275820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481756
5496	NC_015731	TCA	2	6	275821	275826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481756
5497	NC_015731	ATT	2	6	275848	275853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481756
5498	NC_015731	T	8	8	275852	275859	0 %	100 %	0 %	0 %	339481756
5499	NC_015731	TAA	2	6	275988	275993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481756
5500	NC_015731	CAT	2	6	276078	276083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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