MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 74147

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015731	GCC	2	6	225649	225654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481715
4502	NC_015731	TTGCT	2	10	225671	225680	0 %	60 %	20 %	20 %	339481715
4503	NC_015731	CTGC	2	8	225703	225710	0 %	25 %	25 %	50 %	339481715
4504	NC_015731	AC	3	6	225714	225719	50 %	0 %	0 %	50 %	339481715
4505	NC_015731	GAT	2	6	225736	225741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481715
4506	NC_015731	TAT	2	6	225810	225815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481715
4507	NC_015731	ATG	2	6	225821	225826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481715
4508	NC_015731	GATT	2	8	225839	225846	25 %	50 %	25 %	0 %	339481715
4509	NC_015731	A	6	6	225892	225897	100 %	0 %	0 %	0 %	339481715
4510	NC_015731	ATA	2	6	225933	225938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481715
4511	NC_015731	TGC	2	6	225948	225953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_015731	AGTTG	2	10	226000	226009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015731	AGC	2	6	226046	226051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4514	NC_015731	CCAAT	2	10	226053	226062	40 %	20 %	0 %	40 %	339481716
4515	NC_015731	GAA	2	6	226123	226128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339481716
4516	NC_015731	AG	3	6	226156	226161	50 %	0 %	50 %	0 %	339481716
4517	NC_015731	GCGA	2	8	226166	226173	25 %	0 %	50 %	25 %	339481716
4518	NC_015731	GCT	2	6	226291	226296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4519	NC_015731	A	6	6	226324	226329	100 %	0 %	0 %	0 %	339481716
4520	NC_015731	ACC	2	6	226431	226436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481716
4521	NC_015731	AGCG	2	8	226579	226586	25 %	0 %	50 %	25 %	339481716
4522	NC_015731	TGC	2	6	226608	226613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4523	NC_015731	GGCG	2	8	226614	226621	0 %	0 %	75 %	25 %	339481716
4524	NC_015731	TGT	2	6	226630	226635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481716
4525	NC_015731	CCG	2	6	226655	226660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4526	NC_015731	CCAG	2	8	226715	226722	25 %	0 %	25 %	50 %	339481716
4527	NC_015731	ACC	2	6	226742	226747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481716
4528	NC_015731	CCG	2	6	226861	226866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4529	NC_015731	GTG	2	6	226919	226924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481716
4530	NC_015731	ATG	2	6	226925	226930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481716
4531	NC_015731	GT	3	6	226947	226952	0 %	50 %	50 %	0 %	339481716
4532	NC_015731	TGG	2	6	227007	227012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481716
4533	NC_015731	GTC	2	6	227032	227037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4534	NC_015731	AGC	2	6	227053	227058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4535	NC_015731	ATC	3	9	227060	227068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481716
4536	NC_015731	GAT	2	6	227074	227079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481716
4537	NC_015731	CAG	2	6	227080	227085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4538	NC_015731	GCC	2	6	227086	227091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481716
4539	NC_015731	CAG	3	9	227092	227100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4540	NC_015731	GGC	2	6	227128	227133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481716
4541	NC_015731	AGC	2	6	227254	227259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4542	NC_015731	TCG	2	6	227292	227297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481716
4543	NC_015731	CT	3	6	227307	227312	0 %	50 %	0 %	50 %	339481717
4544	NC_015731	CAG	2	6	227330	227335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4545	NC_015731	GTT	2	6	227346	227351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481717
4546	NC_015731	CGT	2	6	227434	227439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4547	NC_015731	CGC	2	6	227459	227464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4548	NC_015731	CG	3	6	227662	227667	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4549	NC_015731	CAG	2	6	227684	227689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4550	NC_015731	ATG	2	6	227732	227737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4551	NC_015731	GCTGCG	2	12	227757	227768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339481717
4552	NC_015731	CCG	2	6	227772	227777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4553	NC_015731	CCGG	2	8	227852	227859	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4554	NC_015731	ATG	2	6	227895	227900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4555	NC_015731	GAT	2	6	227908	227913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481717
4556	NC_015731	GGC	2	6	227990	227995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481717
4557	NC_015731	TGG	2	6	228058	228063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481717
4558	NC_015731	CAT	2	6	228130	228135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481717
4559	NC_015731	GCC	2	6	228175	228180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4560	NC_015731	CGC	2	6	228246	228251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481717
4561	NC_015731	CCA	2	6	228376	228381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481717
4562	NC_015731	GC	3	6	228450	228455	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4563	NC_015731	ATGGCC	2	12	228540	228551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4564	NC_015731	ACT	2	6	228591	228596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481717
4565	NC_015731	CAA	2	6	228754	228759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481717
4566	NC_015731	CAG	2	6	228836	228841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4567	NC_015731	T	7	7	228845	228851	0 %	100 %	0 %	0 %	339481717
4568	NC_015731	CAG	2	6	228869	228874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481717
4569	NC_015731	GCTG	2	8	228940	228947	0 %	25 %	50 %	25 %	339481717
4570	NC_015731	CG	4	8	228961	228968	0 %	0 %	50 %	50 %	339481717
4571	NC_015731	CCGCTG	2	12	228999	229010	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339481717
4572	NC_015731	TACG	2	8	229035	229042	25 %	25 %	25 %	25 %	339481717
4573	NC_015731	GGT	2	6	229043	229048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339481717
4574	NC_015731	GCT	2	6	229127	229132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4575	NC_015731	CGG	2	6	229163	229168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481718
4576	NC_015731	AAC	2	6	229207	229212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481718
4577	NC_015731	CCG	2	6	229259	229264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481718
4578	NC_015731	GTCC	2	8	229350	229357	0 %	25 %	25 %	50 %	339481718
4579	NC_015731	TGT	2	6	229371	229376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481718
4580	NC_015731	CTT	2	6	229377	229382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481718
4581	NC_015731	GAC	2	6	229477	229482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4582	NC_015731	TGC	2	6	229503	229508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4583	NC_015731	GAAT	2	8	229548	229555	50 %	25 %	25 %	0 %	339481718
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4587	NC_015731	CAG	2	6	229627	229632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4588	NC_015731	GAT	2	6	229639	229644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339481718
4589	NC_015731	CGA	2	6	229734	229739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481718
4590	NC_015731	CG	3	6	229770	229775	0 %	0 %	50 %	50 %	339481718
4591	NC_015731	GTT	2	6	229872	229877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481718
4592	NC_015731	AGG	3	9	229936	229944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339481718
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4594	NC_015731	ATT	2	6	230039	230044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339481719
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4596	NC_015731	TGCAAA	2	12	230164	230175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339481719
4597	NC_015731	TGC	2	6	230227	230232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481719
4598	NC_015731	CTT	2	6	230234	230239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339481719
4599	NC_015731	GAC	2	6	230244	230249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339481719
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4602	NC_015731	CTG	2	6	230640	230645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481720
4603	NC_015731	CCA	2	6	230651	230656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339481720
4604	NC_015731	AAT	2	6	230787	230792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481720
4605	NC_015731	GCGT	2	8	230807	230814	0 %	25 %	50 %	25 %	339481720
4606	NC_015731	TTGC	2	8	230862	230869	0 %	50 %	25 %	25 %	339481720
4607	NC_015731	T	6	6	230873	230878	0 %	100 %	0 %	0 %	339481720
4608	NC_015731	CGCC	2	8	230972	230979	0 %	0 %	25 %	75 %	339481720
4609	NC_015731	GGAC	2	8	230989	230996	25 %	0 %	50 %	25 %	339481720
4610	NC_015731	CCGG	2	8	231073	231080	0 %	0 %	50 %	50 %	339481720
4611	NC_015731	TTG	2	6	231114	231119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339481720
4612	NC_015731	TGC	2	6	231158	231163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339481720
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4615	NC_015731	ATC	2	6	231210	231215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481720
4616	NC_015731	GATT	2	8	231295	231302	25 %	50 %	25 %	0 %	339481720
4617	NC_015731	GCC	2	6	231325	231330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481720
4618	NC_015731	CGC	2	6	231371	231376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339481720
4619	NC_015731	GAAA	2	8	231474	231481	75 %	0 %	25 %	0 %	339481720
4620	NC_015731	TC	3	6	231534	231539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4994	NC_015731	G	7	7	250511	250517	0 %	0 %	100 %	0 %	339481735
4995	NC_015731	GCG	2	6	250575	250580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339481735
4996	NC_015731	GCTC	2	8	250581	250588	0 %	25 %	25 %	50 %	339481735
4997	NC_015731	ATA	2	6	250808	250813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339481735
4998	NC_015731	TCA	2	6	250841	250846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339481735
4999	NC_015731	A	6	6	250920	250925	100 %	0 %	0 %	0 %	339481735
5000	NC_015731	ACA	2	6	250957	250962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339481735

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