MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 23739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015583	GCC	2	6	177619	177624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144905
3502	NC_015583	GGT	2	6	177629	177634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144905
3503	NC_015583	CGGA	2	8	177643	177650	25 %	0 %	50 %	25 %	334144905
3504	NC_015583	TCA	2	6	177739	177744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144905
3505	NC_015583	CAG	2	6	177746	177751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144905
3506	NC_015583	GTG	3	9	177822	177830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144905
3507	NC_015583	CCGCG	2	10	177868	177877	0 %	0 %	40 %	60 %	334144905
3508	NC_015583	GGC	2	6	177920	177925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144905
3509	NC_015583	GGCA	2	8	177961	177968	25 %	0 %	50 %	25 %	334144905
3510	NC_015583	GCC	3	9	177980	177988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144905
3511	NC_015583	CCT	2	6	178000	178005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144905
3512	NC_015583	CGC	2	6	178019	178024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_015583	GCCT	2	8	178027	178034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_015583	GTA	2	6	178078	178083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015583	GC	3	6	178220	178225	0 %	0 %	50 %	50 %	334144906
3516	NC_015583	CTTC	2	8	178278	178285	0 %	50 %	0 %	50 %	334144906
3517	NC_015583	GCT	2	6	178339	178344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144906
3518	NC_015583	CT	3	6	178430	178435	0 %	50 %	0 %	50 %	334144906
3519	NC_015583	CGC	2	6	178558	178563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144906
3520	NC_015583	GCAA	2	8	178794	178801	50 %	0 %	25 %	25 %	334144906
3521	NC_015583	GCG	2	6	178846	178851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144906
3522	NC_015583	TACCG	2	10	178996	179005	20 %	20 %	20 %	40 %	334144906
3523	NC_015583	TCT	2	6	179058	179063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144906
3524	NC_015583	GC	3	6	179145	179150	0 %	0 %	50 %	50 %	334144906
3525	NC_015583	TGG	2	6	179151	179156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144906
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3527	NC_015583	CCCG	2	8	179244	179251	0 %	0 %	25 %	75 %	334144906
3528	NC_015583	ATC	2	6	179252	179257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144906
3529	NC_015583	CGG	2	6	179319	179324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144906
3530	NC_015583	CGC	2	6	179341	179346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144906
3531	NC_015583	GCC	2	6	179357	179362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144906
3532	NC_015583	ACC	2	6	179417	179422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144907
3533	NC_015583	CCG	2	6	179449	179454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144907
3534	NC_015583	CG	3	6	179490	179495	0 %	0 %	50 %	50 %	334144907
3535	NC_015583	GCCT	2	8	179747	179754	0 %	25 %	25 %	50 %	334144907
3536	NC_015583	C	7	7	179771	179777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3537	NC_015583	CG	3	6	179814	179819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_015583	CGT	2	6	179872	179877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144908
3539	NC_015583	AT	3	6	179886	179891	50 %	50 %	0 %	0 %	334144908
3540	NC_015583	GGT	2	6	179986	179991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144908
3541	NC_015583	CGA	2	6	180001	180006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144908
3542	NC_015583	AGGAC	2	10	180037	180046	40 %	0 %	40 %	20 %	334144908
3543	NC_015583	TCA	3	9	180052	180060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144908
3544	NC_015583	CAGTT	2	10	180138	180147	20 %	40 %	20 %	20 %	334144908
3545	NC_015583	CGCAG	2	10	180280	180289	20 %	0 %	40 %	40 %	334144908
3546	NC_015583	GGA	2	6	180311	180316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144908
3547	NC_015583	CGC	2	6	180352	180357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144908
3548	NC_015583	GAT	2	6	180368	180373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144908
3549	NC_015583	GC	3	6	180380	180385	0 %	0 %	50 %	50 %	334144908
3550	NC_015583	GAT	2	6	180422	180427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144908
3551	NC_015583	CG	3	6	180590	180595	0 %	0 %	50 %	50 %	334144908
3552	NC_015583	GAT	2	6	180719	180724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144908
3553	NC_015583	GGA	2	6	180747	180752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144908
3554	NC_015583	GGC	2	6	180753	180758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144908
3555	NC_015583	CGGT	2	8	180769	180776	0 %	25 %	50 %	25 %	334144908
3556	NC_015583	ACC	2	6	180878	180883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144908
3557	NC_015583	CCGA	2	8	180896	180903	25 %	0 %	25 %	50 %	334144908
3558	NC_015583	GAA	2	6	180938	180943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144908
3559	NC_015583	GAC	2	6	180953	180958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144908
3560	NC_015583	CAG	2	6	181022	181027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144908
3561	NC_015583	TGC	2	6	181055	181060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144908
3562	NC_015583	ATC	2	6	181101	181106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144908
3563	NC_015583	AG	3	6	181163	181168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015583	GAA	2	6	181180	181185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015583	CTC	2	6	181287	181292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_015583	AGCCT	2	10	181471	181480	20 %	20 %	20 %	40 %	334144909
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3569	NC_015583	GC	3	6	181609	181614	0 %	0 %	50 %	50 %	334144909
3570	NC_015583	GCC	2	6	181688	181693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144909
3571	NC_015583	CATCT	2	10	181803	181812	20 %	40 %	0 %	40 %	334144909
3572	NC_015583	GTC	2	6	181848	181853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144909
3573	NC_015583	ACG	2	6	181900	181905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
3574	NC_015583	GC	3	6	181978	181983	0 %	0 %	50 %	50 %	334144909
3575	NC_015583	GGTCGA	2	12	182129	182140	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334144909
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3577	NC_015583	GACGA	2	10	182365	182374	40 %	0 %	40 %	20 %	334144909
3578	NC_015583	AGCG	2	8	182397	182404	25 %	0 %	50 %	25 %	334144909
3579	NC_015583	GC	3	6	182455	182460	0 %	0 %	50 %	50 %	334144909
3580	NC_015583	GCAGC	2	10	182504	182513	20 %	0 %	40 %	40 %	334144909
3581	NC_015583	CAG	2	6	182520	182525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
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3583	NC_015583	CGA	2	6	182669	182674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
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3585	NC_015583	GCA	2	6	182741	182746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
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3589	NC_015583	GAA	2	6	182822	182827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144909
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3591	NC_015583	GA	3	6	182902	182907	50 %	0 %	50 %	0 %	334144909
3592	NC_015583	GGC	2	6	182910	182915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144909
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3596	NC_015583	GATC	2	8	183087	183094	25 %	25 %	25 %	25 %	334144909
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3602	NC_015583	AG	3	6	183329	183334	50 %	0 %	50 %	0 %	334144909
3603	NC_015583	GCG	2	6	183367	183372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144909
3604	NC_015583	GCA	2	6	183390	183395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
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3607	NC_015583	GCC	2	6	183496	183501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144909
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3610	NC_015583	CGA	2	6	183614	183619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144909
3611	NC_015583	CCAG	2	8	183623	183630	25 %	0 %	25 %	50 %	334144909
3612	NC_015583	GAT	2	6	183651	183656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144909
3613	NC_015583	CG	3	6	183658	183663	0 %	0 %	50 %	50 %	334144909
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3621	NC_015583	CGCAG	2	10	183814	183823	20 %	0 %	40 %	40 %	334144909
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3869	NC_015583	CGA	3	9	196101	196109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144922
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3991	NC_015583	TGG	2	6	202011	202016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144928
3992	NC_015583	CG	3	6	202081	202086	0 %	0 %	50 %	50 %	334144928
3993	NC_015583	CTG	2	6	202107	202112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144928
3994	NC_015583	GCA	2	6	202122	202127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144928
3995	NC_015583	CTG	2	6	202140	202145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144928
3996	NC_015583	ATC	2	6	202161	202166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144928
3997	NC_015583	CG	3	6	202232	202237	0 %	0 %	50 %	50 %	334144928
3998	NC_015583	GGC	2	6	202353	202358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144928
3999	NC_015583	TCG	2	6	202396	202401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144928
4000	NC_015583	GTC	2	6	202424	202429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144928

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