MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 23739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015583	TCG	2	6	103153	103158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144847
2002	NC_015583	AGC	2	6	103163	103168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144847
2003	NC_015583	CCTCGA	2	12	103355	103366	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334144847
2004	NC_015583	CAT	3	9	103376	103384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144847
2005	NC_015583	GCC	2	6	103399	103404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144847
2006	NC_015583	GCA	2	6	103492	103497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_015583	TCAA	2	8	103508	103515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2008	NC_015583	TGA	2	6	103686	103691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144848
2009	NC_015583	TCG	2	6	103737	103742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144848
2010	NC_015583	CGG	2	6	103756	103761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144848
2011	NC_015583	CAGG	2	8	103802	103809	25 %	0 %	50 %	25 %	334144848
2012	NC_015583	CGA	2	6	103831	103836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144848
2013	NC_015583	GGCTT	2	10	103842	103851	0 %	40 %	40 %	20 %	334144848
2014	NC_015583	CTG	2	6	103865	103870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144848
2015	NC_015583	GCC	2	6	103880	103885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144848
2016	NC_015583	ATG	2	6	103937	103942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144848
2017	NC_015583	CGG	2	6	104026	104031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144848
2018	NC_015583	TTCT	2	8	104055	104062	0 %	75 %	0 %	25 %	334144848
2019	NC_015583	GCC	2	6	104103	104108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144848
2020	NC_015583	ATC	2	6	104132	104137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144848
2021	NC_015583	GTG	2	6	104159	104164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144848
2022	NC_015583	ACT	2	6	104166	104171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144848
2023	NC_015583	CGG	2	6	104209	104214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144848
2024	NC_015583	CCTG	2	8	104219	104226	0 %	25 %	25 %	50 %	334144848
2025	NC_015583	GCG	2	6	104258	104263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144848
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2027	NC_015583	CCGC	2	8	104422	104429	0 %	0 %	25 %	75 %	334144848
2028	NC_015583	TG	3	6	104473	104478	0 %	50 %	50 %	0 %	334144848
2029	NC_015583	TCG	2	6	104511	104516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144848
2030	NC_015583	TCT	2	6	104529	104534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144848
2031	NC_015583	GAG	2	6	104573	104578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144848
2032	NC_015583	GCAAC	2	10	104587	104596	40 %	0 %	20 %	40 %	334144848
2033	NC_015583	GTATC	2	10	104607	104616	20 %	40 %	20 %	20 %	334144848
2034	NC_015583	GATCG	2	10	104651	104660	20 %	20 %	40 %	20 %	334144848
2035	NC_015583	CTG	2	6	104675	104680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144848
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2037	NC_015583	TCT	2	6	104820	104825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144848
2038	NC_015583	CGGCT	2	10	104890	104899	0 %	20 %	40 %	40 %	334144848
2039	NC_015583	GCC	2	6	105014	105019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144848
2040	NC_015583	CTT	2	6	105025	105030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144848
2041	NC_015583	TCA	2	6	105045	105050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144848
2042	NC_015583	GAA	2	6	105074	105079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144848
2043	NC_015583	C	6	6	105110	105115	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2044	NC_015583	CT	4	8	105128	105135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_015583	CCT	2	6	105136	105141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_015583	AAG	2	6	105152	105157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_015583	GATC	2	8	105235	105242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2048	NC_015583	TGA	2	6	105285	105290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2049	NC_015583	CAT	2	6	105336	105341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_015583	TTGC	2	8	105342	105349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2051	NC_015583	CAA	2	6	105397	105402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144849
2052	NC_015583	GCAA	2	8	105424	105431	50 %	0 %	25 %	25 %	334144849
2053	NC_015583	CGA	2	6	105442	105447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144849
2054	NC_015583	GC	3	6	105459	105464	0 %	0 %	50 %	50 %	334144849
2055	NC_015583	AAGC	2	8	105511	105518	50 %	0 %	25 %	25 %	334144849
2056	NC_015583	GGC	2	6	105548	105553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144849
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2063	NC_015583	GAC	2	6	105891	105896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144849
2064	NC_015583	TGA	2	6	105904	105909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144849
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2070	NC_015583	ACG	2	6	106171	106176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144849
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2079	NC_015583	GAC	2	6	106599	106604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144850
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2087	NC_015583	GGAT	2	8	106894	106901	25 %	25 %	50 %	0 %	334144850
2088	NC_015583	GCT	2	6	106970	106975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144850
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2114	NC_015583	GC	3	6	108292	108297	0 %	0 %	50 %	50 %	334144850
2115	NC_015583	GCCT	2	8	108488	108495	0 %	25 %	25 %	50 %	334144851
2116	NC_015583	CG	3	6	108534	108539	0 %	0 %	50 %	50 %	334144851
2117	NC_015583	TCCGC	2	10	108564	108573	0 %	20 %	20 %	60 %	334144851
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2123	NC_015583	CTG	2	6	108938	108943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144851
2124	NC_015583	CAT	2	6	108949	108954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144851
2125	NC_015583	CGGT	2	8	108984	108991	0 %	25 %	50 %	25 %	334144851
2126	NC_015583	CCG	2	6	109015	109020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144851
2127	NC_015583	TCT	2	6	109042	109047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144851
2128	NC_015583	GATC	2	8	109066	109073	25 %	25 %	25 %	25 %	334144851
2129	NC_015583	GCAA	2	8	109098	109105	50 %	0 %	25 %	25 %	334144851
2130	NC_015583	ACCCA	2	10	109128	109137	40 %	0 %	0 %	60 %	334144851
2131	NC_015583	GCC	2	6	109169	109174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144851
2132	NC_015583	CGA	2	6	109213	109218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144851
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2135	NC_015583	GCC	2	6	109565	109570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144852
2136	NC_015583	GATC	2	8	109618	109625	25 %	25 %	25 %	25 %	334144852
2137	NC_015583	TGA	2	6	109632	109637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144852
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2144	NC_015583	G	6	6	110279	110284	0 %	0 %	100 %	0 %	334144853
2145	NC_015583	CGAA	2	8	110333	110340	50 %	0 %	25 %	25 %	334144853
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2152	NC_015583	CGT	2	6	110698	110703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144853
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2155	NC_015583	GATC	2	8	110899	110906	25 %	25 %	25 %	25 %	334144853
2156	NC_015583	TCG	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144853
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2163	NC_015583	CGC	2	6	111070	111075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144853
2164	NC_015583	CTGCA	2	10	111137	111146	20 %	20 %	20 %	40 %	334144853
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2171	NC_015583	CTG	2	6	111448	111453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144854
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2179	NC_015583	TGA	2	6	111732	111737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144854
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2227	NC_015583	GGCG	2	8	114535	114542	0 %	0 %	75 %	25 %	334144855
2228	NC_015583	GTT	2	6	114590	114595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144855
2229	NC_015583	ACC	2	6	114600	114605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144855
2230	NC_015583	CGAC	2	8	114616	114623	25 %	0 %	25 %	50 %	334144855
2231	NC_015583	GAT	2	6	114661	114666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144855
2232	NC_015583	ACC	2	6	114676	114681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144855
2233	NC_015583	CGGC	2	8	114696	114703	0 %	0 %	50 %	50 %	334144855
2234	NC_015583	CGC	2	6	114802	114807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144855
2235	NC_015583	GCA	2	6	114820	114825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144855
2236	NC_015583	GGC	2	6	114863	114868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144855
2237	NC_015583	GAC	2	6	114872	114877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144855
2238	NC_015583	CAT	2	6	114883	114888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144855
2239	NC_015583	GCCCG	2	10	114967	114976	0 %	0 %	40 %	60 %	334144855
2240	NC_015583	TTACCC	2	12	114993	115004	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	334144855
2241	NC_015583	AGC	2	6	115049	115054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144855
2242	NC_015583	GC	3	6	115100	115105	0 %	0 %	50 %	50 %	334144855
2243	NC_015583	CCTG	2	8	115185	115192	0 %	25 %	25 %	50 %	334144855
2244	NC_015583	GC	3	6	115229	115234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2245	NC_015583	GCAC	2	8	115304	115311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2246	NC_015583	CTAT	2	8	115357	115364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2247	NC_015583	GCG	2	6	115458	115463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144856
2248	NC_015583	GGA	2	6	115490	115495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144856
2249	NC_015583	CGA	2	6	115634	115639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144856
2250	NC_015583	CAAT	2	8	115649	115656	50 %	25 %	0 %	25 %	334144856
2251	NC_015583	ATGCG	2	10	115657	115666	20 %	20 %	40 %	20 %	334144856
2252	NC_015583	CGG	2	6	115697	115702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144856
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2260	NC_015583	TAC	2	6	116226	116231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144856
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2264	NC_015583	CCCG	2	8	116523	116530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2265	NC_015583	CG	3	6	116691	116696	0 %	0 %	50 %	50 %	334144857
2266	NC_015583	CGA	2	6	116769	116774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144857
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2270	NC_015583	GCTT	2	8	116830	116837	0 %	50 %	25 %	25 %	334144857
2271	NC_015583	CGGCG	2	10	116844	116853	0 %	0 %	60 %	40 %	334144857
2272	NC_015583	TCG	2	6	116867	116872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144857
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2277	NC_015583	CGG	2	6	117087	117092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144857
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2354	NC_015583	CCTGTG	2	12	121187	121198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2365	NC_015583	CGA	2	6	121615	121620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144860
2366	NC_015583	GC	3	6	121623	121628	0 %	0 %	50 %	50 %	334144860
2367	NC_015583	CG	3	6	121717	121722	0 %	0 %	50 %	50 %	334144860
2368	NC_015583	CG	3	6	121729	121734	0 %	0 %	50 %	50 %	334144860
2369	NC_015583	CCA	2	6	121756	121761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144860
2370	NC_015583	CTC	2	6	121820	121825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144860
2371	NC_015583	GTCC	2	8	121883	121890	0 %	25 %	25 %	50 %	334144860
2372	NC_015583	GCA	2	6	121956	121961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144860
2373	NC_015583	AAGG	2	8	122036	122043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_015583	CGC	2	6	122210	122215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144861
2375	NC_015583	GAA	2	6	122244	122249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144861
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2377	NC_015583	CGAA	2	8	122264	122271	50 %	0 %	25 %	25 %	334144861
2378	NC_015583	CGT	2	6	122399	122404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144861
2379	NC_015583	CCTGCG	2	12	122477	122488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334144861
2380	NC_015583	GTC	2	6	122595	122600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144861
2381	NC_015583	TGC	2	6	122666	122671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144861
2382	NC_015583	TCG	2	6	122704	122709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144861
2383	NC_015583	CAT	2	6	122753	122758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144861
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2385	NC_015583	TCCTGC	2	12	122869	122880	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334144861
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2387	NC_015583	TCG	2	6	122923	122928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144861
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2390	NC_015583	CGG	2	6	123164	123169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144861
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2394	NC_015583	CGA	2	6	123341	123346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144861
2395	NC_015583	CG	3	6	123356	123361	0 %	0 %	50 %	50 %	334144861
2396	NC_015583	CCT	2	6	123362	123367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144861
2397	NC_015583	TGGC	2	8	123407	123414	0 %	25 %	50 %	25 %	334144861
2398	NC_015583	CGG	2	6	123449	123454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144861
2399	NC_015583	CAC	2	6	123482	123487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144861
2400	NC_015583	CCG	2	6	123562	123567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144861
2401	NC_015583	ACC	4	12	123635	123646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144861
2402	NC_015583	GC	4	8	123656	123663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2403	NC_015583	ATGA	2	8	123666	123673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_015583	GC	4	8	123674	123681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2405	NC_015583	GA	3	6	123692	123697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2406	NC_015583	TTC	2	6	123708	123713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144862
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2408	NC_015583	GC	3	6	123820	123825	0 %	0 %	50 %	50 %	334144862
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2441	NC_015583	TCG	3	9	125397	125405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144863
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2444	NC_015583	CGG	2	6	125530	125535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144863
2445	NC_015583	GAG	2	6	125637	125642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2446	NC_015583	CGA	2	6	125673	125678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144864
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2451	NC_015583	ACA	2	6	125784	125789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144864
2452	NC_015583	TGGG	2	8	125846	125853	0 %	25 %	75 %	0 %	334144864
2453	NC_015583	GAAC	2	8	125995	126002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2454	NC_015583	GGTCAA	2	12	126007	126018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2455	NC_015583	GCG	2	6	126030	126035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2456	NC_015583	GCAC	2	8	126057	126064	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2457	NC_015583	TTC	2	6	126068	126073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2458	NC_015583	GC	3	6	126093	126098	0 %	0 %	50 %	50 %	334144865
2459	NC_015583	CGC	2	6	126132	126137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144865
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2473	NC_015583	GC	4	8	126481	126488	0 %	0 %	50 %	50 %	334144865
2474	NC_015583	CTG	2	6	126489	126494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144865
2475	NC_015583	CGA	2	6	126502	126507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144865
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2477	NC_015583	CAT	2	6	126574	126579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144865
2478	NC_015583	G	6	6	126627	126632	0 %	0 %	100 %	0 %	334144865
2479	NC_015583	CAG	2	6	126677	126682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144865
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2481	NC_015583	TGC	2	6	126783	126788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144865
2482	NC_015583	TGC	2	6	126879	126884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144865
2483	NC_015583	CGAT	2	8	126885	126892	25 %	25 %	25 %	25 %	334144865
2484	NC_015583	CCG	2	6	126933	126938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144865
2485	NC_015583	CGG	2	6	126948	126953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144865
2486	NC_015583	GCAG	2	8	127114	127121	25 %	0 %	50 %	25 %	334144865
2487	NC_015583	GAGC	2	8	127143	127150	25 %	0 %	50 %	25 %	334144865
2488	NC_015583	GGC	2	6	127157	127162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144865
2489	NC_015583	GTCG	2	8	127189	127196	0 %	25 %	50 %	25 %	334144865
2490	NC_015583	GCG	2	6	127274	127279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144866
2491	NC_015583	GC	3	6	127316	127321	0 %	0 %	50 %	50 %	334144866
2492	NC_015583	CG	3	6	127486	127491	0 %	0 %	50 %	50 %	334144866
2493	NC_015583	GCG	2	6	127574	127579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144866
2494	NC_015583	TC	3	6	127618	127623	0 %	50 %	0 %	50 %	334144866
2495	NC_015583	TCG	2	6	127640	127645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144866
2496	NC_015583	TGC	2	6	127646	127651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144866
2497	NC_015583	GCAC	2	8	127655	127662	25 %	0 %	25 %	50 %	334144866
2498	NC_015583	GCT	2	6	127734	127739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144866
2499	NC_015583	GGCC	2	8	127740	127747	0 %	0 %	50 %	50 %	334144866
2500	NC_015583	AGC	2	6	127860	127865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144866

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