MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 23739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015583	CCT	2	6	252062	252067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144966
5002	NC_015583	AGGC	2	8	252106	252113	25 %	0 %	50 %	25 %	334144966
5003	NC_015583	GCG	2	6	252167	252172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5004	NC_015583	CGG	2	6	252184	252189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5005	NC_015583	CGA	2	6	252190	252195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5006	NC_015583	AGA	2	6	252224	252229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144966
5007	NC_015583	CAA	2	6	252405	252410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144966
5008	NC_015583	GTCA	2	8	252446	252453	25 %	25 %	25 %	25 %	334144966
5009	NC_015583	CGG	2	6	252464	252469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5010	NC_015583	CG	3	6	252493	252498	0 %	0 %	50 %	50 %	334144966
5011	NC_015583	CTG	2	6	252510	252515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5012	NC_015583	GGC	2	6	252516	252521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5013	NC_015583	GAAG	2	8	252549	252556	50 %	0 %	50 %	0 %	334144966
5014	NC_015583	CGG	2	6	252658	252663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5015	NC_015583	TCG	2	6	252742	252747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5016	NC_015583	CCG	2	6	252823	252828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144966
5017	NC_015583	CGT	2	6	252962	252967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5018	NC_015583	CGA	3	9	252974	252982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5019	NC_015583	GCG	2	6	253003	253008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144966
5020	NC_015583	AGC	2	6	253072	253077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5021	NC_015583	TCG	3	9	253105	253113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5022	NC_015583	CTG	2	6	253149	253154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5023	NC_015583	CG	3	6	253159	253164	0 %	0 %	50 %	50 %	334144966
5024	NC_015583	TGGAA	2	10	253268	253277	40 %	20 %	40 %	0 %	334144966
5025	NC_015583	CCG	2	6	253317	253322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144966
5026	NC_015583	GCA	2	6	253353	253358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5027	NC_015583	GAG	2	6	253359	253364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144966
5028	NC_015583	CCG	2	6	253373	253378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144966
5029	NC_015583	ATC	2	6	253392	253397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144966
5030	NC_015583	GTC	2	6	253458	253463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5031	NC_015583	GCA	3	9	253481	253489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5032	NC_015583	CGA	2	6	253514	253519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5033	NC_015583	GTC	2	6	253545	253550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5034	NC_015583	GAC	2	6	253554	253559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5035	NC_015583	CG	3	6	253619	253624	0 %	0 %	50 %	50 %	334144966
5036	NC_015583	TGA	2	6	253702	253707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144966
5037	NC_015583	CGCGAG	2	12	253746	253757	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334144966
5038	NC_015583	ATC	2	6	253776	253781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144966
5039	NC_015583	CAG	2	6	253812	253817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144966
5040	NC_015583	GAG	2	6	253931	253936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144967
5041	NC_015583	CCATTA	2	12	253972	253983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144967
5042	NC_015583	CG	3	6	254001	254006	0 %	0 %	50 %	50 %	334144967
5043	NC_015583	GCA	2	6	254071	254076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144967
5044	NC_015583	CTCG	2	8	254260	254267	0 %	25 %	25 %	50 %	334144967
5045	NC_015583	GGA	2	6	254293	254298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144967
5046	NC_015583	TCT	2	6	254307	254312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144967
5047	NC_015583	GCC	2	6	254333	254338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144967
5048	NC_015583	GC	4	8	254344	254351	0 %	0 %	50 %	50 %	334144967
5049	NC_015583	ACC	2	6	254397	254402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144967
5050	NC_015583	GC	3	6	254412	254417	0 %	0 %	50 %	50 %	334144967
5051	NC_015583	GC	3	6	254485	254490	0 %	0 %	50 %	50 %	334144967
5052	NC_015583	ACAGG	2	10	254587	254596	40 %	0 %	40 %	20 %	334144967
5053	NC_015583	ACTC	2	8	254616	254623	25 %	25 %	0 %	50 %	334144967
5054	NC_015583	CGG	2	6	254629	254634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144967
5055	NC_015583	CGA	2	6	254701	254706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144967
5056	NC_015583	GA	3	6	254745	254750	50 %	0 %	50 %	0 %	334144967
5057	NC_015583	GAC	2	6	254790	254795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5058	NC_015583	GCACTG	2	12	254907	254918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5059	NC_015583	ATGG	2	8	254940	254947	25 %	25 %	50 %	0 %	334144968
5060	NC_015583	CGATCC	2	12	254992	255003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334144968
5061	NC_015583	CGC	3	9	255033	255041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144968
5062	NC_015583	CCT	2	6	255074	255079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144968
5063	NC_015583	GCA	2	6	255106	255111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5064	NC_015583	CGA	2	6	255167	255172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5065	NC_015583	CACTG	2	10	255179	255188	20 %	20 %	20 %	40 %	334144968
5066	NC_015583	TCG	2	6	255229	255234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5067	NC_015583	GC	3	6	255296	255301	0 %	0 %	50 %	50 %	334144968
5068	NC_015583	GGCT	2	8	255336	255343	0 %	25 %	50 %	25 %	334144968
5069	NC_015583	TCG	2	6	255376	255381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5070	NC_015583	ACCG	2	8	255534	255541	25 %	0 %	25 %	50 %	334144968
5071	NC_015583	GAA	2	6	255552	255557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144968
5072	NC_015583	GAA	2	6	255596	255601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144968
5073	NC_015583	TCC	2	6	255648	255653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144968
5074	NC_015583	CCA	2	6	255670	255675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144968
5075	NC_015583	AGC	2	6	255723	255728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5076	NC_015583	CT	3	6	255904	255909	0 %	50 %	0 %	50 %	334144968
5077	NC_015583	GCG	2	6	255982	255987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144968
5078	NC_015583	GAT	2	6	256031	256036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144968
5079	NC_015583	GGC	3	9	256059	256067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144968
5080	NC_015583	CGA	2	6	256069	256074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5081	NC_015583	CCGG	2	8	256086	256093	0 %	0 %	50 %	50 %	334144968
5082	NC_015583	TTC	2	6	256111	256116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144968
5083	NC_015583	CGCA	2	8	256139	256146	25 %	0 %	25 %	50 %	334144968
5084	NC_015583	AGC	2	6	256147	256152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144968
5085	NC_015583	ATC	2	6	256272	256277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144968
5086	NC_015583	CGG	2	6	256286	256291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144968
5087	NC_015583	CGC	2	6	256406	256411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144968
5088	NC_015583	GC	3	6	256422	256427	0 %	0 %	50 %	50 %	334144968
5089	NC_015583	CCTTCG	2	12	256435	256446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334144968
5090	NC_015583	CTT	2	6	256497	256502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144968
5091	NC_015583	CGAA	2	8	256619	256626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_015583	GAA	2	6	256701	256706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015583	ATA	2	6	256757	256762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015583	AAG	2	6	256775	256780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144969
5095	NC_015583	CGCTGC	2	12	256828	256839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334144969
5096	NC_015583	CGTC	2	8	256929	256936	0 %	25 %	25 %	50 %	334144969
5097	NC_015583	CTG	2	6	256964	256969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144969
5098	NC_015583	CGC	2	6	256981	256986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144969
5099	NC_015583	TCG	2	6	257034	257039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144969
5100	NC_015583	TTG	2	6	257112	257117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144969
5101	NC_015583	CCAG	2	8	257193	257200	25 %	0 %	25 %	50 %	334144969
5102	NC_015583	CGA	2	6	257215	257220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144969
5103	NC_015583	TAC	2	6	257222	257227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144969
5104	NC_015583	ACGA	2	8	257273	257280	50 %	0 %	25 %	25 %	334144969
5105	NC_015583	TCT	2	6	257409	257414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144969
5106	NC_015583	AGCTG	2	10	257647	257656	20 %	20 %	40 %	20 %	334144970
5107	NC_015583	GC	3	6	257699	257704	0 %	0 %	50 %	50 %	334144970
5108	NC_015583	GCAG	2	8	257750	257757	25 %	0 %	50 %	25 %	334144970
5109	NC_015583	CCT	2	6	257812	257817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144970
5110	NC_015583	TCT	2	6	257867	257872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144970
5111	NC_015583	TCCCCC	2	12	257997	258008	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	334144970
5112	NC_015583	GAG	2	6	258021	258026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144970
5113	NC_015583	TGC	2	6	258062	258067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144970
5114	NC_015583	GCC	2	6	258084	258089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144970
5115	NC_015583	CCGGCA	2	12	258112	258123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334144970
5116	NC_015583	CAT	2	6	258194	258199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144970
5117	NC_015583	CCG	2	6	258297	258302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144970
5118	NC_015583	AC	3	6	258370	258375	50 %	0 %	0 %	50 %	334144970
5119	NC_015583	CGT	2	6	258383	258388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144970
5120	NC_015583	GCCGG	2	10	258395	258404	0 %	0 %	60 %	40 %	334144970
5121	NC_015583	GGC	2	6	258501	258506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144970
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5134	NC_015583	CG	3	6	259097	259102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5142	NC_015583	GCCCG	2	10	259584	259593	0 %	0 %	40 %	60 %	334144971
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5242	NC_015583	TCG	2	6	263243	263248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144973
5243	NC_015583	TCG	2	6	263267	263272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144973
5244	NC_015583	AGG	2	6	263273	263278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144973
5245	NC_015583	AGG	2	6	263324	263329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144973
5246	NC_015583	TGG	2	6	263375	263380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144973
5247	NC_015583	TGC	2	6	263415	263420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144973
5248	NC_015583	CAT	2	6	263430	263435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144973
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5251	NC_015583	GC	3	6	263611	263616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_015583	AGG	2	6	263664	263669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_015583	GCC	2	6	263697	263702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5254	NC_015583	TCC	2	6	263704	263709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5255	NC_015583	GGC	2	6	263736	263741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_015583	GCG	2	6	263758	263763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_015583	ACTTA	2	10	263768	263777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5258	NC_015583	CG	3	6	263825	263830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5259	NC_015583	TTC	2	6	263877	263882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144974
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5261	NC_015583	TCA	2	6	263984	263989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144974
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5264	NC_015583	CTG	2	6	264060	264065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144974
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5273	NC_015583	GTC	2	6	264675	264680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144974
5274	NC_015583	TCC	2	6	264704	264709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5275	NC_015583	CTGC	2	8	264724	264731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5276	NC_015583	C	6	6	264842	264847	0 %	0 %	0 %	100 %	334144975
5277	NC_015583	CGGG	2	8	264918	264925	0 %	0 %	75 %	25 %	334144975
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5281	NC_015583	CGC	2	6	265045	265050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144975
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5283	NC_015583	TC	3	6	265174	265179	0 %	50 %	0 %	50 %	334144975
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5342	NC_015583	CGCGG	2	10	267696	267705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5343	NC_015583	GC	3	6	267707	267712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5344	NC_015583	TCT	2	6	267723	267728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5345	NC_015583	CGGCC	2	10	267748	267757	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5346	NC_015583	AGTG	2	8	267777	267784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5347	NC_015583	CGG	2	6	267798	267803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5348	NC_015583	GAT	2	6	267813	267818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5350	NC_015583	TCG	2	6	267907	267912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144977
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5353	NC_015583	CG	3	6	268037	268042	0 %	0 %	50 %	50 %	334144977
5354	NC_015583	ACG	2	6	268216	268221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144977
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5362	NC_015583	AAT	2	6	268787	268792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144977
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5489	NC_015583	CGA	2	6	275442	275447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144983
5490	NC_015583	CTG	2	6	275476	275481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144983
5491	NC_015583	CGC	2	6	275496	275501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144983
5492	NC_015583	CCG	2	6	275565	275570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144983
5493	NC_015583	GC	3	6	275575	275580	0 %	0 %	50 %	50 %	334144983
5494	NC_015583	CAT	2	6	275665	275670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144983
5495	NC_015583	TCCT	2	8	275701	275708	0 %	50 %	0 %	50 %	334144983
5496	NC_015583	GAC	2	6	275719	275724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144983
5497	NC_015583	TCT	2	6	275763	275768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144983
5498	NC_015583	ACC	2	6	275777	275782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144983
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5500	NC_015583	TGCC	2	8	275874	275881	0 %	25 %	25 %	50 %	334144983

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