MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 3368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015580	CTCGA	2	10	2870	2879	20 %	20 %	20 %	40 %	334139604
2	NC_015580	CTCGG	2	10	2883	2892	0 %	20 %	40 %	40 %	334139604
3	NC_015580	CGGCG	2	10	2983	2992	0 %	0 %	60 %	40 %	334139604
4	NC_015580	CGATG	2	10	3259	3268	20 %	20 %	40 %	20 %	334139604
5	NC_015580	TGGCG	2	10	4255	4264	0 %	20 %	60 %	20 %	334139606
6	NC_015580	TTCCA	2	10	7934	7943	20 %	40 %	0 %	40 %	334139610
7	NC_015580	CCCGG	2	10	8893	8902	0 %	0 %	40 %	60 %	334139610
8	NC_015580	CGAAT	2	10	11333	11342	40 %	20 %	20 %	20 %	334139612
9	NC_015580	GCCGC	2	10	12668	12677	0 %	0 %	40 %	60 %	334139614
10	NC_015580	GATCT	2	10	13377	13386	20 %	40 %	20 %	20 %	334139614
11	NC_015580	GCCAT	2	10	14053	14062	20 %	20 %	20 %	40 %	334139616
12	NC_015580	GTGCC	2	10	14114	14123	0 %	20 %	40 %	40 %	334139616
13	NC_015580	GAATG	2	10	14530	14539	40 %	20 %	40 %	0 %	334139617
14	NC_015580	ATGGC	2	10	15637	15646	20 %	20 %	40 %	20 %	334139618
15	NC_015580	TGCGA	2	10	16898	16907	20 %	20 %	40 %	20 %	334139619
16	NC_015580	CCTGC	2	10	17258	17267	0 %	20 %	20 %	60 %	334139620
17	NC_015580	TGCGC	2	10	17599	17608	0 %	20 %	40 %	40 %	334139620
18	NC_015580	CGGGG	2	10	20006	20015	0 %	0 %	80 %	20 %	334139624
19	NC_015580	CGGCG	2	10	20330	20339	0 %	0 %	60 %	40 %	334139625
20	NC_015580	CGGTG	2	10	23590	23599	0 %	20 %	60 %	20 %	334139626
21	NC_015580	CGGCG	2	10	24550	24559	0 %	0 %	60 %	40 %	334139626
22	NC_015580	AGGGC	2	10	24838	24847	20 %	0 %	60 %	20 %	334139627
23	NC_015580	TGGCC	2	10	29269	29278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015580	GCGCC	2	10	29444	29453	0 %	0 %	40 %	60 %	334139631
25	NC_015580	CGGCG	2	10	38860	38869	0 %	0 %	60 %	40 %	334139639
26	NC_015580	CGGCG	2	10	38932	38941	0 %	0 %	60 %	40 %	334139639
27	NC_015580	AGGGG	2	10	39527	39536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015580	GGCCC	2	10	41044	41053	0 %	0 %	40 %	60 %	334139640
29	NC_015580	CAGCG	2	10	43246	43255	20 %	0 %	40 %	40 %	334139644
30	NC_015580	GGGAA	2	10	43380	43389	40 %	0 %	60 %	0 %	334139644
31	NC_015580	GATCG	2	10	43584	43593	20 %	20 %	40 %	20 %	334139644
32	NC_015580	CGCTG	2	10	45847	45856	0 %	20 %	40 %	40 %	334139646
33	NC_015580	GCCCG	2	10	47689	47698	0 %	0 %	40 %	60 %	334139648
34	NC_015580	AATCG	2	10	48018	48027	40 %	20 %	20 %	20 %	334139649
35	NC_015580	CGCGC	2	10	49021	49030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_015580	CACGC	2	10	49274	49283	20 %	0 %	20 %	60 %	334139650
37	NC_015580	AGCTG	2	10	52031	52040	20 %	20 %	40 %	20 %	334139650
38	NC_015580	GTCAT	2	10	52048	52057	20 %	40 %	20 %	20 %	334139650
39	NC_015580	CTGGG	2	10	54282	54291	0 %	20 %	60 %	20 %	334139652
40	NC_015580	CGGCG	2	10	54980	54989	0 %	0 %	60 %	40 %	334139653
41	NC_015580	CGGCC	2	10	55262	55271	0 %	0 %	40 %	60 %	334139653
42	NC_015580	GCCGC	2	10	57238	57247	0 %	0 %	40 %	60 %	334139655
43	NC_015580	CCCCA	2	10	57886	57895	20 %	0 %	0 %	80 %	334139656
44	NC_015580	CCGGG	3	15	60460	60474	0 %	0 %	60 %	40 %	334139659
45	NC_015580	CTTTT	2	10	61214	61223	0 %	80 %	0 %	20 %	334139659
46	NC_015580	CCTGA	2	10	62157	62166	20 %	20 %	20 %	40 %	334139660
47	NC_015580	CAGCC	2	10	63027	63036	20 %	0 %	20 %	60 %	334139662
48	NC_015580	GCGTT	2	10	63492	63501	0 %	40 %	40 %	20 %	334139662
49	NC_015580	TGCGC	2	10	68768	68777	0 %	20 %	40 %	40 %	334139667
50	NC_015580	GCGTC	2	10	69327	69336	0 %	20 %	40 %	40 %	334139668
51	NC_015580	ATCAA	2	10	69720	69729	60 %	20 %	0 %	20 %	334139669
52	NC_015580	GCGCC	2	10	76417	76426	0 %	0 %	40 %	60 %	334139674
53	NC_015580	GTGCG	2	10	76500	76509	0 %	20 %	60 %	20 %	334139674
54	NC_015580	ATCGA	2	10	78656	78665	40 %	20 %	20 %	20 %	334139676
55	NC_015580	CGACC	2	10	79327	79336	20 %	0 %	20 %	60 %	334139676
56	NC_015580	TCCGG	2	10	79960	79969	0 %	20 %	40 %	40 %	334139676
57	NC_015580	CGGTC	2	10	82106	82115	0 %	20 %	40 %	40 %	334139678
58	NC_015580	CAGAG	2	10	85911	85920	40 %	0 %	40 %	20 %	334139682
59	NC_015580	TCCGT	2	10	86433	86442	0 %	40 %	20 %	40 %	334139682
60	NC_015580	GCCCG	2	10	86900	86909	0 %	0 %	40 %	60 %	334139683
61	NC_015580	CGGTG	2	10	87337	87346	0 %	20 %	60 %	20 %	334139683
62	NC_015580	CGCGG	2	10	87352	87361	0 %	0 %	60 %	40 %	334139683
63	NC_015580	GCTCC	2	10	92826	92835	0 %	20 %	20 %	60 %	334139688
64	NC_015580	CGTGG	2	10	93009	93018	0 %	20 %	60 %	20 %	334139688
65	NC_015580	ATTCC	2	10	96654	96663	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015580	GCGCG	3	15	97449	97463	0 %	0 %	60 %	40 %	334139693
67	NC_015580	GATCG	2	10	101441	101450	20 %	20 %	40 %	20 %	334139694
68	NC_015580	TCGAT	2	10	102520	102529	20 %	40 %	20 %	20 %	334139694
69	NC_015580	CCGCG	2	10	102793	102802	0 %	0 %	40 %	60 %	334139694
70	NC_015580	TTGCG	2	10	104267	104276	0 %	40 %	40 %	20 %	334139695
71	NC_015580	CGCTG	2	10	104423	104432	0 %	20 %	40 %	40 %	334139695
72	NC_015580	CATGG	2	10	106790	106799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015580	GGCCC	2	10	106915	106924	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_015580	TCCTG	2	10	107494	107503	0 %	40 %	20 %	40 %	334139697
75	NC_015580	TTCCA	2	10	107991	108000	20 %	40 %	0 %	40 %	334139697
76	NC_015580	CGCGC	2	10	110724	110733	0 %	0 %	40 %	60 %	334139700
77	NC_015580	GCCTT	2	10	114608	114617	0 %	40 %	20 %	40 %	334139703
78	NC_015580	CCGCG	2	10	115403	115412	0 %	0 %	40 %	60 %	334139704
79	NC_015580	TCCGC	2	10	115937	115946	0 %	20 %	20 %	60 %	334139704
80	NC_015580	CGAAG	2	10	116368	116377	40 %	0 %	40 %	20 %	334139704
81	NC_015580	GCGGG	2	10	118387	118396	0 %	0 %	80 %	20 %	334139707
82	NC_015580	CCGCG	2	10	120312	120321	0 %	0 %	40 %	60 %	334139710
83	NC_015580	AGCGC	2	10	121946	121955	20 %	0 %	40 %	40 %	334139712
84	NC_015580	CCGTC	2	10	122021	122030	0 %	20 %	20 %	60 %	334139712
85	NC_015580	CGATC	2	10	122169	122178	20 %	20 %	20 %	40 %	334139712
86	NC_015580	CAAGG	2	10	122571	122580	40 %	0 %	40 %	20 %	334139712
87	NC_015580	GGCCG	2	10	124129	124138	0 %	0 %	60 %	40 %	334139713
88	NC_015580	CCGGC	2	10	124781	124790	0 %	0 %	40 %	60 %	334139714
89	NC_015580	TGCCA	2	10	126553	126562	20 %	20 %	20 %	40 %	334139716
90	NC_015580	GCTGG	2	10	126567	126576	0 %	20 %	60 %	20 %	334139716
91	NC_015580	GCCGC	2	10	127718	127727	0 %	0 %	40 %	60 %	334139717
92	NC_015580	CGTGG	2	10	129158	129167	0 %	20 %	60 %	20 %	334139718
93	NC_015580	AATCG	2	10	129894	129903	40 %	20 %	20 %	20 %	334139720
94	NC_015580	GGGCG	2	10	131938	131947	0 %	0 %	80 %	20 %	334139721
95	NC_015580	GGGCG	2	10	132283	132292	0 %	0 %	80 %	20 %	334139722
96	NC_015580	CGATC	2	10	133090	133099	20 %	20 %	20 %	40 %	334139722
97	NC_015580	GTGCC	2	10	134369	134378	0 %	20 %	40 %	40 %	334139723
98	NC_015580	GCCTT	2	10	135011	135020	0 %	40 %	20 %	40 %	334139723
99	NC_015580	GGCGC	2	10	135615	135624	0 %	0 %	60 %	40 %	334139723
100	NC_015580	GTGCG	2	10	137580	137589	0 %	20 %	60 %	20 %	334139725
101	NC_015580	GGGCA	2	10	137993	138002	20 %	0 %	60 %	20 %	334139725
102	NC_015580	CGCGG	2	10	138234	138243	0 %	0 %	60 %	40 %	334139725
103	NC_015580	CGATG	2	10	139529	139538	20 %	20 %	40 %	20 %	334139727
104	NC_015580	GGCGA	2	10	141649	141658	20 %	0 %	60 %	20 %	334139729
105	NC_015580	CGATC	2	10	143865	143874	20 %	20 %	20 %	40 %	334139729
106	NC_015580	GCTCG	2	10	144166	144175	0 %	20 %	40 %	40 %	334139730
107	NC_015580	GGGCT	2	10	144812	144821	0 %	20 %	60 %	20 %	334139730
108	NC_015580	GCAAG	2	10	145072	145081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015580	CCGTT	2	10	146355	146364	0 %	40 %	20 %	40 %	334139732
110	NC_015580	CTGGT	2	10	146621	146630	0 %	40 %	40 %	20 %	334139732
111	NC_015580	CCTGG	2	10	147005	147014	0 %	20 %	40 %	40 %	334139733
112	NC_015580	TGAAG	2	10	147248	147257	40 %	20 %	40 %	0 %	334139733
113	NC_015580	CCGGA	2	10	147807	147816	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015580	TCCCG	2	10	148136	148145	0 %	20 %	20 %	60 %	334139734
115	NC_015580	AGCAT	2	10	149830	149839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015580	TCGTG	2	10	153820	153829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015580	CCGAA	2	10	158189	158198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015580	AACGA	2	10	159088	159097	60 %	0 %	20 %	20 %	334139738
119	NC_015580	CCATT	2	10	161318	161327	20 %	40 %	0 %	40 %	334139739
120	NC_015580	GTCCA	2	10	161422	161431	20 %	20 %	20 %	40 %	334139739
121	NC_015580	GATGC	2	10	162561	162570	20 %	20 %	40 %	20 %	334139740
122	NC_015580	AGGTC	2	10	162890	162899	20 %	20 %	40 %	20 %	334139740
123	NC_015580	CAGAT	2	10	164632	164641	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015580	GGCAG	2	10	164772	164781	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015580	GGATC	2	10	167189	167198	20 %	20 %	40 %	20 %	334139744
126	NC_015580	TTGCG	2	10	170260	170269	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015580	TGCGC	2	10	170448	170457	0 %	20 %	40 %	40 %	334139746
128	NC_015580	TGCCT	2	10	170611	170620	0 %	40 %	20 %	40 %	334139746
129	NC_015580	CGGGG	2	10	171600	171609	0 %	0 %	80 %	20 %	334139746
130	NC_015580	GACGA	2	10	172506	172515	40 %	0 %	40 %	20 %	334139747
131	NC_015580	CGTTG	2	10	174098	174107	0 %	40 %	40 %	20 %	334139748
132	NC_015580	CGACG	2	10	176105	176114	20 %	0 %	40 %	40 %	334139749
133	NC_015580	CGGAT	2	10	178834	178843	20 %	20 %	40 %	20 %	334139752
134	NC_015580	CGGCG	2	10	179664	179673	0 %	0 %	60 %	40 %	334139753
135	NC_015580	TCTCA	2	10	184261	184270	20 %	40 %	0 %	40 %	334139758
136	NC_015580	TCGCT	2	10	184509	184518	0 %	40 %	20 %	40 %	334139758
137	NC_015580	CAACG	2	10	184546	184555	40 %	0 %	20 %	40 %	334139758
138	NC_015580	GGGCC	2	10	184899	184908	0 %	0 %	60 %	40 %	334139759
139	NC_015580	TTGAT	2	10	185425	185434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_015580	GCTGG	2	10	190792	190801	0 %	20 %	60 %	20 %	334139765
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149	NC_015580	CGGAT	2	10	194285	194294	20 %	20 %	40 %	20 %	334139768
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157	NC_015580	AGGCG	2	10	201342	201351	20 %	0 %	60 %	20 %	334139773
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174	NC_015580	CGAAG	2	10	222923	222932	40 %	0 %	40 %	20 %	334139795
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177	NC_015580	CCGGA	2	10	223623	223632	20 %	0 %	40 %	40 %	334139796
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190	NC_015580	GCGCA	2	10	237919	237928	20 %	0 %	40 %	40 %	334139807
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195	NC_015580	CGGCT	2	10	242855	242864	0 %	20 %	40 %	40 %	334139812
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201	NC_015580	AAGAC	2	10	250890	250899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
202	NC_015580	CTCGC	2	10	252000	252009	0 %	20 %	20 %	60 %	334139819
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219	NC_015580	CTTTG	2	10	267108	267117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
220	NC_015580	CGCTT	2	10	267244	267253	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
221	NC_015580	GGAAA	2	10	267435	267444	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
222	NC_015580	TCTGG	2	10	267728	267737	0 %	40 %	40 %	20 %	334139837
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231	NC_015580	TGCGC	2	10	278838	278847	0 %	20 %	40 %	40 %	334139850
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234	NC_015580	CTGGC	2	10	280765	280774	0 %	20 %	40 %	40 %	334139853
235	NC_015580	CCATG	2	10	281621	281630	20 %	20 %	20 %	40 %	334139854
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238	NC_015580	GCCGA	2	10	284630	284639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
239	NC_015580	AGCGC	2	10	285075	285084	20 %	0 %	40 %	40 %	334139858
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241	NC_015580	TCGGC	2	10	288100	288109	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
242	NC_015580	GATGC	2	10	288206	288215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
243	NC_015580	CCGAT	2	10	289906	289915	20 %	20 %	20 %	40 %	334139861
244	NC_015580	AGCTG	2	10	291019	291028	20 %	20 %	40 %	20 %	334139862
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247	NC_015580	GCCGC	2	10	292963	292972	0 %	0 %	40 %	60 %	334139865
248	NC_015580	CAGAC	2	10	293104	293113	40 %	0 %	20 %	40 %	334139865
249	NC_015580	CAAGC	2	10	294442	294451	40 %	0 %	20 %	40 %	334139866
250	NC_015580	CGGCG	2	10	295690	295699	0 %	0 %	60 %	40 %	334139869
251	NC_015580	ACCAC	2	10	295877	295886	40 %	0 %	0 %	60 %	334139869
252	NC_015580	CTGGG	2	10	297828	297837	0 %	20 %	60 %	20 %	334139870
253	NC_015580	CTTAC	2	10	298331	298340	20 %	40 %	0 %	40 %	334139871
254	NC_015580	CGAGA	2	10	302286	302295	40 %	0 %	40 %	20 %	334139872
255	NC_015580	GAATG	2	10	303083	303092	40 %	20 %	40 %	0 %	334139873
256	NC_015580	GCTGC	2	10	303270	303279	0 %	20 %	40 %	40 %	334139873
257	NC_015580	CAGAG	2	10	303473	303482	40 %	0 %	40 %	20 %	334139873
258	NC_015580	GACTG	2	10	305415	305424	20 %	20 %	40 %	20 %	334139874
259	NC_015580	AGCCC	2	10	305481	305490	20 %	0 %	20 %	60 %	334139874
260	NC_015580	GCGCC	2	10	307960	307969	0 %	0 %	40 %	60 %	334139876
261	NC_015580	CGCGA	2	10	309881	309890	20 %	0 %	40 %	40 %	334139876
262	NC_015580	GCTTG	2	10	310533	310542	0 %	40 %	40 %	20 %	334139876
263	NC_015580	CTCGT	2	10	311705	311714	0 %	40 %	20 %	40 %	334139877
264	NC_015580	CCGGC	2	10	319264	319273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
265	NC_015580	GCGCC	2	10	320171	320180	0 %	0 %	40 %	60 %	334139883
266	NC_015580	CAACG	2	10	320641	320650	40 %	0 %	20 %	40 %	334139884
267	NC_015580	CGGCG	2	10	321832	321841	0 %	0 %	60 %	40 %	334139885
268	NC_015580	TGGCG	2	10	322480	322489	0 %	20 %	60 %	20 %	334139885
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282	NC_015580	GCTGA	2	10	342073	342082	20 %	20 %	40 %	20 %	334139904
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301	NC_015580	GCCGG	2	10	360891	360900	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
302	NC_015580	GCGCT	2	10	360921	360930	0 %	20 %	40 %	40 %	334139925
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343	NC_015580	ACCAC	2	10	403947	403956	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
344	NC_015580	CGGCC	2	10	405013	405022	0 %	0 %	40 %	60 %	334139969
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363	NC_015580	GGGCA	2	10	426274	426283	20 %	0 %	60 %	20 %	334139983
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382	NC_015580	CGGGC	2	10	441714	441723	0 %	0 %	60 %	40 %	334139996
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385	NC_015580	GCCGA	2	10	447548	447557	20 %	0 %	40 %	40 %	334140001
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391	NC_015580	CGCGC	2	10	454935	454944	0 %	0 %	40 %	60 %	334140007
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