MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015580	GTC	2	6	184611	184616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015580	CTT	2	6	184744	184749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139759
4003	NC_015580	CGAG	2	8	184755	184762	25 %	0 %	50 %	25 %	334139759
4004	NC_015580	CGG	2	6	184860	184865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139759
4005	NC_015580	TCG	2	6	184880	184885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139759
4006	NC_015580	GGGCC	2	10	184899	184908	0 %	0 %	60 %	40 %	334139759
4007	NC_015580	GCC	2	6	184933	184938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139759
4008	NC_015580	GTG	2	6	185032	185037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139759
4009	NC_015580	AGC	2	6	185046	185051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139759
4010	NC_015580	GAA	2	6	185080	185085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139759
4011	NC_015580	CGAGCG	2	12	185091	185102	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334139759
4012	NC_015580	ACG	2	6	185108	185113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139759
4013	NC_015580	GCG	2	6	185147	185152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139759
4014	NC_015580	GCC	2	6	185158	185163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139759
4015	NC_015580	CGT	2	6	185167	185172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139759
4016	NC_015580	GGT	2	6	185173	185178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139759
4017	NC_015580	CGG	2	6	185220	185225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139759
4018	NC_015580	CTGC	2	8	185261	185268	0 %	25 %	25 %	50 %	334139759
4019	NC_015580	CAT	2	6	185311	185316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015580	TCG	2	6	185344	185349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015580	CCG	2	6	185350	185355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_015580	TTGAT	2	10	185425	185434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015580	TGT	2	6	185473	185478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015580	CAA	2	6	185543	185548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015580	GCT	2	6	185627	185632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4026	NC_015580	TCG	2	6	185673	185678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4027	NC_015580	GCC	2	6	185729	185734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139760
4028	NC_015580	CG	3	6	185739	185744	0 %	0 %	50 %	50 %	334139760
4029	NC_015580	CGG	2	6	185760	185765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139760
4030	NC_015580	ACG	3	9	185778	185786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4031	NC_015580	CGG	2	6	185934	185939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139760
4032	NC_015580	CGG	2	6	185953	185958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139760
4033	NC_015580	CGA	2	6	185973	185978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4034	NC_015580	CGT	2	6	185986	185991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4035	NC_015580	TGG	2	6	186143	186148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139760
4036	NC_015580	TCG	2	6	186183	186188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4037	NC_015580	ATC	2	6	186194	186199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4038	NC_015580	TCA	3	9	186249	186257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4039	NC_015580	TGC	2	6	186267	186272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4040	NC_015580	GTC	2	6	186275	186280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139760
4041	NC_015580	AAC	2	6	186281	186286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139760
4042	NC_015580	GCTCG	2	10	186307	186316	0 %	20 %	40 %	40 %	334139760
4043	NC_015580	GC	3	6	186348	186353	0 %	0 %	50 %	50 %	334139760
4044	NC_015580	GTG	2	6	186361	186366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139760
4045	NC_015580	CTT	2	6	186388	186393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139760
4046	NC_015580	CCG	2	6	186399	186404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139760
4047	NC_015580	GAT	2	6	186415	186420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139760
4048	NC_015580	TAC	2	6	186422	186427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4049	NC_015580	ATC	2	6	186476	186481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4050	NC_015580	CAC	2	6	186524	186529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139760
4051	NC_015580	TCT	2	6	186576	186581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139760
4052	NC_015580	GGC	2	6	186608	186613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139760
4053	NC_015580	TGA	2	6	186627	186632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139760
4054	NC_015580	ATC	2	6	186671	186676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4055	NC_015580	ATG	2	6	186680	186685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139760
4056	NC_015580	GAT	2	6	186730	186735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139760
4057	NC_015580	CTA	2	6	186841	186846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4058	NC_015580	TCT	2	6	186933	186938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139760
4059	NC_015580	CGC	2	6	186940	186945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139760
4060	NC_015580	CGC	2	6	187036	187041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139760
4061	NC_015580	TCA	2	6	187056	187061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139760
4062	NC_015580	GC	3	6	187063	187068	0 %	0 %	50 %	50 %	334139760
4063	NC_015580	CGG	2	6	187072	187077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139760
4064	NC_015580	TGG	2	6	187107	187112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139760
4065	NC_015580	AAC	2	6	187235	187240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_015580	CGT	2	6	187319	187324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139761
4067	NC_015580	CGG	2	6	187328	187333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139761
4068	NC_015580	ACA	2	6	187366	187371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139761
4069	NC_015580	GCT	2	6	187447	187452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139761
4070	NC_015580	GAT	2	6	187469	187474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139761
4071	NC_015580	CGA	2	6	187487	187492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139761
4072	NC_015580	TGC	2	6	187520	187525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139761
4073	NC_015580	ACC	2	6	187540	187545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139761
4074	NC_015580	GAC	2	6	187608	187613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139761
4075	NC_015580	GGT	2	6	187646	187651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139761
4076	NC_015580	GAG	2	6	187833	187838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139761
4077	NC_015580	GAA	2	6	187965	187970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139761
4078	NC_015580	TGC	2	6	188016	188021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139762
4079	NC_015580	CTG	2	6	188045	188050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139762
4080	NC_015580	TGC	2	6	188055	188060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139762
4081	NC_015580	GTG	2	6	188069	188074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139762
4082	NC_015580	CCGGC	2	10	188092	188101	0 %	0 %	40 %	60 %	334139762
4083	NC_015580	GAA	2	6	188110	188115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139762
4084	NC_015580	GCC	2	6	188123	188128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139762
4085	NC_015580	GCC	2	6	188181	188186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139763
4086	NC_015580	CGA	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4087	NC_015580	TGG	2	6	188274	188279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139763
4088	NC_015580	GAT	2	6	188345	188350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139763
4089	NC_015580	GCTGG	2	10	188372	188381	0 %	20 %	60 %	20 %	334139763
4090	NC_015580	GAAC	2	8	188402	188409	50 %	0 %	25 %	25 %	334139763
4091	NC_015580	GCA	2	6	188417	188422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4092	NC_015580	GGC	2	6	188423	188428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
4093	NC_015580	GC	3	6	188498	188503	0 %	0 %	50 %	50 %	334139763
4094	NC_015580	CGG	2	6	188513	188518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
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4098	NC_015580	CGA	2	6	188672	188677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4099	NC_015580	GAT	2	6	188693	188698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139763
4100	NC_015580	CTG	2	6	188721	188726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4101	NC_015580	CGG	2	6	188728	188733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
4102	NC_015580	GGCCAG	2	12	188780	188791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334139763
4103	NC_015580	GCA	2	6	188801	188806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4104	NC_015580	GC	3	6	188809	188814	0 %	0 %	50 %	50 %	334139763
4105	NC_015580	GCC	2	6	188866	188871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139763
4106	NC_015580	CGG	2	6	188912	188917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
4107	NC_015580	TCG	2	6	188932	188937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139763
4108	NC_015580	CAC	2	6	188955	188960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139763
4109	NC_015580	GGC	2	6	189014	189019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
4110	NC_015580	GCG	3	9	189037	189045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139763
4111	NC_015580	GCC	2	6	189102	189107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015580	CGC	2	6	189354	189359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139764
4113	NC_015580	GCT	2	6	189413	189418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139764
4114	NC_015580	TGCC	2	8	189482	189489	0 %	25 %	25 %	50 %	334139764
4115	NC_015580	GACC	2	8	189503	189510	25 %	0 %	25 %	50 %	334139764
4116	NC_015580	CTT	2	6	189530	189535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139764
4117	NC_015580	CGG	2	6	189647	189652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139764
4118	NC_015580	TCT	2	6	189661	189666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139764
4119	NC_015580	GCA	2	6	189689	189694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139764
4120	NC_015580	CCG	2	6	189712	189717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139764
4121	NC_015580	CGG	2	6	189770	189775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139764
4122	NC_015580	CGA	2	6	189839	189844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139764
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4140	NC_015580	TGG	2	6	190480	190485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139764
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4144	NC_015580	TCG	3	9	190719	190727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139765
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4151	NC_015580	TGCGC	2	10	191129	191138	0 %	20 %	40 %	40 %	334139766
4152	NC_015580	GCC	2	6	191170	191175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139766
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4155	NC_015580	CAT	2	6	191259	191264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139766
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4188	NC_015580	TGC	2	6	192252	192257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139766
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4191	NC_015580	GCAGC	2	10	192405	192414	20 %	0 %	40 %	40 %	334139766
4192	NC_015580	GCC	2	6	192440	192445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139766
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4203	NC_015580	GCT	2	6	192813	192818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139766
4204	NC_015580	TGA	2	6	192851	192856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139766
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4219	NC_015580	TTG	2	6	193391	193396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4220	NC_015580	CGAGGC	2	12	193417	193428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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4222	NC_015580	TGC	2	6	193517	193522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4223	NC_015580	GCG	2	6	193580	193585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4224	NC_015580	GCG	2	6	193591	193596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4225	NC_015580	CGG	2	6	193670	193675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139768
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4228	NC_015580	CTG	2	6	193779	193784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139768
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4232	NC_015580	GGT	2	6	194055	194060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139768
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4237	NC_015580	TGC	2	6	194174	194179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139768
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4239	NC_015580	GGA	2	6	194250	194255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139768
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4241	NC_015580	CG	3	6	194331	194336	0 %	0 %	50 %	50 %	334139768
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4365	NC_015580	GCG	2	6	200053	200058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139772
4366	NC_015580	ATC	2	6	200066	200071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139772
4367	NC_015580	CAG	2	6	200110	200115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139772
4368	NC_015580	GGC	2	6	200176	200181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139772
4369	NC_015580	ACCGC	2	10	200186	200195	20 %	0 %	20 %	60 %	334139772
4370	NC_015580	GC	3	6	200214	200219	0 %	0 %	50 %	50 %	334139772
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4372	NC_015580	CGA	2	6	200304	200309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139772
4373	NC_015580	GATC	2	8	200335	200342	25 %	25 %	25 %	25 %	334139772
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4375	NC_015580	CGA	2	6	200373	200378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139772
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4378	NC_015580	AGGCG	2	10	200550	200559	20 %	0 %	60 %	20 %	334139773
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4380	NC_015580	AGCCGT	2	12	200670	200681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139773
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4384	NC_015580	GCG	2	6	200910	200915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139773
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4390	NC_015580	ATCGGC	2	12	201197	201208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139773
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4392	NC_015580	AGGCG	2	10	201342	201351	20 %	0 %	60 %	20 %	334139773
4393	NC_015580	CGA	2	6	201363	201368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139773
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4400	NC_015580	CGA	2	6	201570	201575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139773
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4413	NC_015580	GCGAC	2	10	202141	202150	20 %	0 %	40 %	40 %	334139774
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4484	NC_015580	AGC	2	6	205374	205379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4485	NC_015580	GCG	2	6	205401	205406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139779
4486	NC_015580	GCT	2	6	205440	205445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4487	NC_015580	CG	3	6	205472	205477	0 %	0 %	50 %	50 %	334139779
4488	NC_015580	CGG	2	6	205490	205495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139779
4489	NC_015580	CGC	3	9	205601	205609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139779
4490	NC_015580	CG	3	6	205635	205640	0 %	0 %	50 %	50 %	334139779
4491	NC_015580	GCTGCA	2	12	205660	205671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4492	NC_015580	CTG	2	6	205672	205677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139779
4493	NC_015580	CGA	2	6	205700	205705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4494	NC_015580	CCG	2	6	205790	205795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4495	NC_015580	GACGC	2	10	205809	205818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4496	NC_015580	C	6	6	205882	205887	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4497	NC_015580	CG	3	6	205949	205954	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780
4498	NC_015580	CGA	2	6	206075	206080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4499	NC_015580	TCG	2	6	206113	206118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139780
4500	NC_015580	CG	3	6	206204	206209	0 %	0 %	50 %	50 %	334139780

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