MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015580	CTG	2	6	135919	135924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139723
3002	NC_015580	GC	4	8	135975	135982	0 %	0 %	50 %	50 %	334139723
3003	NC_015580	CGC	2	6	135987	135992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139723
3004	NC_015580	GCG	2	6	136001	136006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3005	NC_015580	CG	4	8	136026	136033	0 %	0 %	50 %	50 %	334139723
3006	NC_015580	TCG	2	6	136049	136054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139723
3007	NC_015580	CGCT	2	8	136099	136106	0 %	25 %	25 %	50 %	334139723
3008	NC_015580	GTTC	2	8	136127	136134	0 %	50 %	25 %	25 %	334139723
3009	NC_015580	GC	3	6	136269	136274	0 %	0 %	50 %	50 %	334139723
3010	NC_015580	CGA	2	6	136305	136310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139723
3011	NC_015580	CG	4	8	136382	136389	0 %	0 %	50 %	50 %	334139723
3012	NC_015580	CCAG	2	8	136421	136428	25 %	0 %	25 %	50 %	334139723
3013	NC_015580	GGC	2	6	136467	136472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3014	NC_015580	AAC	2	6	136489	136494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139723
3015	NC_015580	CGG	2	6	136513	136518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3016	NC_015580	TAC	2	6	136522	136527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139723
3017	NC_015580	GCGG	2	8	136537	136544	0 %	0 %	75 %	25 %	334139723
3018	NC_015580	GCC	2	6	136604	136609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139723
3019	NC_015580	GCG	2	6	136703	136708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3020	NC_015580	CGC	2	6	136720	136725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139723
3021	NC_015580	GCG	2	6	136767	136772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3022	NC_015580	GCGG	2	8	136795	136802	0 %	0 %	75 %	25 %	334139723
3023	NC_015580	CGG	4	12	136920	136931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139723
3024	NC_015580	CGT	2	6	136958	136963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139724
3025	NC_015580	CG	4	8	137033	137040	0 %	0 %	50 %	50 %	334139724
3026	NC_015580	CCA	2	6	137045	137050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139724
3027	NC_015580	CGC	2	6	137075	137080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139724
3028	NC_015580	CGGG	2	8	137093	137100	0 %	0 %	75 %	25 %	334139724
3029	NC_015580	GGC	2	6	137150	137155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139724
3030	NC_015580	CGC	2	6	137192	137197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139724
3031	NC_015580	TGC	2	6	137337	137342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139725
3032	NC_015580	GAT	2	6	137370	137375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139725
3033	NC_015580	CG	3	6	137433	137438	0 %	0 %	50 %	50 %	334139725
3034	NC_015580	GCG	2	6	137467	137472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139725
3035	NC_015580	CGG	2	6	137492	137497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139725
3036	NC_015580	CGG	2	6	137535	137540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139725
3037	NC_015580	CGA	2	6	137574	137579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139725
3038	NC_015580	GTGCG	2	10	137580	137589	0 %	20 %	60 %	20 %	334139725
3039	NC_015580	GTC	2	6	137671	137676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139725
3040	NC_015580	CGA	2	6	137688	137693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139725
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3042	NC_015580	TCT	2	6	137945	137950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139725
3043	NC_015580	GC	3	6	137965	137970	0 %	0 %	50 %	50 %	334139725
3044	NC_015580	GC	3	6	137974	137979	0 %	0 %	50 %	50 %	334139725
3045	NC_015580	CGC	2	6	137983	137988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139725
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3048	NC_015580	CGG	3	9	138110	138118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139725
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3051	NC_015580	CGCGG	2	10	138234	138243	0 %	0 %	60 %	40 %	334139725
3052	NC_015580	GCG	2	6	138499	138504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139726
3053	NC_015580	CG	3	6	138520	138525	0 %	0 %	50 %	50 %	334139726
3054	NC_015580	GAT	2	6	138530	138535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139726
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3056	NC_015580	TTC	2	6	138564	138569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139726
3057	NC_015580	GCT	2	6	138638	138643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
3058	NC_015580	GCT	2	6	138659	138664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
3059	NC_015580	CTG	3	9	138741	138749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
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3062	NC_015580	CGCC	2	8	138856	138863	0 %	0 %	25 %	75 %	334139726
3063	NC_015580	TCG	2	6	138877	138882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
3064	NC_015580	GCT	2	6	138887	138892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
3065	NC_015580	GCC	2	6	138953	138958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139726
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3071	NC_015580	TCG	2	6	139180	139185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139726
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3094	NC_015580	GGAC	2	8	140022	140029	25 %	0 %	50 %	25 %	334139728
3095	NC_015580	TCTT	2	8	140052	140059	0 %	75 %	0 %	25 %	334139728
3096	NC_015580	GAA	2	6	140105	140110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139728
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3101	NC_015580	ATC	3	9	140292	140300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139728
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3103	NC_015580	ACG	2	6	140385	140390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139728
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3106	NC_015580	GAG	2	6	140510	140515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139728
3107	NC_015580	TCG	2	6	140539	140544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139728
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3109	NC_015580	CGA	2	6	140644	140649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139728
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3111	NC_015580	ATAG	2	8	140704	140711	50 %	25 %	25 %	0 %	334139728
3112	NC_015580	CAG	3	9	140720	140728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139728
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3118	NC_015580	CAGC	2	8	140870	140877	25 %	0 %	25 %	50 %	334139728
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3122	NC_015580	CCGG	2	8	141041	141048	0 %	0 %	50 %	50 %	334139728
3123	NC_015580	AGC	2	6	141063	141068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139728
3124	NC_015580	CGGGCG	2	12	141144	141155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139728
3125	NC_015580	GCG	2	6	141214	141219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139728
3126	NC_015580	GCC	2	6	141225	141230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139728
3127	NC_015580	GC	3	6	141279	141284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_015580	CAT	2	6	141293	141298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015580	C	6	6	141309	141314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3130	NC_015580	CCG	2	6	141398	141403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139729
3131	NC_015580	CGC	2	6	141432	141437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139729
3132	NC_015580	GCC	3	9	141438	141446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139729
3133	NC_015580	GCC	2	6	141453	141458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139729
3134	NC_015580	ACT	2	6	141476	141481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139729
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3137	NC_015580	CCGG	2	8	141577	141584	0 %	0 %	50 %	50 %	334139729
3138	NC_015580	GGCGA	2	10	141649	141658	20 %	0 %	60 %	20 %	334139729
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3145	NC_015580	TCG	2	6	142028	142033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139729
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3162	NC_015580	CGC	2	6	143220	143225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139729
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3205	NC_015580	GGGCT	2	10	144812	144821	0 %	20 %	60 %	20 %	334139730
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3208	NC_015580	CGG	2	6	144927	144932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3209	NC_015580	GCAAG	2	10	145072	145081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3210	NC_015580	GCG	3	9	145109	145117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139731
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3214	NC_015580	TCG	2	6	145224	145229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139731
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3217	NC_015580	CACC	2	8	145433	145440	25 %	0 %	0 %	75 %	334139731
3218	NC_015580	TG	3	6	145446	145451	0 %	50 %	50 %	0 %	334139731
3219	NC_015580	CGG	2	6	145490	145495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139731
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3222	NC_015580	CGT	2	6	145604	145609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139731
3223	NC_015580	AG	4	8	145628	145635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_015580	TGGA	2	8	145697	145704	25 %	25 %	50 %	0 %	334139732
3225	NC_015580	TGC	2	6	145818	145823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3226	NC_015580	GCTG	2	8	145920	145927	0 %	25 %	50 %	25 %	334139732
3227	NC_015580	TTC	2	6	145961	145966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139732
3228	NC_015580	GTC	2	6	145967	145972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3229	NC_015580	TTC	2	6	145997	146002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139732
3230	NC_015580	CG	3	6	146022	146027	0 %	0 %	50 %	50 %	334139732
3231	NC_015580	GCT	2	6	146038	146043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3232	NC_015580	CGT	2	6	146047	146052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3233	NC_015580	CTG	2	6	146060	146065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3234	NC_015580	ATG	2	6	146066	146071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139732
3235	NC_015580	TCA	2	6	146133	146138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139732
3236	NC_015580	GCA	2	6	146179	146184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3237	NC_015580	GCT	2	6	146188	146193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3238	NC_015580	CGG	2	6	146194	146199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139732
3239	NC_015580	CTT	2	6	146230	146235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139732
3240	NC_015580	CTG	2	6	146249	146254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3241	NC_015580	CGT	2	6	146272	146277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139732
3242	NC_015580	AGAGCG	2	12	146340	146351	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334139732
3243	NC_015580	CCGTT	2	10	146355	146364	0 %	40 %	20 %	40 %	334139732
3244	NC_015580	CTA	2	6	146371	146376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139732
3245	NC_015580	TTC	3	9	146435	146443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139732
3246	NC_015580	GC	3	6	146548	146553	0 %	0 %	50 %	50 %	334139732
3247	NC_015580	CTT	3	9	146566	146574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139732
3248	NC_015580	CTGGT	2	10	146621	146630	0 %	40 %	40 %	20 %	334139732
3249	NC_015580	AAG	2	6	146690	146695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139732
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3252	NC_015580	CGG	2	6	146754	146759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139732
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3254	NC_015580	TAC	2	6	146798	146803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139732
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3281	NC_015580	GC	3	6	148056	148061	0 %	0 %	50 %	50 %	334139734
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3322	NC_015580	TCG	2	6	149797	149802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3324	NC_015580	CTC	2	6	149808	149813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3325	NC_015580	AGCAT	2	10	149830	149839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3330	NC_015580	CTG	2	6	149900	149905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3332	NC_015580	CCCG	2	8	149966	149973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3333	NC_015580	ACG	2	6	149996	150001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3334	NC_015580	GCTT	2	8	150031	150038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3335	NC_015580	AGCT	2	8	150099	150106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3353	NC_015580	TCAT	2	8	151153	151160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3354	NC_015580	ATG	2	6	151212	151217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139737
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3358	NC_015580	GA	3	6	151432	151437	50 %	0 %	50 %	0 %	334139737
3359	NC_015580	GCG	2	6	151446	151451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139737
3360	NC_015580	TC	3	6	151581	151586	0 %	50 %	0 %	50 %	334139737
3361	NC_015580	TCG	2	6	151603	151608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139737
3362	NC_015580	TCGC	2	8	151672	151679	0 %	25 %	25 %	50 %	334139737
3363	NC_015580	CGA	2	6	151687	151692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139737
3364	NC_015580	CCT	2	6	151700	151705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139737
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