MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015580	TTG	2	6	48742	48747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139649
1002	NC_015580	CCG	2	6	48829	48834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139649
1003	NC_015580	CGC	2	6	48907	48912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139649
1004	NC_015580	AGC	2	6	48943	48948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015580	CAC	2	6	49005	49010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_015580	CGCGC	2	10	49021	49030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1007	NC_015580	GACG	2	8	49077	49084	25 %	0 %	50 %	25 %	334139650
1008	NC_015580	CGC	2	6	49085	49090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1009	NC_015580	GTC	2	6	49095	49100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1010	NC_015580	ATG	2	6	49122	49127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1011	NC_015580	GAT	2	6	49212	49217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1012	NC_015580	AGC	2	6	49237	49242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1013	NC_015580	CACGC	2	10	49274	49283	20 %	0 %	20 %	60 %	334139650
1014	NC_015580	GGC	2	6	49302	49307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1015	NC_015580	GGTA	2	8	49308	49315	25 %	25 %	50 %	0 %	334139650
1016	NC_015580	CGG	2	6	49322	49327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1017	NC_015580	ATG	2	6	49345	49350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1018	NC_015580	CGC	2	6	49403	49408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1019	NC_015580	CAG	2	6	49437	49442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1020	NC_015580	CGA	2	6	49457	49462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1021	NC_015580	CGA	2	6	49514	49519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1022	NC_015580	GCC	2	6	49536	49541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1023	NC_015580	AGC	3	9	49552	49560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1024	NC_015580	GCG	2	6	49577	49582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1025	NC_015580	AGC	2	6	49600	49605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1026	NC_015580	TGA	2	6	49637	49642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1027	NC_015580	GAT	2	6	49647	49652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1028	NC_015580	CTG	2	6	49671	49676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1029	NC_015580	CCTGGC	2	12	49772	49783	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334139650
1030	NC_015580	CGA	2	6	49796	49801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1031	NC_015580	CGG	2	6	49807	49812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1032	NC_015580	TGGG	2	8	49834	49841	0 %	25 %	75 %	0 %	334139650
1033	NC_015580	GCC	2	6	49887	49892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1034	NC_015580	TCG	2	6	49922	49927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1035	NC_015580	GAG	2	6	49942	49947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139650
1036	NC_015580	GGC	2	6	49998	50003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1037	NC_015580	GTC	2	6	50059	50064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1038	NC_015580	GAC	3	9	50097	50105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1039	NC_015580	GCG	2	6	50128	50133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1040	NC_015580	CGA	2	6	50144	50149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1041	NC_015580	CGA	2	6	50174	50179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1042	NC_015580	GAG	2	6	50199	50204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139650
1043	NC_015580	CCT	2	6	50257	50262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139650
1044	NC_015580	CTGG	2	8	50265	50272	0 %	25 %	50 %	25 %	334139650
1045	NC_015580	CG	3	6	50282	50287	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1046	NC_015580	G	6	6	50309	50314	0 %	0 %	100 %	0 %	334139650
1047	NC_015580	GCT	2	6	50321	50326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1048	NC_015580	TGCT	2	8	50332	50339	0 %	50 %	25 %	25 %	334139650
1049	NC_015580	GTC	2	6	50341	50346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1050	NC_015580	GCC	3	9	50386	50394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1051	NC_015580	CG	3	6	50396	50401	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1052	NC_015580	CAG	2	6	50439	50444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1053	NC_015580	CGG	3	9	50465	50473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1054	NC_015580	CTGG	2	8	50514	50521	0 %	25 %	50 %	25 %	334139650
1055	NC_015580	GTT	2	6	50526	50531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139650
1056	NC_015580	CTG	3	9	50547	50555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1057	NC_015580	CGA	2	6	50561	50566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1058	NC_015580	GGT	2	6	50621	50626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139650
1059	NC_015580	CG	3	6	50627	50632	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1060	NC_015580	GCGG	2	8	50634	50641	0 %	0 %	75 %	25 %	334139650
1061	NC_015580	GCC	2	6	50689	50694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1062	NC_015580	GAA	2	6	50721	50726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139650
1063	NC_015580	GAT	2	6	50730	50735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1064	NC_015580	GCG	2	6	50761	50766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1065	NC_015580	CCGA	2	8	50791	50798	25 %	0 %	25 %	50 %	334139650
1066	NC_015580	GCG	2	6	50833	50838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139650
1067	NC_015580	GC	3	6	50876	50881	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1068	NC_015580	CT	3	6	50943	50948	0 %	50 %	0 %	50 %	334139650
1069	NC_015580	TGA	2	6	51056	51061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139650
1070	NC_015580	GC	3	6	51063	51068	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1071	NC_015580	TCA	2	6	51080	51085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139650
1072	NC_015580	CGA	3	9	51092	51100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1073	NC_015580	GAA	2	6	51120	51125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139650
1074	NC_015580	CGA	2	6	51170	51175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1075	NC_015580	GGT	2	6	51183	51188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139650
1076	NC_015580	CGA	2	6	51191	51196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1077	NC_015580	TCG	2	6	51211	51216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1078	NC_015580	ATCG	2	8	51222	51229	25 %	25 %	25 %	25 %	334139650
1079	NC_015580	TCTCGA	2	12	51275	51286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334139650
1080	NC_015580	CGT	2	6	51293	51298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1081	NC_015580	CGA	2	6	51314	51319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1082	NC_015580	CAG	2	6	51330	51335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1083	NC_015580	CAT	2	6	51360	51365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139650
1084	NC_015580	CGCC	2	8	51426	51433	0 %	0 %	25 %	75 %	334139650
1085	NC_015580	GACGAT	2	12	51453	51464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334139650
1086	NC_015580	CG	3	6	51557	51562	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1087	NC_015580	CCG	2	6	51596	51601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1088	NC_015580	GC	3	6	51632	51637	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1089	NC_015580	CAC	2	6	51654	51659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139650
1090	NC_015580	GCC	2	6	51843	51848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1091	NC_015580	GC	3	6	51868	51873	0 %	0 %	50 %	50 %	334139650
1092	NC_015580	GTT	2	6	51879	51884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139650
1093	NC_015580	GATC	2	8	51926	51933	25 %	25 %	25 %	25 %	334139650
1094	NC_015580	ACC	2	6	51934	51939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139650
1095	NC_015580	CGC	2	6	51956	51961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1096	NC_015580	TCGA	2	8	51988	51995	25 %	25 %	25 %	25 %	334139650
1097	NC_015580	CAG	2	6	51996	52001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1098	NC_015580	CTT	2	6	52002	52007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139650
1099	NC_015580	GTC	2	6	52017	52022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139650
1100	NC_015580	AGCTG	2	10	52031	52040	20 %	20 %	40 %	20 %	334139650
1101	NC_015580	GTCAT	2	10	52048	52057	20 %	40 %	20 %	20 %	334139650
1102	NC_015580	CGC	2	6	52091	52096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1103	NC_015580	TGGT	2	8	52177	52184	0 %	50 %	50 %	0 %	334139650
1104	NC_015580	GGA	2	6	52227	52232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139650
1105	NC_015580	GCC	2	6	52288	52293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139650
1106	NC_015580	TCT	2	6	52298	52303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139650
1107	NC_015580	GAA	2	6	52443	52448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139650
1108	NC_015580	TTC	2	6	52519	52524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139651
1109	NC_015580	GTT	2	6	52557	52562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139651
1110	NC_015580	GC	3	6	52576	52581	0 %	0 %	50 %	50 %	334139651
1111	NC_015580	GCA	2	6	52736	52741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1112	NC_015580	CGA	2	6	52748	52753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1113	NC_015580	CCG	2	6	52786	52791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139651
1114	NC_015580	GC	3	6	52824	52829	0 %	0 %	50 %	50 %	334139651
1115	NC_015580	AGC	2	6	52972	52977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1116	NC_015580	CGC	2	6	52985	52990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139651
1117	NC_015580	GCC	3	9	53019	53027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139651
1118	NC_015580	CGA	2	6	53081	53086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1119	NC_015580	CACGCG	2	12	53136	53147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334139651
1120	NC_015580	CGA	2	6	53213	53218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1121	NC_015580	CTGG	2	8	53289	53296	0 %	25 %	50 %	25 %	334139651
1122	NC_015580	CTG	2	6	53301	53306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139651
1123	NC_015580	CGA	2	6	53324	53329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139651
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1125	NC_015580	CCGA	2	8	53401	53408	25 %	0 %	25 %	50 %	334139651
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1252	NC_015580	CG	3	6	59186	59191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1253	NC_015580	AAGC	2	8	59196	59203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1254	NC_015580	GC	3	6	59237	59242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_015580	C	6	6	59277	59282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1256	NC_015580	CA	3	6	59312	59317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1257	NC_015580	GCA	2	6	59363	59368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139658
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1262	NC_015580	CGA	2	6	59586	59591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139658
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1282	NC_015580	CGA	2	6	60058	60063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139658
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1285	NC_015580	TCA	2	6	60207	60212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139658
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1288	NC_015580	CCGGG	3	15	60460	60474	0 %	0 %	60 %	40 %	334139659
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1325	NC_015580	CGC	2	6	62250	62255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1326	NC_015580	TCA	2	6	62292	62297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139661
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1341	NC_015580	GAA	2	6	62953	62958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1342	NC_015580	CG	3	6	63020	63025	0 %	0 %	50 %	50 %	334139662
1343	NC_015580	CAGCC	2	10	63027	63036	20 %	0 %	20 %	60 %	334139662
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1364	NC_015580	GGCG	2	8	64007	64014	0 %	0 %	75 %	25 %	334139663
1365	NC_015580	GC	3	6	64015	64020	0 %	0 %	50 %	50 %	334139663
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1370	NC_015580	CTC	2	6	64189	64194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139664
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1372	NC_015580	GC	3	6	64405	64410	0 %	0 %	50 %	50 %	334139664
1373	NC_015580	CGT	2	6	64411	64416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139664
1374	NC_015580	GACC	2	8	64459	64466	25 %	0 %	25 %	50 %	334139664
1375	NC_015580	CAC	2	6	64492	64497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139664
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1377	NC_015580	CCGAGG	2	12	64536	64547	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334139664
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