MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015580	CGC	2	6	24746	24751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139627
502	NC_015580	ACTC	2	8	24796	24803	25 %	25 %	0 %	50 %	334139627
503	NC_015580	AGGGC	2	10	24838	24847	20 %	0 %	60 %	20 %	334139627
504	NC_015580	GAA	2	6	24851	24856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139627
505	NC_015580	GCG	2	6	24923	24928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139627
506	NC_015580	CGA	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139627
507	NC_015580	GC	3	6	25036	25041	0 %	0 %	50 %	50 %	334139627
508	NC_015580	TCG	2	6	25125	25130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139627
509	NC_015580	CAT	2	6	25213	25218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139627
510	NC_015580	ATG	2	6	25232	25237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139627
511	NC_015580	GACG	2	8	25238	25245	25 %	0 %	50 %	25 %	334139627
512	NC_015580	GGA	2	6	25270	25275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139627
513	NC_015580	CG	3	6	25362	25367	0 %	0 %	50 %	50 %	334139627
514	NC_015580	AAG	2	6	25385	25390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139627
515	NC_015580	AGG	2	6	25518	25523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139627
516	NC_015580	GAT	2	6	25570	25575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139627
517	NC_015580	GGGC	2	8	25596	25603	0 %	0 %	75 %	25 %	334139627
518	NC_015580	GCT	2	6	25653	25658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139627
519	NC_015580	CGC	2	6	25678	25683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139627
520	NC_015580	GCG	2	6	25688	25693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139627
521	NC_015580	CG	3	6	25766	25771	0 %	0 %	50 %	50 %	334139628
522	NC_015580	GCTG	2	8	25807	25814	0 %	25 %	50 %	25 %	334139628
523	NC_015580	GGA	2	6	25815	25820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139628
524	NC_015580	CTG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139628
525	NC_015580	CTGG	2	8	25895	25902	0 %	25 %	50 %	25 %	334139628
526	NC_015580	CGG	2	6	25994	25999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139628
527	NC_015580	GAG	2	6	26025	26030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139628
528	NC_015580	CTCG	2	8	26069	26076	0 %	25 %	25 %	50 %	334139628
529	NC_015580	GC	3	6	26098	26103	0 %	0 %	50 %	50 %	334139628
530	NC_015580	GCC	2	6	26173	26178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139628
531	NC_015580	GC	5	10	26261	26270	0 %	0 %	50 %	50 %	334139628
532	NC_015580	CG	3	6	26305	26310	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
533	NC_015580	CTG	2	6	26344	26349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
534	NC_015580	CG	3	6	26370	26375	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
535	NC_015580	CTT	2	6	26446	26451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139629
536	NC_015580	GGC	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
537	NC_015580	CGC	2	6	26532	26537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
538	NC_015580	GCT	2	6	26610	26615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
539	NC_015580	CTG	2	6	26617	26622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
540	NC_015580	CGC	2	6	26649	26654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
541	NC_015580	CGC	2	6	26721	26726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
542	NC_015580	CTG	2	6	26830	26835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
543	NC_015580	TCC	2	6	26837	26842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139629
544	NC_015580	CTGC	2	8	26849	26856	0 %	25 %	25 %	50 %	334139629
545	NC_015580	CGC	2	6	26866	26871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
546	NC_015580	CGC	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
547	NC_015580	GCT	2	6	26904	26909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
548	NC_015580	GC	3	6	26910	26915	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
549	NC_015580	GGC	2	6	26961	26966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
550	NC_015580	CGA	3	9	26990	26998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139629
551	NC_015580	GCT	2	6	27030	27035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
552	NC_015580	TCG	3	9	27071	27079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
553	NC_015580	CGC	2	6	27091	27096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
554	NC_015580	TCG	2	6	27119	27124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
555	NC_015580	GTC	2	6	27130	27135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
556	NC_015580	GCT	3	9	27183	27191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
557	NC_015580	TGC	2	6	27209	27214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
558	NC_015580	CGGC	2	8	27302	27309	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
559	NC_015580	GGC	2	6	27319	27324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
560	NC_015580	CGC	2	6	27344	27349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139629
561	NC_015580	CTG	2	6	27379	27384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
562	NC_015580	CTG	3	9	27487	27495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
563	NC_015580	ACG	2	6	27544	27549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139629
564	NC_015580	TGC	2	6	27560	27565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
565	NC_015580	TGC	3	9	27629	27637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
566	NC_015580	GGC	2	6	27655	27660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
567	NC_015580	ACG	2	6	27769	27774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139629
568	NC_015580	CAG	2	6	27784	27789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139629
569	NC_015580	GCG	2	6	27807	27812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
570	NC_015580	CGG	2	6	27866	27871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
571	NC_015580	GTC	2	6	27904	27909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139629
572	NC_015580	CTT	2	6	27963	27968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139629
573	NC_015580	GATC	2	8	27972	27979	25 %	25 %	25 %	25 %	334139629
574	NC_015580	ACCT	2	8	28015	28022	25 %	25 %	0 %	50 %	334139629
575	NC_015580	GC	3	6	28031	28036	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
576	NC_015580	CGCGGG	2	12	28037	28048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139629
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580	NC_015580	GAGC	2	8	28191	28198	25 %	0 %	50 %	25 %	334139629
581	NC_015580	CG	3	6	28284	28289	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
582	NC_015580	CG	3	6	28352	28357	0 %	0 %	50 %	50 %	334139629
583	NC_015580	TCAA	2	8	28366	28373	50 %	25 %	0 %	25 %	334139629
584	NC_015580	GGAC	2	8	28439	28446	25 %	0 %	50 %	25 %	334139629
585	NC_015580	CGC	2	6	28529	28534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139630
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588	NC_015580	GC	4	8	28678	28685	0 %	0 %	50 %	50 %	334139630
589	NC_015580	CGT	2	6	28706	28711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139630
590	NC_015580	TCG	2	6	28828	28833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139630
591	NC_015580	CGC	2	6	28886	28891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139630
592	NC_015580	GCC	2	6	28986	28991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139630
593	NC_015580	CGG	2	6	29181	29186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015580	GCT	2	6	29191	29196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015580	TGGCC	2	10	29269	29278	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
596	NC_015580	GTT	2	6	29293	29298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015580	GCG	2	6	29301	29306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015580	GCG	2	6	29383	29388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139631
599	NC_015580	GCAG	2	8	29402	29409	25 %	0 %	50 %	25 %	334139631
600	NC_015580	TCG	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139631
601	NC_015580	GCGCC	2	10	29444	29453	0 %	0 %	40 %	60 %	334139631
602	NC_015580	GCCA	2	8	29464	29471	25 %	0 %	25 %	50 %	334139631
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608	NC_015580	CGAG	2	8	29699	29706	25 %	0 %	50 %	25 %	334139631
609	NC_015580	CGG	2	6	29711	29716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139631
610	NC_015580	TG	3	6	29738	29743	0 %	50 %	50 %	0 %	334139631
611	NC_015580	CAG	2	6	29787	29792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139631
612	NC_015580	GC	3	6	29804	29809	0 %	0 %	50 %	50 %	334139631
613	NC_015580	CGT	2	6	29847	29852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139631
614	NC_015580	AGG	2	6	30023	30028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015580	CG	4	8	30075	30082	0 %	0 %	50 %	50 %	334139632
616	NC_015580	CCG	2	6	30120	30125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139632
617	NC_015580	TCA	2	6	30216	30221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139632
618	NC_015580	CG	3	6	30252	30257	0 %	0 %	50 %	50 %	334139632
619	NC_015580	GCC	2	6	30259	30264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139632
620	NC_015580	GCAT	2	8	30320	30327	25 %	25 %	25 %	25 %	334139632
621	NC_015580	CG	3	6	30328	30333	0 %	0 %	50 %	50 %	334139632
622	NC_015580	CCG	2	6	30399	30404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139632
623	NC_015580	CGC	2	6	30405	30410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139632
624	NC_015580	CGA	2	6	30450	30455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139632
625	NC_015580	TCT	2	6	30480	30485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139632
626	NC_015580	TCG	2	6	30505	30510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015580	GGA	2	6	30556	30561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015580	GCCC	2	8	30627	30634	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
629	NC_015580	GTC	2	6	30664	30669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139633
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757	NC_015580	TCG	2	6	37459	37464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139637
758	NC_015580	GCTG	2	8	37480	37487	0 %	25 %	50 %	25 %	334139637
759	NC_015580	CGA	2	6	37504	37509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139637
760	NC_015580	GCA	2	6	37543	37548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139637
761	NC_015580	CGG	2	6	37565	37570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139637
762	NC_015580	GGA	2	6	37595	37600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139637
763	NC_015580	TCC	2	6	37603	37608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139637
764	NC_015580	CGA	2	6	37652	37657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139637
765	NC_015580	CG	3	6	37675	37680	0 %	0 %	50 %	50 %	334139637
766	NC_015580	CGC	2	6	37727	37732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139637
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769	NC_015580	TCG	2	6	37943	37948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139638
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806	NC_015580	AGGGG	2	10	39527	39536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
807	NC_015580	GGC	2	6	39738	39743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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853	NC_015580	CTG	2	6	41802	41807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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865	NC_015580	GC	3	6	42408	42413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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873	NC_015580	CGA	2	6	42702	42707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139643
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875	NC_015580	CAG	2	6	42997	43002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
876	NC_015580	GCA	2	6	43008	43013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
877	NC_015580	CCG	2	6	43062	43067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139644
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880	NC_015580	CGG	3	9	43217	43225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139644
881	NC_015580	CAGCG	2	10	43246	43255	20 %	0 %	40 %	40 %	334139644
882	NC_015580	CTT	2	6	43356	43361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139644
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884	NC_015580	CGCT	2	8	43393	43400	0 %	25 %	25 %	50 %	334139644
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