MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015580	CG	3	6	273031	273036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_015580	AGC	2	6	273051	273056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015580	CGC	2	6	273136	273141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_015580	CGT	2	6	273213	273218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015580	GTT	2	6	273312	273317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015580	GCG	2	6	273388	273393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_015580	CGA	2	6	273423	273428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6008	NC_015580	GAA	2	6	273452	273457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139845
6009	NC_015580	GGC	2	6	273501	273506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139845
6010	NC_015580	GCC	2	6	273520	273525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6011	NC_015580	CG	4	8	273591	273598	0 %	0 %	50 %	50 %	334139845
6012	NC_015580	CGC	2	6	273640	273645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6013	NC_015580	CGC	2	6	273693	273698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6014	NC_015580	CAC	2	6	273832	273837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139845
6015	NC_015580	ACTGG	2	10	273939	273948	20 %	20 %	40 %	20 %	334139845
6016	NC_015580	GCG	2	6	274001	274006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139845
6017	NC_015580	GGC	2	6	274228	274233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139845
6018	NC_015580	GCT	2	6	274257	274262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6019	NC_015580	GCC	2	6	274273	274278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6020	NC_015580	GGC	2	6	274299	274304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139845
6021	NC_015580	GC	3	6	274303	274308	0 %	0 %	50 %	50 %	334139845
6022	NC_015580	CAT	2	6	274380	274385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139845
6023	NC_015580	CGG	2	6	274416	274421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139845
6024	NC_015580	ACG	2	6	274505	274510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6025	NC_015580	TCG	2	6	274535	274540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6026	NC_015580	CGCA	2	8	274555	274562	25 %	0 %	25 %	50 %	334139845
6027	NC_015580	GGA	2	6	274635	274640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139845
6028	NC_015580	TCGC	2	8	274663	274670	0 %	25 %	25 %	50 %	334139845
6029	NC_015580	GCCA	2	8	274810	274817	25 %	0 %	25 %	50 %	334139845
6030	NC_015580	CCG	2	6	274839	274844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6031	NC_015580	TCG	2	6	274877	274882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6032	NC_015580	CGC	2	6	274926	274931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139845
6033	NC_015580	GC	3	6	274930	274935	0 %	0 %	50 %	50 %	334139845
6034	NC_015580	GAT	2	6	275025	275030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139845
6035	NC_015580	CGA	2	6	275031	275036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139845
6036	NC_015580	GGGCT	2	10	275038	275047	0 %	20 %	60 %	20 %	334139845
6037	NC_015580	TCA	2	6	275185	275190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015580	GGTCA	2	10	275228	275237	20 %	20 %	40 %	20 %	334139846
6039	NC_015580	TCA	2	6	275244	275249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139846
6040	NC_015580	CTT	2	6	275371	275376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139846
6041	NC_015580	TGG	3	9	275378	275386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139846
6042	NC_015580	CAC	2	6	275406	275411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139846
6043	NC_015580	GCC	2	6	275456	275461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139846
6044	NC_015580	GC	4	8	275491	275498	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
6045	NC_015580	GAG	2	6	275501	275506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139846
6046	NC_015580	CGAC	2	8	275541	275548	25 %	0 %	25 %	50 %	334139846
6047	NC_015580	CCT	2	6	275569	275574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139846
6048	NC_015580	GTG	2	6	275588	275593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139846
6049	NC_015580	GCT	2	6	275698	275703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6050	NC_015580	GGCT	2	8	275761	275768	0 %	25 %	50 %	25 %	334139846
6051	NC_015580	CG	4	8	275771	275778	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
6052	NC_015580	CTG	2	6	275792	275797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6053	NC_015580	GCT	2	6	275836	275841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6054	NC_015580	TCG	2	6	275961	275966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6055	NC_015580	CGT	2	6	276041	276046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6056	NC_015580	GAC	2	6	276076	276081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6057	NC_015580	GCA	2	6	276125	276130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6058	NC_015580	CTG	2	6	276137	276142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139846
6059	NC_015580	TCC	2	6	276301	276306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139846
6060	NC_015580	GGC	2	6	276441	276446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139846
6061	NC_015580	CTT	2	6	276451	276456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139846
6062	NC_015580	TTG	2	6	276474	276479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139846
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6064	NC_015580	CGCGT	2	10	276578	276587	0 %	20 %	40 %	40 %	334139846
6065	NC_015580	ATG	2	6	276597	276602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139846
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6069	NC_015580	TGG	2	6	276789	276794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139846
6070	NC_015580	CGC	2	6	276801	276806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139846
6071	NC_015580	CG	3	6	276812	276817	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
6072	NC_015580	CG	4	8	276851	276858	0 %	0 %	50 %	50 %	334139846
6073	NC_015580	CACCCA	2	12	276870	276881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139846
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6075	NC_015580	GAC	2	6	276911	276916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139846
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6078	NC_015580	CAAA	2	8	277281	277288	75 %	0 %	0 %	25 %	334139847
6079	NC_015580	GGA	2	6	277323	277328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139847
6080	NC_015580	CG	3	6	277330	277335	0 %	0 %	50 %	50 %	334139847
6081	NC_015580	GTG	2	6	277363	277368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139847
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6086	NC_015580	CCG	2	6	277537	277542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139847
6087	NC_015580	GGC	2	6	277563	277568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139847
6088	NC_015580	AAG	2	6	277582	277587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139847
6089	NC_015580	ATCA	2	8	277677	277684	50 %	25 %	0 %	25 %	334139847
6090	NC_015580	TCA	2	6	277711	277716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015580	CAT	2	6	277800	277805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139848
6092	NC_015580	C	7	7	277818	277824	0 %	0 %	0 %	100 %	334139848
6093	NC_015580	CT	3	6	277844	277849	0 %	50 %	0 %	50 %	334139848
6094	NC_015580	T	6	6	277849	277854	0 %	100 %	0 %	0 %	334139848
6095	NC_015580	GTTG	2	8	277960	277967	0 %	50 %	50 %	0 %	334139848
6096	NC_015580	AACG	2	8	277984	277991	50 %	0 %	25 %	25 %	334139848
6097	NC_015580	ATTCA	2	10	278029	278038	40 %	40 %	0 %	20 %	334139848
6098	NC_015580	GCC	2	6	278062	278067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139848
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6103	NC_015580	CATAT	2	10	278256	278265	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6104	NC_015580	GC	4	8	278357	278364	0 %	0 %	50 %	50 %	334139849
6105	NC_015580	TCG	2	6	278421	278426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139849
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6107	NC_015580	GCA	2	6	278606	278611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139849
6108	NC_015580	ACTC	2	8	278647	278654	25 %	25 %	0 %	50 %	334139849
6109	NC_015580	CAAG	2	8	278668	278675	50 %	0 %	25 %	25 %	334139849
6110	NC_015580	CTG	2	6	278720	278725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139849
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6118	NC_015580	ATC	2	6	278965	278970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139850
6119	NC_015580	CCA	2	6	278971	278976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139850
6120	NC_015580	GC	4	8	279086	279093	0 %	0 %	50 %	50 %	334139851
6121	NC_015580	GCTGT	2	10	279107	279116	0 %	40 %	40 %	20 %	334139851
6122	NC_015580	CGG	2	6	279124	279129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139851
6123	NC_015580	CTGCG	2	10	279159	279168	0 %	20 %	40 %	40 %	334139851
6124	NC_015580	TCA	2	6	279205	279210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139851
6125	NC_015580	GC	3	6	279236	279241	0 %	0 %	50 %	50 %	334139851
6126	NC_015580	CG	3	6	279287	279292	0 %	0 %	50 %	50 %	334139851
6127	NC_015580	TGG	2	6	279326	279331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139851
6128	NC_015580	TGG	2	6	279342	279347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139851
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6130	NC_015580	GAT	2	6	279448	279453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139851
6131	NC_015580	GGC	2	6	279509	279514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139851
6132	NC_015580	GTC	2	6	279601	279606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015580	GTC	2	6	279626	279631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_015580	GCG	2	6	279636	279641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_015580	CT	3	6	279722	279727	0 %	50 %	0 %	50 %	334139852
6136	NC_015580	CCAC	2	8	279737	279744	25 %	0 %	0 %	75 %	334139852
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6139	NC_015580	ACG	2	6	279845	279850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139852
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6142	NC_015580	TGC	2	6	280105	280110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139852
6143	NC_015580	CGA	2	6	280114	280119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139852
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6158	NC_015580	CTGA	2	8	280818	280825	25 %	25 %	25 %	25 %	334139853
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6197	NC_015580	GCGT	2	8	283087	283094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6229	NC_015580	G	6	6	284468	284473	0 %	0 %	100 %	0 %	334139857
6230	NC_015580	CTT	2	6	284531	284536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139857
6231	NC_015580	CTT	2	6	284543	284548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139857
6232	NC_015580	CGG	3	9	284555	284563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139857
6233	NC_015580	CTGAT	2	10	284568	284577	20 %	40 %	20 %	20 %	334139857
6234	NC_015580	GAC	2	6	284588	284593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6235	NC_015580	GCCGA	2	10	284630	284639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6236	NC_015580	CGG	2	6	284647	284652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6237	NC_015580	GGCG	2	8	284689	284696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6238	NC_015580	CGC	2	6	284777	284782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6239	NC_015580	CG	3	6	284803	284808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6240	NC_015580	ATG	2	6	284842	284847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139858
6241	NC_015580	TCC	2	6	284891	284896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139858
6242	NC_015580	TGG	2	6	284909	284914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139858
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6244	NC_015580	CAA	2	6	284931	284936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139858
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6246	NC_015580	CGCC	2	8	284993	285000	0 %	0 %	25 %	75 %	334139858
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6252	NC_015580	TAT	2	6	285196	285201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334139858
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6257	NC_015580	AAGGC	2	10	285263	285272	40 %	0 %	40 %	20 %	334139858
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6329	NC_015580	ATGA	2	8	288267	288274	50 %	25 %	25 %	0 %	334139860
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6352	NC_015580	CG	3	6	289200	289205	0 %	0 %	50 %	50 %	334139860
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6359	NC_015580	GCC	2	6	289404	289409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139860
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6361	NC_015580	GCG	2	6	289495	289500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139860
6362	NC_015580	CGG	3	9	289508	289516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139860
6363	NC_015580	CGC	2	6	289631	289636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139861
6364	NC_015580	GAC	2	6	289647	289652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139861
6365	NC_015580	GGC	2	6	289687	289692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139861
6366	NC_015580	CTT	2	6	289697	289702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139861
6367	NC_015580	GC	3	6	289755	289760	0 %	0 %	50 %	50 %	334139861
6368	NC_015580	GGTCGA	2	12	289781	289792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	334139861
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6370	NC_015580	GC	3	6	289892	289897	0 %	0 %	50 %	50 %	334139861
6371	NC_015580	CCGAT	2	10	289906	289915	20 %	20 %	20 %	40 %	334139861
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6375	NC_015580	CGT	2	6	290051	290056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139861
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6382	NC_015580	GC	3	6	290330	290335	0 %	0 %	50 %	50 %	334139862
6383	NC_015580	GC	3	6	290341	290346	0 %	0 %	50 %	50 %	334139862
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6390	NC_015580	TCA	3	9	290697	290705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139862
6391	NC_015580	ATC	2	6	290724	290729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139862
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6423	NC_015580	AGACC	2	10	292212	292221	40 %	0 %	20 %	40 %	334139863
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6454	NC_015580	GATC	2	8	293692	293699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6484	NC_015580	CGG	2	6	295461	295466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139869
6485	NC_015580	ACT	2	6	295538	295543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139869
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6488	NC_015580	TCG	2	6	295736	295741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139869
6489	NC_015580	GGC	2	6	295792	295797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139869
6490	NC_015580	ACCAC	2	10	295877	295886	40 %	0 %	0 %	60 %	334139869
6491	NC_015580	CCG	2	6	296011	296016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139869
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