MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 85912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015580	TCG	2	6	228097	228102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139800
5002	NC_015580	GGGC	2	8	228383	228390	0 %	0 %	75 %	25 %	334139800
5003	NC_015580	GC	3	6	228448	228453	0 %	0 %	50 %	50 %	334139800
5004	NC_015580	GCG	2	6	228475	228480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139800
5005	NC_015580	GAG	2	6	228591	228596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139800
5006	NC_015580	CGCGAC	2	12	228597	228608	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334139800
5007	NC_015580	CGA	2	6	228677	228682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139800
5008	NC_015580	CGC	2	6	228728	228733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139800
5009	NC_015580	GCC	2	6	228795	228800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139800
5010	NC_015580	ACG	2	6	228838	228843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139800
5011	NC_015580	CTG	2	6	228864	228869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139800
5012	NC_015580	ATC	2	6	228891	228896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139800
5013	NC_015580	CGGC	2	8	228959	228966	0 %	0 %	50 %	50 %	334139800
5014	NC_015580	GGT	2	6	228995	229000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139800
5015	NC_015580	GACCG	2	10	229044	229053	20 %	0 %	40 %	40 %	334139800
5016	NC_015580	GC	3	6	229147	229152	0 %	0 %	50 %	50 %	334139800
5017	NC_015580	GCG	2	6	229178	229183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139800
5018	NC_015580	CGC	2	6	229252	229257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5019	NC_015580	CGC	2	6	229273	229278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5020	NC_015580	GCCT	2	8	229284	229291	0 %	25 %	25 %	50 %	334139801
5021	NC_015580	TCGC	2	8	229292	229299	0 %	25 %	25 %	50 %	334139801
5022	NC_015580	GGC	2	6	229367	229372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139801
5023	NC_015580	GTC	2	6	229376	229381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139801
5024	NC_015580	CGG	2	6	229387	229392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139801
5025	NC_015580	GGGC	2	8	229410	229417	0 %	0 %	75 %	25 %	334139801
5026	NC_015580	CGG	2	6	229428	229433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139801
5027	NC_015580	GAGCGA	2	12	229525	229536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	334139801
5028	NC_015580	CGC	2	6	229567	229572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5029	NC_015580	GATC	2	8	229699	229706	25 %	25 %	25 %	25 %	334139801
5030	NC_015580	GTC	2	6	229751	229756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139801
5031	NC_015580	GGGCG	2	10	229768	229777	0 %	0 %	80 %	20 %	334139801
5032	NC_015580	GCGAG	2	10	229833	229842	20 %	0 %	60 %	20 %	334139801
5033	NC_015580	GGC	2	6	229849	229854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139801
5034	NC_015580	CG	3	6	229896	229901	0 %	0 %	50 %	50 %	334139801
5035	NC_015580	GCC	3	9	229907	229915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5036	NC_015580	GCGA	2	8	230036	230043	25 %	0 %	50 %	25 %	334139801
5037	NC_015580	TCG	2	6	230052	230057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139801
5038	NC_015580	CGG	2	6	230070	230075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139801
5039	NC_015580	CGC	2	6	230134	230139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5040	NC_015580	GCGG	2	8	230167	230174	0 %	0 %	75 %	25 %	334139801
5041	NC_015580	AGG	2	6	230232	230237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139801
5042	NC_015580	GC	3	6	230362	230367	0 %	0 %	50 %	50 %	334139801
5043	NC_015580	GTG	2	6	230399	230404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334139801
5044	NC_015580	AGC	2	6	230469	230474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139801
5045	NC_015580	ACC	2	6	230484	230489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139801
5046	NC_015580	GCC	2	6	230493	230498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139801
5047	NC_015580	GGCG	2	8	230571	230578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_015580	ATG	2	6	230596	230601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015580	CCCT	2	8	230664	230671	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5050	NC_015580	G	6	6	230704	230709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015580	GCG	2	6	230730	230735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_015580	GC	4	8	230744	230751	0 %	0 %	50 %	50 %	334139802
5053	NC_015580	TGT	2	6	230769	230774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139802
5054	NC_015580	CGA	2	6	230799	230804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5055	NC_015580	TCG	2	6	230828	230833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5056	NC_015580	TCG	2	6	230918	230923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5057	NC_015580	GCC	2	6	230953	230958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139802
5058	NC_015580	ACG	2	6	230981	230986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139802
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5060	NC_015580	CG	3	6	231225	231230	0 %	0 %	50 %	50 %	334139802
5061	NC_015580	TGC	2	6	231260	231265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5062	NC_015580	GCG	2	6	231266	231271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139802
5063	NC_015580	TCG	2	6	231299	231304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5064	NC_015580	GCG	2	6	231305	231310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139802
5065	NC_015580	CGT	2	6	231441	231446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
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5067	NC_015580	CGG	2	6	231525	231530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139802
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5069	NC_015580	CGC	2	6	231625	231630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139802
5070	NC_015580	CG	3	6	231645	231650	0 %	0 %	50 %	50 %	334139802
5071	NC_015580	CCGG	2	8	231710	231717	0 %	0 %	50 %	50 %	334139802
5072	NC_015580	GAC	2	6	231739	231744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139802
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5074	NC_015580	GCCCTT	2	12	231799	231810	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	334139802
5075	NC_015580	ACG	2	6	231818	231823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139802
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5080	NC_015580	TCG	2	6	231971	231976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5081	NC_015580	TCT	2	6	231978	231983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139802
5082	NC_015580	CGCGG	2	10	231985	231994	0 %	0 %	60 %	40 %	334139802
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5085	NC_015580	GCCC	2	8	232092	232099	0 %	0 %	25 %	75 %	334139802
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5088	NC_015580	CG	4	8	232161	232168	0 %	0 %	50 %	50 %	334139802
5089	NC_015580	GCC	2	6	232277	232282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139802
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5094	NC_015580	TCG	2	6	232565	232570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139802
5095	NC_015580	GAG	2	6	232633	232638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334139802
5096	NC_015580	GCGG	2	8	232683	232690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_015580	CCA	2	6	232808	232813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334139803
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5101	NC_015580	AGGCGG	2	12	233087	233098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	334139803
5102	NC_015580	GC	3	6	233134	233139	0 %	0 %	50 %	50 %	334139803
5103	NC_015580	CGTGT	2	10	233222	233231	0 %	40 %	40 %	20 %	334139803
5104	NC_015580	CGG	2	6	233276	233281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015580	CGT	2	6	233324	233329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139804
5106	NC_015580	CGGC	2	8	233338	233345	0 %	0 %	50 %	50 %	334139804
5107	NC_015580	TGT	2	6	233353	233358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334139804
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5109	NC_015580	GAA	2	6	233432	233437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139804
5110	NC_015580	TTCGAT	2	12	233489	233500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	334139804
5111	NC_015580	ATG	2	6	233556	233561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015580	GC	3	6	233574	233579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_015580	GGA	2	6	233594	233599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015580	GCA	2	6	233622	233627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_015580	GC	3	6	233633	233638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_015580	AGC	2	6	233718	233723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015580	CGC	2	6	233750	233755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_015580	GGC	2	6	233946	233951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5119	NC_015580	TGA	2	6	233954	233959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139805
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5123	NC_015580	GCG	2	6	234019	234024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5124	NC_015580	GAA	2	6	234045	234050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139805
5125	NC_015580	AGCCG	2	10	234066	234075	20 %	0 %	40 %	40 %	334139805
5126	NC_015580	CGG	2	6	234107	234112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5127	NC_015580	CGG	2	6	234116	234121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5128	NC_015580	CGG	2	6	234151	234156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5129	NC_015580	CGG	2	6	234179	234184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139805
5130	NC_015580	GC	3	6	234228	234233	0 %	0 %	50 %	50 %	334139805
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5132	NC_015580	CGGT	2	8	234283	234290	0 %	25 %	50 %	25 %	334139805
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5226	NC_015580	CGAT	2	8	237504	237511	25 %	25 %	25 %	25 %	334139807
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5233	NC_015580	GCGCA	2	10	237919	237928	20 %	0 %	40 %	40 %	334139807
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5239	NC_015580	GGC	2	6	238112	238117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139807
5240	NC_015580	GCC	2	6	238145	238150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139807
5241	NC_015580	CGA	2	6	238243	238248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139807
5242	NC_015580	TCTGC	2	10	238281	238290	0 %	40 %	20 %	40 %	334139807
5243	NC_015580	GGC	2	6	238300	238305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139807
5244	NC_015580	GCG	2	6	238346	238351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_015580	GAC	2	6	238423	238428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_015580	GAC	2	6	238432	238437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_015580	CG	4	8	238478	238485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5248	NC_015580	A	6	6	238486	238491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_015580	CAC	2	6	238492	238497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5250	NC_015580	GCG	2	6	238498	238503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5251	NC_015580	C	6	6	238507	238512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5252	NC_015580	GGA	2	6	238541	238546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_015580	C	6	6	238550	238555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5254	NC_015580	G	6	6	238699	238704	0 %	0 %	100 %	0 %	334139808
5255	NC_015580	GGC	2	6	238745	238750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139808
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5257	NC_015580	GCTCG	2	10	238894	238903	0 %	20 %	40 %	40 %	334139808
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5260	NC_015580	GAC	2	6	239053	239058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139808
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5263	NC_015580	GGC	2	6	239116	239121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139808
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5265	NC_015580	GC	3	6	239329	239334	0 %	0 %	50 %	50 %	334139808
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5272	NC_015580	CCCG	2	8	239649	239656	0 %	0 %	25 %	75 %	334139809
5273	NC_015580	GGCGCG	2	12	239670	239681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139809
5274	NC_015580	CAG	2	6	239682	239687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139809
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5282	NC_015580	TTCCT	2	10	239974	239983	0 %	60 %	0 %	40 %	334139809
5283	NC_015580	CTC	2	6	239989	239994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139809
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5295	NC_015580	CAT	2	6	240334	240339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5300	NC_015580	GCAG	2	8	240508	240515	25 %	0 %	50 %	25 %	334139810
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5331	NC_015580	CAT	2	6	242072	242077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5332	NC_015580	TGC	2	6	242123	242128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5333	NC_015580	GCA	2	6	242171	242176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139812
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5351	NC_015580	TCC	2	6	243003	243008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334139812
5352	NC_015580	ACT	2	6	243055	243060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139812
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5354	NC_015580	TCG	2	6	243110	243115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139812
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5363	NC_015580	GCC	2	6	243506	243511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139812
5364	NC_015580	ACG	2	6	243579	243584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139812
5365	NC_015580	CGC	2	6	243625	243630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334139812
5366	NC_015580	GC	3	6	243629	243634	0 %	0 %	50 %	50 %	334139812
5367	NC_015580	CGG	2	6	243676	243681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139812
5368	NC_015580	ACA	2	6	243711	243716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334139812
5369	NC_015580	ATCGT	2	10	243741	243750	20 %	40 %	20 %	20 %	334139812
5370	NC_015580	GCGG	2	8	243895	243902	0 %	0 %	75 %	25 %	334139812
5371	NC_015580	CGA	2	6	244030	244035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5372	NC_015580	GCT	2	6	244056	244061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_015580	C	6	6	244091	244096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5374	NC_015580	GCAG	3	12	244117	244128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5375	NC_015580	CG	3	6	244160	244165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5376	NC_015580	GAGT	2	8	244409	244416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_015580	TGCG	2	8	244462	244469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5378	NC_015580	ACG	2	6	244471	244476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5379	NC_015580	AGTTC	2	10	244480	244489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5380	NC_015580	CG	3	6	244544	244549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5381	NC_015580	CGGT	2	8	244584	244591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5382	NC_015580	CGG	2	6	244612	244617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5383	NC_015580	GGA	2	6	244725	244730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_015580	TGCC	2	8	244822	244829	0 %	25 %	25 %	50 %	334139813
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5387	NC_015580	AC	3	6	244950	244955	50 %	0 %	0 %	50 %	334139813
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5393	NC_015580	GCA	2	6	245128	245133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139813
5394	NC_015580	CTG	2	6	245137	245142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139813
5395	NC_015580	GCG	2	6	245154	245159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139813
5396	NC_015580	TTCC	2	8	245199	245206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5397	NC_015580	CG	3	6	245216	245221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5398	NC_015580	TTG	2	6	245242	245247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_015580	TCTG	2	8	245340	245347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5400	NC_015580	GCC	2	6	245393	245398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5401	NC_015580	GCTG	2	8	245546	245553	0 %	25 %	50 %	25 %	334139814
5402	NC_015580	GTC	3	9	245577	245585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139814
5403	NC_015580	TGC	2	6	245627	245632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139814
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5405	NC_015580	GC	3	6	245769	245774	0 %	0 %	50 %	50 %	334139814
5406	NC_015580	GGC	2	6	245802	245807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139814
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5409	NC_015580	GCCC	2	8	246019	246026	0 %	0 %	25 %	75 %	334139815
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5423	NC_015580	CCGT	2	8	246794	246801	0 %	25 %	25 %	50 %	334139815
5424	NC_015580	CGA	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139815
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5428	NC_015580	CG	3	6	246928	246933	0 %	0 %	50 %	50 %	334139815
5429	NC_015580	CGCGGG	2	12	246937	246948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139815
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5434	NC_015580	GCG	2	6	247053	247058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139815
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5440	NC_015580	CGG	2	6	247201	247206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139815
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5445	NC_015580	AATGGC	2	12	247400	247411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334139816
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5455	NC_015580	AAG	2	6	247894	247899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334139817
5456	NC_015580	CTG	2	6	247910	247915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139817
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5461	NC_015580	ATCG	2	8	248083	248090	25 %	25 %	25 %	25 %	334139817
5462	NC_015580	CTT	2	6	248151	248156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334139817
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5472	NC_015580	ATCGC	2	10	248483	248492	20 %	20 %	20 %	40 %	334139817
5473	NC_015580	CAT	2	6	248493	248498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139817
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5476	NC_015580	CGG	2	6	248699	248704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139817
5477	NC_015580	GAC	2	6	248736	248741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139817
5478	NC_015580	CCAG	2	8	248780	248787	25 %	0 %	25 %	50 %	334139817
5479	NC_015580	CT	3	6	248839	248844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5480	NC_015580	TC	3	6	248876	248881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5481	NC_015580	GTC	2	6	248932	248937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139818
5482	NC_015580	GGC	2	6	249052	249057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139818
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5485	NC_015580	CG	3	6	249242	249247	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818
5486	NC_015580	GGC	2	6	249250	249255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139818
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5488	NC_015580	GCA	2	6	249306	249311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334139818
5489	NC_015580	GCT	2	6	249315	249320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139818
5490	NC_015580	CTG	2	6	249352	249357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334139818
5491	NC_015580	TCA	2	6	249380	249385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334139818
5492	NC_015580	GC	4	8	249478	249485	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818
5493	NC_015580	CGG	2	6	249501	249506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139818
5494	NC_015580	CG	3	6	249539	249544	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818
5495	NC_015580	GC	3	6	249576	249581	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818
5496	NC_015580	GC	3	6	249586	249591	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818
5497	NC_015580	GAT	2	6	249606	249611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334139818
5498	NC_015580	GCG	2	6	249677	249682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334139818
5499	NC_015580	GGGC	2	8	249684	249691	0 %	0 %	75 %	25 %	334139818
5500	NC_015580	CG	3	6	249758	249763	0 %	0 %	50 %	50 %	334139818

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