MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 2600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	CCG	2	6	30	35	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133218
2	NC_015579	CGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133218
3	NC_015579	CTG	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133218
4	NC_015579	GGC	2	6	415	420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133218
5	NC_015579	TCA	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133218
6	NC_015579	GGC	2	6	478	483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133218
7	NC_015579	AAG	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133218
8	NC_015579	GCT	2	6	875	880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
9	NC_015579	CTG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
10	NC_015579	AGA	2	6	916	921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
11	NC_015579	CAA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133219
12	NC_015579	CGA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
13	NC_015579	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
14	NC_015579	CGC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
15	NC_015579	TTC	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133219
16	NC_015579	GTC	2	6	1353	1358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
17	NC_015579	CGC	2	6	1387	1392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
18	NC_015579	CTG	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
19	NC_015579	CGG	2	6	1610	1615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
20	NC_015579	TCG	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
21	NC_015579	TGC	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
22	NC_015579	AGA	2	6	1826	1831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
23	NC_015579	GAT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133219
24	NC_015579	CGA	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
25	NC_015579	GCG	2	6	2029	2034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
26	NC_015579	TGC	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
27	NC_015579	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133219
28	NC_015579	CGC	2	6	2173	2178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
29	NC_015579	GGA	3	9	2189	2197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133219
30	NC_015579	CGC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
31	NC_015579	TCT	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133219
32	NC_015579	GTC	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133219
33	NC_015579	GGC	2	6	2662	2667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
34	NC_015579	GCC	2	6	2745	2750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
35	NC_015579	GAA	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
36	NC_015579	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
37	NC_015579	GAA	2	6	2904	2909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133219
38	NC_015579	CGG	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133219
39	NC_015579	ATG	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133219
40	NC_015579	CCG	3	9	2986	2994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133219
41	NC_015579	GCT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015579	CGG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015579	CAT	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
44	NC_015579	ATT	2	6	3195	3200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334133220
45	NC_015579	CAT	2	6	3325	3330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
46	NC_015579	TTC	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133220
47	NC_015579	CCG	2	6	3424	3429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
48	NC_015579	CAT	2	6	3447	3452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
49	NC_015579	CGC	2	6	3473	3478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
50	NC_015579	TAC	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133220
51	NC_015579	TGA	2	6	3601	3606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133220
52	NC_015579	GCG	2	6	3641	3646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133220
53	NC_015579	GCT	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133220
54	NC_015579	CCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
55	NC_015579	GCC	2	6	4030	4035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133220
56	NC_015579	GAC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133220
57	NC_015579	ACG	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133220
58	NC_015579	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133220
59	NC_015579	GCG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133220
60	NC_015579	GCC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015579	GCG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015579	CGC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015579	CGC	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133221
64	NC_015579	CGA	2	6	4746	4751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133221
65	NC_015579	TGG	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133221
66	NC_015579	GGC	2	6	4887	4892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133221
67	NC_015579	GAT	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133221
68	NC_015579	GAA	2	6	5352	5357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133221
69	NC_015579	TCA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015579	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015579	GAC	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015579	CGC	2	6	5575	5580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133222
73	NC_015579	GTC	2	6	5611	5616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133222
74	NC_015579	TTC	2	6	5660	5665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133222
75	NC_015579	GCG	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015579	GCC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133223
77	NC_015579	AGC	2	6	5896	5901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133223
78	NC_015579	CCA	2	6	5933	5938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133223
79	NC_015579	CGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133223
80	NC_015579	GTC	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133224
81	NC_015579	CCG	2	6	6346	6351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133224
82	NC_015579	CAG	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133224
83	NC_015579	GAT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015579	ATC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015579	TCG	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015579	CTG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
87	NC_015579	GCT	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
88	NC_015579	CGC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133225
89	NC_015579	GCA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
90	NC_015579	ACC	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133225
91	NC_015579	GTC	2	6	6995	7000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
92	NC_015579	ATG	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133225
93	NC_015579	CAG	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
94	NC_015579	CAC	2	6	7220	7225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133225
95	NC_015579	CGA	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
96	NC_015579	CGA	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
97	NC_015579	CAG	2	6	7454	7459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133225
98	NC_015579	CGG	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133225
99	NC_015579	GTA	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133225
100	NC_015579	TCG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133225
101	NC_015579	TGT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015579	CCT	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015579	CCG	2	6	8080	8085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133226
104	NC_015579	GTC	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133226
105	NC_015579	GGC	3	9	8448	8456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133227
106	NC_015579	CAA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334133227
107	NC_015579	TCA	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015579	CTG	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015579	GCC	2	6	8783	8788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133228
110	NC_015579	GAA	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133228
111	NC_015579	CGA	2	6	8873	8878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133228
112	NC_015579	CGG	2	6	8924	8929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133228
113	NC_015579	ATC	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133228
114	NC_015579	AAG	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133228
115	NC_015579	CCA	2	6	9068	9073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133228
116	NC_015579	ACG	2	6	9115	9120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133228
117	NC_015579	ACC	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133228
118	NC_015579	GAG	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334133228
119	NC_015579	GCC	2	6	9636	9641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015579	AGC	2	6	9661	9666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015579	GGC	2	6	9726	9731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015579	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015579	GCA	2	6	9882	9887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133229
124	NC_015579	ACG	2	6	9962	9967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133229
125	NC_015579	TAC	2	6	10012	10017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133229
126	NC_015579	CGT	2	6	10103	10108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015579	TCG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015579	TCC	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015579	GCA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015579	CTG	2	6	10539	10544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133230
131	NC_015579	GGT	3	9	10634	10642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015579	CAT	2	6	10682	10687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
133	NC_015579	ATC	2	6	10689	10694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
134	NC_015579	TCA	2	6	10720	10725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133231
135	NC_015579	TCT	2	6	10886	10891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133231
136	NC_015579	GCA	2	6	10988	10993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133231
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139	NC_015579	ATC	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015579	GTC	2	6	11183	11188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015579	GGA	2	6	11307	11312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015579	TGA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015579	TTC	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015579	GCG	2	6	11535	11540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015579	AAG	2	6	11728	11733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133232
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153	NC_015579	GAT	2	6	12056	12061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015579	CGC	2	6	12298	12303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133233
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157	NC_015579	TGT	2	6	12564	12569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133234
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253	NC_015579	CGT	2	6	20861	20866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133242
254	NC_015579	GGC	2	6	20870	20875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133242
255	NC_015579	GCA	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133243
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257	NC_015579	ATG	2	6	21555	21560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133244
258	NC_015579	GCG	2	6	21664	21669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133244
259	NC_015579	GCG	2	6	21735	21740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133244
260	NC_015579	CGG	2	6	21811	21816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133244
261	NC_015579	GCC	2	6	21854	21859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133244
262	NC_015579	TGC	2	6	21873	21878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133244
263	NC_015579	CTT	2	6	21890	21895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133244
264	NC_015579	TGG	2	6	21992	21997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133244
265	NC_015579	CAG	2	6	22011	22016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133244
266	NC_015579	ATC	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133244
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280	NC_015579	CTG	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133246
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282	NC_015579	GCC	2	6	23734	23739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133246
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286	NC_015579	TGC	2	6	24301	24306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133247
287	NC_015579	ACC	2	6	24313	24318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133247
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289	NC_015579	ATG	2	6	24639	24644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015579	CTC	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_015579	ACC	2	6	24669	24674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133248
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327	NC_015579	CGC	2	6	27530	27535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133251
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336	NC_015579	CAG	3	9	28350	28358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133251
337	NC_015579	GCG	2	6	28390	28395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133251
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342	NC_015579	CCA	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133251
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381	NC_015579	GCG	2	6	31132	31137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133252
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497	NC_015579	CCA	2	6	39964	39969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_015579	GCT	2	6	40136	40141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133261

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