MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 3820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015579	CAT	2	6	175974	175979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133403
3502	NC_015579	GCC	2	6	176056	176061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133403
3503	NC_015579	GGC	2	6	176062	176067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133403
3504	NC_015579	GGC	2	6	176091	176096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133403
3505	NC_015579	ACG	2	6	176128	176133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133403
3506	NC_015579	GC	4	8	176138	176145	0 %	0 %	50 %	50 %	334133403
3507	NC_015579	GC	3	6	176168	176173	0 %	0 %	50 %	50 %	334133403
3508	NC_015579	CCCA	2	8	176263	176270	25 %	0 %	0 %	75 %	334133403
3509	NC_015579	GGC	2	6	176288	176293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133403
3510	NC_015579	TCG	2	6	176338	176343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133403
3511	NC_015579	CGA	2	6	176354	176359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133403
3512	NC_015579	TTC	2	6	176368	176373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133403
3513	NC_015579	CG	3	6	176462	176467	0 %	0 %	50 %	50 %	334133403
3514	NC_015579	AGC	2	6	176532	176537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133403
3515	NC_015579	GCC	2	6	176553	176558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133403
3516	NC_015579	GCG	2	6	176562	176567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133403
3517	NC_015579	AAAG	2	8	176636	176643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015579	CTC	2	6	176666	176671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_015579	TGC	2	6	176678	176683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_015579	AG	3	6	176690	176695	50 %	0 %	50 %	0 %	334133404
3521	NC_015579	CAGCGT	2	12	176700	176711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334133404
3522	NC_015579	GGT	2	6	176712	176717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133404
3523	NC_015579	CTG	2	6	176799	176804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133404
3524	NC_015579	CCG	2	6	176854	176859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133404
3525	NC_015579	CCG	2	6	176941	176946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133404
3526	NC_015579	GCG	2	6	176947	176952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133404
3527	NC_015579	CGT	2	6	176972	176977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133404
3528	NC_015579	GTT	2	6	176997	177002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133404
3529	NC_015579	GGCCG	2	10	177042	177051	0 %	0 %	60 %	40 %	334133404
3530	NC_015579	GTT	2	6	177081	177086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133404
3531	NC_015579	GC	3	6	177123	177128	0 %	0 %	50 %	50 %	334133404
3532	NC_015579	GTT	2	6	177135	177140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133404
3533	NC_015579	TTG	2	6	177163	177168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133404
3534	NC_015579	TCGCTG	2	12	177217	177228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133404
3535	NC_015579	GTG	2	6	177334	177339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133404
3536	NC_015579	CGA	2	6	177404	177409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133404
3537	NC_015579	CGG	2	6	177416	177421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133404
3538	NC_015579	TCT	2	6	177440	177445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133404
3539	NC_015579	CTCTT	2	10	177461	177470	0 %	60 %	0 %	40 %	334133404
3540	NC_015579	CGTGAT	2	12	177607	177618	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334133405
3541	NC_015579	AGA	2	6	177641	177646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133405
3542	NC_015579	GCC	2	6	177706	177711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133405
3543	NC_015579	CGC	2	6	177726	177731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133405
3544	NC_015579	GCT	2	6	177741	177746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133405
3545	NC_015579	CGG	2	6	177950	177955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133405
3546	NC_015579	GC	3	6	178080	178085	0 %	0 %	50 %	50 %	334133405
3547	NC_015579	CTAA	2	8	178220	178227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_015579	GGC	2	6	178289	178294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_015579	TTCGA	2	10	178607	178616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_015579	GCA	2	6	178659	178664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_015579	GCCGC	2	10	178680	178689	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3552	NC_015579	CGG	2	6	178692	178697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015579	GAG	2	6	178773	178778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015579	GGC	2	6	178784	178789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015579	TCT	2	6	178823	178828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_015579	GTCG	2	8	178852	178859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_015579	GC	3	6	178895	178900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_015579	TGG	2	6	178909	178914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_015579	GCAA	2	8	178984	178991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_015579	TC	3	6	179061	179066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_015579	CT	3	6	179225	179230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_015579	CG	3	6	179284	179289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_015579	AAG	2	6	179354	179359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015579	TCG	2	6	179509	179514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133407
3565	NC_015579	CCT	2	6	179576	179581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334133407
3566	NC_015579	CCA	2	6	179654	179659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133407
3567	NC_015579	GT	3	6	179846	179851	0 %	50 %	50 %	0 %	334133407
3568	NC_015579	GAT	2	6	180014	180019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133407
3569	NC_015579	CG	3	6	180021	180026	0 %	0 %	50 %	50 %	334133407
3570	NC_015579	CGAA	2	8	180069	180076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_015579	AT	4	8	180101	180108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015579	TGA	3	9	180138	180146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015579	AGC	2	6	180148	180153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_015579	CGA	2	6	180304	180309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_015579	TTG	2	6	180377	180382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015579	AGCG	2	8	180511	180518	25 %	0 %	50 %	25 %	334133408
3577	NC_015579	AG	3	6	180544	180549	50 %	0 %	50 %	0 %	334133408
3578	NC_015579	TCA	2	6	180552	180557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133408
3579	NC_015579	CG	3	6	180648	180653	0 %	0 %	50 %	50 %	334133408
3580	NC_015579	CGA	2	6	180657	180662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3581	NC_015579	CCG	2	6	180675	180680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133408
3582	NC_015579	TTC	2	6	180892	180897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334133408
3583	NC_015579	GCC	2	6	180923	180928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133408
3584	NC_015579	CCGGAA	2	12	181051	181062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3585	NC_015579	CCA	2	6	181078	181083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334133408
3586	NC_015579	GAA	2	6	181105	181110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133408
3587	NC_015579	GGC	2	6	181123	181128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133408
3588	NC_015579	CGC	2	6	181146	181151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133408
3589	NC_015579	ACTG	2	8	181209	181216	25 %	25 %	25 %	25 %	334133408
3590	NC_015579	CTGT	2	8	181239	181246	0 %	50 %	25 %	25 %	334133408
3591	NC_015579	AGGCG	2	10	181275	181284	20 %	0 %	60 %	20 %	334133408
3592	NC_015579	GCA	2	6	181334	181339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3593	NC_015579	TCA	2	6	181344	181349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133408
3594	NC_015579	CAG	2	6	181369	181374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3595	NC_015579	GCT	2	6	181399	181404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3596	NC_015579	GCA	2	6	181434	181439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3597	NC_015579	CAG	2	6	181468	181473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3598	NC_015579	AGC	2	6	181514	181519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133408
3599	NC_015579	GAA	2	6	181586	181591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334133409
3600	NC_015579	TAG	2	6	181626	181631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334133409
3601	NC_015579	GCC	2	6	181662	181667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3602	NC_015579	CGT	2	6	181717	181722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3603	NC_015579	AGC	2	6	181788	181793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3604	NC_015579	GGC	2	6	181832	181837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133409
3605	NC_015579	CAT	2	6	181900	181905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334133409
3606	NC_015579	CCGCTG	2	12	182012	182023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334133409
3607	NC_015579	CCG	2	6	182037	182042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3608	NC_015579	TGG	2	6	182071	182076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334133409
3609	NC_015579	GGC	2	6	182087	182092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334133409
3610	NC_015579	GTT	2	6	182138	182143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334133409
3611	NC_015579	GTC	2	6	182171	182176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3612	NC_015579	GC	3	6	182259	182264	0 %	0 %	50 %	50 %	334133409
3613	NC_015579	CGC	2	6	182290	182295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3614	NC_015579	GCC	2	6	182345	182350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3615	NC_015579	CGT	2	6	182363	182368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3616	NC_015579	GTC	2	6	182372	182377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3617	NC_015579	GCC	2	6	182408	182413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3618	NC_015579	GTC	2	6	182429	182434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3619	NC_015579	CAG	2	6	182435	182440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3620	NC_015579	TGC	2	6	182470	182475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334133409
3621	NC_015579	GCC	2	6	182609	182614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3622	NC_015579	CGC	2	6	182719	182724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
3623	NC_015579	CG	3	6	182734	182739	0 %	0 %	50 %	50 %	334133409
3624	NC_015579	GCC	2	6	182771	182776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334133409
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3655	NC_015579	AAG	2	6	184319	184324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3741	NC_015579	GGCA	2	8	188516	188523	25 %	0 %	50 %	25 %	334133413
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3819	NC_015579	CGAT	2	8	192039	192046	25 %	25 %	25 %	25 %	334133416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.